1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : SpolPrx04 (Spipo8G0009900 [2.0] / Peroxidase39)
Entry ID 13190
Creation 2015-05-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-05-28 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Catherine Mathe
Last annotation changes 2016-02-26 (Catherine Mathe)
Peroxidase information: SpolPrx04 (Spipo8G0009900 [2.0] / Peroxidase39)
Name (synonym) SpolPrx04 (Spipo8G0009900 [2.0] / Peroxidase39)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx007]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Araceae Spirodela
Organism Spirodela polyrhiza (great duckweed)    [TaxId: 29656 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SpolPrx04
start..stop		 S start..stop
LminPrx70 562 0 1..328 1..329
CescPrx30 523 0 1..328 1..327
PotacuPrx47 483 1.2e-173 5..328 3..327
PaPrx02 479 4.71e-172 1..329 1..326
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 970607..970819 211 N° 2 970966..971166 199 N° 3 971372..971534 161 N° 4 971647..972056 408
join(970607..970819,970966..971166,971372..971534,971647..972056)


exon

Literature and cross-references SpolPrx04 (Spipo8G0009900 [2.0] / Peroxidase39)
DNA ref. Phytozome 12:   pseudo8 (970607..972056)
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 12:   31511527
Protein sequence: SpolPrx04 (Spipo8G0009900 [2.0] / Peroxidase39)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   328 (304)
PWM (Da):   %s   35082.93 (32548.7) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   8.95 (8.91) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-328
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MGRMNSSMVIVVMGVLAIASCAQAQLRLGFYGQSCPNAEKIVLDYVKSRIPKAPSLAAALIRMHFHDCFVRGCDGSVLLNSTKTANASQTEKVSPPNLSVRGFGFIDGIKALVEKECPGV
VSCADIVALAARDSVVTIGGPFWSVPTGRRDGTVSNFTEALFNLPPPTFNFANLTNVYASKGLNVTDLVLLSGAHTIGVSHCTSFSNRLYNFTGRGDQDPALDSNYAARLKQKCTSLADN
VTLVEMDPGSVRTFDLGYYSLLLKRRGLFQSDAALTTNAAAKAFITNLVASPPQVFFQLFAGAMEKMGRIEVKTGSAGEIRRNCALVN*

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns).
Promoter►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT GAATACATAC ACATGTACCA ATGAATGAAC TTTAGCTTCT TGGTGAAATT  TCAGAGTATT CGCGAGCTAA ATGACGTTAT AATGTAGTTT CCACGGAGAC TCGGACTAAA TTGATGAAGA TCTATCAGTA AAGTGACACG GAAGGCAGTT GAATTAATCT TGACCAGATA  TTTTATTAGA AAAACTCCAT CCCCACGTCA GAATCCCGCA AGGATGCTGC TCGGTGCCAG CTAGAATATT TGGTGGCTCG CGGGAAGATG GGGGGCGCCG AGAGGAGGGA CGTTGAGTTA  TTACTGTTGT TGATTCCATA TTTATCCTAG CAGGAGTAGT TGAGATGGAA CATGCAGAGA TCTACTCAAA TTCGAATTAG AATAAGATCG TTATGGTATT ATTTAAATCT CCACAAGAAA  AGTTGCAGTT TTTAATTTAG GACCTGGTCA GAAGATGGAA GTACTCGACG GCAAAGAGAT TCCTGCTGCT GCCGAGCACC GACGTGGGGA GGTCGTTCTA TAAATCATTC CCACCGAGGG  GATTCTTCTG AGCATCACAG AAACCGGTCG GGGGGAGAGA GAGGGAGACA GACCCAGGGC GAGAGTTGTT CATTGGGAAC ATGGGTAGGA TGAATTCGTC TATGGTGATC GTCGTGATGG  GTGTATTGGC CATTGCGAGC TGTGCCCAGG CTCAGCTTAG GCTCGGATTC TACGGCCAGA GCTGCCCCAA TGCCGAGAAG ATTGTTCTGG ACTACGTAAA AAGTCGCATA CCTAAAGCCC  CATCTCTCGC TGCTGCACTC ATCAGGATGC ACTTCCACGA CTGTTTCGTC AGGGTATGTA TTCAATTCTC TTCCTTCCTC CTGCCTTCCT CTCCCTCCTA CGTTTCTCCT CCTTTCTGTA  ATTTCTTCCT CCTTGCTCCT TTTCCTTCCT CTTCCACTGT TGTTGCTGCC GCTGAACTCG AGTGATCTCC ACGTCTCAGG GATGCGATGG TTCAGTCTTG CTCAACTCCA CGAAGACCGC  TAACGCAAGC CAGACGGAGA AAGTTTCGCC GCCGAACCTC AGCGTCCGCG GCTTCGGCTT CATCGACGGC ATCAAAGCCC TCGTCGAGAA GGAGTGCCCC GGTGTAGTCT CCTGCGCCGA  CATCGTTGCT CTGGCGGCCA GGGACTCCGT CGTAACCATA GTGAGTAGTC GGAACGTCTT CCATTGCAAT CTTTAACATT TTAGACTCAA CTTATCGAAG TCAACCTCCT TCTCAGTGCA  TATCACAAAC TATAATATGA AAAACAATAA AATATAATAC ATACAAACTT CTTGTACATA TAAGTTAATC CATTGATTAT GGGTTAATTA CCGCGATTCA AGGTGGTCTA ATTCTCTTCA  AACAGGGTGG CCCGTTTTGG AGCGTGCCGA CAGGGCGCAG GGACGGGACG GTCTCCAACT TCACCGAGGC CTTGTTTAAT CTCCCACCTC CCACCTTTAA CTTCGCGAAC CTTACCAATG  TCTACGCCAG CAAGGGCCTT AACGTCACCG ATCTCGTCCT CCTCTCCGGT GGGTTCTCCT CCTCATCTTC CTCCACTGTC GTCGTCGTCG TCGTCGTCAT CTTTCAAGAA GAAAGCTCTG  AATGAGGTCA CTAACAATCC CTCTGGTTTC GGCTCCTCAG GAGCTCACAC CATCGGGGTC AGCCACTGCA CCTCCTTCTC TAACCGCCTC TACAACTTCA CCGGGAGGGG CGACCAGGAC  CCTGCCCTTG ATAGCAACTA CGCGGCCAGA CTGAAGCAGA AATGCACCTC CCTCGCTGAC AACGTCACCC TCGTCGAGAT GGACCCAGGG AGCGTCAGGA CCTTTGACCT CGGCTACTAC  TCTCTCCTGC TCAAGAGGAG AGGACTCTTC CAGTCGGACG CCGCCCTCAC TACCAACGCC GCCGCGAAGG CCTTCATCAC TAATCTCGTC GCCAGCCCTC CCCAGGTCTT CTTCCAGCTA 
TTCGCCGGCG CCATGGAGAA GATGGGCCGG ATCGAAGTGA AGACCGGGTC AGCGGGTGAG ATCAGGAGGA ACTGCGCCCT GGTCAACTAA 

Retrieve as FASTA  
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGTAGGATGAATTCGTCTATGGTGATCGTCGTGATGGGTGTATTGGCCATTGCGAGCTGTGCCCAGGCTCAGCTTAGGCTCGGATTCTACGGCCAGAGCTGCCCCAATGCCGAGAAG
ATTGTTCTGGACTACGTAAAAAGTCGCATACCTAAAGCCCCATCTCTCGCTGCTGCACTCATCAGGATGCACTTCCACGACTGTTTCGTCAGGGGGTATGTATTCAATTCTCTTCCTTCC
TCCTGCCTTCCTCTCCCTCCTACGTTTCTCCTCCTTTCTGTAATTTCTTCCTCCTTGCTCCTTTTCCTTCCTCTTCCACTGTTGTTGCTGCCGCTGAACTCGAGTGATCTCCACGTCTCA
GGGATGCGATGGTTCAGTCTTGCTCAACTCCACGAAGACCGCTAACGCAAGCCAGACGGAGAAAGTTTCGCCGCCGAACCTCAGCGTCCGCGGCTTCGGCTTCATCGACGGCATCAAAGC
CCTCGTCGAGAAGGAGTGCCCCGGTGTAGTCTCCTGCGCCGACATCGTTGCTCTGGCGGCCAGGGACTCCGTCGTAACCATATAGTGAGTAGTCGGAACGTCTTCCATTGCAATCTTTAA
CATTTTAGACTCAACTTATCGAAGTCAACCTCCTTCTCAGTGCATATCACAAACTATAATATGAAAAACAATAAAATATAATACATACAAACTTCTTGTACATATAAGTTAATCCATTGA
TTATGGGTTAATTACCGCGATTCAAGGTGGTCTAATTCTCTTCAAACAGGGTGGCCCGTTTTGGAGCGTGCCGACAGGGCGCAGGGACGGGACGGTCTCCAACTTCACCGAGGCCTTGTT
TAATCTCCCACCTCCCACCTTTAACTTCGCGAACCTTACCAATGTCTACGCCAGCAAGGGCCTTAACGTCACCGATCTCGTCCTCCTCTCCGCGGTGGGTTCTCCTCCTCATCTTCCTCC
ACTGTCGTCGTCGTCGTCGTCGTCATCTTTCAAGAAGAAAGCTCTGAATGAGGTCACTAACAATCCCTCTGGTTTCGGCTCCTCAGGAGCTCACACCATCGGGGTCAGCCACTGCACCTC
CTTCTCTAACCGCCTCTACAACTTCACCGGGAGGGGCGACCAGGACCCTGCCCTTGATAGCAACTACGCGGCCAGACTGAAGCAGAAATGCACCTCCCTCGCTGACAACGTCACCCTCGT
CGAGATGGACCCAGGGAGCGTCAGGACCTTTGACCTCGGCTACTACTCTCTCCTGCTCAAGAGGAGAGGACTCTTCCAGTCGGACGCCGCCCTCACTACCAACGCCGCCGCGAAGGCCTT
CATCACTAATCTCGTCGCCAGCCCTCCCCAGGTCTTCTTCCAGCTATTCGCCGGCGCCATGGAGAAGATGGGCCGGATCGAAGTGAAGACCGGGTCAGCGGGTGAGATCAGGAGGAACTG
CGCCCTGGTCAACTAA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGGTAGGATGAATTCGTCTATGGTGATCGTCGTGATGGGTGTATTGGCCATTGCGAGCTGTGCCCAGGCTCAGCTTAGGCTCGGATTCTACGGCCAGAGCTGCCCCAATGCCGAGAAG
ATTGTTCTGGACTACGTAAAAAGTCGCATACCTAAAGCCCCATCTCTCGCTGCTGCACTCATCAGGATGCACTTCCACGACTGTTTCGTCAGGGGATGCGATGGTTCAGTCTTGCTCAAC
TCCACGAAGACCGCTAACGCAAGCCAGACGGAGAAAGTTTCGCCGCCGAACCTCAGCGTCCGCGGCTTCGGCTTCATCGACGGCATCAAAGCCCTCGTCGAGAAGGAGTGCCCCGGTGTA
GTCTCCTGCGCCGACATCGTTGCTCTGGCGGCCAGGGACTCCGTCGTAACCATAGGTGGCCCGTTTTGGAGCGTGCCGACAGGGCGCAGGGACGGGACGGTCTCCAACTTCACCGAGGCC
TTGTTTAATCTCCCACCTCCCACCTTTAACTTCGCGAACCTTACCAATGTCTACGCCAGCAAGGGCCTTAACGTCACCGATCTCGTCCTCCTCTCCGGAGCTCACACCATCGGGGTCAGC
CACTGCACCTCCTTCTCTAACCGCCTCTACAACTTCACCGGGAGGGGCGACCAGGACCCTGCCCTTGATAGCAACTACGCGGCCAGACTGAAGCAGAAATGCACCTCCCTCGCTGACAAC
GTCACCCTCGTCGAGATGGACCCAGGGAGCGTCAGGACCTTTGACCTCGGCTACTACTCTCTCCTGCTCAAGAGGAGAGGACTCTTCCAGTCGGACGCCGCCCTCACTACCAACGCCGCC
GCGAAGGCCTTCATCACTAATCTCGTCGCCAGCCCTCCCCAGGTCTTCTTCCAGCTATTCGCCGGCGCCATGGAGAAGATGGGCCGGATCGAAGTGAAGACCGGGTCAGCGGGTGAGATC
AGGAGGAACTGCGCCCTGGTCAACTAA

Retrieve as FASTA