1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : PpaFer04 (Pp3c13_20400)
Entry ID 13903
Creation 2016-10-14 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-10-14 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-10-14 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PpaFer04 (Pp3c13_20400)
Name (synonym) PpaFer04 (Pp3c13_20400)
Class Ferritin    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Funariaceae Physcomitrella
Organism Physcomitrella patens    [TaxId: 3218 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PpaFer04
start..stop		 S start..stop
PpaFer01 204 3.9e-66 60..220 61..253
PpaFer03 203 1.47e-65 41..220 47..252
PpaFer02 199 9.66e-64 65..220 64..251
SpolFer01 192 2.98e-61 31..231 30..252
Literature and cross-references PpaFer04 (Pp3c13_20400)
Protein sequence: PpaFer04 (Pp3c13_20400)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   245
PWM (Da):   %s   27283.56 Transmb domain:   %s   o259-281i
PI (pH):   %s   6.5
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAQAISASVA GALHAFPSFN TDNRYLKTSS VNISAWYSPP KWSLGVLAAG GSNKAHLSCA SPSETGIVFK PCAELQNQII KVPSSCSESL AQQQFSASCE AVIDDQINVE YNVSYVCHAT  LRIRENKRGG RVKLDTILST VMEFDHSEKG DTLYSMELTL ALERLVNEKL LSLHQVAVDN NDPEMCDFIE REYLYEQVEA IKKISMYISQ LRRVGKGHGV ELWRNNNSLC RCHHAVQASD 
ILWCK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Shorter sequence due to shorter prediction (stop in frame of exon 3)
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGCAAG CAATATCAGC CTCAGTTGCA GGTGCCCTAC ATGCCTTTCC ATCTTTTAAC ACTGATAACA GATACCTGAA GACGTCGTCT GTGAACATAT CCGCATGGTA CTCTCCGCCG  AAATGGTCAC TTGGAGTTTT GGCTGCTGGA GGAAGTAACA AAGCTCATTT AAGTTGTGCA AGTCCCTCCG AGACGGGCAT CGTGTTCAAA CCATGTGCTG AATTACAAAA CCAGATCATC  AAGGTCCCGT CTTCATGCTC CGAGTCTTTA GCCCAGCAGC AATTTTCTGC CTCGTGCGAG GCTGTGATCG ATGATCAGAT CAAGTACTAA TCCATCGTGT CTCAAAGTTT TATCTTCTTT  CTTTTTACAG TATTATCGTA TTACGACTGC TGTTTATCTC TTTGTGTATC TAAAGTCTTA ACTGAATATT TTTTGTCGTT GGAACTCTTC TTCTCTTTCT TCTTATTTCC TATTCTTGTA  TTATTTTTTT TTTTTATCAT TATCATTAGT ATTTTTGTCA GTTTAGCAGC ATTAGGAAGT AACTTCTTCT TCCAGGTTCC TCCCATACCA AGTTCTAATA TTTTGTCTTA TGAATGCAGT  GTTGAATACA ACGTATCATA TGTCTGCCAC GCGTTGAGCT CGTAGTTCGA TCGTGACAAT GTAGGACTCT CAGGATTCGC GAAGTAAGTT TATCACTTAA TAATCATTTG ACCTAAAACA  AGTGATATGA TTATTTCATG ACACATCTTA ACATTTTTGG AGCGTCTGCT TATAGATTTT TCAAGAGAAC ATGCCGAGAA GCTGATGAAA TATCTGATAT ATATATATAT ATATATATAT  GACAATTAAT GGCCTCCTTT TCGGTTCTCC GTGTTCTGAT AAAGTTACCA GAACTTGGAT CCCTATTCCG ATGCTGCGGA AAATGTAAGC GGTGTTAATA ATGTCCAGGT GGCTGGTACG  AGCAACTGAT GTATGTCACT GTTACACAGA ATTTTGCTGC AACAGAACAA ACGTGGAGGA AGAGTGAAAC TGGACACCAT ATTGTCAACA GTGATGGAGT TCGATCATTC TGAGAAAGGC  GACACTCTTT ACTGTAAGTT TCCCGAATTT TATAGGAACA CCTTGTATTA TTCTTTTCAA CCCTTTGATT GGGTTGGGAA GTAGACTTAG AAGAAATATG GCATCTTCTG TCCGGTCGAC  ACAGATGCTA ACCTGGATCA CTACTTCTAA GCAGCCATGG AGCTTACTCT TGCTCTTGAG AGGCTCGTGA ACGAGAAGTT GTTGTCACTC CATCAGGTAA ACTGACTATG TAAATTCTTA  TAGACATAAA GTTACTACAA TACCCACAGT TAAAGTAATT TAGCTTTATC GATTCTCGGG CATAACTTGC CGTTATCAAC GCAACCTTTT GTATTATTTT TATGTTGTTT TTTTGTTTTG  ATTTCATTTA TTTTGTTTAC ATTTCTTTTC TGAACAGCTG TGAATCTGTG CAGGTTGCTG TGGACAACAA CGACCCAGAA ATGTGCGATT TCATTGAACG AGAATATTTG TATGAACAGG  TGCTAATATA TTTCAGTACT TACCATCACG AAAAACTTCG GCCTGTCCCA ATTTATTTTG GATTGGATAA GGCTGCTCTG AAGTATGATT TCAGGTCTCA TGATTTGAAT CAACTGGGAT  TTTTGCGAAG CCATTCACAA ATTAACTATT GTGAATGTAT ATTACGGTAG GACTGGGTAC CTCTAATCTA AAATAGTCTT AGGGAGCTAT CGTGTGCACC TTCTAAGTTG CAGGCGTTTA  TGCAATGCTG ATTTTAGGTA GAAGCTATCA AGAAGATCTC CATGTATATA TCACAGTTGA GGAGAGTTGG AAAGGGGCAT GGTAAGTTAA CATCTATTGC TCTGCAGGTC TTCATTTGTT  TAGTTTTATC TCCAGGTATT CGTTAAATAA CTAAACAATA CAGCTGTTAA AATTCATGAA ATATTCAGCA AGAAGTCCAA TTCCCAAACA CTACTGCTCA TCAGCTATGA CGATGGAACA 
ATGCAGGTGT GCATCACTTC GATTTGCAAC TGCAGGGGTA GAACTATGGA GAAACAACAA CAGCTTATGT CGATGCCACC ACGCTGTCCA AGCTTCCGAC ATTCTCTGGT GCAAGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGCAAG CAATATCAGC CTCAGTTGCA GGTGCCCTAC ATGCCTTTCC ATCTTTTAAC ACTGATAACA GATACCTGAA GACGTCGTCT GTGAACATAT CCGCATGGTA CTCTCCGCCG  AAATGGTCAC TTGGAGTTTT GGCTGCTGGA GGAAGTAACA AAGCTCATTT AAGTTGTGCA AGTCCCTCCG AGACGGGCAT CGTGTTCAAA CCATGTGCTG AATTACAAAA CCAGATCATC  AAGGTCCCGT CTTCATGCTC CGAGTCTTTA GCCCAGCAGC AATTTTCTGC CTCGTGCGAG GCTGTGATCG ATGATCAGAT CAATGTTGAA TACAACGTAT CATATGTCTG CCACGCGACT  CTCAGGATTC GCGAAAACAA ACGTGGAGGA AGAGTGAAAC TGGACACCAT ATTGTCAACA GTGATGGAGT TCGATCATTC TGAGAAAGGC GACACTCTTT ACTCCATGGA GCTTACTCTT  GCTCTTGAGA GGCTCGTGAA CGAGAAGTTG TTGTCACTCC ATCAGGTTGC TGTGGACAAC AACGACCCAG AAATGTGCGA TTTCATTGAA CGAGAATATT TGTATGAACA GGTAGAAGCT  ATCAAGAAGA TCTCCATGTA TATATCACAG TTGAGGAGAG TTGGAAAGGG GCATGGGGTA GAACTATGGA GAAACAACAA CAGCTTATGT CGATGCCACC ACGCTGTCCA AGCTTCCGAC 
ATTCTCTGGT GCAAGTAA 

Retrieve as FASTA