Entry information : TsPrx44 (Thhalv10025781m)
| Entry ID | 9817 |
|---|---|
| Creation | 2011-11-18 (Qiang Li) |
| Last sequence changes | 2011-11-21 (Qiang Li) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2015-12-31 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: TsPrx44 (Thhalv10025781m)
| Name (synonym) | TsPrx44 (Thhalv10025781m) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Class III peroxidase [Orthogroup: Prx016] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Eutrema | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Thellungiella salsuginea (Eutrema salsugineum) [TaxId: 72664 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '9817' 'complement(join(5975332..5975632,5975765..5976201,5976314..5976514))' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references TsPrx44 (Thhalv10025781m)
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_1 (5976514..5975332) |
|---|
Protein sequence: TsPrx44 (Thhalv10025781m)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence fromm genomic (intron 1 and 3'). No EST. Extra intron 3' when compared with orthologs!!! | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
