Entry information : PpaMDAR02 (Pp3c9_450)
Entry ID 13923
Creation 2016-10-18 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-10-18 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2016-10-18 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PpaMDAR02 (Pp3c9_450)
Name (synonym) PpaMDAR02 (Pp3c9_450)
Class Monodhydroascorbate Reductase    [Orthogroup: MDAR001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Funariaceae Physcomitrella
Organism Physcomitrella patens    [TaxId: 3218 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PpaMDAR02
start..stop
S start..stop
PpaMDAR01 735 0 22..456 1..434
PpaMDAR03 626 0 43..456 22..435
HaMDAR03 597 0 28..455 8..435
LeMDAR03 584 0 22..456 1..434
Literature and cross-references PpaMDAR02 (Pp3c9_450)
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 12:   32912905
Protein sequence: PpaMDAR02 (Pp3c9_450)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   455
PWM (Da):   %s   49325.37  
PI (pH):   %s   6.2
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MPTNIILRIF FSRCNVPESV VMAAILRKYI VVGGGVAGGY AAREFVKLGL QPGELTIFSK EAAAPYERPA LSKAYLFPDA PARLPGFHVC VGSGGEKQLP DWYAEKGIEL KLETEIVKAD  VENKTLTTNK GDIYEYGTLI LATGSTFLNL ADFKTPGADA KGIYYLRDIG DADKIVEAIK ASKGDEAVVV GGGYIGLELA ACLTMNKIKV NMVFPEPCLM PRLFTPELAS FYERYYEGKG  VNIIKGTTVT AFEKDDNGHV SKVLLKNGSS VNSTFVVVGV GARPLLAPLK GLIEEEKGGF KVDASFKTSN PNVYAVGDIA TFPMKMYGDS RRVEHVDHAR KSAMQAVQAI KAAEKGEVVD 
EYDYLPFFYS RSFNLSWQFY GDNVGETVLW GRNGAAASES KFGAYWVKDN KVMGAFLEGG SPDENKLIAK VAREQPTVNS TDELVSGGLG FASKI* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 9, 10 introns)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTACAA ATATTATTCT TCGAATTTTT TTCAGTCGAT GTAAGTTAGA TAAGCCTCGA TGCTAATTTC TATTTGGTTT GAAAAGTTTG CATATTTGTG AAGAGAGCGA TCCTAATGAT  TGTACTTTCT TAGAGAATGC ATTAAATTAT GATGTGATTC AAGCTAAAAT GACTAGTCCA TCTTTTCTAA TATGTACTGG ATTAGATGGA CCTGTAAATG ATACCACTGT GTCATAGAAT  GGTGTATGGG AGAATGTTAG GGTTTTTAGT GTATAGTGTA TGGTGCTTTT CTGCACTTTA AATAGGTTAA CTTGAGGATC ATTGAGCAGC GGGTCATTTG CTTATAAATG TTTACGCCTG  ATTCTTGCAT GTTTTAGTAA CAGCAGTTAG TACTTAGCAA TCATATCGCG TATCGTTTTC CCAAGATGTA GCGCCATCTG AGATTATATT CAATCGTTCA TGCATTTTGG GAATGTGGTT  TTTCCCAATT GATATGAAAT AGTTCTACGT GCGGCTGTTA GTTTACTTTT GTTCACTCTC TATCGCATGT TTTGAGCTTA CTGTCATGGT TTTTTGTGCA GCGTTCCAGA AAGTGTTGTC  ATGGCTGCTA TATTGCGCAA GTACATTGTG GTGGGAGGAG GTGTAGCTGG AGTAAGCCTT GGAAAGCTTT TTGTAAACTT GGCAGAGCGG TTTTAGAAAG ATGTTAGTAG TGTTAGTGTT  TGAGGATCAC ATCGTGGTTG ACACTGAGCT CTTGAATGGA GGAAGCACTG ATTGAATGAA GGAGAGATAC ATCGTTGAGG AGTATCTGTT TGTTCAGCAA TTGCTTTAAG AGTTCACAGA  AAGAAGGACG TTTAAACCAA AAGCTTTGCA GCTCAAAGTC AGATGGTTTT GTGATCTGTG CAGGGCTACG CTGCACGAGA GTTTGTAAAA CTGGGATTAC AACCTGGGGA ACTGACCATT  TTCTCCAAAG AAGCGGTATA TTGCTGTTCT ACGCGTGCTA ATTTTTTGAA GTTGTGTCTG GGGTGATTGT AGAGGCTTAT CTGTACATGC ATGTTGCATT GGTACAATTG AACGCCCGGA  TACCCAAGCG GAGTAGCCCT ACATAAGGAT GGTTGCTTCA GTTATTGTTT TCGCTGGATT GTATACGTCA TCTATATTTC AGAGGAGGCT TCCTGATTTT TGTCGTTGAG ATGTTGCATT  TTTAAATGGG AAGGCGACAT GCTGTGCAAC GTAGAGTGCC CATGCTCATA TATGCTACAG CTTGTCCAGC AGCTGACTTG AGTAAACTCT GTATGACAGG CGGCACCTTA TGAGCGGCCT  GCTCTGAGCA AAGCTTACTT GTTCCCTGAT GGTAAGGATT CTGTGTATCA TTCTTCCTTA CAGGTTTTCT TCAAACAGTG GAAGGATCTG AATCTTTTAA CAAGTCTATG GCTATTTTAT  GTGACAGCTC CTGCTAGGCT TCCAGGCTTT CATGTGTGCG TGGGGAGTGG AGGAGAGAAG CAATTACCGG ATTGGTATGC TGAAAAAGGT AAGTGCTCCA AATCGTACCT GTGCCTGTTC  AGTGTATCTT CGGTGTTCTC CAGGAGACAG GAAGACGTGA AGGATACATG CAGTTATAGC ATCAACAATG TGTATTCTGA CTTTCAGGTA TTGAACTTAA ATTGGAGACT GAGATCGTGA  AAGCGGACGT GGAGAATAAG ACCTTGACAA CTAATAAGGG CGATATTTAC GAGTATGGGA CTCTGATTCT TGCAACAGGC TCCACGGTGG GTATTTTTCC ATATTCATTT TCGCAAGTTT  TGTAGCTTTA GTTAATTTTG TGCTAAAGCT TTGGTATTAC TTGTAATTTT TGAAATGTTG TTCCACAAAA TGCTGTAGTG GTCCAAAGAG TTCGAAGAAG AAACAATTGA CTTACTGAGA  GATATGGTTG GGTACAGTTC CTTAACCTTG CCGACTTCAA AACTCCTGGA GCTGACGCCA AAGGTATTTA TTACCTAAGA GATATTGGTG ATGCTGATAA AATTGTTGAA GCCATCAAAG  CTAGCAAGGG AGATGAAGCA GTGGTTGTAG GTGGAGGTTA CATTGGGCTG GAATTAGCTG CATGTCTGAC GATGAACAAG ATTAAAGTCA ACATGGTGTT CCCAGAACCA TGCTTGAGTA  AGACTCTTAC CAAATTGAGT CAATATGTTT TTTGACATAA GCTTCAAGTA CCTGTTCTGA ACAGAATAGT GATTCTACAA ACTGAATTGT GTGGAGAATG ATCTTCAGAA TCACAACAAG  TTTCATATGC AAGCCCTATA AAAGTATGAG GGGGTTGTTT CTTGTTGACA GTGCCTCGTT TGTTTACACC CGAACTTGCC TCATTTTACG AGAGATACTA TGAGGGTAAA GGCGTAAACA  TCATCAAGGG AACAACTGTA ACTGCATTTG AGAAAGATGA CAATGGCCAC GTAAAATCTT GACCCTAGAA GCTTTACTGT TCTATATTTG CACATCATAA ACTCTGCTGG GAGACGTGGC  CAACATTTGC GAGAAGTTTC TATAATTAAT ACGAATCACT TCGCACTTTC TGAGTTGCAC ATCCTAGGGG GTCTGGTGCA GGTATCTAAA GTCTTATTGA AAAACGGAAG CTCTGTGAAC  AGCACTTTTG TGGTGGTGGG AGTTGGCGCA AGGCCACTTC TGGCTCCTCT GAAGGGTTTG ATAGAAGAAG AGAAGGGTGG TTTCAAGGTT CGTTTCATTC TCCTCCATAA ACTATGAGGT  CCATGAACCC GGACGATATA TACCTGCAAA CTCACCTCCT CGTGTGTTCG TTAACTTGAA ATCCTGACTT TTAAGCAGGT GGTATTTCAA GAAAATGAGG GCCTTAACAG CGTTGCTGTC  ATAGAAAGGA CTGAGGGAAC TAGTTCTTAT TTTTTGTCAA AGCTTAGCCA TAAGTGTACA GTCCAGTGTA TGAGACTTAG CAATATATCT AAATATTTAA TGATCTACAT GGTATATTCG  CTTATATTCA ATTGCTTGTT GGCAGGTTGA TGCTTCATTC AAAACAAGCA ACCCCAATGT GTACGCCGTA GGTGACATTG CAACATTCCC AATGAAGATG TATGGTGATA GCCGGCGAGT  GGAGCATGTG GACCATGCAA GGAAATCTGC CATGCAGGCT GTTCAGGTAT GTTATCCCGT TTGCTTGTAC TTCGACGATC TTTTGAATGA AGAGGTTCAG TGGTTTGTGA CTTCTCTATG  AGGATAATTT TTTATCTGAT AGCTTGTGAA TCAACAATTT GGGCAGGCGA TCAAAGCCGC TGAGAAGGGC GAAGTCGTGG ACGAGTACGA TTACCTCCCA TTCTTCTACT CCCGCTCCTT  CAATCTGTCG TGGCAGTTCT ACGGCGACAA TGTGGGCGAG ACTGTGCTTT GGGGCCGTAA CGGGGCTGCA GCCTCTGAGT CCAAGTTTGG TGCTTACTGG GTCAAGGACA ACAAGGTGAT  GGGGGCATTT TTGGAGGGCG GATCACCTGA TGAGAACAAG TTGATTGCCA AAGTTGCACG AGAGCAGCCT ACTGTGAATT CAACTGATGA GTTAGTGTCT GGTGGCCTAG GCTTTGCATC 
CAAGATATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTACAA ATATTATTCT TCGAATTTTT TTCAGTCGAT GTAACGTTCC AGAAAGTGTT GTCATGGCTG CTATATTGCG CAAGTACATT GTGGTGGGAG GAGGTGTAGC TGGAGGCTAC  GCTGCACGAG AGTTTGTAAA ACTGGGATTA CAACCTGGGG AACTGACCAT TTTCTCCAAA GAAGCGGCGG CACCTTATGA GCGGCCTGCT CTGAGCAAAG CTTACTTGTT CCCTGATGCT  CCTGCTAGGC TTCCAGGCTT TCATGTGTGC GTGGGGAGTG GAGGAGAGAA GCAATTACCG GATTGGTATG CTGAAAAAGG TATTGAACTT AAATTGGAGA CTGAGATCGT GAAAGCGGAC  GTGGAGAATA AGACCTTGAC AACTAATAAG GGCGATATTT ACGAGTATGG GACTCTGATT CTTGCAACAG GCTCCACGTT CCTTAACCTT GCCGACTTCA AAACTCCTGG AGCTGACGCC  AAAGGTATTT ATTACCTAAG AGATATTGGT GATGCTGATA AAATTGTTGA AGCCATCAAA GCTAGCAAGG GAGATGAAGC AGTGGTTGTA GGTGGAGGTT ACATTGGGCT GGAATTAGCT  GCATGTCTGA CGATGAACAA GATTAAAGTC AACATGGTGT TCCCAGAACC ATGCTTGATG CCTCGTTTGT TTACACCCGA ACTTGCCTCA TTTTACGAGA GATACTATGA GGGTAAAGGC  GTAAACATCA TCAAGGGAAC AACTGTAACT GCATTTGAGA AAGATGACAA TGGCCACGTA TCTAAAGTCT TATTGAAAAA CGGAAGCTCT GTGAACAGCA CTTTTGTGGT GGTGGGAGTT  GGCGCAAGGC CACTTCTGGC TCCTCTGAAG GGTTTGATAG AAGAAGAGAA GGGTGGTTTC AAGGTTGATG CTTCATTCAA AACAAGCAAC CCCAATGTGT ACGCCGTAGG TGACATTGCA  ACATTCCCAA TGAAGATGTA TGGTGATAGC CGGCGAGTGG AGCATGTGGA CCATGCAAGG AAATCTGCCA TGCAGGCTGT TCAGGCGATC AAAGCCGCTG AGAAGGGCGA AGTCGTGGAC  GAGTACGATT ACCTCCCATT CTTCTACTCC CGCTCCTTCA ATCTGTCGTG GCAGTTCTAC GGCGACAATG TGGGCGAGAC TGTGCTTTGG GGCCGTAACG GGGCTGCAGC CTCTGAGTCC  AAGTTTGGTG CTTACTGGGT CAAGGACAAC AAGGTGATGG GGGCATTTTT GGAGGGCGGA TCACCTGATG AGAACAAGTT GATTGCCAAA GTTGCACGAG AGCAGCCTAC TGTGAATTCA 
ACTGATGAGT TAGTGTCTGG TGGCCTAGGC TTTGCATCCA AGATATAA 

Retrieve as FASTA