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Entry information : HaRboh12 (HanXRQChr17g0533891)
Entry ID 13789
Creation 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-06-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaRboh12 (HanXRQChr17g0533891)
Name (synonym) HaRboh12 (HanXRQChr17g0533891)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaRboh12
start..stop		 S start..stop
HaRboh05 1375 0 5..859 21..927
CclRboh01 1343 0 16..859 30..946
PtRboh03 1339 0 14..859 27..948
CsRboh01 1338 0 16..859 30..946
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 2050162..2050564 401 N° 2 2050658..2050823 164 N° 3 2051326..2051374 47 N° 4 2053155..2053268 112
N° 5 2054184..2054600 415 N° 6 2055268..2055654 385 N° 7 2055745..2055840 94 N° 8 2055908..2056023 114
N° 9 2056425..2056592 166 N° 10 2056827..2056986 158 N° 11 2057062..2057244 181 N° 12 2057848..2057976 127
N° 13 2058516..2058594 77 N° 14 2058675..2058787 111  
join(2050162..2050564,2050658..2050823,2051326..2051374,2053155..2053268,2054184 ..2054600,2055268..2055654,2055745..2055840,2055908..2056023,2056425..2056592,20 56827..2056986,2057062..2057244,2057848..2057976,2058516..2058594,2058675..20587 87)


exon

Literature and cross-references HaRboh12 (HanXRQChr17g0533891)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr17 (2050162..2058787)
Protein sequence: HaRboh12 (HanXRQChr17g0533891)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   859
PWM (Da):   %s   98140.19 Transmb domain:   %s   o298-320i440-462o482-504i661-678o
PI (pH):   %s   8.83
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MTTKAGAEADRHNTQSETSPDEELVEITLDLQNNDAIILRSVGMDTPVTATSNRSRQSSMRMQNDVVGVDSHSRGVRDGEVDRSRCGTGKALKGLRFISNGKINGVDGWKEVEINFDKYA
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YNQKGGSTNLEFHKEHF

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGACTACGAAAGCCGGTGCAGAAGCCGACCGCCACAATACGCAGAGTGAGACTTCTCCAGATGAAGAGCTTGTTGAAATCACTCTCGATCTTCAGAATAACGACGCTATCATTCTACGT
AGTGTAGGTATGGACACTCCGGTAACCGCAACATCGAATCGGTCACGGCAGTCATCCATGAGGATGCAAAACGACGTCGTAGGAGTGGATTCACATTCACGCGGAGTGCGTGATGGTGAG
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CACTGAAAAACTCAAACCTGTTTTTATATTTTTATTTATTTATTTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTGTATTATAGTAGATTAATTATTTGAGCATTA
GCCTGTGTTTGCCTCTTTTGGGTAATGGGTTTAAAAGGGTGGCGAGTGGTTGAAGGAGGTGCTGGCATTATATCTTTTTTTCTGTTAAGTATGCATAATGCATGTGCGGAGTTGATTCGG
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GAGGTTGAACACGTGTTTCACGTATAAAGCTTGACTAGACCCGCGTATCTAAACGAGCCTAGTATTTATATAAATAATACCAAAGGCTTTGTAGCATAGCGGTATCAAGGTGCAATAAAA
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TGCATTGGCGAAGCCACGCCCCCCCGAATTTTCGCAAAACCGGGGGGGCGGCAACGTATATACCTATACGAAAGTACTATTTATAACACTACGCATCGAAAAGTTCGGGGGGTCGGGCGC
CCCCCCCGGACATAGCTTATCCTGCGCCAATGGGTGCGTGTGCGTGTGTGTGGGTGTTTTCCACTCGTATATATGTCAAAATTGTTAATTATAAAATGCAAAGAGTTAAAGCAATTTAAA
AGAACGAATAATGTAATCATAATTCATACAAGTATGCCTCTTCCTAGTTGTATATATGATTAGGGTTGATTATTCAATGATTAGTGTCTTTTTAACTTGTAAACCCATACAAATTATAAG
TAGCTAGCTAGCTAACTTACGTTAATAGATCATCTATATTCACACGTCTTCTATCTATTAATTATAATATTGATATCGTTTCTTATTCATTTAGCTAATAATTAGGTATTCTAATTCTAA
ACATTATAATGCATGTTAAAGTCAGTCGTTATTCATTTTTATGTACTAGAATGTTACACGTTATTTTGTTCCCATCACTGAATTTGTTATATATAGAGTCCCTCAATTACGCGTATTCTC
CACTATGCCATGGGCCAGTCACCAGTGTGTATAAAGCTAAGTGGTCAACCATATATTGTCATCATAAAATACAAAAAAGAATAATCATATCCTCACTCACATTTATATTTGAACATACAA
CATGACTAGTTGTACCATAACTCCATAACACTTTATTTCTTTTTCTAGCCAATTTCAGCTTTAATAATCATCATAAATTTATTTGAACATAAGCAAATAAAATCATCAAAGTTACAATTT
TCTTAGTTAGTGTGATCTCATTAACTTATTAATATAAAAATGTATATGATATTATGTTATGATCATCCAGCTATGGCAGCTCGAAACACTTCTGTTACAGAAAGACACTTACTTGAACTA
CAGTCAAGCCTTGAGCTACACAAGCCAAGCCTTGAGCCAGAACCTCTTGAGAAACCATAGCCCAATAAAGCGAATCAGCTTCAAATTCCTTTATTATTTACAAGAGAACTGGAGAAGACT
TTGGATTATCAGCTTATGGATATTGATTATGATAGGTCTATTTCATTGGAAATACTTCCAATACAAACAAAGGGCTGCATTTGACGTTATGGGCTACTGCGTTCTCTCCGCTAAAGGCGC
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CCATAAGAGGTTCAAATCTATTACCCTTCTACGTGTTATAACTAGATTACATGTTAAATAGGTTCTGGTTAAATAAATGACATTTTTAGTAGTGGTTGAAACGGGTCAGAGCTGTATATA
CAAACATAATATTACTACAGTAGTAATAAAAATATTGAATAAATAATTTAGAGTTAATTATGTTTTTCGTCCCTGTGATCTGTTGAAAATAACCATTATAGTCCACCTCACTTAACACCG
TCCATTTAACCCGTTAAAATGAGTGGACGAAAAGGCAAGCACGTGGTCTGACTAACGGGTTAAATGGATAGTGTTAAGTGAGGTGGATTGTAATTGTTACAAAAGTGAAAGTATAGGTAC
TGTTTTTGCAATTTTTAAACTAATGGAATGTAATGGTTATTTTCAACAAACCATAGGGACGAAAAAAGTAATTAACTTTCTTTTTAAAAGGAATGGACGAAAATGCCCCTGCACATGCAA
AGCACGTAGTCTGACTAACAGATTAAATGGATGGTGTTAAGTAAGGTAGACTGTAATTGTTACAAAAGTGAAAATACCGGTACCATTTTCGCAAGTTTTAAACTAATAGAGTGTAATGGT
TATTTCAGTGACTCAATAATTTAAAATGTTGTATTAACTGAAAACAGAATCTAAGTGATTTAAATTTCTTTTACAGACGGTAGCTGCAGCCATTGTAATGGGTATAATACTCCATGCGGG
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AGAGGGTGTAACCGGAATCATAATGGTGGTATGCATGACGATTGCCTTCACACTCGCAACCAGATGGTTCAGGCGAAGTCTAGTGAAGCTACCAAAACCATTTGATCATCTCACTGGCTA
CAATGCCTTCTGGTATTCACATCACCTTTTTGTGATCGTCTACATTTTGCTGCTAGTACATGGATGGTTCCTTTATTTGGTGAAGGAATGGTACAAAAAGACGCGGTATGTATGATTGAA
AACTTATTGCCTATTAGTTTAGCAATAAAAGGTGTTTTAGTTGTAAGTTATAACTGTCACCTAATGTGGTTACAGACATGGATGTATCTTGCATTTCCGGTTTTGCTTTATGCAGGCGAA
AGAACGCTTAGATTCTTTCGGTCTGGCTCCTATACTGTCCGCCTTCTAAAGAGGTTAGCAAAATGCGTCAAAGTTTCAACCTTTTTAACTTGTCTTATTTTTTATTGTAAAATTATTTAG

GTTGCGATTTATCCGGGTAACGTTCTCACGTTACAAATGTCCAAGCCTCCTAAGTTTCGGTATAAGAGTGGACAATACATGTTTGTTCAATGCCCGATTGTATCTTCATTCGAATGTGGT
GAATTTTCATTTCTAAACTAAAATGATAATTTTAAGTAGAGTTAATTGTCATTTTCGTTCCTGTGGTTTGTTCAATTAATCAATTATGCCAGCCTAGAGCAAATTTCAAATTTGTACCAT
TTCCGTCCCTCACAATCTTGAAACATGGCAGGTCCATCCAAAAAACTAACAACTGTTAGAACCTGCTGTTAACTAAAGGAAAATGACGTTTTTACCCTTCATTAAACGGTAGGTTTAATA
AACGTTAAATTCTTGGACGGAACTGCCATGTTTCAAGAATATCAAGGACAGAGATGGTAGAGATTTGTAATTTGCCCTGGACTAATGGCACTTAACTCTTTTACATAAGAATAACAGTTA
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TTTATATGGGTCAGTTGGTTTGAAACGGGCTGGGCCTGGTCAACGCACAAATACTACTTTTTTGGTTTGACGTGTTCTTCTCTTGATCATATTTTTTGACCCGTTTGAGATAGAACACTT
TCACACAACCCAAAATGATGTAACCACATAAGATGGCCATGCGACATGCATGTCTTTTAATATTATGTGTAACTTTATTTTAGCTTGCCGAGACTATTGATTGACGGGCCGTATGGTGCT
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GAAAAGTAAGTAACTTTTGAAAAAAACATGCATGTTTGACCAATTAGCATTACCTTGACATTGTATGATTTCAATTTCAGAGCCACAGTAGTTCAGATCAGAGTTCTACGTGTGCTGACT
CATCCCCTCAAGGTAAAATTTCGCCCAGAAAGAAGAAAGGTGTAAGGACGACAAATGCATACTTTTATTGGGTGACTAGAGAACAAGGTTCATTTGACTGGTTCAAAGGGGTGATGAACG
AAGTTGCGGAATGTGACCATCAAAAGTATACTCTAATACTTACTAAACAAACATTCATATATTTTCTTGATATCCAGAGTAGGGGTGTTCAAAACCAGATATACGAAAATTCGGATATCC
GAAATTTTCGGATATCCGAAATTTTCGGATACCAGATTTCACTATCCGAATCCGTATCCGAAATTTCGGATATCCGGACCCAAATTCCGGATATGGATTCGGATAGTAAATCGGATATCC
GAAAATTCAACTTTTTATTTAATTTTTATTTCTTTAGTATTTTTTTCATATTCGGAAACGGATATTTTGGATAGTTTCGGATATCCGAATATAAGTTTTCGGATATTTCGGATATTTTCG
GATACTTCGGGTATATTCGGATATTTGGATATCCGAAAAAAATGAAAATTAAATTTTCGGATATTTCGGATATCCGAAATATCTGAAAATTTTGAAAATCACTATCCGAATCCGAATCCG
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TGCCAAAAATGGCGTTGACATTGTGTCTGGCACAAGGGGGTAACTAACTTATTACTTTGCCATTCGACATGATGCAGCATTTTGAAAGAAAATTCCATCAAATCAAATGAGTTGTATAAG
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GGCTTTTATTATACAACAGGTGTGTTCTATTGTGGTGCACCAGTGCTAGCTAAGGGGTTAAGTAAGTTATGTGATGAGTACAACCAAAAAGGTGGTTCAACCAATCTTGAATTCCACAAG
GAGCACTTTTAG

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGACTACGAAAGCCGGTGCAGAAGCCGACCGCCACAATACGCAGAGTGAGACTTCTCCAGATGAAGAGCTTGTTGAAATCACTCTCGATCTTCAGAATAACGACGCTATCATTCTACGT
AGTGTAGGTATGGACACTCCGGTAACCGCAACATCGAATCGGTCACGGCAGTCATCCATGAGGATGCAAAACGACGTCGTAGGAGTGGATTCACATTCACGCGGAGTGCGTGATGGTGAG
GTTGATCGAAGTCGTTGCGGTACTGGTAAAGCTCTAAAAGGTCTCCGATTCATCAGTAATGGTAAAATCAACGGTGTGGATGGTTGGAAGGAAGTTGAGATTAATTTCGATAAGTATGCA
AAGGATGGATATCTGTATCGTGCTGATTTCGCACAATGCATAGGAATGAGAGATTCAAAGGAGTTTGCAGTTGAAGTGTTTGATGCAATTAGCAGAAGAAGAAGACGTAGGCTAAAAGTT
GACAAGATCAGTAGAGATGAGTTATCTGAATATTGGTCACAGATCACTGATCAGAGCTTCGATTCTCGCCTCCAGATCTTCTTCGACATGGTAGACAAGAACGAAGATGGAAGAATCACT
GAAGAAGAAGTTAAAGAGATAATAATGGTGAGTGCGTCAGCAAACAAGCTATCAAGGTTGCAAGACCAAGCAGAAGAGTATGCAGCTCTAATTATGGAAGAATTGGACCCCCAAAGACTT
GGCTACATTGAGCTATGGCAGCTCGAAACACTTCTGTTACAGAAAGACACTTACTTGAACTACAGTCAAGCCTTGAGCTACACAAGCCAAGCCTTGAGCCAGAACCTCTTGAGAAACCAT
AGCCCAATAAAGCGAATCAGCTTCAAATTCCTTTATTATTTACAAGAGAACTGGAGAAGACTTTGGATTATCAGCTTATGGATATTGATTATGATAGGTCTATTTCATTGGAAATACTTC
CAATACAAACAAAGGGCTGCATTTGACGTTATGGGCTACTGCGTTCTCTCCGCTAAAGGCGCAGCCGAAACTCTCAAGCTCAATATGGCTATCGTGTTATTGCCTGTGTGCAGGAACACC
ATAACTTGGCTGAGGTCCACCAAGTTATCTTATTTTATACCGTTTGATGATAACATCAACTTCCATAAGACGGTAGCTGCAGCCATTGTAATGGGTATAATACTCCATGCGGGAAACCAT
CTGGCATGCGATTTCCCAAGGCTTATAAACGAAGACGAAAACAGCTACGCTCTTAACATGAGTAAATACTTCGGGGAAAACAAACCGAGCTATATAACCCTGCTTCGAGGGGTAGAGGGT
GTAACCGGAATCATAATGGTGGTATGCATGACGATTGCCTTCACACTCGCAACCAGATGGTTCAGGCGAAGTCTAGTGAAGCTACCAAAACCATTTGATCATCTCACTGGCTACAATGCC
TTCTGGTATTCACATCACCTTTTTGTGATCGTCTACATTTTGCTGCTAGTACATGGATGGTTCCTTTATTTGGTGAAGGAATGGTACAAAAAGACGACATGGATGTATCTTGCATTTCCG
GTTTTGCTTTATGCAGGCGAAAGAACGCTTAGATTCTTTCGGTCTGGCTCCTATACTGTCCGCCTTCTAAAGGTTGCGATTTATCCGGGTAACGTTCTCACGTTACAAATGTCCAAGCCT
CCTAAGTTTCGGTATAAGAGTGGACAATACATGTTTGTTCAATGCCCGATTGTATCTTCATTCGAATGGCATCCATTTTCAATCACGTCTGCTCCAGACGATGATTATCTTTCAGTTCAC
ATACGACAGCTAGGTGATTGGACACTAGAACTAAAAAGGGTATTTTCGGAAGTCTGTGAACCACCTCTAGCTGGCAAAAGCGGGTTGCTCAGAGCAGACGAAACCACCAAAGCAACCTTG
CCGAGACTATTGATTGACGGGCCGTATGGTGCTCCTGCACAAGACTACCGTAAATACGATGTTCTTTTGCTTGTTGGACTCGGCATTGGAGCAACACCTTTTATTAGTATTCTTAAAGAT
TTGCTAAACAACATTGTTAAATCGGATGAATTAGAAAGCCACAGTAGTTCAGATCAGAGTTCTACGTGTGCTGACTCATCCCCTCAAGGTAAAATTTCGCCCAGAAAGAAGAAAGGTGTA
AGGACGACAAATGCATACTTTTATTGGGTGACTAGAGAACAAGGTTCATTTGACTGGTTCAAAGGGGTGATGAACGAAGTTGCGGAATGTGACCATCAAGGTGTTATAGAGATGCATAAC
TATCTAACCAGTGTGTATGAAGAAGGTGATGCGCGATCAGCTCTCATCACCATGGTTCAAGCTCTAAACCATGCCAAAAATGGCGTTGACATTGTGTCTGGCACAAGGGTTCGAACGCAT
TTCGCGAGGCCAAATTGGAAGAAAGTATTCTCGAAAACTTGTAAAAAACATGCAGGTGCTAGGATAGGTGTGTTCTATTGTGGTGCACCAGTGCTAGCTAAGGGGTTAAGTAAGTTATGT
GATGAGTACAACCAAAAAGGTGGTTCAACCAATCTTGAATTCCACAAGGAGCACTTTTAG

Retrieve as FASTA  
cDNA►
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