Entry information : PpaENODL01Pp3c1_7880
Entry ID 14066
Creation 2016-10-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-10-26 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PpaENODL01Pp3c1_7880
Name PpaENODL01Pp3c1_7880
Class Early nodulin    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Funariaceae Physcomitrella
Organism Physcomitrella patens    [TaxId: 3218 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PpaENODL01
start..stop
S start..stop
PpaENODL08 67 0.0000000000000263 16..167 5..142
AtENODL09 62 0.00000000000214 69..194 43..165
HaCRX07 60 0.0000000000139 52..188 30..154
AtENODL16 60 0.0000000000148 69..172 39..141
Literature and cross-references PpaENODL01Pp3c1_7880
Protein sequence: PpaENODL01Pp3c1_7880
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   216 (175)
PWM (Da):   %s   23112.74 (18424.2)  
PI (pH):   %s   8.05 (6.76) Peptide Signal:   %s   cut: 42 range:42-216
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTSRVDMLLR SWSWSRAPAL FKVVLLLAIS VETGLIHNVQ GKNYTVGADY VNVVGNASWT NTINGLSQPA ALEAAYQKWA DSVNFTVGDT INFDYERGQH TVYLVDTKSA YTSCALTAGS 
GQTLPYGTPT TYTIKDTDVV LYFTCTVSGH CRAGQKVKIV PFGVTVSPTP APLPPNNVPD SAHASSPSMG TIAMLLLVLL SIFQAQSYGS KSPVTL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACAAAATAAA ATAAAGGTTA TCACCTATCT TTAGAAAATA GTTTCATCCA AATCATAGTT AATTTTCTTT TAAAAAGGTT TATCTTAAAT AACATCCTAT TTATACAAGA AAAAATTAAC  CAAGTGAAAA ATCCTATCAA TAAATTTATT CTTGAAACTT AATTTCTTGA AATCATATAA TAAATTTTGT AAAAATAATT ATAATTCTCA AAATAATTAA TGAAGGGGGG CCGTTAGCCA  TGGCCCCCGC TCCTCTGCCC CCCTGCCCAC CAGTGTAGAT GGATGCAACC ATCCATCCAC AACACATACA TCCATCCACA ACCACCCATC CACCGTACAT CCAACATCGA TTCATTCATC  CACCAGGTCC AACGGCAGCG GCGGATTCTC GGCGAAGATC CAATATTGCG GAGATGAAGA ACATAAGAGA GGAATGGTGA TGGGGTGAGC ACCCAGAACA ACTTCTCAGC AGTGCTGAGA  AGCAATCAAT CAATCATTGA GAGAGTGGAA AACACCTCAA AATCCCAAGG AACACAACAC AACACAAACA CACAAATAGA AACCACCACT AGGGGTTTGG GGAGAAGACG AGGTCCAACA  GGAAAGCAGC AGGGAAGGGA AAATTATAAG ATGTGGGTGG GGTGGGATTG GGGTTCCAGG CATGAGAGAG AGGATAATAA TAACAATAAT AATAAAGCAT CTGACGCCAA CACTGACTCG  CCCAGGGAAG ACCCTCTAAC CAGTGGAGGA GGAGGGAGGA GAACTAGTCA AGTGCCGTTT CTAGAACGAG AACCTTGCCC CCTCGCTTTG CTGATATTAA CCGATCACTG TGTGCCTCCG  CATGTTGCTA GCCATTGTGG AGAGGTGTAA AGCATCCCCC CATTGGCACA AGAATAGGAA TGAGAATAAT GATGTATAGC TGTTTTATTT CTAGAAAAGT ATGGTAGTAC CGATTTCCAC  CCCTCTCAGT ATTTGGTATA GTTGCGGTCC TCCGCGGATC CCGACTGGTC CAGCGCTGGT AGGAACCGCT TTTGGAGTTG AATCGGAGAT TCCCCATGTT TGTCGCGGAC TGTGCGCTCT  TGGACTTTCA GGGGAGGGGG CTAATGGCAC TGTCTCAAGA CTTTTTGTAC TCGTAGACTG TCCTCTGAGA ATGTCTTACT TCGTTCTCTG CATATGTAGT TGTGATTAAA CTCATGCGGC  GCGTGTGGGA TTGCTACATC GCCAGAGTAA ATGATTTGAC GAGGGTGCTT AGTGATAGGG AAATTCGGTT TAGAAAATTT GATGGTTTAT CTGAGGTGTT GAAGTAACGC ACAGGTTTTT  ACATAACGCT GTTGAGCTTT GAGACGCTCA TCAGTCTCTG GCTACACGTT CCCATTCAAT TCTGCTCTGA CGGTTGCCAC GATCTCTTCC GTTTTCATGA TTTCGTCTGC CGCAAGCCGA  GCAGATCATT TGTTGGTATA GCTCATTTAT GGACCTTACT ATCACTCATT TGTATCGGTA TTCGTGTGTA TGATCGTTAC TGATATCGAC GTGTAGCATT CAAAGCTAGA ACACAAGGAA  TGAGGTGAAG ATCGGGAGCA CAGACTTCTG CAGGACTGGG AAGCATTAGA AGTAGTATCC GTGTGCGGAA CTCTGCAAAG GTGATCAATA AATAATACCG AATCTAGTCT CTTCTATTCT  TGGACAAGTT TTTGTTGGTT ATGATCTAAC CCATAGTAGC CTGCATCGCT ACAGCCGTAA CCTTGTTGGA AAGCATTCTC ACTCAGTGTG TTTTTGCGTG TACTTGCAGA TAATCCGATA  GAATCCTCGA CAAAGAGCTC GCAGCGACGC TGACGAGATT CATTTCGCCA GATCGTGCGG GTATGCAATG ACCTGTAAAT CCGTTAGGCT TCACTCATAA AGCTCTTCAG ATTTCTTTTC  CCTGAGGTTT TTGCAGCACT TTGGATTAAT ATTGTCTCTC TGATTTGCAT TTGAACCAGG CGTAATTTTC TTTAAACAGC GAAGAGCGCA ACGCATTCAG AGAATGACCT CTAGAGTAGA  CATGCTTTTG AGGTCATGGA GCTGGTCACG TGCTCCCGCT CTGTTCAAGG TAGTTCTGCT ACTAGCGATA AGCGTAGAAA CAGGACTCAT TCACAATGTT CAAGGCAAAA ATTACACCGT  AGGGGCCGAT TATGTGAATG TCGTAGGCAA CGCTAGTTGG ACGAACACAA TTAACGGATT GTCGCAACCT GCTGCTCTGG AGGCCGCTTA TCAGAAGTGG GCCGATTCGG TGAATTTTAC  AGTGGGCGAC ACAATAAGTG AGATTCTTGT GCACCAATGA TACATTTCGA TTTTCAGAAT TTATAAAATG TTGTACTTTT AAGAGCTTCT AGAATCCACG CTGAGTTAGG GTTAGGAGCA  TTTTCAAAGC CGCTAATTGC TACTGCCTCA CCCAAGGCCA TTTCAGCGCT CAAGCAGAGC TGCCATTTTG ACCCAACAAT TGATGATGCT TTAAACTGCG AGTTTCAATG CACGATTGAT  TTCTTACCGT AGTGTTGTGC TCGTGACGTC CAGATTTTGA CTACGAGAGA GGACAACACA CTGTGTACCT CGTCGATACC AAGTCAGCTT ACACGAGCTG CGCTCTCACT GCCGGTTCAG  GACAAACCCT CCCGTATGGA ACCCCGACAA CTGTAAGAAA CCCTTTATTG TCAACCTTTT GTCCACCTCA GGGACGTATG GGGCCGCTGA ACTGAGTCCA TACTTCCATC AGAGGCTACT  CATGTTATTG ATGTTGAATG AAGGCTCTGA TTTACACAAC TCTGTTATTT AAGCCTCTTG GCGCTGAGTT GCTTGTGGAA TGGTTTGTTG AACAGTACAC CATCAAAGAC ACCGACGTCG  TACTGTACTT CACCTGCACC GTTTCTGGGC ATTGTCGGGC AGGACAGAAA GTGAAGATCG TACCATTTGT AAGCCCTTTC CCATTTCAAC TCCGCCTCCT CTTTATAGGA CTGAAACGAT  CCAGGACAAG GATCGACGTG AGTTCATACA TTGTTCACTA ATGTTGGCTT GTTGTGGGAT CAGGGAGTCA CAGTCTCTCC CACCCCAGCT CCTCTACCAC CTAATAACGT TCCGGATTCG  GCTCACGCAT CCAGCCCAAG CATGGGGACG ATTGCAATGC TCCTCCTCGT GCTTCTTTCC ATATTTCAAG CTCAAAGCTA CGGTAGCAAG TCGCCTGTAA CTTTGTAAAA CACGACCTAG  CGAAATCTGC AGGCATTCAT CCTTGTAGAT CACGGTGAGG TGGCGAGGTT GGAGAATCGA GCGATGCGTA ATTGCTGTCG GTGGCTAAAC AGCAACAAAG GCCTCCGGTG AAACAACAAA  AAACTGATCG CTATAGATCC ATTCTTCCTT CCAAGCTCGT GTACAGAAAT GGTGATGGGC ATGATGGAGC TACGATACAC ATTTTGCACC GTTTTTCTGT GGAATTCACA AAGCTATTTG  AAGTACTTCA GAGACTGAAA CCAGGTTTTG CAGAGAGTCT TGAATTCGAA GGCCACCGAC GCTTATATGA AGTAGGTTCG GCGGAGCTTT CTAGGATGGA GTTTCAAATT TGTTGAGCTC  CAATTTATGA CTTTGTTGAG CATTTTTTCT CGCAATTGCG ATGAGTGGGC ACGCCTGATT TGCGACAAAA GTTTGCACTT TGGTATGACT TATTTTTGGA AATCGTTTGA AAGTATCTGA 
AACAAGTATT TACATTGTGA ATGATGGTGA AAATAACTAG ACAAAGGACA CCTGTAATCT TATTGTTTTT TACGGTCTTG CTTTTTTTTT TCTACTA 

Retrieve as FASTA