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Entry information : HaSTC16HanXRQChr06g0177961
Entry ID 14591
Creation 2017-11-07 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2017-11-23 (Catherine Mathe (Scipio))
Peroxidase information: HaSTC16HanXRQChr06g0177961
Name HaSTC16HanXRQChr06g0177961
Class Stellacyanin    [Orthogroup: STC003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Asteraceae Helianthus
Organism Helianthus annuus (Sunflower)    [TaxId: 4232 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value HaSTC16
start..stop		 S start..stop
HaSTC15 322 9.25e-115 10..171 8..169
HaSTC22 199 5.5e-66 1..129 1..128
HaSTC21 189 5.12e-60 1..124 1..124
HaCRX04 97 2.65e-26 6..133 1..134
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '14591' 'complement(join(45692785..45692816,45696647..45697012,45697087..45697270))' Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 45697087..45697270 182 N° 2 45696647..45697012 364 N° 3 45692785..45692816 30  
complement(join(45692785..45692816,45696647..45697012,45697087..45697270))


exon

Literature and cross-references HaSTC16HanXRQChr06g0177961
DNA ref. HanXRQ genome:   HanXRQChr06 (45697270..45692785)
Protein sequence: HaSTC16HanXRQChr06g0177961
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   193 (164)
PWM (Da):   %s   19879.42 (16710.7)  
PI (pH):   %s   7.94 (7.43) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-193
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MNCTKMANKNLSIIILIATLVAQATWVRAAEHIVGDDKGWTEGVD
YHAWATAREFKPGDKLVFNYDPAKYRVLFVSYCQYKWCNTEGSVFPIKDEAILGVAGDYTFISNRDECLKGMKLHVHVRRPPGECPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGGCPGG
CPLKVAKRAGRP

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAATTGTACCAAAATGGCTAACAAGAATTTGAGCATCATCATCCTCATAGCAACCCTAGTGGCTCAAGCTACTTGGGTTAGAGCAGCAGAGCATATAGTTGGAGATGATAAAGGTTGG
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GTTGATGGGTTATTAGTATAAAGGTGGCAAAAAGAGCTGGTAGACCGTAG

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAATTGTACCAAAATGGCTAACAAGAATTTGAGCATCATCATCCTCATAGCAACCCTAGTGGCTCAAGCTACTTGGGTTAGAGCAGCAGAGCATATAGTTGGAGATGATAAAGGTTGG
ACCGAGGGTGTCGATTACCATGCATGGGCTACGGCTCGAGAATTCAAGCCGGGAGACAAACTTGTGTTCAATTACGATCCAGCAAAATATAGGGTATTATTCGTAAGTTATTGCCAATAC
AAGTGGTGTAATACCGAGGGATCAGTTTTTCCAATAAAGGATGAGGCCATCCTAGGAGTAGCAGGCGACTATACGTTTATTTCTAATCGAGATGAGTGTTTGAAAGGTATGAAGCTTCAT
GTCCATGTCAGGCGGCCACCTGGAGAGTGTCCCGGTGGATGTCCCGGAGGGTGTCCGGGTGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGTGGGTGTCCCGGAGGATGTCCCGGT
GGGTGTCCCGGTGGATGTCCCGGAGGGTGTCCCGGTGGATGTCCTGGAGGGTGTCCCGGAGGGTGTCCATTAAAGGTGGCAAAAAGAGCTGGTAGACCGTAG

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAATTGTA CCAAAATGGC TAACAAGAAT TTGAGCATCA TCATCCTCAT AGCAACCCTA GTGGCTCAAG CTACTTGGGT TAGAGCAGCA GAGCATATAG TTGGAGATGA TAAAGGTTGG  ACCGAGGGTG TCGATTACCA TGCATGGGCT ACGGCTCGGG AATTCAAGCC GGGAGACAAA CTTGTGTTCA ATTACGATCC AGCAAAATAT AGGGTATTAT TCGTAAGTTA TTGCCAATAC  AAGTGGTGTA ATACCGAGGG ATCAGTTATG CAAATAAAGG ATGAGGCCAT CCTAGGAGTA GCAGGCGACT ATACGTTTAT TTCTAATCGA GATGAGTGTT TGAAAGGTAT GAAGCTTCAT  GTCCATGTCA GGCGGCCACC TGGAGAGTGT CCCGGTGGAT GTCCCGGAGG GTGTCCGGGT GGGTGTCCCG GAGGGTGTCC CGGTGGGTGT CCCGGTGGGT GTCCCGGAGG ATGTCCCGGT  GGGTGTCCCG GTGGATGTCC CGGAGGGTGT CCCGGTGGAT GTCCTGGAGG GTGTCCCGGA GGGTGTCCAT TAAAGGTGGC AAAAAGAGCT GGTAGACCGT AGATGAACAG ACTCTGGCCA  GGTAATCCCG CATGTTCCAA AAATAAATGC ACACAACCGG TCCATGAAAG TTTTGCTAGG ATTCATGAGG GGATGGAAGT GCTTAACGAT CTTTACTTCC TGTGATGGTG TTCAAAGAAA  AAGAATGTGT TAGTAATGTT CATAATGGTA TAAAAGGCTG CTGCAGAAAT ACATTAATCT TTCATCAACC TGAATGGTGG TTCTGATTGC AGATGCTTGT ACAATATCTG AATCGGCATG  TGAAAGCTGG ATTGAAGGCA GAGGTGTGAG TTGATTTATC CTGCAATGAG GGACACCTGC AATCCTTTAC AAATGATGAC TACTCAACAG TTAAAGGGCC GAAGAAAAGC GAATACCATC  GATTAGTTGG AACGATGCCA GCCACAAAAA GTAACAGTGC TTCTTCGACA AACTCACAAA CTATTGATCA TCTAAAGAGT GTTGTCAATG CTATGGCTAT CGTCATCCAA GAACATATCC  TCAATGCAAA CCTGTCTTTG GTTCTTAGCA ATACGAACAT ATAGGTAATT ACATGCATGA ACCATTATTT GTTCTTTTAC GATTATGTAT TTATGTACCA GCATTTGTTT CATTTATATG 
TCTTAGGTCT CTGGTATTGG TTCTTTGGGC AATAAAGATG TTTGGACAAT TGATCTTTAA ATTTTTGTTG ACAT 

Retrieve as FASTA