Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
242 |
PWM (Da): |
26092.11 |
|
PI (pH): |
8.21 |
|
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MKAAVERACPGVVSCADILTIAAEESVALSGGPAWTNLLGRRDSRTANRTLANENLPGPNNSLERLKDRFRNVGLNDNFDLVALSGAHTFGRAQCRTFSDRLFNFNNTGNPDPTLNTTLL QQLRQLCPQGGNGSVLTNLDVTTPDLFDNKYFFNLQISKGLLQSDQELFSTPGADTTAIVNVFSSNQAAFFKSFVISMIRMGNLKPLTGNQGEIRLNCRRVNGNSNIATRSSSSEGDLVS SF |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Partial sequence from genomic (5' end is missing). No prediction from phytozome. |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAAAGCTGCCGTTGAAAGGGCCTGTCCAGGCGTTGTTTCCTGTGCTGATATTCTTACTATTGCAGCTGAAGAATCTGTTGCTCTGGTATGTGTGAATTTCTATTAACAACTCCTCATC TTTCTCGACTACATATTTTATGCTTAAAAGTGATTAAATTACTATGGTATCAGAGTGTAAGTTTGACTTTACATTCGTGTTGGAATTTTCAGACCCTGAGTACTTTAACTAAATGAATCC ACATGCTTAGTTTTGAGCGGCAACAGTCCCATCGAATTACCATGTTGACTTCGTGATAGCCCCGGGCCAAATTTTCCGTTTGAAAAGGGGAGGGTTTTTCTTTNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNAAAAAAAAAACACAAAAAAAAACGGTGATGCGATTCATCGAGGACACATCAGTTTTACGTGCTGGGTTCCAGTATATATTTTGAAAAAAAAAAAAAATTCTTCTTTATATG ATACAGTCTGGTTGAACCGTTCACTCAAAATTATAACGTCGGGAAACTGCTAATTTTGGGTGCAACAAGACCCATATAAATATTAGCCAAATAGAGTCGGAAAGATTAATTGCATGTGTC TTTCTAATTTTAGTTAAATTTGTTTATTATGCATCTCTCAAGTGATGCTTTTGACTAATGATCGTGGTTTTGGTAACAGTCTCAGGGGGTCCTGCATGGACAAATCTATTGGGAAGAAGA GACAGCAGAACAGCAAACAGGACTCTTGCAAATGAAAATCTTCCAGGACCGAACAATAGTCTTGAGAGGCTCAAAGATAGATTCAGAAATGTTGGCCTCAACGACAATTTTGATCTTGTT GCACTCTCCGGTAATATTTGCTTTTACGCCCTTTGACTTGAGTACAAACAGACCTTGGAGTCTTTTGGGATAAAGCAGTATTGGAGCCAGAATTAGAAATCTGGATGGTGGAAAATTTTT TAATGCCAATACTGAGTCTTGAAATCTTAGAGATAGTTTAAATGTTGAATATCTTATTTAAAAAGAAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNTTACTAAGACGACCACCGACACAAAGCACATTCATACTCTACAGCACCTAGGAGGCTTGACTGAATATCCTAATGATGCGAAGAAACTGTGTTTTAAAGTTTGACA TTGGTGATTAGGAATATGTTAAAACGTTTGACAAATTTACTCCCCTTAATCACATCATGAAATTTGAATTGCTTCCCAAAAAGAAAAGTGAGAACCACCATAATGAAACTCAGTTATTAT CCTTAATTTGTATGAATTTGAGTAAAAATAACAAAGATCGGCTATGCATGTTTTTCAGGAGAGCTCACACGTTTGGAAGGGCTCAGTGCCGAACTTTTAGCGATAGATTATTCAATTTCA ACAACACTGGCAATCCAGACCCAACACTTAACACAACCCTCTTACAGCAACTTAGGCAACTATGCCCACAAGGTGGAAACGGCAGCGTTCTAACTAATCTTGATGTCACAACACCTGATT TGTTTGACAACAAATACTTCTTCAATCTTCAAATCAGCAAGGGCCTTCTGCAGAGTGATCAAGAGTTGTTTTCGACTCCCGGTGCCGATACCACTGCCATTGTCAATGTCTTTAGTAGCA ACCAGGCTGCTTTCTTTAAAAGCTTTGTGATTTCAATGATAAGAATGGGGAATTTGAAACCATTGACAGGCAATCAAGGGGAGATTAGATCGAACTGCAGGAGGGTCAACGGAAACAGTA ATATAGAAACCAGATCATCGTCAGAGGGTGATTTGATCAGCTCTTTCTAAATAAGCTAGTTTGCAGCACATGTGAGAGATAGAGTTTGTGGGTAACAAACTCGTGAATTTACTCCTATGT TTTGCCTGAAACATGCTTTTTATTTTCAATAAACTAAGGTTGTGTTTGTGTATTCACATCCTTGCTTTCTATGTATCAGAAATCCTTGTCATACAGTATGTGTGTATTTTTTTTCCTATG TCATCGGTACGCATTGTCATCTGAGTCACTTTCCAGTTTTTAGTGATCCATTTTATCCCCCAGCTTTAAAATATTAACCGGAAAAAAACCTTATTCTTACATATTTCTTTCTATTTCTAC TTTTTGTCAAATATCCGTAGTTTGACAAAATAGTAGGGAAGAATCTTTTATTTTCAGAAATAATCATACATAGCTTTTTTTATGGGATAACAAAACTTATTTTTAGACAAATTTTAAAAA TCCATTTGACAATTTTTGGGGTCTGTGTGTACCAAAAAAGAGCCTATATAATTTCTAAAACCAATTGAATCTCCGTACTATTTCACTAAACCATTTCGCAAGGCAAACACTAACTTACAA CTGCTGTAAGTTACAGCACTCACAAAAATATGCATGAACAGTAATAAATGGTGGGTCCCATGTAATTTTTGTGTGTGCTGTAACTTACAGCTGGCTGTAAGTTAGGGGCTCCCATTTCGC AATTATTATGATCCTTTTTCCCCATAAAAGAAAACATTAGTAGCAACAGTTATCTTTTTCATGATCATTAATAAAATCATTTTTTACCCATTTCAAAAGTCATCCAGCCATTTCTTAATT ATTTAACTCCCACTTGAGGTTTCAATTAATCAAGACCTCATTTGAAATTAAAGTAAGACCGATTTACCTTTTAAAAACAACATTAAATTATTTAGAAAATATTTACTGCTATTTTTAAAA CCTCATTTGAAATTAAACTTCGAGGTTGCTGCAAAGTTCTAATCCTAATCTGGTTTGTTTGGTTATAAATAAAGAGGCATTTCTCTTTGTTTTCCAAGTCCTAAGACTAATTATTCTCTT AATAGAGAAGTAGTAACTCTTAGACAAAATGGCTTCACTTCGTTATCTTCTTGCAGCAGCTCTTGTTGTTGCTTTTGTGCTTGAGGGATCACCATCTCAAGCTCAACTTTCTCCCTCTTT TTATTCTTCCACATGCCCTAATTTATTGAACATTATCGAGGATGTGCTTAAGAAAGCTTTCTCGTCCGATATCCGCATCGGTGCCAGCCTCATCAGGCTTCATTTCCATGACTGTTTTGT TGATGTAAGCAATCTCTGCTCTCTCATTTTTCATCTTCTTTACGTTATCAAGCTCTCTGTCTATTTACTTATTGATATAACATAGTTTCAAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCGGGTTTGCGGGTACAATTG CCATCCCTAGTTTCAAGCATGTCAATGAACAGTATCTTTATAATTTTTTGTGTCATTAAACAAAATATAGAGTTTTCATTAAGAGTTTGAATATATCATTTTAATTTCAACAACTTCCAA AACCATTTTCATATATCTTTTTTTTTTCTCTTTTTCTTTTCTCTTTACGACAAATTTTTCCTCTCTAATTCGATGTACCGAGGACCATGTAATTCTTTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN GGGGTTTTCATGTACTAGAAATTTAAATCTAGCAAAGATTTGGTCCAAAACAGGAATTCAAATCCACCTCATGGCCTCATCCCTGCTCAGTGCTTTTAATGATCATGGGTCCAATATTAA TGGTGCATGGTTGAAAAAAAATCACACTTGTTTTATATTCTTCCAACCGAAAATTTTGAATCAACAGGAAATCCTAGTCTTAAAAACATATGTAATAATAAGACAATTTAAATAAGAAGA GTTTGCATTATTTATTTAATTTTTTTGAATTCATGTCCATAAGATAAGAAGGAATCTATCTACTTGTTAAAATAACAATATAATGGACTGTTAACATAGCAAGTTGTTAACTAATACTAT TTTTTCCGGGGTGTGATGCATCGATTTTGCTGGACAGCACTAAAAACATAGACAGCGAGAAATTTGCTGCGCCAAATAATAATTCGGCGAGGGGTTTCGAAGTTATTGATAACATGAAAG CTGCCGTTGAAAAGGCATGTCCAAGGGTTGTTTCCTGCGCTGATATTCTTACTATTGCGGCTGAACGATCCGTTGCTTTGGTATGAATTTCTTTTACCAACTCCTCTTCCTTATTAATAT TTTATGCTTAGAAGTAAATTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTTGTAATGTAATTATTTTTTAATCTCAACCAATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTTTGTAATGTA ATTATTTTTTTAATTTCAACTAGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGGAAATAAAACCG CACTTCGCGCAGTTTTGAAAAAAAATTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGATGGGTATCAAAATAAGTGAACAGAATAATGGTAAATCTTTGCAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCCGTAAGTTCAACTTTACCCTTAGAAGAATACATTAATTAAATAATTATTCACATAGACCAATGTGCAAGAT CTGAGTCCACATGTTTAGCCTTTGATTTAAGTGAAGGGATTCATAGTTGGACCCATCATTATTAAATTGGGACGACGCAATGGACTCCATTATTTAAAAGGCCCGGCTACAGTGCAACTG TGATACCGTGCTACAGTTACATTCAGCCGTTGGATCCACTTAGATGAGTGGAGTCTATTAGAATTTAATGGCTGGATGCAACAGTAGCACGGTACCATATTTGCACCACAATTTTTCCCT TATTTAAAAGGGGTGACTTATTGACTATGGTGCATCAGCTACACTGTGTGGTACCAAAATTGCTACACATATGTCAATATAGTGATTATTAAGGGATAAATTGTTACTGACAGTGAGACA CTTTTTACTGCGCTGGTGCATCGTAGCAAGTCCTTAGTTTTAAACTTAAAAGTTTTCTTCTTTTGTTATACGACAAAGTTTTGATTCAACGGCTAGCAAATTAAATAGTCCGCCCCAAAC GCACATCTCTTAAGATTATTGTTGATTTTGAGTGAATGGCTTTTGGTTACAGTCAGGGGGTCCGTCATGGGCAGTTCCATTGGGAAGAAGGGACAGCAGAACAGCAAACAGAGCTCTTGC AAATCAGAAACTTCCAGGACCATCTGATACTCTTGATGTGCTCAAATCTAGTTTTAGAAATGTTGGCCGCAATGACAATTTTGATCTTGTTGCACTCTCCGGTAATTATTAATTGCTTCT GCATCCTTTTAATTACTTGAGTAAAGTTATGGGAGTAGACTTTTAAAAGTCAAAAGAGCATGGTACTAGCAAACCACGCTCAAAAATTAATTTAAGAAATGAGTGTTATGCCTTAAATTT ATGTATACTTAACTCAAAATTGGGCATGCATGTTTTTCAGGAGCTCACAGGTTTGGTAGGGCTCAGTGCCGATTTTTCAGGGGCAGATTATACGATTTCAACAACACTGGCAAGCCAGAC CCGACACTGGACAGAACCCTGTTAAAGCAACTGAGGGAACTATGCCCACAAGGTGGAAACGGCGGCGTTCTTGCTAATTTTGATGTCAAAACACCTGATGTTTTCGACAACAAATACTTC TCCAATCTTAGACTCCGCAAAGGCCTTCTGCAGAGTGATCAAGAGTTGTTTTCGACTCCTGGTGCCGATACCGCTGCCATTGTCGAGGACTTTGGGAGGAACCAGAATGCTTTCTTTAAA AACTTTGTGACCTCAATGATAAGAATGGGCAATTTGAAACCACTGCAGGAGAAATCAAGGGGAGATTAGATTGAACTGCAGGAGGGTCAATGGAAACAGTAATATTGCAACAAGATCATC ATCATCGGAGGGTGATTTGGTCAGCTCTTTCTAA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAAAGCTGCCGTTGAAAGGGCCTGTCCAGGCGTTGTTTCCTGTGCTGATATTCTTACTATTGCAGCTGAAGAATCTGTTGCTCTGTCAGGGGGTCCTGCATGGACAAATCTATTGGGA AGAAGAGACAGCAGAACAGCAAACAGGACTCTTGCAAATGAAAATCTTCCAGGACCGAACAATAGTCTTGAGAGGCTCAAAGATAGATTCAGAAATGTTGGCCTCAACGACAATTTTGAT CTTGTTGCACTCTCCGGAGCTCACACGTTTGGAAGGGCTCAGTGCCGAACTTTTAGCGATAGATTATTCAATTTCAACAACACTGGCAATCCAGACCCAACACTTAACACAACCCTCTTA CAGCAACTTAGGCAACTATGCCCACAAGGTGGAAACGGCAGCGTTCTAACTAATCTTGATGTCACAACACCTGATTTGTTTGACAACAAATACTTCTTCAATCTTCAAATCAGCAAGGGC CTTCTGCAGAGTGATCAAGAGTTGTTTTCGACTCCCGGTGCCGATACCACTGCCATTGTCAATGTCTTTAGTAGCAACCAGGCTGCTTTCTTTAAAAGCTTTGTGATTTCAATGATAAGA ATGGGGAATTTGAAACCATTGACAGGAAATCAAGGGGAGATTAGATTGAACTGCAGGAGGGTCAATGGAAACAGTAATATTGCAACAAGATCATCATCATCGGAGGGTGATTTGGTCAGC TCTTTCTAA |
Retrieve as FASTA
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