Entry information : HaPrx41 (HanXRQChr01g0008451)
Entry ID 13595
Creation 2016-05-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-12-08 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-12-08 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: HaPrx41 (HanXRQChr01g0008451)
Name (synonym) HaPrx41 (HanXRQChr01g0008451)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx025]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaPrx41
start..stop
S start..stop
IaquPrx74 467 9.27e-167 33..340 36..342
CroPrx51 466 2.62e-166 20..340 31..352
NnPrx07 464 1.47e-165 7..339 17..346
PtPrx07 463 3.15e-165 7..339 15..344
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13595' 'join(57568029..57568268,57568341..57568541,57582954..57583535)' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 57568029..57568268 238 N° 2 57568341..57568541 199 N° 3 57582954..57583535 580  
join(57568029..57568268,57568341..57568541,57582954..57583535)


exon

Literature and cross-references HaPrx41 (HanXRQChr01g0008451)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr01 (57568029..57583535)
Protein sequence: HaPrx41 (HanXRQChr01g0008451)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   340
PWM (Da):   %s   37556.04  
PI (pH):   %s   8.9
Sequence
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Send to Peroxiscan
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AMVEMKCPGVVSCADILALAARDYIHL
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Retrieve as FASTA  
Remarks No EST.
DNA
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GCCAAAACATGCCCTCAACTCGAACAGATTGTCGCCTTCGTCACTTCTCAAAACTTTAAAGTGTCGCCGGCCACTGCTCCGGCGACTATCCGCCTTTTCTTCCATGACTGTTTTGTCCAG
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GAGGGGCTCATGCGAGAACCACCTTTATTGTGACAACCTTGAGAACCAATGTGAACACAACCTAAAATAGCTAAAAAAACCTAAAAAAAATCTAAAAAAACCTAACCCTCACCCCCTCCC
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TATATATATATATATTAAAGATGAATCTTATGGCATCTGTTTAACATGTAAAAGATGCTAAATATAACCTACGTTTATTTAGAAATGCAATGCTATTTTTTTGAGGTTTCATTATATTAT
ATTTCAATTAATTAATTATTATTGATGTTTTTATTTATATATTTTCGTCAATTAATGTGTTTCTATTGTTATAATTTGATATAACTGATTTCAAATAAATATTCTTCAATGACTTATATA
ATAGTTTTATTAGTTGAAAGATAAATAAATATAAAAAAATTAAAAAGTTAAATATATTTGCTTACATTATCTCTTTGTAATATATAAAAGCACATGATTTTGTTAAATATTTCTTAAAGC
TATTTTATAAGAGAACTAATGGATGTATTGACCGGTCATATTCTCTATTGCCTATTAGAATATTGTAGGTTAGCAATTTGGTAACAACATGTGATCCAGTGAGATGGGGCCAATTCATTA
ACGATCAAATTATGTCCCTTTGATGATTAGATAAAATCTGTTTGTCTGAAAAGTGTTTTGCGTGCCCTTTTAAAATGTATAAAGTGACGTATGTAACGTAAAGTGTAACTTTATATATAG
TCTATTTTTCTACTTATGTGATGTATAGTTGTTTTGATGTTGTATATATATATAGTAACTTTAGTACATGGGTAAGATCAAATAAAAAGTATATTTTGCCTAAATAGGATAAGAAGGAAT
CTTAACCATCAATTTTTCAAATCAATGGTTAAGATGCAAGTGTAGGAGAAAGGATGAGTGGAAGGGTATATTAGGAAAATCATATTTATGGACTTTCTCTCTCCACATGCAAGACACATG
CATATTCCACCCCCATTTTTTAAACGTTCATAACTTTTTTATACGACATTATTTTTTCATAAAAATTTCACCGTAAAATGGAGCGTTTTTTATCTTTAATTTGAGTACCATATTGCTATA
TACAATATGAAGACTAAAAAAACCTACTAAAATGTGTTGTATTTCTATGTTGTATAACATTTTTTTGTGCTGAATTTTTGTACTATATTTTTGTGCTGAATTTTTTTGTTTTAATTTTTT
TCTCAATTTTTTGTGCTGGATTTTTTTTTGTACTACATTTTTTCGCTGAATTTTTTCGTGCTATATTTTTTTTATACTAGATTTTTTTTGTACTATATTTTTTTGTACTAGATTTTTTGT
GCTATATTTTTTGTACTAGATTTATTTTTGTTGTATTTTTTTTAAAAAAAAGGGTGCTACATGTCATTTTCACTCCTATTTATAAGGACCAAAATGCTCTTCATTTCTATTTATTAGGAG
TGCCACATGTCATCATCACAATCCTTTCTAGGCTACTTAGACAAAATCCACTTTTTAATGGATCATTCCCCCTTTATTATATATATTATTTTTAAGTTTACTTTCATCTATATATTTTAA
ATAATACACGTTTTTAACTCATTTACTTTTCATTTAGTTTAACTTTTCTTTAAAAACTTGTTCTAAGTGCCGGTAATGTAATGAACCAAACCGATCTTGATCGAAAAGCATATCAAGACT
TTACTTTTTGTGTTTTCTTATTCGGTTGCTATACGTAATGAATCAGACAGATACCGACTGTATTTTCACAGCGAAACGCAAGAGAATCCCACTAGCTCATGTATAAATTGTTTATACATG
TTCCATAGAGCATCTGCAATCAAACTTCACATCAGACTTCGTTGTCATATGGGCATGGCTCTCTGAGATTCTTAAAAAAACCTGGCCCTATCCACCCTGTAATGTTATAATATTAAAAGT
TTCTAAACGAAATCATTCAAAGTTTCAATTCCATATATAATATTGGGTTTTTATTTGGCTTAAAATTATAATTTAATTAGAGTAATCCATAACTGGGTAAATGGTAAATGATTATAATTA
AAAAATGGTTTAAATGTTTAGTGGACCTAAAATGAATTAAATGTTAATGAGAGAGTGGGTTTAACTGCGGCCGAGACAAGAGGGGAACTCGTTCGCCTATAAGCTCGGTTTGGTAAGGAA
TTGATAAGGTACCCGTACAGTCCCACAGTCGCTATAGCAACCTAAAGAGAAAACACACACAATATAAAGTTGTAATATGGCTAAAAGAATATCGACACGTGCTCGGTACATTTTTTTATT
ATTTAACTAAAAATAATAAATGATTTTATTATGTTAATTTTAAACTAAATACTAAACACATAAACATAAATAATCCCTCACTAATACTTGAATAGTAGAAGGAAAAGGATTAACAAAATA
AACCCCCAAAACTACATAATTTTGTTACGTTAAATTTGAATTAACTTGACATAATTTTAATATATTTTAAATTAAATTTCATTTTAAGGTAGGAAAAATTAGTTAAGTTCTAATACATTC
CTACAAATAAAATACTAATTAACTATTAACAACATTTCTGTTAACTTCATTTTCCAAATGGAAAAAAAGAAAATAAAATTTCATGCACAAGCAAGGATTCGATCCAACGACTTATGTTTC
AATTTGGTGTGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATATATATATATAGGGAGAAGATCATGCGAGAACCACCTCTTATTG
TGAGAACCGCGAGAACAAATGTGAACACACAAAAAATGCCTAAAAATAGCTAAAAATCACACAAAAATTTTTTTTTTGAATTTTTTAATATTGTTTATAAAAAAATCGCTACTTTTCGAA
GCAAAAAAAAAAAAAATTTTTAAAATTTTTTTTTTGGCTTCTAAAAGTTGCGATTTTAACATAAAAAATATTAAAAAATGCAAAAAAAAAATTTTAGATTTTTTTAATTTTTTTAGGTTT
TTTGGGGGGTTTAGTTTTTAGCATTTTAGCTTGGGGTGGGGGGGGAGGTTTAGGTTTTTTTGGGGGGGGGGGTTAGGGGGTTAGGTTATTTTAGGTTTTTTTAGCTATTTTAGGTTGTGT
TCACATTGGTTCTCAAGGTTCTCGCATGAGCCCCTCCCTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGGCTTTGGTTCAATTAAGAACCACAACGAATTATGATAAC
CATGAGAGCTCATACTTTCTGCGTGAGTTGTGCCATAATTTTTGCACAAACATAGATGAAAATATTATAAACACATCTATAAGAAAAATTGTCGAGTCAGTAGTTACGCCTGATATAAGT
TTTGTTTACTCCTGGTGTAAGTTTTGTTTACGACTGATGTAGATTCTGTTACATTACGGAGATGAGATTTTTTTTACACCTGATGTAAATTTTTGCATGCAACATTTTTTTTTATTTTTT
ATTTTTTTGACGAAACAGGTGATTTTTTTTAAAGATTTTCGAGAAATTTTTTTTTGAAAAAACCTTTTGCAAGACTTAGTTCTCTGATTCTTGCAATTCAAGGTGGTTTTCATTTTACCC
TTTGTCTATATGTATACATATAAAATATAAAACATATTCAGACCCTGTTTCGATTTTGACCCTGAGTCGGCATCCACCCGACGCATGCTTGGCCATGCACATGGGCCATTGACGCACACT
ACGGATGTTCACACATGTCTATATCCATATAAATCATATATAATGCCTTGTGAAGAAAGTGGTAATTTTTGGCATGTGGATATAAGCAGGACCCTCAAACCCAAATGATTTTTTTTTTTT
TTGTCTTAAAGATGACTTTTCAAAGGAACTAACCGGTACCAATACCGCAAGTACTGGTGCCAAAAAACGGAAAAAGTGGATACCGGTACCAGTATTTACCGGTGTTTAACCCATAAATAC
CGGTACCGTACCGTTACCGAAAAAAGGGGAAAGTGGGTACCGGTATCGAATATACCTGATACGGTTCGGTACCGATACCCAATACCAAATGCTCATCCCTAGATCACACCGACTGAATTT
GGTAAGATAATGAAACCATTATTTGATTAGGGTACAACCACTTAAATACAATTTACAATCATACATGTATATTATAGAATTATATGGCAAGAGATTGATAATTCTCATTCATACTTCAAA
AACTCGGCAGAGCCGATTACAAATACAAGAAGAAACATGCAAACATGGAAAGTATCAACTAAATGGGGAAGGAATATCACTAGGGGAAATAATAAAGAAGAATAAGGAAATAGGATATTC
TATATTCCCCCTCAAGATGAAGCGTGTAAATCAATCATGCAAATCTTGCCAAGTAGGAAATCGAGTTGTTGTCTTGAGAGGCCTTTTGTCAACAGATCAGCAATCTGCATTTTACTACTG
ATATTCATAGTAACAATCTCCTTGGACTCCACGCGCTCACTCACAAAGTAACAGTCCATTTCGACATGTTTTGTCCTCTCGTGGTAGACCAGATTATTTGCAATGTGTCGAGCTGCTTGG
TTGTCACAGAACAAGGGGGTAGGCGAACCACTTTGAATTCCTAATTCCTTAAAGAGCCAGTGCAACCAAAGAATTTCGCTCACCGTGCTTGCCATTGCACGATACTCGGCTTCGGGCGAA
GAGCGCGAGACCACTGATTGTTTCTTCGTTTTCCACGAGATGGGAGAGCCCCCGAGCAATAAGAAGTAACCTGTGCGTGACCTCCTTGTGTAGGGACATCCTAGCCAGTCAGAATCACAA
TACGCGGATAGAGTCGGGTCCCCGGTACGCGAGAGAAGGATACCTTGCCCCGGGGTACCCTTCAGGTATCCAAGAACCCGATTGACTGCCTCCAAATGATTGCTTCTAGGATCCGCCACG
AACTGACTTTGGACATTAACCGCATATGTGATGTCTGGTCGAGTGGCTTGTAAATATAAAAGCCGCCCTATCAAGCGACGATATTGACCAGCATCAACACGATCATTTTCTTCTCCTTTG
TCTACCTTCAAACCCCGTTCAATCGGAGTCACACAAGGTTTACACCCCAGCTTTCCGCTATCCTCCAAAATGTCCAACGTGTATTTGCGTTGGCTAAGGACAAGACCCTCTTTGGTTCTG
GCAACTTCTATACCAAGAAAGTATTTTAGGACTCCCAGGTCCTTAATGCTGAAATTTTGATCAAGTTTCTTCTTAACCTCTTCGATCTTTGCCAAACAATTCCCCGTTATTATGACATCG
TCAACATAGATCAAAATAACTGTCATGATGTCACCGGTCTCGAAAATGAACAAGGAGTGGTCCGCTTTGGATTGTTTGAAACTCATGCTTAAAAGAAATGTGGTGAATTTGTGGTACCAA
TTTCGTGAGGCCTGCTTTAACCTATATAGGGACTTCCTTAGTCGACACACACGCGTTTCGTCTTTGTTGGTGAAACCTTGAGGAATCTTCATGTACACTTCTTCCTCGAGTTCACCGTGA
AGGAAGGCATTGTTTACGTCGAGTTGGTGAATAACCCAGTTTCTTTTGACCGCCACGGCAAGAAGAGTTCGCATGGTTACTAGTTTAGCAACAGGCGCGAACGTGTCATGATAATCAATT
CCTTCTTGTTGCGTAAACCCCTTTGCAACGAGTCGAGCCTTGAATCTTTCAATTTCACCGTTTGGCTTGTACTTAATTTTGTAGACCCACTTCGAATCAATGGCTCGTTTCCCTTGCGGA
AGACTTTCCAAGGTCCACGTCCCGTTCTTTTCCAAGGCCTTAATTTCACTTCTCATAGCTTCACACCAACGCGAGTCTTGCGAAGCTTCTTGAAAACACCTTGGCTCATCATTTTTATTG
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GAGGGGGGAACGTTGACCACGAAATCTTTGAATTTTGAAGGTTGCGACCTGGTACGAGTTGGTCTGGCTTCGGCAGTGGGTTCTACCCCACCAACTTCAATATTTTCACCTTCCAAATTA
TTTATTTCAATATTGGGTCCAACTCCATTATCTTCGGCCTCCCCTTATACATTTTGGCCCAAATCAGAATCTACCTCAGGCCCATTTACATTCTCGTGATCAGGCCCATTCACATTCTCA
TTGATTTCAACTTCCTGACTTTCAATATTTTGAGATTGGTTTGGGTGGCAATCGGTCAATGGCTCTTGAACTTGGCAATTATCAAGACACTCATGTATTTTAACAAGCTTAACATTATCA
TCTACCTCACCCGTGTGAATTTTGGCAAAAGGAAAGTTCTCTTCGTAGAAGAGAACATCTCTACTGACCATGATCTTTCTTGTTTCAAGATCGAAAATTTTGTATCCTTTTATTCCCGGA
GGGTATCCTAGAAATACTCCCGGTTTCCCCCTTTGCTCGAACTTGTCCCCCTTTGTATTAAAATTTTTAAAATAAACAAGGCAACCAAAGACCCTAAGATGACCGTAATCGGGTTTGGTT
CCAAAGATGATTTCATAGGGAGTTTTGTTTTTAAGGACATTTGAAGGTAAACGATTTATAACATATACCGCCGTAAGAACACACTCTCCCCAAAAACGTTTAGGGAGGTTTGCACCGAAC
CTTAAGGCCCGAGCCGTCTCTAAAAGATGTCGGTGTTTTCTCTCAACAACGCCGTTTTGTTGAGGGGTGTGGGGACACGTGGTCTCAAGTAACATCCCCCTTTCATTATAGAATTCCATC
ATGTCATTAGATGTAAACTCACCACCGTTGTCACATCTTATCCTTTTAATGTTTTTATCAATTTGGACCTCAACCATTTTACAAAAAAACATAAGACATTTGCTCGCATCACTTTTATGT
TTAATAAGAAACACCCACACGGCTCTACTATAGTCATCAACTATGGTAAGGAAATAATTGGCCTTGGTATACGATGGCACACGATACCCCCCCCCCCCCAAAAATATCACAGTGAACTAA
CTGAAAAGGTTCAATGGTTTTAATAAAACTAGATGGAAAAGGTGTTCTGGCAAATTTGGCCATGGCACAAGAATCACAAAAATTACCAAGTTCAGTAGTAATAGTACTTAGAAAATCAAC
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GCTCCAATCAAGTTCCTCCTCTGCAATCCCTGCATGACACAAAAGTCGGGAAAAAATGATACGACACATTGCAGATCACGGCTAAGGCGACTAACTGAAGCAAATTGCATTTAAAATCAG
GAATATAAAGGACGTTTTTTACTTTGGCTCCTCCAGGGAGAACGTATTCCCCCTTTCCCTTTACAGGGATGGATTCACCATTCGGAATGAGTACGGACCCTTCGAATGGTGCAGCCTTTT
CATTAATAAGAGTGTTTTGCAAATGTGTTATATATTCGGTGCAACCCGAATCTATTATCCACTCACCTACTTCGTCTGTTTTACTAGCCATATTAGCAAAAGATTTTGTTGTGTCAACAT
TACCGGAGCTTGAGAACTGTTTGAGAAGTGTTTGGTAGTTCTCCTGTGTCAAACCGGGTATAGGGCTCGGTTCCGCTTCGACACAAGCGGCTCTTCCTTTAGTCTTTTCCCCTTTCTTCC
CGGGCCACCAATCGGGATATCCGACTAGTTTAAAACATCCCTCCCGCTTGTTGCCGTCTTTATTGCAAAAGGAGCAGTGATCGGCTCCCTCCTTCAATCCCTTCGTTCCCGCCTTTTCTT
TGCCGAAATTACCATCACGTTTCTGGAATGCCTTGAAAGCGGCTGCCTCCACGCCACCTTTGTTCTCACTTGAGACGGCCCGTTGCTTTTCATCATCGTGAACCATGTGGTATGCGGCCG
TGAATGAAGAGATGGGTTTCGTGGCCAGAATCTGGGTTCGAATAACCGTGAATTCGGTGTTCAACCCCATGAGAAATTCATATAGATGTTCCTTCTCTTGGTGCTCAAACACTTTCTTCC
CAATTTCACACTCACACTTGTTGCACGAACACTATGGAAACGGTTGAACCGACTGGGCCTCATCCCATAGTGATCGAAGGTGTGTGAAATATGCCGATACCGAATCCCTTCCTTGACGGG
AAACAGCAATTTTCTGTTTGATTTCGTACGCTCTAGGAGCGCTCTCCTTTCCGAATCTTTCGTCAAGATCGGACCATATTTCGGCTGCCGTGCTAGCATATTTTACACTATTGCGGATGT
TCTTTTCCATTGCCGTCGTTAGCCAACCCTTTATCATGGCGTCGGCACGCATCCACGGCATGTAATCTTTAGACGATTTTTCCGGTTTCTTGATTGATCCATCAACGAACTCAATCTTGT
TTTTGGCAAAAAGGAAGTTCGTCATCTCTTGCTTCCAATCTGCATAATTGTAGTCGGTTAAAGCTTCGTTGACATGTAACTGTTTCGGAAGATCCGATGGGTGGAGATAGTATGGTGATT
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GTTGACACCTAAGATGAACCTCTGTTCCATTGTAGCCCTTGCATCTATCATATAATCCATTTAATGATTTTCAAGAGATACATTAGGTTGCTCTAAATCAACATGACGTGTAGCAAGTTA
TATTTCGAAGATACGTAGGTAATGAAACTTGAAGATAACCATTAATAGGGCTACACAACTTAATATGTATGACTAAAAGCTCTAAATATAGAAATACTCAAATGAAGAATCACATGTATG
AGATCGCTACAAGTATAATCGGTTTGGTTCATTACGGTCTGGTTCAACTGATTTGGTTATGCAACATGCCAAAACCAAAACCAAACTACAAATTTCGCTTAATTGGTTATAGTTTAACTG
AACCATTTCGGTTCGTCAATTCGGTTTCATTGCATATCTTGCTTTGTCCTTCTTTGCATGATCACTCATATCCAAGATTGCTTCCATCTCCTCCAGCCACTTAACAACTCTAGTACCTCC
TTTCTCATCATTGAAAGTTGTAGGTATACAAGACATGAAAGTCTTATAACTACTAAAAAACACCTTTCTTGACACATAAAGGGTACTTATGACATGCAAAATGGTGTCGTTGAAGGACAC
GTCATAAAATTAAGATGACATGCATTTATGTGTCATCTTTTGATGATACTTTGATGACACGCGTTCTTGACACTCATTTTTGATATGCTTTTACGACGTACATTTATGACATATATTTAT
GACGTTCATTTACGTGTGTCATACTTTTAATTGTTTTTAAAAAGTTATAGAACCATTGTGTTTTTGTGTTTTTTTGTTGTGATCAACGGAAGGTGCTGAGACGTTTCTTTTTATAGGATG
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GTTTATATTTTATGGCGTTTTTGTAGGATAAGACCTTAACTAAAACACAGAAAAAACTACGCAGTAATAAAATTGGCGTTTTGTATTTATTTGACGTTTTATATTTTCAATGGCGTTTTA
TATATGAAAGTATGTTTACCCTTTTTACCCTTAATGAAGCACGTTCTAGTAATACAATTGATGTTATCCCTTAATCAAAATAGATAAAGCTACTACATTTGAACTTTAGCACCTAACATT
AGGAGAATGATAAGTTCTACAACCCTTTGACATTTCAATCGACGGTTGATCTTGGAGGAACCTTGTGAGACAAGGTGGTTAGACACGGAAAAGGTAATGTCAGTTTAGAAAGAAAATGGA
ATGCCAATGAGCTAGTGGTGGAGTGGTAAGGGAGAGACCTTGTGTTCCAAGTGACTCAAGTTCAATTCCTGCCCCTAGCATTTAGTTTCTGCGGCACCTGGTGATGATGGGAGACTAGGC
GAGTAGGCGGCGATCGCTAGTTCGATCCTTGAACTGAGCGGGTTTTACCTCACCGCACTGTCGTGCCTTCGGGCGAGTGTTCACGGGCTTCGGCCCTAGGTGGGGGTTTTCCCCGGTTCG
GAAGGCGAGTGTATCCCGATGTGGTGAATTTCGCCAGTAGCCCATTTGGAGGATTCGTTGGCCGTTTAAAAAAAAAGAAAGAAAATGGAATGATGACATAGGAAGTAAGAGGCTTTGTCC
TAGATTGAGAAATAAAGGTGTAAGGAGTGGTTAAACATTTGAGAGTGACAAACTAAAAAATCAATCAATGAGAGTGTGTCATGTCAAAGTGGTAAACTATGCTCAAAATTGGTTAGACAC
TTGGTGAAGTGGTAAACTATTTAAAAAAAAAGAAAAATGTGTGATTGGTTGAGATTGGAATGGACCCCACCTCACAGTACCCTCTCTCTCTCACACTACCCCCTCTCTCTCATGATTCCC
GAGTGGCAAGCCTACACCGATTTGGCAATGAAACCGCGCAAAAGGGGTCGGCGGAGGTGTTGCCGCACGGCAAAACCCTTTGCCGCACCACTCCGGACAGCCTAAGGGATTTAAGTAGGA
GTATTCGCGCTTGGTTTTAACGATTTTTTGGTCAACGTGTATGCCAAACTCTTAGTAACGATTTTTATTATCGAAAACCAAAAATGGACAGTTGAAAAATAAAACCGAACAAAAAATAAT
CGCTCTTAACGATTTGGTTCTTGTTCGATTTTAGGTTTGAGCTTTATTGGGCCTCTAAAACTTAATAGGAAGCAATAACAGTTTTGAATAAAAACTGGGACTAAAACTTAACAATTAACA
TAACAAGGATTACAAAAAGTGATTAAACATGTTGACCTTGAAAATGATTTTAGCAAGAAAAGAAACGTTTAGGACTCAGACGGGTTAATAAAAGGAATATATCTTACTTAATATACTAAA
AAAAGAATAATAAAAATTTATGGCCTAGTCCAATTAATACGACCGGTTGCCGCAAGCCAAACTACTCGTTATGGTTTGAAATTTTTGAAACTAACCAACCAAACGTTTGAAAGAAAAACC
GACCGTGAAACCAAATCGATGACCGATTTGAGCGGTTTTGTAGTTTTAAACTAATCCGTGAACACCCATATTTCAAGGAAACAAGACAAAGTGCAAAGTTTGGGAAAATGCATATGGGCA
ACGTAAGTATGACATTAAAACATGTTGCAATTAGAAAAAAGACGGGACATGCACCAAAGAAATAACCTAACAACAAACATGTTTTGAGTATGATAAACTTGTCATTTATGATGTAATTGC
CCCAAATTGAAACATAACAAGTTTAGTGAAGTGAGTAAGGAAAAAGGGCATGATTTTGTTACGAACGTGGAAGAGGCATGATAGATCCTAGATGTGGTTAGAGCAGCAGTCCAGCCAAGT
CTTTGAAATAGGAACGAGACCATTCCCACCACCACGAGCAGGCAAGTTGGATCGTTAGCAAGGCATGTTATAACCAAAGAGGCATGTCTTTATACGAAAAGAAGACATTTTGATACTAGT
TGTGACTCAAAGCATGGACCAAATGGATAATAACATGGCCCTTGGTGAAATAGCGCTCAACAAGAAACCGAGAGAGCAGCACATTACAAGTAAACTAGTTGTTCTATCACATGTAGTGGT
GGACCAATGATTTATTTTTCTAAGAGCGCAATCGTGGGCTTAACCAAACTTTGAAGAGGAGAGTTCAGGATTTTTGCCTAAAACATAAACTAAATTTTAAATTTATATCCAAAGCTCTAG
CTCATGAAAAATCTTCAAGCCTAGTCTAGTCTCGGTCACATTTAATAATTATTAAATTTATATACCTATATATATAGGCTAGCTCGGTATATAAACCTCGGGCTCGGGAGCGGTAATTAA
ACATTTTGTAGTCTCTAGCTCAGCACATTTACACACCTAGACGTATACAGTACTAATACATTTGATAATATATTTGTGTGTGTATGATACTAGATATATGTTATTTCCCTTTTCTTTTGT
TCATCACATGTTAACTAAAGAACATCTATATATATTTTCTTAAAAACAGGCGGGAGGTCCATATTATGCGGTTAAGAAAGGAAGGTGGGATGGAAAACAAAAACCAATGGCAAGTTTGGT
GTACCCAAATATCCCACATGCGAATTCCACCATTGATAACCTCATTAAGCTTTTCTCATCCAAAGGTCTTACGCTTAACGATCTGGTAGTCCTATCAGGAGCCCATTCTATCGGCTATGC
GCATTGTAAACACTTTGTGAATCGCCTTTACAACTTTAAAGGGACAAACAAGCCAGATCCGGACATGGATCCGAGGCAACTGAAATCCCTTAGAATGACTTGCCCACAACATGGTGGCAA
CGTCGGTGTTGTGATACCTTTTGATGCAACAACACCTTTTTCATTTGATAATGCATATTTTCAAAACTTGCAAGCGAAATTGGGTTTGTTGGCAACTGATAAAGAACTATTTTTGGACCC
TAGAACGAGGCCTTTAGTACAAGCATTCGCAAACGACAAGAACAAGTTTTTTCAAGATTTTTCTTCGGCTATGGAGAGATTGGGAAATGTTGGTGTGAAAAGAGGAAAAAAGCATGGCGA
GATACGAAGAGTATGCAATATGCATTTATAA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGTCTCTGTCATCTTCAATCCTCATACTCTTGTTCTCCACCACAATAACCACCTGCTTATCATCTGAAACCGTCAACACCTCCATGGTACACCACCGCTTCCTCACAGTGGATTACTAC
GCCAAAACATGCCCTCAACTCGAACAGATTGTCGCCTTCGTCACTTCTCAAAACTTTAAAGTGTCGCCGGCCACTGCTCCGGCGACTATCCGCCTTTTCTTCCATGACTGTTTTGTCCAG
GGGTGTGATGGATCAATCTTGATATCAATGAAGCCCGGAAGCATGGGATTGCCGGAGAAGGAGTCGGAGGATAACCAGGACATTCCGGCCTACGCGTATCAAATTATAGAGAAGGCGAAA
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GCGGGAGGTCCATATTATGCGGTTAAGAAAGGAAGGTGG
GATGGAAAACAAAAACCAATGGCAAGTTTGGTGTACCCAAATATCCCACATGCGAATTCCACCATTGATAACCTCATTAAGCTTTTCTCATCCAAAGGTCTTACGCTTAACGATCTGGTA
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GTTGGTGTGAAAAGAGGAAAAAAGCATGGCGAGATACGAAGAGTATGCAATATGCATTTATAA

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cDNA
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CTCAACCCAC AATTGAAACC ACCACCACCA TGTCTCTGTC ATCTTCAATC CTCATACTCT TGTTCTCCAC CACAATAACC ACCTGCTTAT CATCTGAAAC CGTCAACACC TCCATGGTAC  ACCACCGCTT CCTCACAGTG GATTACTACG CCAAAACATG CCCTCAACTC GAACAGATTG TCGCCTTCGT CACTTCTCAA AACTTTAAAG TGTCGCCGGC CACTGCTCCG GCGACTATCC  GCCTTTTCTT CCATGACTGT TTTGTCCAGG GGTGTGATGG ATCAATCTTG ATATCAATGA AGCCCGGAAG CATGGGATTG CCGGAGAAGG AGTCGGAGGA TAACCAGGAC ATTCCGGCCT  ACGCGTATCA AATTATAGAG AAGGCGAAAG CTATGGTGGA GATGAAGTGC CCTGGGGTTG TATCCTGTGC GGATATACTT GCACTTGCAG CCAGAGATTA TATTCATTTG GCGGGAGGTC  CATATTATGC GGTTAAGAAA GGAAGGTGGG ATGGAAAACA AAAACCAATG GCAAGTTTGG TGTACCCAAA TATCCCACAT GCGAATTCCA CCATTGATAA CCTCATTAAG CTTTTCTCAT  CCAAAGGTCT TACGCTTAAC GATCTGGTAG TCCTATCAGG AGCCCATTCT ATCGGCTATG CGCATTGTAA ACACTTTGTG AATCGCCTTT ACAACTTTAA AGGGACAAAC AAGCCAGATC  CGGACATGGA TCCGAGGCAA CTGAAATCCC TTAGAATGAC TTGCCCACAA CATGGTGGCA ACGTCGGTGT TGTGATACCT TTTGATGCAA CAACACCTTT TTCATTTGAT AATGCATATT  TTCAAAACTT GCAAGCGAAA TTGGGTTTGT TGGCAACTGA TAAAGAACTA TTTTTGGACC CTAGAACGAG GCCTTTAGTA CAAGCATTCG CAAACGACAA GAACAAGTTT TTTCAAGATT  TTTCTTCGGC TATGGAGAGA TTGGGAAATG TTGGTGTGAA AAGAGGAAAA AAGCATGGCG AGATACGAAG AGTATGCAAT ATGCATTTAT AAGGCATATA CCCAATTATT TAATTTAATT 
CTTTTATAAC GTTTATGTTG TTTGTGGCTT GTTAATTTTT ATAAGACATG AATGTGAGTT TTTTTGTTAC CGTTTGATTA AACAAGAATA TTTAAGCTTC TTTAAAGT 

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