Entry information : GmRboh13(Glyma.17G078300./ Glyma17g08610)
Entry ID 7178
Creation 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-03 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-04-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmRboh13(Glyma.17G078300./ Glyma17g08610)
Name GmRboh13(Glyma.17G078300./ Glyma17g08610)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmRboh13
start..stop
S start..stop
GmRboh04 1570 0 1..822 1..821
PauRboh09 1492 0 1..821 1..814
PvRboh07 1476 0 1..821 1..823
CcajRboh01 1475 0 1..821 1..818
Literature and cross-references GmRboh13(Glyma.17G078300./ Glyma17g08610)
DNA ref. GenBank:   ACUP01009771.1 (330375..324186)
EST ref. GenBank:   CO985132.1 [5' end]  BM523487.1 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Gma.6385
Protein sequence: GmRboh13(Glyma.17G078300./ Glyma17g08610)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   821 (313)
PWM (Da):   %s   93141.97 (36136.1) Transmb domain:   %s   o294-313i378-397o428-450i476-498o
PI (pH):   %s   9.97 (8.16) Peptide Signal:   %s   cut: 18 range:18-330
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
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MHNFLTSVHP EGDIRSALLS VIQALHVAKN GTDIVSRTQI HTHFARPNWF NIFSRLARKH GGAKIGVFYC GPSKLARELK KLCTKFSTKT TTRFVFHKEN Y* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 17, 14 introns) and 9 ESTs (BE555472.1, BQ081563.1). Chromo position Gm17:6368476..6374763.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATGGAC TTGTAAAGTC TCAAGTTCCT CATGAACGTT CCCTCCTTGC TCTCTTCAAA TCATCACCCT CTTCATCATC GTTATCTTCC TCATTCTCTT CTTCTTGGAC CTCTGAAGTA  GTCCTTCAGA CAAGGTCCAA GATTCGGCGT GAAGGTGAGC CTAACAATGT AGCAGACTTG AGATCGGAAC AAACACGTTC TCACATAATA GAAAATGAAG CAATTCAAGG TGTGGGATTC  ATCAATGGCA TTGATGGTCA CAGTGGAATG GAGTGGAAGG ATTTGGAGAA ACGGTTCGAC CAGGTGGCAC GAACCGGAAG TGGAGCCGAA CCGGTTGTGA CATGGTCCGA ATTTGGCTTC  TGCATTGGTG AGAATAGCAA ATTAAAGTCA ACAGTTCATG TAATAACATT AATTATAACT TTGTTTCACG ACCACAAATA CAATAATTCA CACAATGCAT GATGCTCATT TGAGACTTTG  ATAAGTCCTT TTCGGTGTCT CTAGTGTTTA TCATCTGGCA TTGGTCAATT AACACGAGAA TAATAGAAAG CAGAGCAGTT AGCCACCTTA GCCATGTTCT TCGGATACGC TATAGTGCCG  TAATATAAGA CAACCAGTTT AATTTTTATT TTTTTTTATT CTTCTTCCTA CTTTAATTTA GTTCAATGAT CAATGTTCAA CACTTTATTT CTCCTTTTAT AATTCTCCAT TAGTTTAATA  TCCTTTTAAT AATATAAAAA AAAACAAATG CGTTATCTAC ACCTACCTGT AACCTGTTCT TAATTTATTC TGATCTTATT ATTATGCCAA TTATTGTTTT AGTTTTTCAC TTTCAATTAT  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GAAGAAGTTG TGCACCAAAT TTTCCACCAA AACCACAACT AGATTTGTTT TCCACAAGGA AAATTACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
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ATGGATGGAC TTGTAAAGTC TCAAGTTCCT CATGAACGTT CCCTCCTTGC TCTCTTCAAA TCATCACCCT CTTCATCATC GTTATCTTCC TCATTCTCTT CTTCTTGGAC CTCTGAAGTA  GTCCTTCAGA CAAGGTCCAA GATTCGGCGT GAAGGTGAGC CTAACAATGT AGCAGACTTG AGATCGGAAC AAACACGTTC TCACATAATA GAAAATGAAG CAATTCAAGG TGTGGGATTC  ATCAATGGCA TTGATGGTCA CAGTGGAATG GAGTGGAAGG ATTTGGAGAA ACGGTTCGAC CAGGTGGCAC GAACCGGAAG TGGAGCCGAA CCGGTTGTGA CATGGTCCGA ATTTGGCTTC  TGCATTGGGA TGCACTCATC ACCAGAGTTT GCCAACGAAT TACTCAGAGC ACTGAGACGC GGCAAGGGCT GGAAATCCAA TATCACCAAA ACTGATTTGT ACCATCTTTG GTTTCGGATG  AAGGATAATT CTTTTAACTC AAGAATGCGA ATATTCTTTG ACATGTGTAA CAGAAACAAG GATGGAAGAA TTACCGAGAC AGATATAAAG CAGACAATTT TATTAACCGC TTCTACAAAT  AAGCTATCCG TGACACATGA TGAAGCAGAG GACTATGCTT CTTTGATCAT GAAATTTCTA GACAAGAAAA ACAAAGGCTA CATTGAGATA TCTCAAATGG GGTCTCTATT CAAGGCAACA  AATCTATCAA ATTCAAAGGC ACATTCTCCA ATGAAACAAG TATCATCAGT AGGTAGCAGC ACACACAATG TTCTTCATAA CACTAGCGGT GACTTTTGTG AAGAACAACA AGAACCAATG  TCAAGGACTG AAGTTTTGTT CAGAACTTAT TGGAGACGTG CTTGGATTGT TCTGGTTTGG TTGCTTGCAT GCTTGGGATT GTTTGTGTGG AAATTTGTTC AATACCGCCA TAGATCAGGG  TTTGAAGTCA TGGGTTATTG TCTTCCTACT GCTAAAGGTG CAGCTGAGAC CTTAAAACTC AACATGGCTC TTGTTCTTCT TCCTGTTTGT AGAAACACAA TCACGTGGCT CCGCAAACAC  CGTCCGATCA ACTCTGTTGT TCCATTCAAT GACAACATTA ACTTCCACAA GCTTATTGCA GGAGGAATAG TGGTGGGTGT GATCCTGCAC GGTGGAACGC ACCTTGCGTG CGATTTCCCA  AGAATCAGTG AGTCGGATAA ATCAATATTC CGGCAAACTA TTGCCGCAGG ATTCGGGTAC CACCGGCCAA CGTACACGCA AATTTTGGCG ACGACGGAGG TGGCCAGTGG GATAGGCATG  GTGGTGTTAA TGGGCATTGC ATTTGCACTG GCAGCCAAGT GGCCACGGCG TCGGTCACCG GTGCTGCCGG TGTCCCTCCG TCGTGTCACT GGTTACAACA CATTTTGGTA CTCTCACCAT  TTGTTTGTCC TTGTCTATGC CCTGCTCATT ATTCACTCCA TGTTCTTGTT CCTAACCGAC AAGTTGATGG AGAAAACGAC ATGGATGTAC ATTGCTTTTC CAGTTTTATT ATACGCTGGG  GAGAGGATCT TTCGAGCCAT TAGATCTGGA TCTTACGAAG TTGATATTTT GAAGGCAAGT ATATGTCCAG GAAAAGTTTT GTACCTCAAA ATGCAAAAAC CAGAAGGTTT TAAGTTCCAT  AGTGGCATGT ATATATTCAT TCAGTGCCCC CAAATTTCGC CCTTTGAATG GCATCCATTT TCCTTGACTT CAGGGCCACA AGATGACTAC CTCAGTGTGC ACATTAGAAC ACTCGGAGAC  TGGAGCTACC AAATATATGA TCTATTCCAA GAGGCAGTGT TATCACGATC AAAAGGGTGT CCAAAACTGT ACATAGATGG CCCTTATGGT TCTGCTGCTC AAGACCATGT AAAGTACGAC  ATTCTAGTAC TAATTGGTCT TGGCATAGGA GCAACACCTT TCATTAGCAT CCTTAAAGAT GTAGTTAAAG GTGTCCAGAC AACGCAAAAT GATCATAGTG GTCTCAGACA ATGCAGCCTA  ACAAAGGGTC CATTAAAAGC ATATCTTTAT TGGGTTACAA GAGAGCCAAA CTCTTTTGAC TGGTTTAGAG ATGTCATGAA GGAAATCTCA AATTCAACTA AAAAACAGTC GGTTGTGGAG  ATGCACAATT TCCTGACAAG TGTACATCCA GAAGGAGATA TTCGTTCAGC TTTGCTAAGT GTTATTCAGG CCTTGCATGT TGCCAAGAAT GGCACTGACA TAGTTTCCAG GACTCAAATA  CACACACATT TTGCTAGACC AAATTGGTTC AACATATTTT CTAGATTGGC TCGCAAGCAT GGAGGAGCTA AGATTGGGGT TTTCTATTGT GGACCATCTA AATTAGCAAG AGAATTGAAG 
AAGTTGTGCA CCAAATTTTC CACCAAAACC ACAACTAGAT TTGTTTTCCA CAAGGAAAAT TACTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
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GAACAAATCT TGTACAATTT AACGGGTATC CGTATAACAA CATGTCAATA AACTGTGGAT TTTGAATCTA CA 

Retrieve as FASTA