Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
362 (274) |
PWM (Da): |
39462.19 (30175.1) |
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PI (pH): |
8.79 (8.65) |
Peptide Signal: |
cut: 0 range:Ymax-273 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MGGSKMTLVPSHTVKLTLGVLVVVMLMHLKCLEAQQQQLVEGLSWKFYESKCPKLESIIRKQMVKVIKKDVGLAAALLRLHFHDCFVQMGGSKMTLVPSHTVKLTLGVLVVVMLMHLKCL EAQQQQLVEGLSWKFYESKCPKLESIIRKQMVKVIKKDVGLA AALLRLHFHDCFVQGCDGSVLLDGSASGPADSEKTAPPNLRLRGFDVIEDLRRRVHKQCGAGSVSCSDITAIVARDTI VLTGGPKYNVPLGRRDGLTFATRNATLSNLPSPFVPVDKLLPDFAARNFDATDVVALSGAHTIGVAHCTSFTQRLYPTQDTTMDKTFASTLKRVCPTATTNATTSLDVRSPNTFDNKYFV DLMNKQGVLTPDQDLYTDKRTRSIVTSFAVNQTLFFEKFVNAMVKMSQMQVLTGTQGEIRNNCSRRNANTYDPLISTVVGDADVDSAQSF* |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
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DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGTGGTTCTAAAATGACATTAGTGCCCTCTCACACTGTTAAACTGACTTTGGGTGTGTTGGTAGTAGTGATGTTAATGCATTTGAAGTGTTTAGAAGCACAACAACAGCAGTTAGTG GAGGGGCTTTCTTGGAAATTCTATGAAAGTAAGTGTCCAAAGTTGGAATCAATTATTAGAAAGCAAATGGTGAAGGTGATCAAGAAGGATGTTGGTCTTGCTGCTGCTCTTTTGAGACTT CATTTCCATGATTGCTTTGTTCAGAGGTATACATGGTTCAAAAGTCGCTAAGCGCTCCCTAATCGGTCAACCGGGGAGTTGAGAGTACTCGGACATGTTAAATTATAAAGAAATTAGTTT TCGCAAATTAAATATATGTCAATAACATAAATTTACTAATATTTGTAACAAAATACAGAAAAATGATATTTATTCTTTAATATGATAGATATAGAAGTACATAAATTATTATTTTTTTAA GTCAAACTCGGCCCGAGTTGACCTACTAGATACGATTTTGGCCGAGGTTGACCGCGTTTGATCGATTCCGATTGATTAGGCGGAGTTGAAGAAAAGTCGTCTCTGCAGCATGTCTTGTAG CGATTACTCGGGGAGTACTCGGCCTTGGACAGTGGCGAAGCTTGAGATTTCCGACCGAGGGGGGGCGGTCGAAAACGTATATACCTAAAAATTTCTATAGAACCGGGGGGTCGAAAACGT ATATACCCAAAATTTTCTATACGAAAGCTACATACATCTAACTCTACTGAGCGAAAAGTTCGAGGGTCCCCCCCCCCCCTCTAACCTACGCCCCTAGCATTAGAGACCTTGTTTTACAAC CATATTTCTATGGTTATGAGATATGTGAAATTTCATGTATCTGCTTTAGCTCTGTATACCATTAGAAAGGTTTCAAACTTGGCCCACTTTTTATATATACATGAATAACTTTATCGACTA TATATTTTCAAAGTGAGTCGATATGAATTTCGTACCACTTAAGAGCATCTTCAATAGTGTGACAATTTCATGCCTTATATTAGAATTTGTAGCGTTTATATCCGCATATCTCATTATAAC GTTGTCAACAACAGGGTTGCGATGGCTCGGTGCTATTGGATGGATCAGCAAGCGGCCCGGCTGATAGTGAGAAAACCGCACCACCAAACCTACGTTTGAGGGGGTTCGATGTCATCGAGG ATCTTCGTCGTAGGGTTCACAAACAATGTGGTGCGGGTAGTGTCTCGTGTTCGGATATCACTGCCATTGTTGCACGGGACACAATTGTCTTGTGGTAAATCCTTTTTTTTTTTTTTTTTG AAAAGTAAAAAAAAATTAAATAATTATACACCTCTTTTCGCTCCATTTTGATTATGTTTAATTACTTTTATTTTACAATAATACAATCAAATAATTTTTAAACTTACAAACTAATGAAAC GAGAGATAATCTAATTATTTAACTTCTTTTGTTAAGATCCATCATATAATAAAACAGTTTTATAAATTAAAACAAAAGTATTTACTGAGTTCATTTATTTATAGTACGGTAAAAGTACGG GTTAAATGGGTTGAATTTATAAACGTGCACAACACTTGTATTTCTTCTCGTCGTTGACATCAACCCTAACTCGGATATACTTAAAATCATGCAATTTGAGCATGACATGGTTAACACATT TATTAAATAGGGTGCAAACAACGAGCCGAGTCCGAGCTCGACTGGACTCAAGCTCAAGCCCGTTTAACTTATTTGAGCTCGAGCTCGGTTCGATTCGAACTTTTTTTACAAGGCTCGAGC TCGGCTCATAGATAGTTTTTCAACCTCGGGCTCGGCTCGTTTATTATTTATTAATTAATTTATATTAACTATAATTAACCTTTTATATATAATTAAGTTATTTATTTCATAATTTTATAA ATAGTAATTATTACTATTTAAAATATATATTTAATATATTATAATGTTATATAAACAATGGGCTCGTTTATGCTTGCGACCCGGCAGAGCTCGGTCTCGTTTCCTAAACGAGTTTGTTTC TAGGCCCCAGCTCGGGTTCATTTAAGCTCGGCTTATTTCGAGCATTTTTTCGAGCCGAACTCGAGTAGCTCACAAGTAGCTCGGCTCGTTTGCACCCCTATTAATTAACAAGTAAAACGG GTTGGCAGGTTGTAAATGATGTGTAATCAAGTTTATGCATGTGTTAAGTCATAAACGGGTTTACTAGATGTAATAAATGGGTTAATTGAGTCGTCAATGAGTTGGTGGGTTGACCTTATA TAACATGGATTTAATTTTTATTATAAATTTAAATAAGTTGAAGTGTTAATTAAACGAGTTAAAAATGTTAACCCGGACATGATCTATTTACTAAATACCACTTGTTATTACAAAGGATAT GAATAATAACTAACTAATAACCTGATTATTTGTGTATCATGTCAATAATTTACGACTTGCACTCAAACAAGGTTTATAACGAAATGACCACATGTTCGTTATAGCCACTGTGTAGGTTTA TAACGAAACGCGACCACATGTCCGGTATAGTTTGTTCGCTACATTGTAAGAGTGTAGCGAACACCCTTCATACTTCTAATGTAACAAACACTACACATAAAAATGTCTTAAAAACATATA TCACGCAAACATGCACAAACACATACAAAGTGTCAAATAGTTTACATAAACTAACATAGTTTTTGTATATTATGTTGTTTATTAGACTGGTGGTCCAAAGTACAACGTTCCTCTAGGTCG AAGAGATGGACTCACATTTGCCACAAGAAACGCAACCCTTTCCAATCTTCCATCACCATTCGTCCCAGTCGACAAGCTACTCCCCGACTTCGCAGCCAGAAACTTCGACGCCACTGATGT CGTGGCCCTATCCGGGGCCCACACCATCGGTGTCGCCCATTGCACATCCTTCACACAACGCCTTTACCCTACACAGGACACAACCATGGACAAAACCTTTGCCAGCACCCTCAAGCGCGT ATGCCCAACCGCCACCACCAATGCCACCACGTCCTTAGACGTTCGCTCTCCAAACACGTTCGACAACAAGTACTTTGTCGACCTCATGAACAAACAAGGCGTTCTGACACCGGACCAAGA CTTGTACACCGACAAACGGACACGAAGCATTGTCACTAGCTTTGCGGTTAATCAAACATTGTTTTTCGAGAAATTCGTCAACGCTATGGTAAAAATGAGCCAAATGCAAGTGCTGACCGG CACACAAGGGGAGATTCGCAACAATTGTTCCAGGCGAAACGCAAACACATACGACCCGCTCATATCGACTGTCGTCGGTGACGCTGACGTGGACAGCGCACAAAGCTTCTAA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGGTGGTTCTAAAATGACATTAGTGCCCTCTCACACTGTTAAACTGACTTTGGGTGTGTTGGTAGTAGTGATGTTAATGCATTTGAAGTGTTTAGAAGCACAACAACAGCAGTTAGTG GAGGGGCTTTCTTGGAAATTCTATGAAAGTAAGTGTCCAAAGTTGGAATCAATTATTAGAAAGCAAATGGTGAAGGTGATCAAGAAGGATGTTGGTCTTGCTGCTGCTCTTTTGAGACTT CATTTCCATGATTGCTTTGTTCAGGGTTGCGATGGCTCGGTGCTATTGGATGGATCAGCAAGCGGCCCGGCTGATAGTGAGAAAACCGCACCACCAAACCTACGTTTGAGGGGGTTCGAT GTCATCGAGGATCTTCGTCGTAGGGTTCACAAACAATGTGGTGCGGGTAGTGTCTCGTGTTCGGATATCACTGCCATTGTTGCACGGGACACAATTGTCTTGACTGGTGGTCCAAAGTAC AACGTTCCTCTAGGTCGAAGAGATGGACTCACATTTGCCACAAGAAACGCAACCCTTTCCAATCTTCCATCACCATTCGTCCCAGTCGACAAGCTACTCCCCGACTTCGCAGCCAGAAAC TTCGACGCCACTGATGTCGTGGCCCTATCCGGGGCCCACACCATCGGTGTCGCCCATTGCACATCCTTCACACAACGCCTTTACCCTACACAGGACACAACCATGGACAAAACCTTTGCC AGCACCCTCAAGCGCGTATGCCCAACCGCCACCACCAATGCCACCACGTCCTTAGACGTTCGCTCTCCAAACACGTTCGACAACAAGTACTTTGTCGACCTCATGAACAAACAAGGCGTT CTGACACCGGACCAAGACTTGTACACCGACAAACGGACACGAAGCATTGTCACTAGCTTTGCGGTTAATCAAACATTGTTTTTCGAGAAATTCGTCAACGCTATGGTAAAAATGAGCCAA ATGCAAGTGCTGACCGGCACACAAGGGGAGATTCGCAACAATTGTTCCAGGCGAAACGCAAACACATACGACCCGCTCATATCGACTGTCGTCGGTGACGCTGACGTGGACAGCGCACAA AGCTTCTAA |
Retrieve as FASTA
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
CATAGTGTTA AGCAATGGGT GGTTCTAAAA TGACATTAGT GCCCTCTCAC ACTGTTAAAC TGACTTTGGG TGTGTTGGTA GTAGTGATGT TAATGCATTT GAAGTGTTTA GAAGCACAAC
AACAGCAGTT AGTGGAGGGG CTTTCTTGGA AATTCTATGA AAGTAAGTGT CCAAAGTTGG AATCAATTAT TAGAAAGCAA ATGGTGAAGG TGATCAAGAA GGATGTTGGT CTTGCTGCTG
CTCTTTTGAG ACTTCATTTC CATGATTGCT TTGTTCAGGG TTGCGATGGC TCGGTGCTAT TGGATGGATC AGCAAGCGGC CCGGCTGATA GTGAGAAAAC CGCACCACCA AACCTACGTT
TGAGGGGGTT CGATGTCATC GAGGATCTTC GTCGTAGGGT TCACAAACAA TGTGGTGCGG GTAGTGTCTC GTGTTCGGAT ATCACTGCCA TTGTTGCACG GGACACAATT GTCTTGACTG
GTGGTCCAAA GTACAACGTT CCTCTAGGTC GAAGAGATGG ACTCACATTT GCCACAAGAA ACGCAACCCT TTCCAATCTT CCATCACCAT TCGTCCCAGT CGACAAGCTA CTCCCCGACT
TCGCAGCCAG AAACTTCGAC GCCACTGATG TCGTGGCCCT ATCCGGGGCC CACACCATCG GTGTCGCCCA TTGCACATCC TTCACACAAC GCCTTTACCC TACACAGGAC ACAACCATGG
ACAAAACCTT TGCCAGCACC CTCAAGCGCG TATGCCCAAC CGCCACCACC AATGCCACCA CGTCCTTAGA CGTTCGCTCT CCAAACACGT TCGACAACAA GTACTTTGTC GACCTCATGA
ACAAACAAGG CGTTCTGACA CCGGACCAAG ACTTGTACAC CGACAAACGG ACACGAAGCA TTGTCACTAG CTTTGCGGTT AATCAAACAT TGTTTTTCGA GAAATTCGTC AACGCTATGG
TAAAAATGAG CCAAATGCAA GTGCTGACCG GCACACAAGG GGAGATTCGC AACAATTGTT CCAGGCGAAA CGCAAACACA TACGACCCGC TCATATCGAC TGTCGTCGGT GACGCTGACG
TGGACAGCGC ACAAAGCTTC TAACGCTTTC AACTTTGAAC CAATAAATAT ATCGTTAGAA TGTTTTATGA TAATATGATG TACTGGCACT TGATGGAAAC TAATAACGGG TGGAATCGTA
TGTGATATAT AACGTTAACT TT
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Retrieve as FASTA
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