Entry information : LminPrx70(Lemmin28g0626880.t1)
Entry ID 18868
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx70(Lemmin28g0626880.t1)
Name LminPrx70(Lemmin28g0626880.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx007]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx70
start..stop
S start..stop
SpolPrx04 562 0 1..329 1..328
CescPrx30 495 2.92e-178 10..329 9..327
PaPrx02 457 1.63e-163 1..329 1..325
PtPrx27 452 1.71e-161 15..329 14..326
Literature and cross-references LminPrx70(Lemmin28g0626880.t1)
Protein sequence: LminPrx70(Lemmin28g0626880.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (305)
PWM (Da):   %s   35317.01 (32927.8) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   9.3 (9.28) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGRMSVAMVI VVMGLLGIAS CAQAQLKLGF YAQSCPNAEQ IVMNYVRTHI PHAPSLAAAI LRMHFHDCFV RGCDGSVLLN STKSTRFGQT EKFSPPNIGS LRGFSFIDGI KAAVEKACPG  VVSCADIVAL AARDSVVTIG GPTWRVPTGR RDGTISNINE PITNLPPPTF NFANLTIAYA GKGLNVNDLI LLSGAHTIGV SHCSSFTNRL YNFTGRGDQD PALDTNYAAQ LKRKCVSLAD 
NVTIVEMDPG SFKTFDLSYY KLLLKRRGLF QSDDALTTNS AAKSFIVNLV NSPPQVFFQQ FAASMEKMGR IGVKTGSAGE IRRNCAFVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAGGCAAATG GGCATTTTAT CATTATTTTA TGTACCATGA ACGGTATGCC TCCTCTGTAT GGGACACGAG GGGTCTCCCA TATCGAGGTA CGTACGGTGT TGTACATCAA CGTCCTTGGA  TCGTACACCC GTACAACGGA CAACGGATCT GAGGTCTGGG TTGACAGCTT TTTCCATACC CATAGGAGAA GAAACATTTA TAATGTTAGA GAGATAGATA AAAAGATGTA GCCATAGGGT  AATTTGATAT TATCATTTCT AAATAAGGTA CATTCGAATC ATTATTATTT GAATTGATGA GAAAGGTCGA AAACATTCTA TATGAGGTAA TTGAATAATG CCTATTCATT GAAATTTTAG  ATTATTGTAT TTGTTATTTT TAGCACAATT TATAAGAAAT AAATGAATAC CATCTTTAAA AATTAAAATG ACTAGTTGAA GATATTTAAT GGGACGTGCT ACATTCTGAC CCATTTCCTT  CTCCCTCTTT TTTCTTATTT TATTTACCAG ATTTTCACCC TTTATATGCT CAGTTTTGGC GATGTAGCTC TCCGCTTGTC ATCTCCCGCG TCTTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTACCG  ATGAGAGATT ATTGGCTAGA GAGCCTTGAT AAGATGTTTA ATGTTGGAGT TAAAAGGTAA GCACCTTTCT CCTAATCCTC GTTCAGAAAG AGTTCTGAGA GAAGTTGAAT AGAGAGAGAG  AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAA GAGAGAGAGA GAGCCGGGAG AAGAGAGAGG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG GAGTAGAGAG AGAGAGAGAG AGACGCGAGA  GAGAGGGGAG TGAGAAAGGG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGGGAGAGTA ATTTCATGAA CTTGGTGGAA ACTTCAGTGG AATGAGTTTT AAGGTATCAA CCTCCGATCA GCTGTTATCC  ATCTAGTCCC CTTTTTCCGA CCTGCTCATG GCACCGCTGG ATTCATTCAT CTCCTACGGA GGGAGGTCGA TGACCCACTC CATGATCTGA AAAGTTACTT AACCGAAGGC CTCCTGCAAT  AATTCACTCT TTTCCTTCAT CATATCCCAA CCACTAATCT GCAAGAACAA AACAACACTC TCTCTCTCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC  TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTGTC TGTCTGTCTG TCTATCTATC  TATCTATCTA TCTATCCATC TATCTGTCTG TCTGTCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC  TATCTATCTA TCCATCTGTC TATCTATCTA TCTATCTATC GATCGATCGA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC  TCTCTCCATC TATCTATCTA TCTATCTATC TCTCTCCATC TCTCTCTTTC TAAAAGGAAG AACGTTGAGT TGGTGAGATC ATTGGTCTCC TGAAAATGTA TATTAAAACA GGAGTCGTTG  AGATGAAGAG TCGAAGAGAT TATCTACCGC GATGAAGATT AGAATAAAAG AAAGCGGAAC TTTTTTTGTT TATTTGAGTA GGAGCCGCGC AGAACATGAT TGTATTCGAA GGCAAGGAGG  TTCCGTTGGC AACGGATTGA CTAGCTGTAG TCCTCTGAGG CTCTATAAAT CTTCTCCATC AAGGGTCATC TTCTGTGCAT CACAGAAGTT TGTAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA 
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGGTTTGTG CCTTTGAAAG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCCAGGGCTG AATCAACGGT TGGATTTTGT TGCTGATTTG AGTGGGATAC GCTTGTTCTT GGTCCATAAT AAGATGGGAG TCATGGAGAT GAGATAAGAG GATTGGATTT TGTTGTTTTT  TCTCGTGTTC TATTGCCATT GGCCAATGTA ATACTCTGAC TTATTTTCCG TATTTTTCAA ATTATTTGTC CCCCGGTTTA TTATATTTTC AAAAGAATAT TCATCGGCCC TATTAATATC  TACTTAATTT GATCGAAGAA ACTTTGGTAA ATGCATTCAA ATTCTAGTAG TGCGACATCA TACACTAGAA ATGAGCTGAA TATGACCATA CTACTTACTA TCTATGAACA TCGTAACCAT  GCTTCATGTT GGAGGCAATA ACATCATTCA GTCCACGTAA CCATGAACAT CATAACCATG TCCATACTAC TTACTATCTA TGATACGACT ATACCACTAT CTATGAACAC CATAACAGTG  CTACATAGCT CTCTATGTTG GAGGCAACAG CATTTAGTCT ATTTACTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC AAAAACGCAT ACGCACAGTC TGCATTATTA TTCTCCAACA  GGCAAACCCT AGGCTTCTAC CTTCCCTCCC CTTCACGGCA AGGCAAAAAG AACCTTCTCT CCCCTGCATT CTGCTTACCT ACGCAATGAT CTTTCCTCAT CCCAGAAGGC GCGTCACTCT  CCCTCGAGCC CTCATATCAA TATCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCAAGTACAA TGCAATCTCC ACCGCCGTCA ATGGAGCACC AGATGGGCAG AACGCAGTAC GTGGCGAAGC  GAGTGCAAGA CACGTTGACG AGCCGGGTTT GCCGCGTCTT CTGCTCCATC TTCCTCACTC TCTCTCTCAT CGCCGCCATT GTCGTCTTCA TTCTCTGGCT CAATCTCCGC CCACATCGCC  CTCGCTTTCA CCTGAGCAAC TTCTCTGTTT CCGGGCTATC CGAGAATCGA ACCCTAGACG TCTCCTTCCG TGTTCTTCTC CGAAACCCTA ACCAGAAGAT CGGAATCTTC TACGTGAACT  CCATGACCGG GCAGCTGTTC TACAACGACG ACAGCATCGT TGGCACCACC AGGCCGCTTC TGCCGCCGTT TTACCAGCCC CCGAAGAACA CGACGGAGAT CGTGGGAGAG CTCACAGATG  AAGCCCTGAT GCATCCTCAG ATCAGGGCTG ACGTGGCGGC ACGAGGGCAA GTCTGGTTTA GATTGAGGCT CGAGGTGACC GTCCGATTTA GGGTGAAGAC TTGGGACACT AATCAGCATG  ACATGAGAGT TGATTGCGAA GCCGGTGTCG GAACAAACGG CGAGATCTTG TCGGCGGCCA AGGACCGGCG GTGCTCTATT TACTTTTGAG CATCCGCCCG GTACGGCAAG CGTGCCGTGC  CGCGTGGATT TGGTCATTTG GGTCGTGCCC AAATCTACAG TGCCGTACCG AGAGCCGGAA TACTGAAGAA GAACGACGGT GCATTTTCAA AGTAATAATT ATTTTTTTTT ATAAAAGATA  ATATTTTTTA TAAAAATATT ACGCGATGGT GAATGTTTTC GAAGTCTAAC ATAATTAAGA AAATAATAAT AATATATGCT TTGGAGGTAA AATATTATTA AGAAAAATTA GAGTAGGTAA  CCCTAAGTTT TGAGGAGTAA ATGACAATGA TTAGTTTGTA AAATATTCCG TGATGGACAA TTTTCTTCGA TGATAGCTGA CTCACTTGAA AAAATAATAA TACAAGTGGA TTATGACTTA  GTCTAATATT AGGGTTAACT ACTCTATATA TACTCGTTGA CCCAAGAACT ATTATGAAGT AAAAACTAAA GGCAGGGGCA AATTCTATAC TATGTAATAT ATTTGAAGCA AACTATTGAG 
TCCTCGACCT CCGCTTCTTT CGAATGCCCT AGACTCCCTC GTGCTCGACC GCCTCTTTGA AGTCATGCCT CGACACAACC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGAGGA TGAGTGTGGC TATGGTGATT GTTGTGATGG GTCTCTTGGG AATTGCAAGC TGTGCCCAAG CTCAGCTTAA GCTAGGGTTC TACGCGCAAA GTTGCCCTAA TGCGGAGCAG  ATTGTGATGA ACTATGTTAG AACCCACATC CCCCACGCTC CGTCTCTCGC TGCCGCGATT CTCAGGATGC ACTTCCACGA CTGTTTCGTA AGGGTAAGTA TTCCATCCCT TAGTGTTTGG  ATCAAGCGCT TACCACTATA CCAAAAGCTA TAGCTGATAG CAAGGGCGAG CGCCTATGCC ACTAGGCGAG CGCCTAAGGG TTCAACCTTC AGCAGGAATG TTGGCATTTT ACGACTTTGC  CCTTCTTTAC ATGTCTCAGG GATGTGACGG GTCGGTTCTT CTCAACTCTA CAAAGAGTAC GAGGTTTGGT CAGACAGAGA AATTTTCGCC GCCAAACATC GGCAGCCTCC GGGGCTTTAG  CTTCATCGAC GGCATCAAAG CCGCAGTTGA GAAGGCCTGC CCTGGCGTCG TCTCCTGTGC TGATATCGTT GCTCTGGCGG CTAGAGACTC CGTCGTAACC ATAGTAAGCA GTTACTCTAT  TTTCTCTTTC ACCCTTGAAT AATTACACAA ACATACCCAA CAAAACTGGA TTATGCATCC AAGTTTAACA TTTCCTGAAA CCCAGACATT TGAACTATCT TCTAATTAGA GAAAGATAAG  GGGAGAGAGG AGAGAGAGAT CAGATGAAAT TGGCAAGAGA GAAGAGAGAG AGATCGATGA GATGAAAGTG TGAAGAGAGG AGAGATAGAT GAGATGAGAA TGGGGGGGGG GGGGGGGAGA  GAGAGAGAGA GAGGGGTTTC CTGAAGCAGT AGCTCTATAT TTTCCTTCAG ACCCTTCAAT AATCCCACAA GCAATCGGCA CAAAATTAGA TTATGCAGCA AAATTTACAT AAATAGCAAT  TCTAACTTGT TTCAAACAGG GCGGCCCGAC TTGGAGAGTC CCCACAGGGC GCAGAGACGG AACGATCTCC AACATCAATG AACCCATTAC AAACCTCCCT CCTCCCACCT TCAACTTTGC  CAATCTGACC ATAGCCTACG CCGGCAAAGG CCTCAACGTC AACGATCTCA TCCTCCTCTC CGGTGGGTTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTA TCTATCTATC TATCTATCTA  TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCAC AGGATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCAC AGGATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA  TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCACAG GATCTATCTA TCTATCTATC ACAGGATCTA  TCTATCTATC ACAGGATCTA TCTATCTATC ACAGGATCTA TCTATCTATC TATCGTCAAG AGTAATTCTA ATCAATTTCT ATCCTCTCGC TTCTCAGGAG CTCACACCAT AGGCGTCAGC  CACTGCTCTT CCTTCACCAA CCGGCTCTAC AACTTCACCG GGAGGGGAGA TCAGGACCCT GCCTTAGACA CGAACTACGC CGCTCAACTT AAACGCAAAT GCGTTTCCCT CGCCGACAAC  GTGACCATCG TCGAGATGGA TCCCGGGAGC TTCAAAACCT TCGATCTTAG CTACTACAAG CTGCTTCTCA AGAGGAGAGG TCTCTTTCAG TCGGACGACG CCCTCACCAC TAACTCCGCG  GCCAAGTCCT TCATCGTCAA CCTCGTCAAC AGCCCTCCAC AAGTCTTCTT CCAGCAGTTC GCCGCTTCAA TGGAGAAAAT GGGCAGGATT GGAGTGAAGA CTGGATCAGC AGGTGAGATC 
AGAAGGAACT GTGCCTTCGT CAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGAGGA TGAGTGTGGC TATGGTGATT GTTGTGATGG GTCTCTTGGG AATTGCAAGC TGTGCCCAAG CTCAGCTTAA GCTAGGGTTC TACGCGCAAA GTTGCCCTAA TGCGGAGCAG  ATTGTGATGA ACTATGTTAG AACCCACATC CCCCACGCTC CGTCTCTCGC TGCCGCGATT CTCAGGATGC ACTTCCACGA CTGTTTCGTA AGGGGATGTG ACGGGTCGGT TCTTCTCAAC  TCTACAAAGA GTACGAGGTT TGGTCAGACA GAGAAATTTT CGCCGCCAAA CATCGGCAGC CTCCGGGGCT TTAGCTTCAT CGACGGCATC AAAGCCGCAG TTGAGAAGGC CTGCCCTGGC  GTCGTCTCCT GTGCTGATAT CGTTGCTCTG GCGGCTAGAG ACTCCGTCGT AACCATAGGC GGCCCGACTT GGAGAGTCCC CACAGGGCGC AGAGACGGAA CGATCTCCAA CATCAATGAA  CCCATTACAA ACCTCCCTCC TCCCACCTTC AACTTTGCCA ATCTGACCAT AGCCTACGCC GGCAAAGGCC TCAACGTCAA CGATCTCATC CTCCTCTCCG GAGCTCACAC CATAGGCGTC  AGCCACTGCT CTTCCTTCAC CAACCGGCTC TACAACTTCA CCGGGAGGGG AGATCAGGAC CCTGCCTTAG ACACGAACTA CGCCGCTCAA CTTAAACGCA AATGCGTTTC CCTCGCCGAC  AACGTGACCA TCGTCGAGAT GGATCCCGGG AGCTTCAAAA CCTTCGATCT TAGCTACTAC AAGCTGCTTC TCAAGAGGAG AGGTCTCTTT CAGTCGGACG ACGCCCTCAC CACTAACTCC  GCGGCCAAGT CCTTCATCGT CAACCTCGTC AACAGCCCTC CACAAGTCTT CTTCCAGCAG TTCGCCGCTT CAATGGAGAA AATGGGCAGG ATTGGAGTGA AGACTGGATC AGCAGGTGAG 
ATCAGAAGGA ACTGTGCCTT CGTCAACTAA 

Retrieve as FASTA