Entry information : VcaGPx01
| Entry ID | 9741 |
|---|---|
| Creation | 2011-11-17 (Passaia Gisèle) |
| Last sequence changes | 2011-11-17 (Passaia Gisèle) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2011-11-18 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: VcaGPx01
| Name | VcaGPx01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Fungi-Bacteria glutathione peroxidase [Orthogroup: Gpx3001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Chlorophyta Chlorophyceae Volvocaceae Volvox | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Volvox carteri [TaxId: 3067 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | Oxidative stress |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '9741' 'join(1..156,326..460,769..910,1138..1210,1652..1690,1910..1973)' |
Exons►
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Literature and cross-references VcaGPx01
| Literature | Prochnik SE, Umen J, Nedelcu AM, Hallmann A, Miller SM, Nishii I, Ferris P, Kuo A, Mitros T, Fritz-Laylin LK, Hellsten U, Chapman J, Simakov O, Rensing SA, Terry A, Pangilinan J, Kapitonov V, Jurka J, Salamov A, Shapiro H, Schmutz J, Grimwood J, Lindquist E, Lucas S, Grigoriev IV, Schmitt R, Kirk D, Rokhsar DS. Genomic analysis of organismal complexity in the multicellular green alga Volvox carteri.Science. 2010 Jul 9;329(5988):223-6. |
|---|---|
| DNA ref. | GenBank: XM_002950404 |
| Cluster/Prediction ref. | UniGene: Vca.5783 |
Protein sequence: VcaGPx01
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic and 19 ESTs (5 introns). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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| cDNA► Send to BLAST |
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