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Entry information : HaRboh03 (HanXRQChr05g0133941)
Entry ID 13779
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaRboh03 (HanXRQChr05g0133941)
Name (synonym) HaRboh03 (HanXRQChr05g0133941)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaRboh03
start..stop		 S start..stop
HaRboh06 1059 0 40..813 26..827
EgrRboh06 1035 0 1..813 12..857
EglRboh06 1034 0 1..813 12..857
EguRboh06 1031 0 1..813 12..857
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '13779' 'join(25387589..25387937,25388009..25388171,25388246..25388294,25388580..25388693,25388755..25389558,25389690..25389779,25389865..25389980,25390071..25390173,25391030..25391103,25391193..25391340,25391593..25391706,25392574..25392702,25392796..25392874,25393514..25393623)' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 25387589..25387937 347 N° 2 25388009..25388171 161 N° 3 25388246..25388294 47 N° 4 25388580..25388693 112
N° 5 25388755..25389558 802 N° 6 25389690..25389779 88 N° 7 25389865..25389980 114 N° 8 25390071..25390173 101
N° 9 25391030..25391103 72 N° 10 25391193..25391340 146 N° 11 25391593..25391706 112 N° 12 25392574..25392702 127
N° 13 25392796..25392874 77 N° 14 25393514..25393623 108  
join(25387589..25387937,25388009..25388171,25388246..25388294,25388580..25388693 ,25388755..25389558,25389690..25389779,25389865..25389980,25390071..25390173,253 91030..25391103,25391193..25391340,25391593..25391706,25392574..25392702,2539279 6..25392874,25393514..25393623)


exon

Literature and cross-references HaRboh03 (HanXRQChr05g0133941)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr05 (25387589..25393623)
Cluster/Prediction ref. HanXRQ:   HanXRQChr05g0133941
Protein sequence: HaRboh03 (HanXRQChr05g0133941)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   813
PWM (Da):   %s   93172.66 Transmb domain:   %s   o366-388i415-437o468-490i641-660o
PI (pH):   %s   9.1
Sequence
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Send to Peroxiscan
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Remarks
DNA ►
Send to BLAST
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ATGGAACACGATGGAAGTGCGGCTTTCTCTATAGACCGGTCAAGTGTGGCTTTCTCTATAGACCAGTCAAGCCGAACATTTCTGAAAGAGGAAGTGAGCTTGTCAGTCACAGGCAGACTA
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ATCGGGACTCGAGCACTGGAAAGTGTTTTGGGTATTATTTCTATATTTGGAAATGAACGTTGCGCTGTTTATGTGGAAATTCCACCAATATTCGTTGATGCCGTCGTTCCAAGTTTTGGG
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TCCTTACAACTGACCATACAATGCTTGTTGACACCATTAAGAGGTGACCCAACGATGCCATTGTTATTATCTGTTTATCGTTATAAAAATAAAATTCTTGATTATCAGTTTGTGGTATGA
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TATGATGCCTATCATAGTAAACCATATATATATATAGAGAGAGGGTAAGTTTCATAAGAAAACTACCCTTCGTGGGAAATACTACATATGTGCGGTACTAATACATATGTAGTAACCACC
ACAAGTGGCCTAGTGGTGGAGTGACTTGGGTTCTCCAATGGAGACCCAAGTTCAATTCCCATTAGTGCCACTTTGGTGGCCACCGACACCCGCTTTAAAGCCGGACCGAGGACACTCGAG
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AAAGGCATCAAAGACGAAAATATTACAAATAATAGAGTTTGCCCACAACTCAACCCATTTGACATGTACCCAGTTTACATTAATTTTCCAATTTGACCCGTGTATGGTAATGCACATCCC
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TATCTACTTACTTAGAACCAACTTTCTTAGATAGGTTAAGCCTGTTTGTTCTAATTATTAGACTATATTATTATGCGCCCACGAGCTCAGTTAGGTTTCTAAGGTTACTCGTATTCTCTG
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GTGTATGAGCATGGTGATATGAGATCTACACTTATATCCATGGTGCAGACTCTGCAACATGCCAAAGATGGAGTCGATGTCGTCTCTCAAAGTCGGGGGTATAAACTTTCTTAAAATATA
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TGGCAACTACACATGAAGGTCGTAGGATAGAGGTAAGACATCACTCATTACTACATTGGGTTTTCTTGTGATTAAAGGTGGCAATCCGGGCTCGTTTACTGGTAAATAGATTAATTTGGG
TTGTGTTTATTCTCAACTGGATCTAGTAAAAAAAAGCTAAAGGAGAACAAGCCAAAGATGCTAAAATCACACAAAGTCTATTATTATTATTATCACTTACAACCTCTTAAATCGTTGTAT
TCAAACTTTAGACTATTACTCCATCTGTCTCAAAATTATCGTCCGCGTGACTATTTTTGTTTGTCCCCAAAGAAATGTTCACTTTTGAAAAATGGATAGTCAAAAATACTATTTTCGCCA
CGGGTAAAATCAGCATTCTACACGCTAAAAATTGTACGCCTTTATCATTGATACAAGTTTTTCAAATCAATTACGTCTTAAATGCATGGGCATTCTACAAACTAAGTGTTATACATGAAG
CCAAAGGTTTTTTTGTTGGTGCACAATTAAGCTGGACAAAGGGAGTATTGTAATAAAATTGTTTCTGTAGTCATAATTAACGGGTTCACTATTCATATATAAATGGACATAAAGCGACGT
AACCACACACATTTGCCCGCTACCAAAAATGATCCGGTTTAAGTTAAACCTTGGTTTCCAATGAACTGCAGGTGTTTTCTACTGTGGAGCCCAAGCACTCGTAAGACAATTAAAAAAGCT
CTGCAAAGAATTTAGCCGTCAAAACATTACTCGCTTTGATTTCCACAAGGAGAATTTCTAA

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CDS►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGAACACGATGGAAGTGCGGCTTTCTCTATAGACCGGTCAAGTGTGGCTTTCTCTATAGACCAGTCAAGCCGAACATTTCTGAAAGAGGAAGTGAGCTTGTCAGTCACAGGCAGACTA
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ATTAATTTCCACAAGATAATCGCGCTCGCAATCGCGATAGGAACAGTAGTTCACACCGTTGCGCACATGGCCTGCAATTTTATAAGGTTGTCAAGATGTCCTTTGAACAAATTCAAGGCC
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TCTTTTAGGAGAAACGTTGTTAAGTTGCCTCACCCGTTCAACGATTTAGCCGGTTTTACTTCCTTTTGGTACACTCATCATCTGTTGATCATCGTTTACTTTTTATTCATCGTTCATGGC
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GAATGGCATCCTTTTACCATCACTTCTGCGCCTGGAGATGATTATCTAAGTGTACATATTCGTACTCTGGGAGACTGGACGAAAGCACTACGGGAAGAATTTGCAAAGGCCTGTGAGCCG
AATGGAAATCTAGCCCGAATGGAAACTAATTCGAACTTGACCATTCAGGAATCACAAGCAATCTATCCTAGAATCTACATCAAAGGACCATATGGCGCACCTGCACAAAACTACCGGAAA
TACAATGTCCTATTACTTATCGGTTTGGGTATTGGAGCCACCCCGTTTATCAGCATATTAAATGACCTCTTACATCACCTAAAAAAGTCGAAATCCGGCGAGATCCTGGATAAAAGAGCT
TACTTTTATTGGGTAACAAGGGAGCAGGGTTCATTCGAATGGTTCAAAGGTGTAATGGATGATATCGCAGAACATGATCACGAGAACATTATTGAAATGCATAACTACCTCACAAGTGTG
TATGAGCATGGTGATATGAGATCTACACTTATATCCATGGTGCAGACTCTGCAACATGCCAAAGATGGAGTCGATGTCGTCTCTCAAAGTCGGATTAAAACGCATTTTGCAAGACCAAAT
TGGAGAAAAGTATTCTACAACTTGGCAACTACACATGAAGGTCGTAGGATAGGTGTTTTCTACTGTGGAGCCCAAGCACTCGTAAGACAATTAAAAAAGCTCTGCAAAGAATTTAGCCGT
CAAAACATTACTCGCTTTGATTTCCACAAGGAGAATTTCTAA

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cDNA►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
TGACTATCTA CCATTCATTC ATGTCCATAA ACATTTCTCA CTCAGTTTAA CCAAAAGAAT TCTTACAACA TATGTCCACA AAAGTATAAT GAAACAATCA TTCTTCTTTG AAATCTAAAA  GATATACTAA AGATGGAACA CGATGGAAGT GCGGCTTTCT CTATAGACCG GTCAAGTGTG GCTTTCTCTA TAGACCAGTC AAGCCGAACA TTTCTGAAAG AGGAAGTGAG CTTGTCAGTC  ACAGGCAGAC TAAGCAGGAA ATCTAGCAGG TTAGGTTCTA GCCGACAGAG ACTCCCGCCT AATGACGAGT CAAGGATGGT AAGGCAAAGA TCAAGTGCGG CTAGAGGGCT TGATGGCTTG  CGGTTTGTTG ATAGAGTTGT GACCGGGAAA GAGGGGGACG CGTGGATGGC TATTGAGAAA CGTTTTCAAC AATTTTCAGT AGATGGAAAG CTGCCTAGAG AAAAATTTGG AATATGTATT  GGAATGGGCA ACAGTGGCGA GTTCACAGGG GAACTGTTCG ATGCACTTGC GAGGCGGAAG AGGATTGATG GATCTAAAGG GATCACATTA GAGCAAGTAA AAGTATTCTG GGAAGATTTG  TCGAATGAGG ACCTTGATAC CCGAATTCAT ATTTTCTTCG ATATGTGTGA CAAGAATGGA GACGGGTTGC TAACTGAGGA AGAAGTAAAA GAGGTCCTGA TAATGAGTGC ATCAGCCAAC  AAGCTTTCAA ATTTCAAGAA ACAAGCCGGT ACATATGCAG CTCTAATCAT GGAAAGACTC GACCCTGATG ACTACGGTTA CATAGAGATG TGGCAACTCG AGACGTTGTT GAAAAGTATG  GCGACACCAA AGGAAGCTAC CATGAACCCT GAAGACACAA ACGATCTAGC CAAAACAATG ATCCCAGAAC TTTACAGGAA CCCGTGGAGA AAATTCATGA CAAGAGTGTT TGAATCGGGA  CTCGAGCACT GGAAAGTGTT TTGGGTATTA TTTCTATATT TGGAAATGAA CGTTGCGCTG TTTATGTGGA AATTCCACCA ATATTCGTTG ATGCCGTCGT TCCAAGTTTT GGGGTATTGT  AGTTGCACAG CGAAAGGTTC CGGAGAGACT CTAAAGTTTA ATATGGCTCT CATTCTCCTT CCTGTATGCC GAAGAACACT TACAGCCATT AGAGAAACTT TCCTTGGGAA AGTATTACCT  GTGGATGAGA ACATTAATTT CCACAAGATA ATCGCGCTCG CAATCGCGAT AGGAACAGTA GTTCACACCG TTGCGCACAT GGCCTGCAAT TTTATAAGGT TGTCAAGATG TCCTTTGAAC  AAATTCAAGG CCATCTTTGG AAATTTATTT GTAACGCAAC CGAGTTACAT GGATTTAGTA ACAAGCATCC CGGGATATAC TGGAATCATC ATGATTATTT TGATGGCTAT TTCCTTCACC  TTTGCAACAA GTTCTTTTAG GAGAAACGTT GTTAAGTTGC CTCACCCGTT CAACGATTTA GCCGGTTTTA CTTCCTTTTG GTACACTCAT CATCTGTTGA TCATCGTTTA CTTTTTATTC  ATCGTTCATG GCACCTTCTT AATCCTCACT GTAGGATGGT ACAGAAAAAC AACATGGATG TACCTGTTGC TTCCAATGTT GTGTTATGCA AGTGAGAGAC TCCTTACAAC TGACCATACA  ATGCTTGTTG ACACCATTAA GGCTATCATA TATAGCGGGA ATGTGCTAGC ACTCTACATG ACCAAACCTA TAGGATTCAA GTACAAGAGT GGCATGTACC TCTTTGTACA GTGTCCACAA  ATATCACGCT TCGAATGGCA TCCTTTTACC ATCACTTCTG CGCCTGGAGA TGATTATCTA AGTGTACATA TTCGTACTCT GGGAGACTGG ACGAAAGCAC TACGGGAAGA ATTTGCAAAG  GCCTGTGAGC CGAATGGAAA TCTAGCCCGA ATGGAAACTA ATTCGAACTT GACCATTCAG GAATCACAAG CAATCTATCC TAGAATCTAC ATCAAAGGAC CATATGGCGC ACCTGCACAA  AACTACCGGA AATACAATGT CCTATTACTT ATCGGTTTGG GTATTGGAGC CACCCCGTTT ATCAGCATAT TAAATGACCT CTTACATCAC CTAAAAAAGT CGAAATCCGG CGAGATCCTG  GATAAAAGAG CTTACTTTTA TTGGGTAACA AGGGAGCAGG GTTCATTCGA ATGGTTCAAA GGTGTAATGG ATGATATCGC AGAACATGAT CACGAGAACA TTATTGAAAT GCATAACTAC  CTCACAAGTG TGTATGAGCA TGGTGATATG AGATCTACAC TTATATCCAT GGTGCAGACT CTGCAACATG CCAAAGATGG AGTCGATGTC GTCTCTCAAA GTCGGATTAA AACGCATTTT  GCAAGACCAA ATTGGAGAAA AGTATTCTAC AACTTGGCAA CTACACATGA AGGTCGTAGG ATAGGTGTTT TCTACTGTGG AGCCCAAGCA CTCGTAAGAC AATTAAAAAA GCTCTGCAAA  GAATTTAGCC GTCAAAACAT TACTCGCTTT GATTTCCACA AGGAGAATTT CTAAAGAGAG ATTAAATGTA CAAGTTGTTT TCATTCCGGC ATAATGGCAT ATAGAGTTCA CTTGTAGGTC 
TGCAGCCTTG TAGTTCCAAA TTGGTAGAAT AATCAAGAAC AATGTTAAAT CTTCTATAAT AGAACACTTT TTCGGTGATT CTAATTAGCA CAAAGAAATT GTCATGCAT 

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