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Entry information : NoffRboh10-1A (Nasoff1394g0389090.t1)
Entry ID 18516
Creation 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffRboh10-1A (Nasoff1394g0389090.t1)
Name (synonym) NoffRboh10-1A (Nasoff1394g0389090.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh003]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffRboh10-1A
start..stop		 S start..stop
AlyRboh10 1623 0 1..911 1..912
AtRboh10 1609 0 1..911 1..912
TsRboh10 1608 0 1..911 1..892
AlyRboh08 1499 0 1..911 1..886
Literature and cross-references NoffRboh10-1A (Nasoff1394g0389090.t1)
Protein sequence: NoffRboh10-1A (Nasoff1394g0389090.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   911
PWM (Da):   %s   102843.26 Transmb domain:   %s   i341-358o425-444i473-495o523-545i716-733o
PI (pH):   %s   9.82
Sequence
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MKNNRKVGTE DSKKWMLESV EIDRNSEGSV KQPENVINSN KPPVPESSGT DKPESSGGGG GASGILKNVS RNLGVGSIIR SMSVSKWRKS GNLGDPNTRK SGNLGPPLPK AQEKRTGPQR  VERTTSSAAR GLQSLRFLDR TVTGRERDSW RAIENRFNQF AVDGRLPKEK FGVCIGMGDT LEFAAEVYEA LGRRRQINTE NGIDKEQLKL FWEDMIKKDL DCRLQIFFDM CDKDGDGKLT  EEEVKEVIVL SASANRLGNL KKNAACYASL IMEELDPDQL GYIEMWQLEV LLTGMVTNTD AKKMVRKSQP LKRAMLPKRY RTPASKYVSV TAELMYEHWK KIWVVTLWLA VNVYLFMWKY  NEFTKTDLYN ITGRCVCAAK GTAELLKLNM ALILVPVLRR TLTFLRSTFL NQLIPFDDNI NLHKLIAVAI GVISLVHTAL HLLCNYPRLS TCPKYLFVKY GAESLGDKQP TYLGLMLTPV  SITGVLMIIF MGISFTLAMH SFRRNIVKLP KPFNRLAGFN SFWYAHHLLV IAYVLLIIHG YILIIEKPWY QKTTWMYVVV PMVLYACERL LSRVQEHNHR VHIIKAIVYS GNVLALYMTK  PQGFKYKSGM YMFVKCPDIS KFEWHPFSVT SAPGDEYLSV HIRALGDWTS ELRNRFAETC EPHQTSKPAG PNNLIRMETR ARGTNPLIEE SQILFPGIFI KGPYGAPAQN YQKYDILLLI  GLGIGATPFI SILKDMLNNL KPSIPKTGQK CEGSLGGGES LGGGGSLNGG SKKFPQRAYF YWVTREQASF EWFKGVMDDV AVYDKTNVIE MHNYLTSMYD EGDARSALIA MVQKLQHAKN 
GVDIVSESRI RTHFARPNWR KVFSELSSKH ETSRIGVFYC GSPALVRPLK SLCQEFSLES STRFTFHKEN F 

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Remarks
Promoter►
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGAAGGAGGA GAAGACGGTG ACGGAGAGAG AATTAGAGGG TTGAAGAAGA CGAAGCTGAC GTGGAAGGAA GCAGAGCCGT TAGATTAGTG AGTGTAATGT GAAAAGACCA AAAAGGGTAA  AGCCACAGAG AGTTAGGGCA TAGTAGGACG nCCCCCAAAC AAAAAAAAAA AAAAAAGTTG TTGAGACGGA CCGAGTGGTA TTATGAGTCG ACTCGGACCG AGTTGACACG AGAAGAAAGA  CGATCCAGTT TGTGTGGCTT TTTTATTTAC TTTACTTCTT CGTGGCCCAC TCTATTCCGA CGTCGTTTTA GGTATATTTT TTAAAAGATC CCAAAATATA ACAATAATAA TAATAAAGAA  ATATATAGGG AGCACATGTT TTTTTTTTGT TCTATTCTTT TCCACTTTAA CTAACAATGA GCAAAGGAAA ATAGTAGATT TATTTGATCT ATCAACTCTA AAAAAAATAC ATTATGCTTT  GATGGTCTTA TAATTGTAAT TAGATATTTT CTAAATATAA AAACTAATAT GAACCAATTT TAAACATAAA AAATCAAAAA TGTGTTTTGT ATGTTTTTAT GGACATATTG AAACCACTAA  TTTATGTATT TTTCTTTGCT AAAAATATAT AATATATGTT TTATGTTGGC TTTGAATTAG TCCAGATAGT AACATATGTA TAAAATGACA ATAGTACAAA CCACTAGGCT ACATGTTATA  CATAGTCTAT GTGGTCTATA GACATGTTTA TAGTATAAAC TATTTTTGAT TTATATTATA ATTAACTTTG ATTTTTTTTA GCAATACCTT TTATGCATTA ATTTTTTCAT TATATATATA  TCAACCAAAA ACAAATAAGC CGTATTTTAA TTAAAATTCC AACCTTTTTA ATTAATTATA AATAAAATTA GATCAATAAT ATCTAATATA TATTTCTAAA CGAACGTATT ATATTACCCG  AGTTTTAGCC TAATAAAAAT ATAATTGAAG AGAGATAGGT TATTTATATG AAACCGAAGA GATATAGTCG AATGAAATTA ATCATAAAAA TAAATTTTCA AGACAAACCT TAACAAAAAA  AGTACACTAT ACAGCCCACT ATAAAAAAAC ACAACACAAA TCCACTAAGA GTTGTATATC TATTGCAGAG ACTACAAAAT ACAACAGAGT TTCCCACTTT CATCCAAGAC TTTCAAAGCA  TCTTTCATTT CCCTAACTGT ACGTATCATT TGTCTAGCAA ACAGTTGCCT TATCTATCGC AGGTCCAGGC AATTAATGTC GGGGCAAACC TTACCAGGCA TGTCATCGAA TCAGTCCGAT  TATCGAAAAC GTAGGGCTTG AGTCTTGCTA GTTTTAACCT AAACAAATTG GGATCTTTTG AACTATTGTC ATTCGGGCCT AATCCAACTA TGCTCGGGGG CCACCCTAAG TGGCCAAAGT  TTTTTTTATA AGACGCTTTA CTAAGTTTTG TTTTTTGTCC AACTTTTATT TTTTTGTACA ATTTTTATTT TTTTAATTGA ACTATTTGAT TAGTTGTTGC TTTTTTTACA TTATTTGGGA  GATGGTAAAA CATGTTGTAA ACTATTTTCT TTAATAATTA GAATCTTCGA TGTTTGTTGT ATCTTTTGTA ATTCGCCTGA TTTTTTTCTT TCTTTTTGGG GGTTGTGTGT AATTGACGTC  AATTTTTTAA CACTTTCTAT ATTTAGTAAC CCTTCATGTA TCTCTCTCCT CAAGTAAATA GACAATGTAA AATATTACGA ACGACACACA ATAAGGAAGC TATTCTTAGT CTTTTCACGT  AAAATTATCG ATATGGAAAA CTCCAAATAT GAAAGAGCAA GATCTCACAC GAACAAAAAG AGAACGTGAG AGAAAATCAA CATCTCTCAG GAACCATTAT CAACAAAAAA AAAACCATAG 
ATCTATCAAT CGTAGAACAC CTCAAAAAAA GTAGACGTGA ATTATATCCT CATGTGTGTT AATTAAAAAA ATTAGCTATC 

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Terminator +►
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CTTTCATATG ATAAAATTGT TTTCAGTTAA TTGAGACAAC CAATTTTGAG TTCATTTATC TACTTAGACA TACTGAGAGG TTGCAGTTAG AGAAATGTAC AGTCACAATC CGATAGATAA  ATCTCTAAAC CTACACTAAG TTTTAGGAAT TTATAATATA TTTTATATTC TGTAAACGAA ATTTTAGTCT TTGAACGACT TCATAATTAA AGTTGTACTA TTACTTCATT TAAACTTCTT  ATTCAAAGTT CCACTTAAAA ATTATATTTC TTCATAAACT CATAACACTT ATTTTTACTA AATCAAAAAG TTTGATTGAA AAGTAATGAT CTTTTAGGAT TCTAATCAAA TATAGTGTAA  ACTGAAATGA TTTTTTTGTG TTATTTGACT TAATTCTTTC AGCGGTAACT TTTTTACCGA TAACAGTCAA TTTTACATAT CAATATTTCA TTAACTATAC CATATATTAA TATACTATAT  TTAATCTTAA CAATCTTTTG AACAAGCATA TCCTCAATAT ATATATATAT ATATATACAA AGTCATATAA ATTTGTTTTT GACACTTTTT AAAATAAATT CACAAAATGC AGAAAATAAA  TAAAACACCA AACCAACGTC CCACATCGGA TAATTAGACA AGAAGTGTCT AATATATAAG TAGAGTCAAT CACTAATTAG TTTGAGATCT TTTGGAAAGG AACCCAATAA GACAAAACTG  TGCGGGTCTA AAGAGTAGAC TCAAAGCGGA CAATATCAAA CTAATAGTGA ATTGATATGG GTCTTGAGAA AACCCAATAA ATGGTATCAG AGCCATGGTT TAAAAGAAAG GAGAAAGCCT  CCATGTGACA CGATGAGAAG AGTCCTCGAG AGGAGGCTAA GTATTGTAGT CCGTGGTTTA GAGGGAAAAT TGTTGGACTG TAAACCAACG TCCCACATCG GATAATTAGA CAAGAAGTGT  TTAATATATA AGTAGAGTCA ATCACTAATT AGTTTGAGGC CTTTTGGGAA GGAACCCAAT AAGACAAAAC CGTGCGGGTC TAAAGAGTAG GCCCAAAGCG AACAATATCA AACTAATAGT  GAATTGATAT GGGTCAATTG ATATGGGTCT CAATAGAAAA AGGAACACAT TATAAGTGAA TCAAAAAAAA AAGATTCTAA TTCATAATTA CCGGAAAAAG GAGAAAAAAT CAGAAATTAC  GTGTGTTTTT TTGTGTGCTA ATGAATTAAG TGTGTTTGTA AACATAACTA TTCCTAAACC AGACCGAAAA AGGAACACAT TAATACTCTA ATGATTCTCG AAACAGTTTG AAAATAGTTT 
ACTAATTCAT AATTAATGTA CAAAAAACCT ATTTCCTTTT TTTCTGAAAA AAGAAAATTG GAAAATCTAA CGGTCATGAT TGAGATCTCC TGATGGAAAA ATGGAAA 

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DNA ►
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ATGAAAAATA ACAGGAAGGT CGGGACCGAA GATTCCAAAA AATGGATGTT AGAGAGCGTC GAGATAGATC GAAATAGCGA GGGTTCGGTG AAACAACCCG AAAATGTAAT CAATAGCAAT  AAGCCACCGG TACCCGAGAG TAGTGGTACA GATAAGCCAG AGAGTAGTGG TGGTGGTGGT GGTGCCAGTG GGATCTTGAA AAATGTATCG AGGAATCTTG GCGTGGGATC AATAATCAGG  TCTATGAGCG TTTCCAAATG GAGAAAGAGC GGTAATCTCG GGGACCCTAA CACGAGAAAG AGCGGAAACT TGGGGCCTCC GCTCCCTAAA GCTCAAGAAA AACGAACCGG ACCACAAAGA  GTCGAGAGGA CTACATCTAG CGCAGCTAGG GGACTACAGA GTCTCCGGTT CCTTGATCGG ACGGTCACGG GACGTGAAAG AGATTCTTGG AGAGCTATTG AGAACAGGTT CAATCAGTTT  GCCGTTGATG GGAGGCTTCC CAAAGAAAAA TTCGGTGTTT GCATTGGTAA AACTCTAAAT AATATAGATT TTTTTTACTT AAGTTTAATG TTTTTTTTTG TTGAATTGTT AAATTTATCA  ATCAAAAAAT AGAAATTATT TACGTGAACA TAGTTTTTTT GAAAGGGTTA TTATTCAGGA GAATGAAATG TTAAATTTAT GTTGTTTTGT GGCATAATTA TGTATGTGCA TGTATTAGGA  ATGGGAGATA CATTGGAGTT TGCGGCAGAA GTGTACGAAG CATTGGGTAG AAGAAGACAA ATAAACACAG AAAATGGGAT CGACAAGGAA CAACTCAAGC TGTTTTGGGA AGACATGATC  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CDS►
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GGAAGTCCAG CGCTTGTTCG ACCACTAAAA TCACTTTGTC AGGAGTTCAG TCTTGAATCC TCCACCCGCT TTACTTTCCA CAAAGAGAAT TTCTGA 

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