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Entry information : NoffRboh06-1A (Nasoff479g0250970.t1)
Entry ID 18509
Creation 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffRboh06-1A (Nasoff479g0250970.t1)
Name (synonym) NoffRboh06-1A (Nasoff479g0250970.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffRboh06-1A
start..stop		 S start..stop
NoffRboh06-1B 1915 0 1..940 1..941
TsRboh06 1831 0 1..940 1..943
AlyRboh06 1815 0 1..940 1..941
AtRboh06 1811 0 1..940 1..944
Literature and cross-references NoffRboh06-1A (Nasoff479g0250970.t1)
Protein sequence: NoffRboh06-1A (Nasoff479g0250970.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   940
PWM (Da):   %s   107577.16 Transmb domain:   %s   i381-400o519-541i562-584o588-605i741-758o
PI (pH):   %s   9.33
Sequence
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*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRPFSKNDRR RWSFDSVSGG RTAPGSASTS PGTEYSNGGY GEEFVEVTID LQDDDTIVLR SVEPATTINI DISDEAAGGI MTPVSISRSP TMKRTSSNRL RQFSHELKAE AVAKAKQLSQ  ELKRFSWSRS FSGTLTAASN QTGGLVNSAL EARALRKQRA QLDRTRSSAQ RALRGLRFIS NKNKNVDGWN DVQSNFEKLS NNGYIYRSDF AQCIGMKDSN EFALGLFDAL SRRRRLKVDK  INHDELYEYW SQINDESFDS RLQIFFDIVD KNEDGRITEE EVKEIIMLSA SANKLSRLKE QAEEYAALIM EELDPERLGY IELWQLETLL LQKDTYLNYS QALSYTSQAL SQNLQGLRKK  SRLHRMSSDC VYYMQENWKR IWVLSLWILI MIGLFLWKFF QYKQKDAFHV MGYCLLTAKG AAETLKLNMA LILFPVCRNT ITWLRSTRLS CFVPFDDNIN FHKTIAGAIV VGVILHVGDH  IVCDFPRIVR ATEYDYNRYL FHYFQTKQPT YLDLVKGPEG ITGILMIILM IISFTLATRW FRRNLVKLPK PFDRLTGFNA FWYSHHLFVI VYILLILHGL FLYFAKPWYV HTTWMYISVP  ILLYGGERTL RYFRSGSYSV RLLKVAIYPG NVLTLQMSKP SQFRYKSGQY MFVQCPAVSP FEWHPFSITS APEDDYLSIH IRQLGDWTQE LKRVFSEVCE PPVAGKSGLL RADETTKTSL  PKLLIDGPYG APAQDYKKYD VLLLIGLGIG ATPFISILKD LLNNIVKMEE QADSTSDFSR SSEHSTGSNS ENNNTPRRKR ILKTTNAYFY WVTREQGSFD WFKGVMNEVA ELDQRGVIEM 
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Remarks
Promoter►
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GAAGCACGCA TACATACACC ATATATATAT ATATATCATT TAACTTATAT TAGTTATAAA AAACTGGTGT CGATCAAATT TTAACTTTAT AAATATATAG TAGTTATTCA TCTGTCTTCT  AAAATCGGAT ATACAGTATG AATAGACGAA ATATGTATCT CGTTTTCTTT AGACTAAAAA CAGGTTGGTT AATTAGTAGA TATGCTTAAT TAGAAAAAAC AAATGTTTTC TATATAATTA  GCACTATAAC CCATAGATTC ACATGGCCTA GATGTTAAAC CAATTAAAAC TAGCTAGTAA TATACGTATA AATAGTTGTA GCTAGTAATA TATATATATA TATATATATA TTTAGCTGTG  CAAAAAGTTG TTACTTCTTT AACACAAAAA TATAATTATT TAAATCTTAC TAAAACCTAG CTCCTTTAAA ACCTTTGTTA ACATAGTTAA ATTTTATAAA TCTGTCTTCA TAATTTGTCA  AGTCACTAGC CATCACAAGT TTGGCATTTA GCTCAATCAT ACTCCAATAA ATAATCTACA TCTCCACAGT TTAACCGAAC CCAATAGCTT GTTTCTGAAA GTTGTAAAAG TCGAATATTA  ATTGTGTCAT TTAAAATGTT ATAACTACGG CTAAGAATAT AACACAAAGT CTCATTCGAG TTTCAACAAC TTAGTGTGTC ATAAGACTTA ACTCACAAGT GAATATCTGA ATATCCAACC  CGCAATTCAA GATTAAAATC CAAGAAGCAT TTTCAAGTAA AATCTTTTAA TCTATTAGTA TTTAGTGAAG CACTGAAAAC AAATTGCTGT GATCAAATTT GAATTATTCT TATTAAAGTA  AATTCTTTTC GAAAATATTT ATAGTCGTGG ACTTAAGTCA ATCACTGTAA TCCTTGCACC CACCACAAAT TTCATCTAAA GTTTTATTCA AAGTCGTCGT TCTTATTTTG TTCTGATCAG  TTAACAACTT AGGATAAAAC GCGTCGAACG AAAAAAGAAA GAAAGTAGAC TTGCAGAGAC ACGACAGTCA CACAATCACT CAGATTTAAA TGATTCCTTT GGTATACTTC AAATTATAAC  ACATCCGAAT TGTAGCTATC CTTTACATGT TATATTATAA CCTTCTTTTT TTTGGTTCAA AAATTATAAC TTATTAGAAT ATAGATTAGA TTGGTGGCCT TCAAATATTC GTTTATAATG  TAATACGAAT ATTCATTTAG TTTTGTCGAT GATTTTTAAT TGAAGCGTAA ACTACTATAA GTGAAATGTT TGGATAAATA GAGAAACGTA ACTAGTAAAA CAACCGATGA ATAGAATGAC  TAATACAGTC ACAACTCTCA AGTCTCAAAT TATCAACTTT AAAAGCTGGA CAAAATTGAT CAGGTTTAGA GTTCATATCA GTGTATCAAA TACAATAAAG AAGTTTTTAG TGCTTTATTA  CTACTACTAA TTATCACGGG TTTCATACTC AAAATCGATA AATAAATCAA TTGTTAACAA CAACAAAAAA AACAAAGGGG TTTCATCAAT TCGAAGTTGT ACATGATGTA ATTTCATACT  AATTTCTAAT TGGACAAGAA ATTCAAAAAT AATAATGGCA TCTGAAGTAA TAGTACTTTT GTTTTGTCTA AAGTAACAAA ACAAAAATTA TAATAACCTA AAATCTAATA GAAAAAAAAA  TAATAATATG TCTGTCAACT TTTATCCCGG TCTGGTTCGA TCCTCTCCTC TCCATCGTCT TTTATCTCCG TCAACGTTCT CTCTCACTCA TAAGTCTTTA ACCTCTTCAT CACTTTTCTC  TCTATAAAGC TCATATTTCC TCTGCGCGTT CAAAATGGCT TTTTCCACTG AGCCACGACA ACGCGTTTAA TCTCTCTCTC TCTCTTCAAA GATTCCACCT ACCTTTATAC ATATATATAT 
ATATATATAT ATTCTATGCT ACGTGTATAT TCGCCGGCAA GAACCTGATC TGATATCTTT CTGAATCTTC CCGATTATAG 

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AAGACAACAA GGAAGAAACC TAAAGCCCCC TCTAGATTCT TTAATATCTC ACATTTAGCC ACTTATAGTA CTCTATCAAT CTCTTTCACA CCCCTTCCCA TAAAAATACA TTTTTAATTC  AAAGTAATTG AACGTTAACA CACTGTCAAA AGTGAGTGTG TTAACGTTTA GTTCAACACG TTTTAGGTCT ATATATATAC ACCGACGAAT ACGTGTAAAT ATACGAGATG AAGAATATAA  GGGGGGAAAT TTATCGCAGC ATATAGTAAA AAGTTTTAAG TTATATATTA GGGTTCTTTT ATATATTCTT GTATAGCAAG CAAATGAGAT TCTAGAAGAG AATCGAGGTT TGGTGAGGGA  AAGAGACTAA TCCGACGTCG TTTTCGGGTG TGAAGAAAGT GCAGTACAGC TGCAGGGAAG AGAAAGGATG AAGCTGATAA TGCGTTGATA AGGTCCATGT GATTAGAAGG TAGACAATTT  TTGGGAGTTT TTTTATATAT TTTTCTGTTT AAAATGTTAG TGGAGTCGGT GAAAGAGAGA CTAGCTTAAT CTTTGGAGGA TACGGAATAA GGAAATTATA ATTATTTTAT CATTATTATA  TTATAATTAA TGTAAGGTGT ACTGTGTACA TAACATAAAT ATTGATGTTT TTATGTTTGT CTCCTTTCTT TTAAATCTTT AAACCATCCT GGCAGATCTG CTAGTAAAAT CATTCCTAAC  AATAATTTGC ATAGGATAAA ATTCATTTAA GAGATTAATA GTTTACATAG GAAAAACTAA AATACCATCT CTTTCTTCTT TTTTTTTTTT CTAGGGAAAA TATGTAATAC CATTTCTATT  CTAAAGTTGG AACACTTTTT AGTGGGCCAA AATGTATATA TTTTGTTAAT GGACCAAATT GTCATCAGTT CTAAGCCACT AAGACCACAT TTTCCCAAAG ATTAAAAATA TATAAGGCCC  AGTGGATTTT ACGGTCGTTC ATATAAATCT AGATAAGCTC AAATTGTACT TGTGAAAATA TACTAATTCC AGTTAGGTTG AAAGCTTATG TTGGAGTAAA TATAATATCC AGAAAAAAAT  TTGTCGACGA GGAGAGAAAA CATGGATTGT TTGTCAGTTA ACGAGAACCC AATGAATTTC CCGAAGAGAA AACTGCGTGT TCGTTCTGAT AAGAGCCAAT AGATCAGCTA GAGATTTTTG  ATCATATAAG AGATATCAAA GATCCAGAGC ATCTTACACT TTCTTCAGAA GTGCTCAATG TTCTTACAGA AGAATCAGTT GAAGTTGATG ATGAGAAGAG TTACGTTAGA ATTACGTTTA  CTCCAACTCT TCCATATTGT GACTTGCCAA ATATTATTTG TCTATGCATC TACGCAAAAC TTGTACAAAA GCTTACCTCC TAGATTCAAG ATTGATGTGA GAGTAGAAAC CATGGAGTCA  TGTGAAAGAG GCTGCAAACA ATTAACGACT ACTAAGTGAT AAAGAACGTA TGGCCGCAGG TTTAGAGAAT CCCTCCTGAC TTGGTGGCTC TGTTCAATTT GTGATTTTAG TCCATATGAT  TTTGACATAT TTGTCTAGGA TTTATCTTTT GTCTTTTAGT ATTCTTGTTA CGATCTTTTA TATGACATCA ATTCAATGCA AGAGCCTTTT AATCTTCACA TTGTTTTCCG ACTTCATTCC  AAAATATTTA GTCCCAAAAT AAGCTTAATC TATAACCCAT TCAATCAATG GGGTCCAATA GTGGTCTCTA TTTGGGGAAG TGATATAATT CTATAGTTGG ACAAGAGCTA AGCCTTTCCA  TCCCATTAAG ACAAATTCGA TATAGTATAT AAGCCCACTG GTCAAAATAA AGTTGGAATT TGGAATCAAA TATACAAGAA CATCAATAAA GTCAAGTGTA ACCAAAATAC AACTAAAACG 
AAAAAGACTA CTCACATCAC ATATGTTAGG TTTAGGTTTC CAAAATTGAT CAAAGGAAAA CTCTAAAGCC AAATCAATAA 

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DNA ►
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGCCGT TCTCCAAAAA CGATCGCCGC CGATGGTCAT TTGATTCCGT TTCCGGCGGA AGAACCGCCC CCGGAAGTGC ATCTACTTCA CCGGGAACTG AATACTCCAA TGGTGGTTAT  GGAGAAGAGT TCGTTGAAGT CACAATCGAT CTTCAAGATG ATGATACAAT CGTTCTTCGT AGCGTTGAGC CAGCAACGAC AATTAATATC GATATTTCCG ATGAAGCCGC TGGAGGGATT  ATGACTCCGG TTTCGATTTC AAGATCTCCG ACGATGAAAA GGACTTCATC TAATCGGCTC CGGCAGTTCT CACACGAACT TAAAGCTGAA GCAGTTGCGA AAGCCAAACA GTTATCGCAA  GAACTTAAAC GATTCTCTTG GTCTCGTTCG TTTTCTGGTA CTTTAACCGC CGCTAGTAAT CAAACCGGTG GTTTAGTTAA CTCGGCTTTA GAGGCAAGAG CGTTACGGAA ACAACGAGCT  CAGTTAGATC GGACTCGGTC TAGTGCTCAA AGAGCTCTTC GTGGTTTAAG ATTTATCAGT AATAAAAATA AAAACGTTGA TGGTTGGAAT GATGTTCAAT CCAATTTCGA AAAACTTTCT  AACAATGGTT ACATTTATCG CTCTGATTTC GCTCAATGCA TTGGTTCGAT TTCGAATTTT CGTCTATTAT ATCATTATTA TAAATATTTT TATCTAATTT TATCGTAAGT AATCTTGATT  TTTTATTTTT TGATCAGGAA TGAAAGATTC GAATGAATTT GCACTTGGGC TCTTCGATGC GTTGAGTAGG AGAAGAAGAT TAAAGGTTGA TAAAATTAAT CACGATGAGC TTTATGAGTA  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