Entry information : SiPrx[P]103 (Si024400m)
| Entry ID | 9591 |
|---|---|
| Creation | 2011-07-03 (Qiang Li) |
| Last sequence changes | 2011-12-12 (Qiang Li) |
| Sequence status | theoretical translation / pseudogene |
| Reviewer | Not yet reviewed |
| Last annotation changes | 2011-12-07 (Qiang Li) |
Peroxidase information: SiPrx[P]103 (Si024400m)
| Name (synonym) | SiPrx[P]103 (Si024400m) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Class III peroxidase [Orthogroup: Prx030]* | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Setaria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Setaria italica [TaxId: 4555 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '9591' 'complement(join(11033251..11033654,11033728..11033909,11034014..11034230))' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references SiPrx[P]103 (Si024400m)
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_3 (11034230..11033251) |
|---|
Protein sequence: SiPrx[P]103 (Si024400m)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Pseudogene from genomic. Incorrect prediction from phytozome (Gaps in frame). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
