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Entry information : HaCPF03 (HanXRQChr13g0399791)
Entry ID 14249
Creation 2016-11-28 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2016-11-28 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaCPF03 (HanXRQChr13g0399791)
Name (synonym) HaCPF03 (HanXRQChr13g0399791)
Class CPF Grx    [Orthogroup: CPF003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaCPF03
start..stop		 S start..stop
ThasCPF04 348 1.65e-123 1..231 1..234
ThasCPF03 330 2.19e-116 1..231 1..234
AtCPF04 325 2.51e-114 9..231 12..235
AtCPF03 320 2.65e-112 12..231 17..237
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 85171552..85171556 3 N° 2 85171394..85171468 73 N° 3 85171222..85171282 59 N° 4 85169905..85169991 85
N° 5 85169594..85169692 97 N° 6 85169419..85169521 101 N° 7 85168869..85168942 72 N° 8 85168684..85168791 106
N° 9 85168496..85168576 79 N° 10 85168393..85168401 7  
complement(join(85168393..85168401,85168496..85168576,85168684..85168791,8516886 9..85168942,85169419..85169521,85169594..85169692,85169905..85169991,85171222..8 5171282,85171394..85171468,85171552..85171556))


exon

Literature and cross-references HaCPF03 (HanXRQChr13g0399791)
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr13 (85171556..85168393)
Protein sequence: HaCPF03 (HanXRQChr13g0399791)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   233 (296)
PWM (Da):   %s   26656.85 (32564.5)  
PI (pH):   %s   5.41 (6.50) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-319
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MASVKEVLPPVLDSTSQPPPLFDGTTRLYTNYQCPFAQRVWITRNYGLQDKIKLVPIDLANRPAWYKEKVYPENKVPSLEHNNKIIGESLDLAKYLDAHFDGPALLPNDPAKREFAEELFTYTDTFSKTVLSSFKGDVVKEAGVA
FDYLESALQKFDGPFFLGEISVDFVYIPFVERFQIFIQEVFKYDITSGRPKLAAWIEELNKIDAYTVTKADPEHVIQLYKKRFVDQ*

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCGTAAGAACATCTCTCATCTCTCTCTATTTCTATTTCAATTTGAATTTGATTTTGAAGTTAATATTGATGTATTTTTGTGATAGTATAGCGTGAAGGAGGTTCTTCCGCCAGTGTT
GGATTCTACTTCTCAACCGCCTCCTTTGTTCGACGGAACCACTAGGTATTCGTTCGTGATGTTATCGATTAGTTTAATTGAGTTTAGTGTCACTTTGTTTGTGGTTTAGTGTGATCTGAA
GTTCGTTAATTGGTTTGATTTTGTTTTCAATTGAAGGTGTTATACACAAACTACCAATGTCCCTTCGCACAGCGTGTTTGGATCACCAGGAATTATAAGGTAAATTTGTGGATCTATTCT
ATTGTTTGTAATTTATTTATGATAATTTATAGGTGCACACTTTTTTAGCCCTAAACACTTGATAAAATATTCAATCTGATTTGTTTGGTTGGGTTTTTAAAGATTATAAAATTAGACAAA
TATCATGTGACAGTTTAGTTTATACTTGACCTAAATTCCCTTATTAGTTTAAAGTAAAGTTAAACCTCATGTGACAGTTTAGTTTATACTTGACCTGCGTTGAATGAGCTCTAGGGTATG
TCAACTATGACTAATTGTTTAATCTACTTGAGCATAGTATCATTCATCACATAATACTAAATGATTGCGATAACAAAAAGAACAAATCCATATCATTAACTTTTTTTTTTTTTTTAATTT
ATGACTCAGTTTAGAAAAAATTATGTTTTTTTATGTATACATCAAAAGTAAAAAACCATCAAATAGGTTTTTTCATATGATTTTAAATTCCTATATATGAACAAATAAACTATTTTTTCA
TTTATTTGTTTAATAAAAGGAGAGATGGATGATAAGTTCATATTCATATGCCTTTCTTTTATATTTAAGTTTTTGATGATTAGAAATATAAATGTTTCATTTTGTTCTACAAATAGATCC
TTCCCTTATACTTGTGTGTCACATCCCTTCCTTCAAATTATGTGAGGGAGACTTTTATTTTATGAAAAGTGGTGGTAGATGGTTGCGAGTAGAGAGGAGAAAAAATGTTACTGTTCATCA
TCTGTAAATTTGAGGGGGCACTATTCACTCTTTATAATTTTTTAATATATTTTGAAAGTGGTTGTGAGTGGAAGTGAGAGAAAATGTAATGATAAATGTATTAAAAAGTATTATTTAATT
GAAAATGAGAGAGAAAAGATAGTGATTTTTAGTGTAATAAGGGTAAAAAAATAGGGGGTTGGATGTGAACAGTGGTGGATCCAAGAACTTCTTTCAGTAGGTTCGTTTTGGTAGATTCTC
ACTAGTTTTTTTTCCAAACCGAGTGGGTTCATGTGAACCCATAAAACAAGGCTGGATCTGCCACTGGATGTGAATGCTCTAAGGTAAGGTTGCTTAATGCATAACCAATTTTAAGTAGAG
AACTGCATAACCAAACACTCATACCTATAATGGTTACAAGTAACTTCAAGATCAAGATAGAAAATGTTGGTAGAATTTATATCTCGAAATTAAATTTACATTTTTAAATATCTGGATTTT
GATGTGTAGGGGGACTACAAGACAAGATTAAGCTTGTTCCTATAGACCTTGCTAATAGACCCGCATGGTACAAGGAGAAAGTTTACCCAGAAAATAAGGTATACATTGTTGCTATTCAGT
TTTAATTTGGTATTTAATGAGAAAAATATTTCAAGCTCTTTTTTTATACACAAAAACACTTGATATAATAGCTTGCAAGCATTTTCTTTTCTTTTATGATTTTAAAAAGGTTTATTCTAA
AAATAATAATGTTTAAGTAATTGTTTAAGGTGTATAATGTTGTATCGATGATAATTATATGTTATTTAAGGTGTGCCATCTCTTGAACACAACAACAAAATCATTGGAGAGAGTCTGGAT
TTGGCGAAATATCTAGATGCTCACTTTGACGGGCCTGCATTACTACCAAATGTAAGATTTAACTAACATCTGTCACATTTCCATTTTTACCCCCTCTCAAAGTTGTAACAAGCTTTTGTA
TAGGAGACCCTGCCAAACGAGAGTTTGCTGAGGAGTTATTCACATACACTGACACATTTAGTAAAACAGTGTTATCATCGTTTAAAGGAGATGTTGTGAAAGAAGCTGGTGTGACTCAAA
ACTTTTCTTATAGCTCCTTTTGTATTTAATTTAGGAGTTGAATGTCATTTTAGTCCCTGTGGTTTGGGCCATTTTGCCAGTTTAGTCCAAAGGTTTCATTTTTTGCCTGTGGGTCCAAAA
AGGTTTCACCGTTGCCATTTTAGTCCACTGGGTTAACTTCATCGATTATTTCTGTTGACGAGAAGGGCAATTGGGTCATTTTGTATGGCCGAATTGCTCTTCTAGTTAACAGAATTACAT
ATAAAATGACCCGAATTGTCCTTTTCGTTAACAGAAAAAATGGATGAAGTTAACCCAGTGGACTAAAATGGCAATGGTGAAACCTTTTTGGACCCATAGGCGAAAAATGGAACCTTTGGA
CTAAACTTGCAAAATGTTCCAAACCACAGGGACTAAAATGGCATTTAACTCTTAATTTAGCTATCAAATACTAGTTATGAACTTATAATTTGAAATTTGATCAGGTGTGTTGCTTTTGAT
TACTTGGAATCAGCTCTTCAGAAGTTTGACGGTCCGTTTTTCCTCGGAGAGATCAGTTTGGTGAGTATTCTGTCGAATCGAGCCACTATAAATTTTTACGGGCAGGTTGTTATTGCTAAA
AACCTTATGAATTGCAGGTGTGGACTTTGTTTATATTCCTTTTGTAGAAAGGTTTCAAATATTCATACAAGAGGTATTCAAATATGATATTACCTCAGGCAGGCCAAAATTAGCAGCATG
GATAGAGGTATCAGTTTTTTTTTTTTTTGGTTAACTCCATTGGCTTTAATGGTCAAATGATCTTATTCCAACAAGTTTTTAGAAGTATTTAATTTTAACATTAACCTTATACAGGAGAAC
TGAACAAAATTGATGCGTACACAGTGACAAAAGCGGACCCTGAACACGTTATTCAGTTGTACAAAAAGCGTTTTGTGGTAACTAGCGTTTCGCAGCACATACAAAGTTTCTTTTTATATT
TTTTTATGTTGGTTAAATAATTAGGTAATGCATCATATATCATTGTTGCAGGAGATCAGTGA

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCTAGCGTGAAGGAGGTTCTTCCGCCAGTGTTGGATTCTACTTCTCAACCGCCTCCTTTGTTCGACGGAACCACTAGGTTATACACAAACTACCAATGTCCCTTCGCACAGCGTGTT
TGGATCACCAGGAATTATAAGGGACTACAAGACAAGATTAAGCTTGTTCCTATAGACCTTGCTAATAGACCCGCATGGTACAAGGAGAAAGTTTACCCAGAAAATAAGGTGCCATCTCTT
GAACACAACAACAAAATCATTGGAGAGAGTCTGGATTTGGCGAAATATCTAGATGCTCACTTTGACGGGCCTGCATTACTACCAAATGACCCTGCCAAACGAGAGTTTGCTGAGGAGTTA
TTCACATACACTGACACATTTAGTAAAACAGTGTTATCATCGTTTAAAGGAGATGTTGTGAAAGAAGCTGGTGTTGCTTTTGATTACTTGGAATCAGCTCTTCAGAAGTTTGACGGTCCG
TTTTTCCTCGGAGAGATCAGTTTGGTGGACTTTGTTTATATTCCTTTTGTAGAAAGGTTTCAAATATTCATACAAGAGGTATTCAAATATGATATTACCTCAGGCAGGCCAAAATTAGCA
GCATGGATAGAGGAACTGAACAAAATTGATGCGTACACAGTGACAAAAGCGGACCCTGAACACGTTATTCAGTTGTACAAAAAGCGTTTTGTGGATCAGTGA

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
CCCTCTATAA ATATAACGAT ATCCCCGTTA CATGTGTCTT ACTCTCGTCT GTCTTCACTT CACCGTTTCT CGAAGCATCT CATAACAATA ATAATGGCTA GCGTGAAGGA GGTTCTTCCG  CCAGTGTTGG ATTCTACTTC TCAACCGCCT CCTTTGTTCG ACGGAACCAC TAGGTTATAC ACAAACTACC AATGTCCCTT CGCACAGCGT GTTTGGATCA CCAGGAATTA TAAGGGACTA  CAAGACAAGA TTAAGCTTGT TCCTATAGAC CTTGCTAATA GACCCGCATG GTACAAGGAG AAAGTTTACC CAGAAAATAA GGTGCCATCT CTTGAACACA ACAACAAAAT CATTGGAGAG  AGTCTGGATT TGGCGAAATA TCTAGATGCT CACTTTGACG GGCCTGCATT ACTACCAAAT GACCCTGCCA AACGAGAGTT TGCTGAGGAG TTATTCACAT ACACTGACAC ATTTAGTAAA  ACAGTGTTAT CATCGTTTAA AGGAGATGTT GTGAAAGAAG CTGGTGTTGC TTTTGATTAC TTGGAATCAG CTCTTCAGAA GTTTGACGGT CCGTTTTTCC TCGGAGAGAT CAGTTTGGTG  GACTTTGTTT ATATTCCTTT TGTAGAAAGG TTTCAAATAT TCATACAAGA GGTATTCAAA TATGATATTA CCTCAGGCAG GCCAAAATTA GCAGCATGGA TAGAGGAACT GAACAAAATT  GATGCGTACA CAGTGACAAA AGCGGACCCT GAACACGTTA TTCAGTTGTA CAAAAAGCGT TTTGTGGATC AGTGAAGTTG ATGAAGTCCT TGGAATCATG ATCCTTTGGG TGAATAAAGT  TGTATGTGTG TCAACTAGTA GTGTTGTGTC TGTCTTATAG ATGGAGAAAC ATATGGTCTT TTGTTGTTAC ATATGATGAT AATAAATGTA TTGCATAATT GCAGACTAGA TGGTGTCTGT  CAAATGAACT GGTGTTGTGT TTCTTATTTT ATGTAGTATA TACAAGTGCA ACAGATGACA AACTAGACAT CCCAAGTATT ATTTTTTGTT TAAAAAGACT ACATACATAA TACAATCTGA 
TTTTTATATC AAA 

Retrieve as FASTA