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Entry information : CclPrx124
Entry ID 10044
Creation 2011-11-25 (Qiang LI)
Last sequence changes 2012-01-04 (Qiang LI)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-01-03 (Qiang Li)
Peroxidase information: CclPrx124
Name CclPrx124
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx040]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rutaceae Citrus
Organism Citrus clementina    [TaxId: 85681 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CclPrx124
start..stop		 S start..stop
CclPrx68 479 5.38e-173 1..242 109..349
CsPrx54 470 1.83e-169 1..242 109..349
CclPrx05 467 3.09e-168 1..242 109..350
CsPrx52 466 3.62e-168 1..242 109..350
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 1142589..1142675 85 N° 2 1141828..1141996 167 N° 3 1140931..1141299 367 N° 4 1132928..1133031 102
complement(join(1132928..1133031,1140931..1141299,1141828..1141996,1142589..1142 675))


exon

Literature and cross-references CclPrx124
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold_31 (1142675..1132928)
Protein sequence: CclPrx124
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   242
PWM (Da):   %s   26092.11  
PI (pH):   %s   8.21
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MKAAVERACPGVVSCADILTIAAEESVALSGGPAWTNLLGRRDSRTANRTLANENLPGPNNSLERLKDRFRNVGLNDNFDLVALSGAHTFGRAQCRTFSDRLFNFNNTGNPDPTLNTTLL
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SF

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic (5' end is missing). No prediction from phytozome.
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAAAGCTGCCGTTGAAAGGGCCTGTCCAGGCGTTGTTTCCTGTGCTGATATTCTTACTATTGCAGCTGAAGAATCTGTTGCTCTGGTATGTGTGAATTTCTATTAACAACTCCTCATC
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ACAACACTGGCAATCCAGACCCAACACTTAACACAACCCTCTTACAGCAACTTAGGCAACTATGCCCACAAGGTGGAAACGGCAGCGTTCTAACTAATCTTGATGTCACAACACCTGATT
TGTTTGACAACAAATACTTCTTCAATCTTCAAATCAGCAAGGGCCTTCTGCAGAGTGATCAAGAGTTGTTTTCGACTCCCGGTGCCGATACCACTGCCATTGTCAATGTCTTTAGTAGCA
ACCAGGCTGCTTTCTTTAAAAGCTTTGTGATTTCAATGATAAGAATGGGGAATTTGAAACCATTGACAGGCAATCAAGGGGAGATTAGATCGAACTGCAGGAGGGTCAACGGAAACAGTA
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CTGCTGTAAGTTACAGCACTCACAAAAATATGCATGAACAGTAATAAATGGTGGGTCCCATGTAATTTTTGTGTGTGCTGTAACTTACAGCTGGCTGTAAGTTAGGGGCTCCCATTTCGC
AATTATTATGATCCTTTTTCCCCATAAAAGAAAACATTAGTAGCAACAGTTATCTTTTTCATGATCATTAATAAAATCATTTTTTACCCATTTCAAAAGTCATCCAGCCATTTCTTAATT
ATTTAACTCCCACTTGAGGTTTCAATTAATCAAGACCTCATTTGAAATTAAAGTAAGACCGATTTACCTTTTAAAAACAACATTAAATTATTTAGAAAATATTTACTGCTATTTTTAAAA
CCTCATTTGAAATTAAACTTCGAGGTTGCTGCAAAGTTCTAATCCTAATCTGGTTTGTTTGGTTATAAATAAAGAGGCATTTCTCTTTGTTTTCCAAGTCCTAAGACTAATTATTCTCTT
AATAGAGAAGTAGTAACTCTTAGACAAAATGGCTTCACTTCGTTATCTTCTTGCAGCAGCTCTTGTTGTTGCTTTTGTGCTTGAGGGATCACCATCTCAAGCTCAACTTTCTCCCTCTTT
TTATTCTTCCACATGCCCTAATTTATTGAACATTATCGAGGATGTGCTTAAGAAAGCTTTCTCGTCCGATATCCGCATCGGTGCCAGCCTCATCAGGCTTCATTTCCATGACTGTTTTGT
TGATGTAAGCAATCTCTGCTCTCTCATTTTTCATCTTCTTTACGTTATCAAGCTCTCTGTCTATTTACTTATTGATATAACATAGTTTCAAGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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CTGAGTCCACATGTTTAGCCTTTGATTTAAGTGAAGGGATTCATAGTTGGACCCATCATTATTAAATTGGGACGACGCAATGGACTCCATTATTTAAAAGGCCCGGCTACAGTGCAACTG
TGATACCGTGCTACAGTTACATTCAGCCGTTGGATCCACTTAGATGAGTGGAGTCTATTAGAATTTAATGGCTGGATGCAACAGTAGCACGGTACCATATTTGCACCACAATTTTTCCCT
TATTTAAAAGGGGTGACTTATTGACTATGGTGCATCAGCTACACTGTGTGGTACCAAAATTGCTACACATATGTCAATATAGTGATTATTAAGGGATAAATTGTTACTGACAGTGAGACA
CTTTTTACTGCGCTGGTGCATCGTAGCAAGTCCTTAGTTTTAAACTTAAAAGTTTTCTTCTTTTGTTATACGACAAAGTTTTGATTCAACGGCTAGCAAATTAAATAGTCCGCCCCAAAC
GCACATCTCTTAAGATTATTGTTGATTTTGAGTGAATGGCTTTTGGTTACAGTCAGGGGGTCCGTCATGGGCAGTTCCATTGGGAAGAAGGGACAGCAGAACAGCAAACAGAGCTCTTGC
AAATCAGAAACTTCCAGGACCATCTGATACTCTTGATGTGCTCAAATCTAGTTTTAGAAATGTTGGCCGCAATGACAATTTTGATCTTGTTGCACTCTCCGGTAATTATTAATTGCTTCT
GCATCCTTTTAATTACTTGAGTAAAGTTATGGGAGTAGACTTTTAAAAGTCAAAAGAGCATGGTACTAGCAAACCACGCTCAAAAATTAATTTAAGAAATGAGTGTTATGCCTTAAATTT
ATGTATACTTAACTCAAAATTGGGCATGCATGTTTTTCAGGAGCTCACAGGTTTGGTAGGGCTCAGTGCCGATTTTTCAGGGGCAGATTATACGATTTCAACAACACTGGCAAGCCAGAC
CCGACACTGGACAGAACCCTGTTAAAGCAACTGAGGGAACTATGCCCACAAGGTGGAAACGGCGGCGTTCTTGCTAATTTTGATGTCAAAACACCTGATGTTTTCGACAACAAATACTTC
TCCAATCTTAGACTCCGCAAAGGCCTTCTGCAGAGTGATCAAGAGTTGTTTTCGACTCCTGGTGCCGATACCGCTGCCATTGTCGAGGACTTTGGGAGGAACCAGAATGCTTTCTTTAAA
AACTTTGTGACCTCAATGATAAGAATGGGCAATTTGAAACCACTGCAGGAGAAATCAAGGGGAGATTAGATTGAACTGCAGGAGGGTCAATGGAAACAGTAATATTGCAACAAGATCATC
ATCATCGGAGGGTGATTTGGTCAGCTCTTTCTAA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAAAGCTGCCGTTGAAAGGGCCTGTCCAGGCGTTGTTTCCTGTGCTGATATTCTTACTATTGCAGCTGAAGAATCTGTTGCTCTGTCAGGGGGTCCTGCATGGACAAATCTATTGGGA
AGAAGAGACAGCAGAACAGCAAACAGGACTCTTGCAAATGAAAATCTTCCAGGACCGAACAATAGTCTTGAGAGGCTCAAAGATAGATTCAGAAATGTTGGCCTCAACGACAATTTTGAT
CTTGTTGCACTCTCCGGAGCTCACACGTTTGGAAGGGCTCAGTGCCGAACTTTTAGCGATAGATTATTCAATTTCAACAACACTGGCAATCCAGACCCAACACTTAACACAACCCTCTTA
CAGCAACTTAGGCAACTATGCCCACAAGGTGGAAACGGCAGCGTTCTAACTAATCTTGATGTCACAACACCTGATTTGTTTGACAACAAATACTTCTTCAATCTTCAAATCAGCAAGGGC
CTTCTGCAGAGTGATCAAGAGTTGTTTTCGACTCCCGGTGCCGATACCACTGCCATTGTCAATGTCTTTAGTAGCAACCAGGCTGCTTTCTTTAAAAGCTTTGTGATTTCAATGATAAGA
ATGGGGAATTTGAAACCATTGACAGGAAATCAAGGGGAGATTAGATTGAACTGCAGGAGGGTCAATGGAAACAGTAATATTGCAACAAGATCATCATCATCGGAGGGTGATTTGGTCAGC
TCTTTCTAA

Retrieve as FASTA