View Redoxidase 16342

Entry information : CcajRboh01(Cajca_02872)

Entry ID	16342
Creation	2020-03-12 (Baptiste Sarrette)
Last sequence changes	2020-03-22 (Christophe Dunand)
Sequence status	complete
Reviewer	Not yet reviewed
Last annotation changes	2020-05-04 (Christophe Dunand)

Peroxidase information: CcajRboh01(Cajca_02872)

Name

CcajRboh01(Cajca_02872)

Class

Respiratory burst oxidase homolog [Orthogroup: Rboh004]

Taxonomy

Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons

Organism

Cajanus cajan [TaxId: 3821 ]

Cellular localisation

N/D

Tissue type

N/D

Inducer

N/D

Repressor

N/D

Best BLASTp hits

Perox	score	E-value	CcajRboh01 start..stop	S start..stop
GmRboh04	1479	0	1..818	1..820
PvRboh07	1474	0	1..818	1..823
GmRboh13	1474	0	1..818	1..821
PauRboh09	1466	0	1..818	1..814

Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '16342' 'join(526..892,1333..1489,1594..1642,1902..2015,2108..2542,3238..3624,4192..4287,4862..4977,5108..5210,5288..5470,5595..5726,5857..5985,6370..6448,6678..6787)'

Exons►

Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size	Exon	Start..End	Size
N° 1	526..892	365	N° 2	1333..1489	155	N° 3	1594..1642	47	N° 4	1902..2015	112
N° 5	2108..2542	433	N° 6	3238..3624	385	N° 7	4192..4287	94	N° 8	4862..4977	114
N° 9	5108..5210	101	N° 10	5288..5470	181	N° 11	5595..5726	130	N° 12	5857..5985	127
N° 13	6370..6448	77	N° 14	6678..6787	108
join(526..892,1333..1489,1594..1642,1902..2015,2108..2542,3238..3624,4192..4287, 4862..4977,5108..5210,5288..5470,5595..5726,5857..5985,6370..6448,6678..6787)

Literature and cross-references CcajRboh01(Cajca_02872)

Protein ref.	GenPept: XP_020228075.1 KYP56695.1 [Incorrect prediction]
Cluster/Prediction ref.	Genebank: 109809237

Protein sequence: CcajRboh01(Cajca_02872)

Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)

Length (aa):	818
PWM (Da):	92294.6	Transmb domain:	o293-310i370-392o425-447i473-495o
PI (pH):	9.71

Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

MDGLLKSQIPLNDRSLIALFKSSPSSSSLSSSSTVKEVLHSSSLVQTRYEVSNDVADLSSEQKQKCSHIIENGAIQGVRFINGIVGQSGMEWKDVENRFDQLGRTGSGAEPVVAWSEFGS
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SKAHSPMKQVAATGSSIQNVHKTNGGDFCDEEEEPMSWTEVLFRTYWRRCWVVLLWVLACLGLFVWKFVQYSHRSGFEVMGYCLPTAKGAAETLKLNMALVLLPVCRNTITWLRKHRPIN
SVIPFNDNINFHKLIAGGIVVGVILHGGTHLACDFPRISESDRSIFRQTIAAGFGYHRPTYVELLATTEVTSGIGMVVLMGVAFPLATKWPRRRSPVLPVSLRRVTGYNTFWYSHHLFVL
VYALLIIHSMFLFLTDKLMEKTTWMYIAFPVLLYAGERIFRAIRSGSYEVDILKASLYPGKVLYLKIQKPEGFKFQSGMYIFLQCPQISPFEWHPFSLTSGPRDDYLSVHIRTLGDWSYQ
IYALFQAVLSRSQGCPKLYIDGPYGSAAQDHVKYDILVLIGLGIGATPFISILKDVVKSVQTTQIDDSGLRKCSLTKGPLKAYLYWVTREPNSFDWFRDVMKEISNSTKKQSVVEMHNFL
TSVHPEGDIRSALLSVIQALHFAKNGTDIVSRTPIHTHFARPNWFNIFSRLARKHGGAKIGVFYCGPSKLARELKKLCTKFSTKTTTRFVFHKENY

Retrieve as FASTA

Remarks

DNA ►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

ATGGATGGGCTTCTAAAGTCCCAAATTCCTCTTAATGATCGTTCCCTCATTGCTCTCTTCAAATCATCACCTTCTTCTTCGTCCTTGTCTTCTTCTTCGACCGTCAAAGAAGTCCTTCAT
TCCTCGTCCCTGGTTCAAACCAGGTACGAGGTTTCTAACGATGTAGCAGACTTGAGTTCGGAACAAAAACAAAAATGTTCTCACATAATAGAAAATGGAGCAATTCAAGGTGTGAGGTTC
ATCAATGGCATTGTTGGTCAGAGTGGAATGGAGTGGAAGGATGTGGAGAACCGGTTCGACCAACTTGGTCGAACCGGTTCTGGAGCCGAACCGGTTGTGGCATGGTCCGAATTTGGCTCC
TGCGTTGTGGTGAGAATAGGAAACTAAAGTCAGCAGTTCATGCAACATTATCACTTTGTTTCACGACCACAAATACAATAATTCATAATGCATTAATGCATGATGTTCTTTGAGACATTG
ATAAGTCCTTTTCTATGTCTCTTCTGTTTATCATCTGGCACTGGTCAATTAACTCGAGAATCATATCGAGCAGAGTAGTTAGCCACCTTAGCCATGTTCTTCGGATACGCTATAGTGCCG
TAATATAAGACAACTTGTGTCATTTTTATTATTCATCTCCCTACTTAATTTATTTCAATGATCAATGTTCAACACTTTATTTCTCATTTTTTTAATAATAACAAAAGACCAAATACGTTA
TCTATACCTACCTGTTCTTAAATAATTCTGATCTTATTCTGCAAATTATTGTCTTAATTTTTCACTCTCAATTATGTCCTATTTTATAGGGATGCAGTCATCACCCGAGTTTGCCAATGA
ATTGCTAAGAGCGTTGAGAGGAGGCAAGCATTGGAAATCCAATATCACCAAAACTGATTTGTACAATCTTTGGTTTCGGATGAAGGACAATTCTTTTAACTCGAGATTGCGAATCTTCTT
TGACATATGTAAAAACCAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAAAAAAAAACCTCTGCTAAACTCTCTTATGCACAATTCTGAGATCAAATAATAATTTTTCATTGGCTTTACTTTAGGTGTAACA
GAAACAAGGACGGAAGAGTCACCGAAACAGATATAAAACAGAGGTTATTATTTATTTAATGAAGTTTAATTTATAATTAACTTTACTAGCTAGGGTGTGGTGAGGCTGCTTAAATTTGCA
TGTGTTAATTGTCTTGTTCCGCATGTTGGCGTTGATTTTGGCCCTTCTTCCACAGAAAAACTCTATGATGTGTGGTTCCATAATTAATTGTAGGTGCTGTGTATACAAACCGTCAATTAT
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AATGTTCACAAGACTAATGGTGGTGACTTTTGTGATGAAGAAGAAGAACCAATGTCATGGACGGAAGTGTTGTTCAGAACGTACTGGAGACGTTGTTGGGTTGTTCTACTTTGGGTGCTT
GCATGTTTGGGGTTATTTGTGTGGAAATTTGTCCAGTATAGCCATAGATCAGGGTTTGAAGTCATGGGTTATTGCCTTCCCACTGCTAAAGGTGCAGCTGAGACGTTAAAACTCAACATG
GCTCTCGTTCTTCTTCCGGTTTGTAGAAACACAATCACGTGGCTCCGCAAACACCGTCCCATCAACTCTGTCATTCCATTCAATGACAACATTAACTTCCACAAGAGGTACCCTCTCTAA
TTGTTCCTTCATTTCATTTAACTTGTTCATAACACATTTCTTGGAACCCGAACTGAGAAATTCTTGTATGAATTGGAATATCGTGTGTTTATGGTTCCAAATAATGGATAAAGCTTATAT
GTAGTATCTTAAGTATTGTTCGCCCTGTTCTACAATTAGAATCAAAGCTTCACTTCACTAATATATAGGTAAAACTCAAATTTTAACATGAAAACAATATCAACAATACTTTTAATATCA
TAATTTAGTGTTATTTTTTCTATAATAATCTACTTAGATATAAATTTTAGAACGTTTTTGAAAATTTCTTTATTATAAAATATATATATTTTTTATATTTTTAATAAAAAAACTTTTAAC
TTATATCTAATAAAATTCCAAGTATATTTAGTATTGCCTTTCAATCAAAATTAAAATAGTCCATATAATGAATTTCATTAAATGCCAATGTGTTCGATTCTTATGGGAGAATAATATGTG
GAGTAACTATAGTACTGCATCTAAGTTGTCCATCAAACGTGTTTACAATATAGTTAGCAGATGACTGAATTTGTTAAACAAAAAAATGATAGACTCCATTTTTCTTTCTACTATTGGTAC
ATAGCAAAGCACATTGTAAGAATGATGTGGAAAAACAAAGATGATGCCATTAGTAGTTTAATTTAGCGGACGTACTATGCAGTTGATTGCAGGAGGAATAGTGGTGGGAGTGATATTGCA
CGGTGGGACGCACCTGGCGTGTGATTTTCCGAGAATTAGTGAGTCAGACAGATCGATATTCCGGCAAACGATTGCGGCGGGGTTCGGTTACCACCGGCCGACGTACGTGGAATTATTGGC
CACGACGGAGGTGACGAGTGGGATAGGCATGGTGGTGTTAATGGGCGTCGCATTTCCGCTGGCGACGAAGTGGCCAAGGCGTCGGTCACCGGTGCTGCCGGTGTCCCTCCGACGTGTCAC
CGGATACAACACCTTTTGGTATTCCCACCATTTGTTTGTCCTCGTCTATGCCTTGCTCATCATTCACTCCATGTTCTTGTTCCTTACCGACAAGTTGATGGAGAAAACGCGGTAACCCTT
TTTTCATCACTTTTTCCATCCTTGTTTCTTCTGTGTTTTTTACTTTCTCGTGATTTTTGGCGTCATTTCACTGCCTTGCTGCGTTAATATAACAATAGAGTAAAGTGAATGTGAATGTTT
ATTCTTCTTTTTTTTACTAATAACGGTTAATAAAAAAAACACCCACTCACTCATTCAAGTCTAGTTTTCTATTGGGAAGACATGGACAGCCACGTATGAGACTCGTTTTGTCGAATTCTA
TTACTGTGTGTCTCTTGTAACATGTATTATATATTATGTCAGTTTTTTTCTCTCAAAAAATATTAAAAAATGTGGCATTATGAACCTACCAGAAACAGTTGTTTAGCACTTACCAGAAAA
ATGTGGCATTGAGAATGTTCAAGACTGAATTATTGACTCTTCTGCATTATTTGAACTCCTTGCCACTACTTTATTCCGAGTTGTTCATTGTTGTGATTAAGACGGTAGCAAAAGTTACTA
GAAAGCTCTTTAATTTAAAAAATTATAGAACAAATTTTGGTGTAGAATTTTAATTTCTATTTAATTTTCCATGTGCAGACATGGATGTACATTGCTTTTCCAGTTTTGTTATACGCCGGA
GAAAGGATCTTTCGAGCCATTAGATCTGGATCTTACGAAGTTGATATTTTGAAGAGGTATTTGATCAGCTTTTCTATATATTCAACTGTTTGTAAAATATGTGGGTTTAAAGTTTCTGTT
GATAAATTTTCTAGTAAAAAAATTTGAAATTTTAATTTTAATTCTAATTTTAAATTGATTTATTCAAACAAGACATTTAAAGAATAATAAAATTAAAATCAAATAACTTAAATTTTTTGA
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AAAAAAATTGAAATTATATTATTTTAAGAAATTTTATAAATACTTAAATTTTAAAAAAAAATTATTCCATTTAAATTTTTTATTGAAACACAGTATTATTTCTTTTCTCAAGGATATTTA
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TGCCCCCAAATTTCGCCCTTTGAATGTGGTACTTCTGCTTCCTTCATGCGACCATTTTTATTTACAATTAATTCAATTCATTATTCCAATTTTTGTGTTGTCCAGTTGGTCAATCAATAT
CGATGTTCTATTTGAGTTTCTTTTGTCTAAATTTTCAGGCATCCGTTTTCCTTGACTTCAGGACCACGAGATGATTACCTCAGTGTGCACATTAGAACACTCGGAGACTGGAGCTACCAA
ATATATGCTCTATTCCAAGAGAGGTGAAAATAGAAAATTTTAAGTGCAAAATTGTGCTTTTTGGAATTCTTTGGCCTGAAAATTTGTCCGCAATCTGCAGGCGGTGTTATCACGATCACA
AGGGTGTCCAAAACTGTACATAGATGGCCCTTATGGCTCTGCTGCTCAAGACCATGTAAAGTATGACATTCTGGTACTAATTGGTCTTGGCATAGGAGCCACACCTTTCATTAGCATCCT
TAAAGATGTAGTTAAAAGTGTCCAGACAACGCAAATTGATGATATGTAAGATTTTCTATTGTGTTATTTATTTGAGTATTTTCTTTCTATGATAAATGTCTTCACTAAAATTCAATTGCT
CTGCTTCTGTCTCATTAAACAAATGCCACATTTTGGGCATTCGAAATAGAGTGGTCTCAGAAAATGCAGCTTAACAAAGGGTCCATTAAAAGCATATCTTTATTGGGTTACAAGAGAGCC
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CTTTTATTATAAATGTGCAATTAAAATCTTCAAGGATTTTTCTTAACTATCTAATTTTCTGATAATCTTTAAGTCGGTTGTGGAGATGCACAATTTCCTGACCAGTGTACATCCAGAAGG
AGATATTCGTTCAGCTTTGCTAAGTGTGATTCAGGCCTTGCATTTTGCCAAGAATGGCACTGACATAGTTTCCAGGACTCCACAGTAAGTGCATCTTCTCTTTAGTTTTAGTCAATATAT
GTAGCCAAAATATATGAATTACAAGCAACCTTTAAATTTAGAGTAGTGGCGTTAAAGAAAATCATACAAGATAGTTTAGGCTTGATGCCTTCTGGTTGAAGTTAGATTACGTTATTGTCA
TTTTGCTATATATCAAGTTTGGCATAACAAAACAACATTCTTCAATCTGTCATTTCAAACCATGTTATTAACTGCTCCAACTTAAAGTCGCTTGGAAGAATCTTAACAAATACATGTCAG
CCAAAATATTTTTTTTTAAATAAATGAATCATTCGTGTCTGGTCAAGACTGCACATATGTTTTGTTGTTGTTTGATTAAAAAAATATTTCTCCATCCAAAATTTTCAGATACACACGCAT
TTTGCTCGACCAAATTGGTTCAACATATTTTCTAGATTGGCTCGCAAGCATGGAGGAGCTAAGATTGTGGTGAGAAAAAAATTCCCTCGTGATTCAAGATTTTTATTTCTTTTAATGAAA
CTCGTTACTTAATTGTATAAATTCCCAACTTTGTATCTTATTTAATCATTGAAATAGGCATGCTTAATTTAAAGGCTAAAGTTTTACCCAACCCCCCTATCTCTATATATTTATATTATA
TAAGAAAATAAGAGGTTAAATTGTTTTCCTAACTAGGGATATGAGTTTTCTCTTACAGGGGTTTTCTATTGCGGCCCATCTAAATTAGCAAGAGAGTTGAAGAAGTTATGCACCAAATTT
TCCACCAAAACCACAACTAGATTTGTTTTCCACAAGGAAAACTATTAA

Retrieve as FASTA

CDS►
Send to BLAST

.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2

Retrieve as FASTA