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Entry information : RcAPx02 (29602.m000217)
Entry ID 9328
Creation 2011-06-30 (Qiang Li)
Last sequence changes 2012-01-04 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2011-12-02 (Qiang Li)
Peroxidase information: RcAPx02 (29602.m000217)
Name (synonym) RcAPx02 (29602.m000217)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx2003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Euphorbiaceae Ricinus
Organism Ricinus communis    [TaxId: 3988 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value RcAPx02
start..stop		 S start..stop
CsAPx03 509 0 1..288 1..287
CclAPx03 508 0 1..288 1..287
GhAPx01 507 0 1..288 1..288
MeAPx08 507 0 1..287 1..287
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '9328' 'join(103512..103624,103736..103860,103973..104022,104596..104661,104739..104787,112526..112608,112696..112775,112870..112972,113665..113862)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 103512..103624 111 N° 2 103736..103860 123 N° 3 103973..104022 48 N° 4 104596..104661 64
N° 5 104739..104787 47 N° 6 112526..112608 81 N° 7 112696..112775 78 N° 8 112870..112972 101
N° 9 113665..113862 196  
join(103512..103624,103736..103860,103973..104022,104596..104661,104739..104787, 112526..112608,112696..112775,112870..112972,113665..113862)


exon

Literature and cross-references RcAPx02 (29602.m000217)
DNA ref. Phytozome 12:   29602 (103512..113862)
Protein sequence: RcAPx02 (29602.m000217)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   288
PWM (Da):   %s   31911.37 Transmb domain:   %s   o259-281i
PI (pH):   %s   7.3
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MSLPVVDTEYMKEIDKARRDLRALIAYKNCAPIMLRLAWHDAGTYDKHTKTGGPNGSIRNEEEYSHGSNNGLKIALDFEEVKAKHPRITYADLYLAGVVAVEVTGGPSINFVPGRKDSKI
SPREGRLPDAKQGPPHLRDIFHRMGLCDKDIVALSGGHTGRAHPERSGFDGPWTKEPLKFDNSYFVELLKGETEGLLKLPTDKALLEDPEFRPYVELYADEEAFFKDYAESHKRLSELGF
TPSSSGSKVIAKDSVILAQSAVGVAVAAAVVIFSYFYEVRKRMK*

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic.
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTCGTTACCGGTAGTTGACACAGAGTACATGAAGGAGATAGACAAGGCACGTCGCGATCTCCGTGCTCTTATCGCTTACAAGAACTGCGCTCCTATCATGCTTCGCTTAGCGCGTAAC
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GAAAAGGAATGAAATGATGCCAAAAAAATTGATGTGATTTTGCAAGAATTTGATTCTTAGGTATGATTTATTCCAAACAATTGGATATACTGTGGCGTACAACTCCATATTGGTTTTAGT
AGTCCATCAAGATTTGAGCTCAATACTAGATGATGGATTATTTTTCCATGATTGATTACCTCCCCTAATGAATGGCTTTCACATCTAGTCACTTCTGTGTGACCAGAGAGAAAGAGACCA
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GTCTGAAGTTTCGTCGCTGGAAACCCTGTGCGTGACTCCCAAGCGCCGCCACAAGCTTTCTGCTACAGTAACACGTGCCGGATGCGTGGAGGTGCGTCTGGAACCGGAAATTGCTCCGGT
TTGTCTTGGTTGACTTCTCTTGACTTCCACAACTTGTTTGTGTACCTGTTTAGGTCAGCATCAGTCATGGTATGAGATTTTTTTAGTACAGGTTTGATTTTTTCGGAAATTTTTTGTAGG
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CAAATTATCTTTATTAGCGTCAAACTATTGAGTTATATTTGCTAAATATTTCTATGGATAGCCATTTGACTGATGATCCTCCAAAAGAGGATGCTAGACTACCTTGGATGAGAGAAGATG
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ATGCTTCTCGAATTTATGATGTGTGTAAAGCATTTCATAGGGCGTAGAAAGGTGATAAGTCTCTCACCAACTATTTTATGGATTTCAAGAAAACATATGAAGAACTTAATATGTTGCTTT
CATTTAGTAATAATATAACTATTCAACAAGCTCAACGTGAAAAGATGGCTGTGATGAGTTTTTTAGACGGACTCCCTTTGGAATTTGAGACTGCTAAATCTCAGAGTCTTTCCAGTTCAT
AAATTTCCTCTTTACAAGAGGTTTTTAGTAGAGTCCTTTGTACAGAAAATTCTTCACCTGTTCAGCTTAGTATTGTCCGGGTTAGTCGCAATACTACATATGAATCAGGAAGACAATAAT
ATAAGATCGGGAATGGTAGTAAAATGATAGTATCTAGCAACTATGACAGGTATACTAATACTTGTGGACAAGAGTCAGGAGAGATAATGTGTCACTACTGTCATAAACTAGGACATATGA
GACGAGATTGCAGGAAGTTGCAGTATAAGAAAACTCAGTCCGCCAATGTTACATCCACCATGGATACCTCTGAGAGGCCTGTAATGGTATCTGCAGATGAGTATGCAATATTTTGTCCAG
TACCAAGAATCACTAAAAACTCAATCTCCTCCTATTACTACCATTGTTGAATCAGGTAAATCCAATACATGTCTTGTTTCCTCCTCTTCGAAATGGGTCATTGATTCTGGTGCTATAAAT
CATATGACAGGTAATGCAAAATTATTTTCTACCTTTCAGTCACATAAATCTACCTCTCCAGTTACTTTAGCAGATGGGTCAACATCTTGTGTTATTGGGTCTGACACAATTAATGCCACA
CCGTCATTTTCTTTATCATCAGTTCTTAGTTTATCACAACTATCATTTAATTTAATTTATGTAAGTAAACTCACTCACAGTCTTAACTGTTGTCTCATTTTTTCCTGATCATTGTTTATT
TCACGATCTTACGACGAAGATGATTATTGGTAAGGGACATGAGTCTGGGGGTCTCTACATTCTTGATACACAAATTGCAAGATCTATAGCCTATTTTGGAGTGATGACACATTGTAGGTT
GGGCCACTCATCTCTCCATGTGCTAAAACAACTTTGTCTTCAGTTTCAGAGTCTGTCTTCATTAAATTGCGAGTCTTGTCAGTTTGCTAAACATAATCTTCTTAGTTCAAGTCCTAGAGT
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GGAGTACGTATCAGAATCCTTCCAAACTAAAACACTGATTCCTGTTGAGCCTAGGATATTTGGGTTTACATTCTTTGTTTGGGATGTTCGTACTCTGGTTACCAAGCTAGATCCAAAATC
TTTGAAGTATGTTTTTCTTGGCTATTTTCGTGCTAAAAAAGGATATAGATGTTACTGACCTTCTTTTAACAGATATCTTGTTAGTTGATGTTACTTTTTTGGAAGATACACCTTTCTTTC
CATCTACTCCTCCTTTAAGTCAGGGGGAGGATGGGGATTTTGTAATTTATACTGTTACACCTACTCTTGATAAACCTAAGCCACCTATAGTACAAGTTTATTCTCGGCGATCAACCCCTC
CGGATCCATGTTCTGAACCAACTCCTTCGTTGTCAAATCCAGTCTCTAATGATGATCTTCTTATTGCTCTTTGTAAAGGTAAGCATACATGCACTTATCCAATGTCTTCCTTTGTGTCTT
ATAATCAATTGTCGTCCTCCTCTTCTTTTATTGTATCTCTAGATTCTATATATATTCCTAAGGCTGTTAAAGAAGCCCTTTCTCACCCTGGTTGGCTTAATTTAAGGAGATGAGTGCTTT
ACAGGATAATGGTACTTGGACCTTAGTTGATTTGCCTGCAGCTAAGAAAGCTATTGGGTGTAAATGGGTATTTGCTATTAAAGTCATTCTTGATGGATCCATTGCAAGATTAAAAGCCCG
TCTTGTTGCTAAAGGATATGCTCAAACTTATGGAGTAGATTATTTCGATATATTTTCTCCTGTTGCTAAGATGACTTCCATAAGATTGTTTATTTCTATGGCGGCTACTTATAATTGGCC
TCTTCATCAATTAGATATCAAGAATGCTTTTCTCCATGGGGATCTTCAGGAGGAAGTTTATATGGAGCAACCGCTTGGCTTTGTTGCTCAGGGGGAGTATGGGAAAGTTTTCTATCTTCG
CAAGTTTCTATACGGATTGAAGCAAAGGCCTCGTGCTTGGTTTGGAAAGTTTAGTCAAGCAGTTGAGAAGTTTGACATGAAGAAAAGTAAGTTGGACCATTCTATTTTCTTCAAGCATTC
TGCTGTAGGTATCATTCTGTTAGTTGTGTTTGTGGATGATATTGTCATTATTGGGAGTGGCACTACAGAGATTTCATCCCTTAAATATTTTCTCCACATTCAGTTTCATACTAAATATTT
GGGAATGTTGAGATACCTCTTGGGTGTTAAGGTAATACGAAGTAAGAAGGGAATATTTTTATCTCAAAGGAAATATGTACTTGACCTGTTGTCCGAGATAGGAAAGTTGGGAGCTAAGCC
ATGCAATATTCCAATAGTTCCTAATTTGCAGCTCACAAATGATGATGAGTTATTTAAAGATCTTGAGAGATATAGAAGATTGGTTGGGAAGTTGAATTATCTTACTGTGATTCGTCCAGA
TATTGCATATTCAGTTAGTGTGGTGAGTCAGTACATGTCCTCTTCAACAGTTAATCACTGGACAACTGTCGAACAAATTTTGTGCTACTTAAAAGGAGCACTTGGGCGAGGAATATTATA
TGGTAATCATGGTTATAATAGAATTGAATGTTTTTCAGATACTGACTGGGCGGGTCTAAGGATGATTGAAGATCTACTACAAGCTATTCTGTATTTGTTGGAGGGAATTTGGTTTCATGG
AAAAGTAAGAAGCAAAATGTTGTCTCACGTTCAAATGCGGAATCAGAGTATAGAGCTATAGCCAAGTCAATATATGAAATAATGTGGATATACATCTTTTAACTGAAGTAGGACTTAAAA
CTTCAGTACCGGCTAAGTTGTTGTGTGATAACCAAGCTGCTCTTTACATTGCATCAAATCCTGTATTTCATGAACGAACTAAGTATATCGAGATTGACTTCCATTTCGTTCATGAGAAGA
TTCAGCAAGGTTTGATTTCCACAGGTTATGTTAAGACAGGAGAACAACTAGGAGATACTTTCACGAAGGCTCTTACTGGGATTCGAGTTTATTATCTCTGTAACAAGCTGGACATGATTA
ATATTTATGCTCCAGTTTGAGGGGGAGTGTTATGAAAGTTGTATAGGATTGTATATAGTAATTAGAAGACTAATTTAATTAAGAGTCCTAATTCTACTTAGATTAGGATTGTATATACTG
TGTATATATATATAGGTCTAACTCCCTTGATTAAAAGAATATAAGATTTTCGGATTGAATATAAGATTTTCGGATTCTTTACTCACGTTACAAATTACATTATTAAAGGGTCCAATTAGT
AGTCGAAGTACTTGCTGCATCTCTTCTCTACAAGTTGGTATACTCCTTCCCCTCCTGTTGTTTCTGGTAAAAGGGCATGATATACTGAGGTTGTTAATATGTTTGATCAAGGAACTTTAA
GGATTCATTAATTCAGGCTCAAAGCCTGCTTTACTCTTTTAATCTTAGTTCAAGAAATTCATTCTATATTTATCATTCAGTTGCCACTTGCTTTACATTTTGACTAGAATATATCTCTAT
ATTGATCTCATTTATCACAGGCTCACAGCTTCAGTTCTATATTATATAGATACTTCAGTTTGCTAAGTATGATATTTGTGCTCACATGTTTCAGGCTTGTTTTGCAGTCTACTGTTTCTA
AATAGGACCACAATTGCTTAACCTGACCTCATGTCTGTGTGGGCTTATGTTGACACCTCTACTGTCAATGCTTTACCTGAGTCCTCTTGTACTTGTGGATTCAGATGAAAAAGAAAGTTT
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GAAATGTTCTTAAGTTGCTGTGTTGCTCATTGTTGTCTAGAACTTCAGCGTTTTATCATTCTTTTTCTAAACGGGACATAGAGCACGCTGAAATATCCTGCAACTTGAATTGTTGTTTAA
AGGTCTTAATATCCTATTCACAAATGTGCAGCTGCATCAAGAAGTTGCCTATGGAATTCTACTTAGGAGATGGGTATAGTAGATTTCTATTTAAAATTTCAGGATTGGTTTCCTATTAAT
ATAGGGATCTAAGCTTCAAGAAATACAGACTTTAGTTCAAGCTAATCAGAGTGAAAGGCAGCAGTTAGGGGTTTGCAAATTGCACTCTCAATTGGATCAACAATAAACTGCAATATCATC
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TCTCTTGGTCTTACTCTTTGTGAATTTGCTGTTTCGAAATAGTCTTATCATTGAGATGGGGTTGTGAAACAATTTAGAGGTCTAACTTTGTAATTAATTTTATTCATTTATATCTAACAC
ATCTCAAGAGACTTAATATTGTGAGAAAGCATCAGGTAAAGCAGTAGAAAATAACATAATACTTTGGTGTTTGACTAATAGGAAACATAAGAAAATTCCAACTATTCCTAGTTTACAGCA
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AGCAGTTCAATCAGTTAAATGCTTGTTTCCCCTTAGGATGCTATAAATACAAGATCTATTTTGGTTTACAGGGCTATCCCTTGTATTCCTAGCCTAACTGGAATTCTTGACTTCATAAGA
CATTAATAGTCCCTCACACGAGGATATATATTTATATTTATATATTTTAAATATTTGGGAATTGAATTCTTATATATTGTAAGCATTAAATAAGAACTAGTTGTCTACTTCTGCAGCTTC
TATATTTTAATTTTCTTTTTTGGATTTGGCATTGAAATTTTTGTTGATTATTACTGTACATAATAATTGTATAACAATGGTTTGTGGTATTAATTTTGTTGAATCATGTTAAAGGGAGGA
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TGGCGGTTTTAGGGAACTGCTGAAGGGGGAGACAGAGGGGCTGTTGAAACTTCCAACTGACAAGGCTTTGTTGGAAGACCCTGAGTTTCGTCCTTATGTTGAGCTGTATGCTAAGAGGTA
AAAAGAGATTCTACTTTAATTATAAACCAATATTTACTGTGTGATTGTTAAAATTCGACCATGTGGTGACATTCAGAATTACAATTAGCATGGACATATAAAAACTGTTTGTGTCTAATT
TTTGCATCTAATATTTTTAGCTTCACCTATTAGGAGGTTTACTGTCATACTGTAGTGGGATTGTCTAATCTACTCATGACATGCAAAAACCAATCGACTTGGAATAAATAAAATTGGGAT
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TAATGTGAATCTGCCCCTGTCCTTCTCAGCATGAGTTTATATTCCTTTTTCTGGAACATCTCAATGTTTCTGTTAGTTTGAGAGGACAGGAAGTAGGAAGGGTGAATTTTGATTACATTA
TGATTAGGTGCAAAATAGGAGGGAAACATACATAGTCTATATACTGTTTTCGAAATTCTAATCCATGCCCTTTTCCAGCCTCCTAAACCAAACATAGCCTAAATGTGACCTAGAATCATA
TGTAATAAATACACAAATCTTGGGTTGGTGTATATCCTGGTTCATAATATGTAGCATAATTTCTTTTATGCAAATTTGGTGGATGCCAGGATGAGGAGGCGTTTTTTAAAGACTATGCAG
AATCACATAAGAGACTTTCAGAACTGGGGTTCACCCCAAGTTCCTCTGGATCCAAGGTTATTGCAAAGGACAGTGTAATATTGGCGCAAAGTGCAGTTGGGGTTGCAGTTGCTGCTGCCG
TTGTGATCTTTAGCTATTTCTATGAAGTTCGCAAAAGAATGAAGTAG

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTCGTTACCGGTAGTTGACACAGAGTACATGAAGGAGATAGACAAGGCACGTCGCGATCTCCGTGCTCTTATCGCTTACAAGAACTGCGCTCCTATCATGCTTCGCTTAGCATGGCAC
GATGCAGGAACCTACGATAAGCACACAAAAACTGGTGGACCTAACGGCTCTATAAGGAACGAAGAGGAGTACTCTCATGGCTCTAACAATGGCTTGAAAATTGCTCTTGACTTTTGCGAG
GAAGTGAAAGCTAAACATCCAAGGATTACTTATGCGGATTTATACCAGCTTGCAGGTGTTGTTGCAGTTGAGGTCACTGGAGGCCCTTCCATTAACTTTGTTCCTGGCAGAAAGGACTCC
AAAATCTCTCCCAGGGAAGGGAGGCTTCCAGATGCTAAACAAGGTCCACCACATTTAAGGGATATCTTTCACCGAATGGGTCTGTGTGACAAAGATATAGTGGCACTCTCAGGGGGTCAC
ACTCTGGGAAGGGCACATCCCGAGCGATCAGGTTTTGATGGCCCTTGGACCAAGGAGCCTCTGAAGTTTGATAACTCGTATTTTGTGGAACTGCTGAAGGGGGAGACAGAGGGGCTGTTG
AAACTTCCAACTGACAAGGCTTTGTTGGAAGACCCTGAGTTTCGTCCTTATGTTGAGCTGTATGCTAAGGATGAGGAGGCGTTTTTTAAAGACTATGCAGAATCACATAAGAGACTTTCA
GAACTGGGGTTCACCCCAAGTTCCTCTGGATCCAAGGTTATTGCAAAGGACAGTGTAATATTGGCGCAAAGTGCAGTTGGGGTTGCAGTTGCTGCTGCCGTTGTGATCTTTAGCTATTTC
TATGAAGTTCGCAAAAGAATGAAGTAG

Retrieve as FASTA