Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
204 |
PWM (Da): |
22882.71 |
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PI (pH): |
5.55 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MIDLKPPPYALDALEPHMSKETLEYHWGKHHRGYVNNLNKQIEGTELHEKSLESIILASYNKGDILPAFNNAAQVWNHEFFWESMKPGGGGKPSGELLELIIRDFGSFEALIQEFKLGAA THFGSGWTWLVYDIEHKKLAVLKTSNAINPLVLDYYPLLTLDVWENLRPDYIATFLDKLVSWDAASSRLDAAKVSIEGKKDGG |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic and EST. Shorter 5' but confirmed with EST. |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGATCGATTTGAAGCCACCTCCTTATGCATTGGTACGATAAATATATATAACTCAAAACTATACTATAACTTAAATAATCTATATATATATATATATATATATATATATAGGGGAAAGA TAAATCGAAAACCCATGTGAGTTGAGAAAACCCTATGTAACATTTTTATTTTTTTTTAAAAAAAAATAGGAAATGTAATATAAATGTACACGGACCTATTTATGAAAAAAAAAATGAAAA AAACGCTTACTATTTTTTAAAAAAAAAATGTTGAAAATTTATATGTTACATTTTTTTTGGACATACATATTATGTAACCTGAAATTTTGTAACATTTTAAAAAAAAAAAACTACTTGGTG TTTTTTTGTGTTTCTTTTTTTAAAATGTTCAAATATATGTATATTACATTTCCTATTTTTTTTAGAAATGTATCTTGAGTTTACATGGTTTTTTTACAAAGGTTTTCTGAGTTTTCTCAA CTCAAGTGGGTTTTCGATTTATCCTTCCCCTATATATATATATATACTAGATTATTAGACCCGTGTACTACACGGGTTTAAGGATATAAATTTATAAATTATTTAAATTTATATTCTCTT CAAAAATTTACATAAGTGAATTTTTTACCATAGATAACGCAATAATTGGTCATGTGTAAAACCAATTCTTTGAGAAACACACCAACTTTACTTAGAGCATCCACAATAAGGCACTATTTA GATGTTTTTAGGGAGGGAGAAAGTGATGTGGAGGAGAGAGGGTGTGAAGTGGAGGAGAGAGGATGTGAAGATGTTTGTGAGGAAAAATGAGAAAAAATAGATGAGTGTGAGTTATGTGAG TGTAGTGAGGAGAGAGGAGAGAGGAGAGAGAGAGAGAAAATGTGTTTGTGAGAGGGGCAAGTGAGAGAAAGAATATGATTGGTTGGGCATGTGCCAACTAGGCACCCTAAAGAATGAAAA AAAATGCCCCTTATTGGAGATGCTCTTAGAAATTGTTCTATACTTTTATTTATCGTCATGACAAAACATAAAGCGAGAGAAAACTGTCTTTTTTTTTCAATTTAAATGGAATCCTTCTAT TTCGCGGTATTAAACGAAATCTAGGGATAAACGTTCAAGTGCAAGTATTAGTTCCGGATAATATGAGTGTCTCAATAACCTGGTCACCCAGTGATAGAACCTGTAGTCGAGTTCCATTAC ATAAACCATTTTTTTGATCAATATTTTTGATAACGTCACTGGAACACTGAACTTTGGTAATTATCAATGGTTTGGCAAGCTTAAAAATATAACTCCATTTAGGACATCCGGTGAGTAAGA CTTGCTTCAAAATTATTATGAAGATATTCTATCCTTAAACCCGTTTATTACACGAGTCTAATAACATTAAAAGTGTTTTCAAAGCACGAAAGTAAACCGGTTTTCAAATATCGGATTAAC CCATTCTTTACCATTCTTATTATTATTATAATATAAAATTATAATTTATTTAATATATGTTTTAAACATATAGTAAAAAAAATCATTTTAAAGAATAAGAAGATGTTATCACATTGACAT TATTTGAAATTGTTTATTATATAATTTATTTAATAGATGTTTTAAACATATAGTAAAAAAATCATTTTAAAGAATAAGAAGATGTTATCACATTGACATTATTTGAAATTGTTTATTATA AGTAGAGTTACTAATAATTAACTATATATATTAGATAAGTCAAAAGTAAATAATCATTATCCATTTGTTAGTATTAAGTTCTTAAGGATTTTTTTATTGTTTTGTATTAATTAATTATTA ATTAATTAGTAATAATAGTAGTAGTAAATTGAATGAAAGAATGCCATGTGGCATTAAGTTGCTCTTGTTTTAGTATAAGAATGCCATGTGGCATTAATCATACTTTTTTATTAGTATTAG ATATATATGGGAAGGTTCATTTGAGAAGAAAATTTAATTGAGAAGAAAAAGAACAAAGGGCAATTTTGTAAAACATTAAGTAGTTTTTCACTTATCTCATTTATTATCATTTTTTACTAA TTAATTAGTCATAAAGATTATTATCTTCCACACTAACTTTTTTTGCCTACACACATCAAAAAGTTGTCCTACATATTTCGAAATTCATCCTACACGTTGAAATTTATCTTACACAACTCG TAATTTATTCTAAACAACTTCTAATTTATCCTACACTTTAAATTATTTTATTTTATTTTTTTGAAAAAATATATACTTTGAAGATAAGTTACAAAAAAATTTAATGTATTAGCTATTAAA GAGGAAGACTACAAATTAATGACCTATGTAGATTTACCAATGTAACCTTATAGTAACATTAAATACTTATATTAAATGAAGTAAAATAAAGCATTCTTATTGGTTGAAATTTGTTCTTTT TTCTTCTTACAAAAAATTTCTTCTCATTTGAACTCTCCACTATATATATATATATATATATATATAGGGTAGGGTTCCAGCGTGAACCTAATCCCATGCGTGAACTGCGTGAACTAATCT GGACCATTGATTTCCTTTTTAGTTGTTAAAGGTATGATTGTAATTATATAAAAAATTAGATTTAAATCATTATTTTAATAATTGAATTAAGTTACATCTTTCCTAATTTAAATTCATTAT CCACATTATCTTTTATTTCATTTTTATTTTTTAGATTTCACCACCAGAATTCGGATTATGATTTTTAAGATTCACGTAACCTTCAGATTTCAACAGTATACACATGTGTACTTTGATATG AATTGAACAGTACACATGTGTACTCAGCATGGTACATATGTGTAATTAGCTACATAATAGATACATATAAACAAAACTTGTAAACTATTTTATATTAAGCAAATAACAATTTCCATAATG TTTGCCAAACCAAAAAAAACATACAATTACAAGTTCCAGTTTCGTGAAAAAAATAAACGCAACATAGTCGGAAAAATAAAAAAGACATAGTCTTTTACAACTATTCGTCGCGTTGTATGC TGAAACATCCTTATCGACCAAGCAAACAAACATACGTGAATCATCCTTATCGACCTCATACGTGAATCATCCTTATCGACCTTCCATCTCCACTTTCCTCGTTTACGACGTCTCCTATAA TAACACAAAAAACTCAGCAATTAGTACTTTGCATAATTCACAAGTGTACATCAACAACTTTACATATTTAATACACAAAAAAATATGAGATATCACAAAACATACGCTATACACATATGT ACATCGCATTAAAATCAGAGCAAAATCAGAATACACATGTGTACATCGCATTAAAAACAGAGAAAAATCAGAATACACATGTGTACAACGCGTTAAAAACAGAGCAAAATCAAAAAATTG AACAAAAAACTGGGACATCACAAAAACAGACGCTATACACATGTGTACATCGCATAAAAACATAACAAAATCAGAATACACATGTGTACATCGCATTACAAACAAAGCAAAATCAAAAAA AGTGAACTCCAACAAAACTAAACAACTTTCTGATATCATTTTCAAACTAATACAAATTAAACACATTCCTATCGATTCGAATGTCACCAAAACCCTAATTCCGTAAAACAAACTGAATCT AAAAGAAAAAAAGCAACGTATTACGCATCAGTTCAATACAGAAAACACTACAACGTGAATCGTAACAATAATATATACGATTACATCTAAACTAATTGGAATTAAAGAGTTCAAAATTGA ATCATAAAGTGAGTGCTTACGAAGAAAGGAGATACTTAGGTCTGAAACTCGGAAGAAATACGGAGACCGAAACCTCACAGCGGAGTGTCTAGTGCAGATCGTCGACGACGAATGGTGGAT GCAGTAGGGATGGATGGAGTCGGACGGTGCTGATCGGAGGTATGAATCAATCGTTGTTTCGTCGGACGGGATTTACGCAGATCGGAGGGATTTATACTGTTTCGCCGGACAGGATTTATG CTGTTTCGTCGGACAGGATTTATGCACTCATCTTGCCGCCGCCATGAATTTTCCGGCGATTTGCTTGATCTGACAGTGTTCCTCTTGTTTCCTTTGCCGTCGCCAATGAAGGTTAGAGAG AAAGAAGTTCTGTGATTTTGATTAAGAGGGAATAAAGAAAATTGATAAACTAAACTGTAGCTATTTATGGGATTTAGGCTATGGAATAATATGGAAACTATTCAGTTTCCGAATTTTAAA ATTTTTTTAATCAAAATTAATTCCATATCATTAAATTACTAATTAATGTAATTACACTTTTACCCTTTTCTATTTAATAAAATGCTAAAATATAACCAAATAATTACAATCATGCCACTC ATTTAAAATCTCAAGATCATAAAAATCAATGGTCCAGATCAGTTCACGCAGTTCACGCATGTGATTTTGTTCACGTTTGAACCTAATCCATATATATATATATATATATAGGTAGAGGAT CCTGTACATTAATCCAGAAGTGTGAGAAATGCATTATAGCACTATATAACACCATATAACAATATGTAACACCATATAACATTATGTAACACTATATAACACTATATAACAAATATAACA CTATAGTTTGTCTGATAGCATGTCTATGATAGATGTATAGTGTTATATATTGTTATATAGTGTCATATAGTGTTACATAGTGTTATATGGTGTTTATATGGTGTTACATAGTGTTATATG GTGTTATATAGTGTTATATATAGTGTTATAATACACTTCTCACACTTCTGAATTAATGTACACTATCCCTACCCTATACACATATATATATATATAGATATATATATATATTGCATTTTA GTCTTCATATATATAGGCATGTCCAAACTTGCTAATCATGATTCAAAAATAAGCACCACCGGTTAAGACTGCTAGAATTTAGCCGACACATAAAACCTTTGAGCTTTTAGCTGCCAACTA GGATTTAGCCTCCGCTTTAACCCCGACTAGAATTTAGCCTCCATTTTATCCGTGAGCTAGAATTTAGCCGCCTGCTTTTTATTTACCGGTTAGGATTTAGCCCCCGCTTTTTATCCGCCA ACTAGGATTTTAGCTCACGCATTTTATCCTCCATCTAAATTTAACTCACGCTTTACACGTGTATTATTTTGATTGCTTTTTTTACTACTTTTCAAGGTTCTTGTGCTGGCTAATTTCTAA TCGTCTCAGCCGGCAATGCTTATTTGTCGAATATTGATTGGTTGGTTTAGACATGTCTATTTTTATGAAGGCTAAACGCAGTGTTTATTTTGTTAATTTTGTCAGTCAAAAATGTCCATA TTGTTAAGTTTTCCATAATTTAATTACTAGGAGATGCTCTTGAACCACACATGAGCAAAGAGACATTGGAATATCATTGGGGAAAACACCACAGAGGTTATGTCAACAATCTAAACAAGC AGATTGAGGGAACTGAACTACATGAAAAGTCATTAGAAAGCATAATATTAGCTTCATATAATAAAGGCGATATTCTTCCCGCCTTCAACAATGCTGCACAGGTTTGGAACCATGAATTCT TCTGGGAATCTATGAAACCTGGTGGTGGTGGAAAGCCTTCCGGAGAACTTTTAGAATTAATAATCCGAGATTTCGGTTCGTTTGAAGCGCTAATTCAAGAGTTTAAGTTAGGTGCCGCTA CTCACTTTGGTTCTGGATGGACTTGGCTTGTATGTAAGTGTTGTGTTTGTTCCACCAAGATCCATGACCAAACAATTTGAAACAACATTGATCCATTAATTTTTAAAAGTCTTTGTTTAT GTGTAGATATGACATAGAGCACAAGAAGCTTGCTGTGTTGAAGACCTCAAATGCAATTAATCCTCTGGTGTTGGATTACTATGTGAGTAAACAATAATATTATTTTCTTTTTGTTATATT GGTATTAAATTAATCATTAATTCTTGTATTAACCTTTGTATTATATCTCTTGCATATGTTTGTCATATTGGGGAGGGTTTATTTTAGAACCGCTTTTATTGCGAGAACCACGAGAACCAA TGTGAACACAACAAAATAAAAAGGGAAAATTACCAAAATGTTGGTTGACTAAGAGGGTTTTCAATTTTGTCACTCTCCTGCGTCATTGGAAGGACCACTGAGCATGGGATGAGTCGGCAT ATCATGTTGAAGAGTCCATGTATCACGCTTCTTCAGAAGAGTCCACCGACGCTTCGGAAGAGTCACCGACGCTTCGGAAGAGTCCACCGACGCTTCGGAAGAGTCACCGACTCTTCCCAT AAATATGTGGGACACGTGTCAGCTTCTAGGGACATGGACGCATCAACATAACATGCGGACTCTTCCGAAGCTTAGTGGTCCTTCCAAGGACGCAGGAGAGTGACAAAATTGAAAACCCTT TTGGTCAACCAACAGTTTCGTAATTTTCCCAAATAAAAACCCACTCACAACCACCCAAAACCTAAACACCCCCCCCCCCTGGCGGCTAAAAAAAAAAAAAACTATACCTCACCCAAAAAC TTATACGAGTTGTGAGAATTTAAAGAACTCGGTCTTACGAAAGGTTTTTTCAAAAGTAGTGATAAGGTGGCAATGTTTTTCACTTTTAAGTGTTAAAAAATGGGTGTTTTTCTTATATGC GCTAGCTAGGCATGCTTTTTAAAGTTTTTAGGTTTTGTTATTCTGGATGACTTAATTGGGCTACTTGCTTGGCGTAACATAAGCTATTGAGTAGTGTATATATATATGATATATTTATAA TTATAATCTAACAATTGGTTTCTTTTTCTTGGACTTGCCAGCCCCGCTCCTCACCTTAGATGTTTGGGAGGTAGTTATATCTCTTCGCTTACATTTTCCACAATAAATAAACAATGTCCA TGATATATTCACTAACTTCAATTTGAAACTGAATTGTGATTGCAGCATGCATACTACCTGGATTTTAAGGCAAGAACTTGCTACTTTCTTCCAGATCGATGCACATATTTATCGGGGTGT TTGGATATTTGCGCTATAAAACTGATTAATCGGTTACATATCTGCAAGACAAAAATTATTATTTAAGAAATATTAACATCATTAATTTATCCACATTTTCATTGAAATAATACTTCCAAC ATAATTAATATGTAAGAATTATCTAAGCTAAAAATCATTTTCAATTCAATCTCTAAAAAAATACTTAGGTTTATTAGAAGAAGTCTTGAGTTTGAATACTTCAACAACAGATAAAAAAAA TCCATTTTAGTCATTTTATCTATTACTTCACTTAAGAAAAACTAGAACTATCACAGCTTCAAAAGGTTTGAAGCACATCAAATCGGTATCATATCATATTATTTACTATTTAGCATCAAT AATGAGTTTCAAAATGCATGTCCAAACACCCTCATTCACCATATGTATAAACAAAGTGACCCTTTAGCCTATCTAATGCTTGATTAGTGTCACAATAATGGTATTAAAATTAAAAGTCTA TTGCAGAAAACCTCAGGCCCGATTATATAGCTACTTTCCTCGATAAGCTTGTATCATGGGATGCGGCAAGTTCCAGACTCGATGCAGCCAAGGTTAGCATTGAGGGAAAGAAAGATGGAG GCAAT |
Retrieve as FASTA
|
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGATCGATTTGAAGCCACCTCCTTATGCATTGGATGCTCTTGAACCACACATGAGCAAAGAGACATTGGAATATCATTGGGGAAAACACCACAGAGGTTATGTCAACAATCTAAACAAG CAGATTGAGGGAACTGAACTACATGAAAAGTCATTAGAAAGCATAATATTAGCTTCATATAATAAAGGCGATATTCTTCCCGCCTTCAACAATGCTGCACAGGTTTGGAACCATGAATTC TTCTGGGAATCTATGAAACCTGGTGGTGGTGGAAAGCCTTCCGGAGAACTTTTAGAATTAATAATCCGAGATTTCGGTTCGTTTGAAGCGCTAATTCAAGAGTTTAAGTTAGGTGCCGCT ACTCACTTTGGTTCTGGATGGACTTGGCTTGTATATGACATAGAGCACAAGAAGCTTGCTGTGTTGAAGACCTCAAATGCAATTAATCCTCTGGTGTTGGATTACTATCCGCTCCTCACC TTAGATGTTTGGGAGAACCTCAGGCCCGATTATATAGCTACTTTCCTCGATAAGCTTGTATCATGGGATGCGGCAAGTTCCAGACTCGATGCAGCCAAGGTTAGCATTGAGGGAAAGAAA GATGGAGGCAAT |
Retrieve as FASTA
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
TCCAACTTAA CACAACTTAT AATCATCCTA TTTCTACTGC AGAGAGTCTG CCTCCAATCT AAACCGTCAG GCTAGAAAAT CTGCTTCTGG AGCCATGATC GATTTGAAGC CACCTCCTTA
TGCATTGGAT GCTCTTGAAC CACACATGAG CAAAGAGACA TTGGAATATC ATTGGGGAAA ACACCACAGA GGTTATGTCA ACAATCTAAA CAAGCAGATT GAGGGAACTG AACTACATGA
AAAGTCATTA GAAAGCATAA TATTAGCTTC ATATAATAAA GGCGATATTC TTCCCGCCTT CAACAATGCT GCACAGGTTT GGAACCATGA ATTCTTCTGG GAATCTATGA AACCTGGTGG
TGGTGGAAAG CCTTCCGGAG AACTTTTAGA ATTAATAATC CGAGATTTCG GTTCGTTTGA AGCGCTAATT CAAGAGTTTA AGTTAGGTGC CGCTACTCAC TTTGGTTCTG GATGGACTTG
GCTTGTATAT GACATAGAGC ACAAGAAGCT TGCTGTGTTG AAGACCTCAA ATGCAATTAA TCCTCTGGTG TTGGATTACT ATCCGCTCCT CACCTTAGAT GTTTGGGAGC ATGCATACTA
CCTGGATTTT AAGAACCTCA GGCCCGATTA TATAGCTACT TTCCTCGATA AGCTTGTATC ATGGGATGCG GCAAGTTCCA GACTCGATGC AGCCAAGGTT AGCATTGAGG GAAAGAAAGA
TGGAGGCAAT TGATGTAATG CGTAAACACG CCACAATAAA ACCTATCACT ACACCCTTTG GTCGCCACAA TAAAACCTAC ACTACACCCT TTGGTCTTCT TCGCATTCCC TCATTATGGT
TAAGTATTTA TGATGTGTCT TCTTGGTTTG GTTTGCTTGT TTGATCTTCT AGCATTCGTA TTGAGTTGGG TTGGTCCGAA AATAACACAT GGACATTCAA AGTATTATTT CTTGTACTTT
TATATTTGGT GTGAGATCTC CCTGGTTTGA ATCGAACAAT AAACATAAAT CTTAGAAGGT AAATCTCATG AATAACAAAC AAAATACAGA AATATATCAT TGTAGATTTA GCATCAACCC
CCATGGATTA TCCATGGGGT ATTACATCAA AGATCCATTA AGAAGATACT ATCAGATACA CACCTCCAAA TGATGGTCGC T
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Retrieve as FASTA
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