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Entry information : HaPrx10 (HanXRQChr13g0388991)
Entry ID 13556
Creation 2016-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaPrx10 (HanXRQChr13g0388991)
Name (synonym) HaPrx10 (HanXRQChr13g0388991)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx013]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaPrx10
start..stop		 S start..stop
HaPrx11 554 0 1..321 1..321
CiPrx02 550 0 1..321 1..321
LsePrx23 510 0 1..321 1..321
HaPrx100 494 4.94e-178 1..321 1..322
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13556' 'complement(join(12847806..12848188,12848678..12848843,12849014..12849205,12849744..12849968))' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 12849744..12849968 223 N° 2 12849014..12849205 190 N° 3 12848678..12848843 164 N° 4 12847806..12848188 381
complement(join(12847806..12848188,12848678..12848843,12849014..12849205,1284974 4..12849968))


exon

Literature and cross-references HaPrx10 (HanXRQChr13g0388991)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr13 (12849968..12847806)
EST ref. GenBank:   GE499568.1 [3' end]  GE499567.1 [Fragment]
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr13g0388991
Protein sequence: HaPrx10 (HanXRQChr13g0388991)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   321 (293)
PWM (Da):   %s   34238.7 (31170.1) Transmb domain:   %s   o15-37i
PI (pH):   %s   7.99 (7.70) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-321
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MALSTLSSLFKLSTFTLFFLVLFGPSYGQLSANFYTTTCPNFRSI
IRSAVNTAVSNEARMGASLLRLHFHDCFVNGCDASVLLDDTANFTGEKTARPNSNSIRGFNIIDTIKTQLESQCPGVVSCADILSAAASDSVVALGGPSWNVLFGRRDSTTASLSAANSNLPSGASSLSTLISSFSNQGFTTNEMIALSG
AHTIGQARCTTFRNRLYNDNNINASFAASLTPNCPSSGGDNNLSPLDSSPTTFDNRYYRDLINQRGLLHSDQELFNGGSADAQVRTYSTNPTTFSRDFASAMLKMSNLNPLTGSSGQVRT
NCRRTN

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Remarks Complete sequence from genomic and 2 ESTs
DNA ►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTTTATCAACTTTATCATCTTTGTTTAAGCTTTCAACTTTTACATTATTTTTTTTGGTTCTGTTTGGACCTAGTTATGGTCAGCTATCTGCCAACTTCTATACTACAACGTGCCCA
AATTTTCGTAGTATTATAAGAAGCGCTGTGAACACAGCTGTGTCAAATGAAGCTCGAATGGGAGCCTCGTTGCTTCGCCTTCATTTCCATGATTGTTTTGTTAACGCAAGTCTCGTTACT
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TTATAAGCTGTCTTTTTTGGAAATAATATAATATGAGAAGATCTATAATTTTTATATTTCCTTATAAATGGGTACACTACTTATTCAAGAGAGCAGTTATTCTAAATATATATTTATATA
TAAGCACAAGTTTGTTCGGTCACTATGAGTATATTTCTAGATACTTTTGAATGACCAACTATATCCTAAACAGTTTGAACATATGTATATGACTTTAATAGTTTAATACGTATTAAAAAA
AACATTGGAGAATTTTATTTTGATTTGTATTTAACTTAAATTAACACATTATTGTCTCCTCTCAGATTGTTTACTTGTTGACTTTATATGTGTCCTTCAATGATTAAATTTCGTATCAAT
GTCGTTAAACATATTTTTCTGATTTTTTGCTTAAAATATGTAGGGGGATGTGATGCATCCGTCTTACTGGACGACACTGCAAACTTTACTGGAGAAAAAACAGCACGTCCAAATAGCAAT
TCGATTAGAGGTTTCAACATCATTGACACTATCAAAACTCAATTGGAGAGTCAATGCCCCGGTGTTGTTTCTTGTGCTGATATATTATCTGCGGCTGCTAGTGATTCCGTTGTGGCTGTA
AGTACAAAAATATTGAACGTAAAGAGATATATTATCGTAAAAATGTTTTCTACGACCGTTTTTACCATGGAGTCAGTTTTGTTCGAAAAATGTTGCTAAAGCCAAACCGACGAATTTCAT
AGTAGGGATGAATTTAGCTGATTTTGTTGTAACTTTTTAAATTTCAGCTCTTGGTGGGCCAAGTTGGAATGTGTTATTTGGAAGAAGGGACTCAACAACAGCTAGTTTAAGTGCTGCAAA
TTCTAATCTTCCATCAGGAGCATCAAGTCTCAGTACCCTCATTTCATCCTTTTCAAACCAAGGCTTTACTACTAATGAAATGATAGCTCTATCAGGTGACTTACTTTGACTGATCAGTTT
TGGTCAACTAAATATCAGTTGAGACTTGTTATTCGTGCTAAATCAACAACTATCATCTATTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAA
TAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATGCTAATGCTAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATTATAA
TTATTATTATTATTATAACAACAGTGACACTTAATACAAAAATAATGTTCATGGGTGATTAATTATTTTTTTTGTAAACAAATGACAACTACAACATTCATTACCGTGTGTTTCTATGTA
CAGTGACACTTAATAAAAAAAAAATATTGTTCATGGGTGATTTATTATATTTTTTTGAAAACAAATGACAACTAGAATATTCATTATCGTGTGTTTCTTTGTAGGAGAGCTCATACAATT
GGCCAAGCAAGGTGCACAACGTTTCGTAATCGTCTCTACAATGACAACAACATTAACGCATCGTTTGCGGCGTCACTGACACCAAATTGTCCGTCGAGTGGCGGTGACAACAATCTGTCA
CCACTAGATTCTTCACCTACAACTTTTGACAACAGATACTATCGTGATTTGATTAACCAAAGGGGATTATTGCATTCAGACCAAGAGTTATTTAATGGAGGTTCGGCTGATGCACAAGTG
AGAACCTATAGTACGAATCCGACCACTTTCTCTCGTGACTTTGCAAGTGCAATGTTGAAGATGAGCAACCTTAACCCTTTAACTGGCTCAAGTGGTCAAGTTAGGACCAATTGCCGAAGA
ACAAATTAA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTTTATCAACTTTATCATCTTTGTTTAAGCTTTCAACTTTTACATTATTTTTTTTGGTTCTGTTTGGACCTAGTTATGGTCAGCTATCTGCCAACTTCTATACTACAACGTGCCCA
AATTTTCGTAGTATTATAAGAAGCGCTGTGAACACAGCTGTGTCAAATGAAGCTCGAATGGGAGCCTCGTTGCTTCGCCTTCATTTCCATGATTGTTTTGTTAACGGATGTGATGCATCC
GTCTTACTGGACGACACTGCAAACTTTACTGGAGAAAAAACAGCACGTCCAAATAGCAATTCGATTAGAGGTTTCAACATCATTGACACTATCAAAACTCAATTGGAGAGTCAATGCCCC
GGTGTTGTTTCTTGTGCTGATATATTATCTGCGGCTGCTAGTGATTCCGTTGTGGCTCTTGGTGGGCCAAGTTGGAATGTGTTATTTGGAAGAAGGGACTCAACAACAGCTAGTTTAAGT
GCTGCAAATTCTAATCTTCCATCAGGAGCATCAAGTCTCAGTACCCTCATTTCATCCTTTTCAAACCAAGGCTTTACTACTAATGAAATGATAGCTCTATCAGGAGCTCATACAATTGGC
CAAGCAAGGTGCACAACGTTTCGTAATCGTCTCTACAATGACAACAACATTAACGCATCGTTTGCGGCGTCACTGACACCAAATTGTCCGTCGAGTGGCGGTGACAACAATCTGTCACCA
CTAGATTCTTCACCTACAACTTTTGACAACAGATACTATCGTGATTTGATTAACCAAAGGGGATTATTGCATTCAGACCAAGAGTTATTTAATGGAGGTTCGGCTGATGCACAAGTGAGA
ACCTATAGTACGAATCCGACCACTTTCTCTCGTGACTTTGCAAGTGCAATGTTGAAGATGAGCAACCTTAACCCTTTAACTGGCTCAAGTGGTCAAGTTAGGACCAATTGCCGAAGAACA
AATTAA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
AAAAAGATCT CTATATATAC ATGTTGCATA ACCTTTCATC AATCACAACT AATACTTCTT TCTCAAACAT CTATCACTTG TTGATATTGC ATACACATGG CTTTATCAAC TTTATCATCT  TTGTTTAAGC TTTCAACTTT TACATTATTT TTTTTGGTTC TGTTTGGACC TAGTTATGGT CAGCTATCTG CCAACTTCTA TACTACAACG TGCCCAAATT TTCGTAGTAT TATAAGAAGC  GCTGTGAACA CAGCTGTGTC AAATGAAGCT CGAATGGGAG CCTCGTTGCT TCGCCTTCAT TTCCATGATT GTTTTGTTAA CGGATGTGAT GCATCCGTCT TACTGGACGA CACTGCAAAC  TTTACTGGAG AAAAAACAGC ACGTCCAAAT AGCAATTCGA TTAGAGGTTT CAACATCATT GACACTATCA AAACTCAATT GGAGAGTCAA TGCCCCGGTG TTGTTTCTTG TGCTGATATA  TTATCTGCGG CTGCTAGTGA TTCCGTTGTG GCTCTTGGTG GGCCAAGTTG GAATGTGTTA TTTGGAAGAA GGGACTCAAC AACAGCTAGT TTAAGTGCTG CAAATTCTAA TCTTCCATCA  GGAGCATCAA GTCTCAGTAC CCTCATTTCA TCCTTTTCAA ACCAAGGCTT TACTACTAAT GAAATGATAG CTCTATCAGG AGCTCATACA ATTGGCCAAG CAAGGTGCAC AACGTTTCGT  AATCGTCTCT ACAATGACAA CAACATTAAC GCATCGTTTG CGGCGTCACT GACACCAAAT TGTCCGTCGA GTGGCGGTGA CAACAATCTG TCACCACTAG ATTCTTCACC TACAACTTTT  GACAACAGAT ACTATCGTGA TTTGATTAAC CAAAGGGGAT TATTGCATTC AGACCAAGAG TTATTTAATG GAGGTTCGGC TGATGCACAA GTGAGAACCT ATAGTACGAA TCCGACCACT  TTCTCTCGTG ACTTTGCAAG TGCAATGTTG AAGATGAGCA ACCTTAACCC TTTAACTGGC TCAAGTGGTC AAGTTAGGAC CAATTGCCGA AGAACAAATT AAACTACCTT ATATTATAAA  AAAATCGCCT TACAATCCGT TTAAGATGCT GAAATATGAT CATTTTTAAC GGGTAATGTT TTGTTCTTTT TAAGTTTCAT TTGTATTGTG ACTAGTTTTG CGTGATTTTG TGAATCATGA  AGTTGTAATT TGTGAACAAC AATAATAATT GAAGGCGTTT TGCATTTATA TGTCACTTTA CTTGCACCCA AGATAATAAT AGTTTTTATG ATTAATATTG ATGATAAATG GCACAATAGT 
ACATTTCAAT AGCCCCTGA 

Retrieve as FASTA