Entry information : NoffAPx-R01-1B(Nasoff22g0033090.t1)
Entry ID 17558
Creation 2022-04-23 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2022-04-23 (Catherine )
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-11-28 (Catherine )
Peroxidase information: NoffAPx-R01-1B(Nasoff22g0033090.t1)
Name NoffAPx-R01-1B(Nasoff22g0033090.t1)
Class Ascorbate peroxidase related    [Orthogroup: APx-R001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffAPx-R01-1B
start..stop
S start..stop
NoffAPx-R01-1A 568 0 24..326 52..364
AlyAPx-R 560 0 3..326 2..329
TsAPx-R 556 0 1..326 1..330
AtAPx-R 552 0 3..326 2..329
Literature and cross-references NoffAPx-R01-1B(Nasoff22g0033090.t1)
Protein sequence: NoffAPx-R01-1B(Nasoff22g0033090.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326
PWM (Da):   %s   35414.4  
PI (pH):   %s   9.8
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTTTTITSLL ETCLLKYSSS SPFKFKSLTK TRPFSPANSN HYVRSLKARR IRCVSDAPGS RPAFVSSRRK MLVMLSTVQL LSPLLPPNGN AADIYALMQS EISKVVTKGK AAGVLRLVFH  DAGTFDLDDN SGGINGSIAY ELERPENTGL KKSLKVLGKA KIKVDAIQPV SWADMISVAG SEAVSICGGP TIPVILGRLD SVQPDPEDKL PPETLSASGL KECFKRKGFS TQELVALSGA 
HTLGSKGFGD PTAFDNAYYK ILLTKPWTST SKMTSMVGLP SDHALVEDDE CLRWVKRYAE DQDKFFKDFT NAYIKLVNSG AKWKML 

Retrieve as FASTA  
Remarks
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGACGA CGACGATTAC GTCTCTGTTG GAGACTTGTC TTTTAAAGTA CTCCTCGTCT TCACCTTTCA AATTCAAATC ACTGACGAAA ACACGACCGT TCTCTCCGGC GAACAGTAAC  CATTATGTCA GATCTTTAAA AGCCAGGCGT ATTCGTTGCG TCTCCGATGC TCCTGGTTCG CGTCCTGCTT TCGTTTCTAG TAGAAGAAAA ATGCTTGTCA TGTTGTCCAC AGTGCAGCTT  CTATCTCCTT TGCTTCCGCC AAACGGAAAC GCTGCTGACA TTTATGCATT GATGCAAAGC GAAATAAGTA AAGTTGTGAC AAAGGGTAAA GCTGCTGGAG TGCTTCGTTT AGTGTTTCAT  GATGCTGGAA CCTTTGACCT CGACGATAAT TCAGGTGGCA TCAACGGGTC TATTGCTTAT GAACTCGAGA GACCTGAAAA CACAGGTTTG AAGAAATCTT TAAAGGTTCT AGGGAAAGCA  AAGATTAAGG TTGATGCAAT ACAACCAGTG TCTTGGGCGG ATATGATCTC TGTCGCTGGG TCTGAAGCAG TTTCTATATG TGGTGGCCCA ACAATCCCTG TAATTTTGGG AAGACTTGAT  TCAGTGCAAC CTGATCCAGA AGACAAGCTG CCTCCAGAAA CCCTGAGTGC CTCGGGTTTA AAAGAATGCT TCAAAAGAAA AGGATTTTCG ACCCAGGAGC TTGTTGCTTT ATCTGGGGCA  CATACGCTTG GGAGTAAAGG CTTTGGAGAT CCGACAGCTT TTGACAATGC ATACTACAAA ATCCTTCTTA CAAAACCATG GACATCAACG TCCAAAATGA CGAGCATGGT CGGGCTTCCT  TCAGATCATG CGTTAGTAGA GGATGATGAG TGCTTAAGGT GGGTGAAACG ATATGCGGAA GACCAAGACA AGTTCTTCAA AGACTTCACC AATGCTTATA TCAAACTAGT TAATTCTGGG 
GCCAAATGGA AAATGTTATG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGACGA CGACGATTAC GTCTCTGTTG GAGACTTGTC TTTTAAAGTA CTCCTCGTCT TCACCTTTCA AATTCAAATC ACTGACGAAA ACACGACCGT TCTCTCCGGC GAACAGTAAC  CATTATGTCA GATCTTTAAA AGCCAGGCGT ATTCGTTGCG TCTCCGATGC TCCTGGTTCG CGTCCTGCTT TCGTTTCTAG TAGAAGAAAA ATGCTTGTCA TGTTGTCCAC AGTGCAGCTT  CTATCTCCTT TGCTTCCGCC AAACGGAAAC GCTGCTGACA TTTATGCATT GATGCAAAGC GAAATAAGTA AAGTTGTGAC AAAGGGTAAA GCTGCTGGAG TGCTTCGTTT AGTGTTTCAT  GATGCTGGAA CCTTTGACCT CGACGATAAT TCAGGTGGCA TCAACGGGTC TATTGCTTAT GAACTCGAGA GACCTGAAAA CACAGGTTTG AAGAAATCTT TAAAGGTTCT AGGGAAAGCA  AAGATTAAGG TTGATGCAAT ACAACCAGTG TCTTGGGCGG ATATGATCTC TGTCGCTGGG TCTGAAGCAG TTTCTATATG TGGTGGCCCA ACAATCCCTG TAATTTTGGG AAGACTTGAT  TCAGTGCAAC CTGATCCAGA AGACAAGCTG CCTCCAGAAA CCCTGAGTGC CTCGGGTTTA AAAGAATGCT TCAAAAGAAA AGGATTTTCG ACCCAGGAGC TTGTTGCTTT ATCTGGGGCA  CATACGCTTG GGAGTAAAGG CTTTGGAGAT CCGACAGCTT TTGACAATGC ATACTACAAA ATCCTTCTTA CAAAACCATG GACATCAACG TCCAAAATGA CGAGCATGGT CGGGCTTCCT  TCAGATCATG CGTTAGTAGA GGATGATGAG TGCTTAAGGT GGGTGAAACG ATATGCGGAA GACCAAGACA AGTTCTTCAA AGACTTCACC AATGCTTATA TCAAACTAGT TAATTCTGGG 
GCCAAATGGA AAATGTTATG A 

Retrieve as FASTA