Entry information : SbRboh09 (Sobic.009G206500.1[2.1] / Sb09g026320[1.4])
Entry ID | 928 |
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Creation | 2008-11-15 (Christophe Dunand) |
Last sequence changes | 2008-11-15 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Catherine Mathe |
Last annotation changes | 2015-12-10 (Catherine Mathe) |
Peroxidase information: SbRboh09 (Sobic.009G206500.1[2.1] / Sb09g026320[1.4])
Name (synonym) | SbRboh09 (Sobic.009G206500.1[2.1] / Sb09g026320[1.4]) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Class | Respiratory burst oxidase homolog [Orthogroup: Rboh002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Sorghum | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Sorghum bicolor [TaxId: 4558 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
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Tissue types | Pannicles Seedlings |
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Inducer | N/D |
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Repressor | N/D |
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Best BLASTp hits |
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Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '928' 'complement(join(55615214..55615323,55616277..55616355,55616544..55616672,55616766..55616963,55617178..55617337,55617428..55617595,55617699..55617814,55617886..55617981,55618072..55618455,55618865..55619287,55622072..55622185,55622843..55622891,55623010..55623169,55623262..55623949))' |
Exons►
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Literature and cross-references SbRboh09 (Sobic.009G206500.1[2.1] / Sb09g026320[1.4])
Literature | REFERENCE 1 Klein,R.R., Cordonnier-Pratt,M.-M., Gingle,A., Sudman,M. and Pratt ,L.H. An EST database from Sorghum: developing preanthesis pannicles. |
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DNA ref. | Phytozome 12: chromosome_9 (55623949..55615214) |
EST ref. | GenBank: BI140015 |
Protein sequence: SbRboh09 (Sobic.009G206500.1[2.1] / Sb09g026320[1.4])
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 9, 13 introns) and 3 ESTs (BI245845, CF073108). Cultivar="BTx623". | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
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CDS► Send to BLAST |
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