Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
442 |
PWM (Da): |
48890.73 |
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PI (pH): |
6.31 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MWVILPSKILSCGASSSVPGKKQSVSLLLFLGKQSGEQINKGSSSFSWIPSLLYFNNEIKIGDSIDFEYDYYNDEELVESMMRYLYKTQTDVTPALLCLVFHDFLIQKRDGSVLMDSLNA GNQSEKDTVPNWSMKGFNIIEKSKSKVEEECPATVSYVDILILAAREGIILAGCPYYPVTTGRSNSLVSFPEIAAFDIPSPNDDLSKTITLFASRGFTSASSRDGxNDNIMYIGGAEITQ PNFFYNGTVVGHCLEGFISPFCDIERMTPLSFPSPQSDNRTNPRLINTLPSPAIMRLMIKDGMFQLHTTGFSVLNDPAIFSDGHAYCNNFRFHIVPNRLLTSADLMRLPTGTTLPTMDHS GDSLIITNGGSRGGQMRINYIRIKTPDVVYNLKIAVQSVLLPFPHLHSATVEFRGMEALALCMILPLRLVILLCLRQKGLCR* |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic (introns 1 and 2). No prediction from Phytozome. |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGTGGGTTATTCTTCCATCGAAAATTCTAAGTTGTGGTGCGTCTTCCTCTGTTCCTGGAAAGAAACAGAGTGTCTCTTTACTTCTCTTTCTTGGTAAACAAAGTGGTGAACAGATAAAT AAGGGTAGTTCATCTTTTTCATGGATTCCTTCTCTTCTTTACTTCAATAACGAAATAAAGATCGGTGATTCTATTGATTTTGAATACGATTACTATAATGATGAAGAACTTGTTGAATCG ATGATGCGATATCTTTACAAAACTCAAACTGATGTTACTCCAGCTTTATTGTGTTTGGTGTTTCATGATTTCTTGATTCAGAGGTTTGTTTTTTAGCTAATTTACTGAATTTTTGTCTTA CAATGGGATTTTGATTTCATTAGGGTTTTAGTGGGTTTTGTGTTAATTTAATTTGATTTGATTGTTTTGAATGAAATGGGGATTCTTGTAGAAACGTGATGGATCTGTTCTAATGGATTC TCTCAATGCTGGAAATCAATCTGAGAAAGATACTGTACCTAATTGGTCAATGAAAGGTTTCAATATAATCGAAAAAAGCAAATCCAAAGTCGAAGAAGAGTGTCCTGCAACAGTTTCTTA CGTTGATATTCTTATTCTTGCAGCTAGAGAAGGAATTATTTTGTGGTAATGCATTGATTATGTTGGTGTTTTGGTAATGTATTCATTATTTTGGTGTTTTGGTGTTTTCGTCGATTTGCT CTTCTGATTGTTTGTTGTTATTGCAGGCTGGTTGTCCTTACTATCCTGTGACTACCGGAAGGAGTAATAGCCTTGTATCGTTTCCTGAAATTGCCGCTTTTGACATTCCATCTCCTAATG ATGATCTTTCCAAGACCATTACATTATTTGCTAGTAGAGGATTTACTTCTGCAAGTAGCAGAGATGGANNNAATGATAATATCATGTACATTGGTGGAGCAGAGATCACTCAACCTAATT TCTTCTACAACGGTACCGTAGTTGGTCATTGTCTTGAAGGTTTTATCTCTCCTTTTTGTGACATAGAAAGGATGACTCCTCTATCTTTTCCTTCTCCACAATCTGATAATCGCACAAATC CACGATTAATTAATACTCTGCCTTCCCCTGCTATTATGCGTCTGATGATTAAAGATGGTATGTTTCAACTTCATACTACTGGTTTCAGTGTTCTTAATGATCCTGCAATCTTTTCTGATG GCCATGCCTATTGTAACAATTTCAGATTCCATATCGTACCTAATCGCTTGTTAACGAGTGCTGATCTAATGAGGCTGCCAACAGGCACTACTTTGCCTACAATGGATCACAGTGGTGACT CCTTGATAATTACTAATGGAGGAAGTAGAGGTGGTCAGATGAGGATCAATTACATAAGAATCAAGACTCCTGATGTGGTTTACAATCTCAAGATTGCGGTTCAGAGTGTACTCTTGCCAT TTCCTCATCTTCATTCAGCTACTGTGGAGTTTCGAGGTATGGAGGCACTGGCACTTTGTATGATTCTGCCGCTGCGGTTGGTGATCCTGCTATGTTTAAGACAAAAAGGGCTCTGCAGAT AA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGTGGGTTATTCTTCCATCGAAAATTCTAAGTTGTGGTGCGTCTTCCTCTGTTCCTGGAAAGAAACAGAGTGTCTCTTTACTTCTCTTTCTTGGTAAACAAAGTGGTGAACAGATAAAT AAGGGTAGTTCATCTTTTTCATGGATTCCTTCTCTTCTTTACTTCAATAACGAAATAAAGATCGGTGATTCTATTGATTTTGAATACGATTACTATAATGATGAAGAACTTGTTGAATCG ATGATGCGATATCTTTACAAAACTCAAACTGATGTTACTCCAGCTTTATTGTGTTTGGTGTTTCATGATTTCTTGATTCAGAAACGTGATGGATCTGTTCTAATGGATTCTCTCAATGCT GGAAATCAATCTGAGAAAGATACTGTACCTAATTGGTCAATGAAAGGTTTCAATATAATCGAAAAAAGCAAATCCAAAGTCGAAGAAGAGTGTCCTGCAACAGTTTCTTACGTTGATATT CTTATTCTTGCAGCTAGAGAAGGAATTATTTTGGCTGGTTGTCCTTACTATCCTGTGACTACCGGAAGGAGTAATAGCCTTGTATCGTTTCCTGAAATTGCCGCTTTTGACATTCCATCT CCTAATGATGATCTTTCCAAGACCATTACATTATTTGCTAGTAGAGGATTTACTTCTGCAAGTAGCAGAGATGGANNNAATGATAATATCATGTACATTGGTGGAGCAGAGATCACTCAA CCTAATTTCTTCTACAACGGTACCGTAGTTGGTCATTGTCTTGAAGGTTTTATCTCTCCTTTTTGTGACATAGAAAGGATGACTCCTCTATCTTTTCCTTCTCCACAATCTGATAATCGC ACAAATCCACGATTAATTAATACTCTGCCTTCCCCTGCTATTATGCGTCTGATGATTAAAGATGGTATGTTTCAACTTCATACTACTGGTTTCAGTGTTCTTAATGATCCTGCAATCTTT TCTGATGGCCATGCCTATTGTAACAATTTCAGATTCCATATCGTACCTAATCGCTTGTTAACGAGTGCTGATCTAATGAGGCTGCCAACAGGCACTACTTTGCCTACAATGGATCACAGT GGTGACTCCTTGATAATTACTAATGGAGGAAGTAGAGGTGGTCAGATGAGGATCAATTACATAAGAATCAAGACTCCTGATGTGGTTTACAATCTCAAGATTGCGGTTCAGAGTGTACTC TTGCCATTTCCTCATCTTCATTCAGCTACTGTGGAGTTTCGAGGTATGGAGGCACTGGCACTTTGTATGATTCTGCCGCTGCGGTTGGTGATCCTGCTATGTTTAAGACAAAAAGGGCTC TGCAGATAA |
Retrieve as FASTA
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