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Entry information : NoffRboh03-1B (Nasoff1819g0417230.t1)
Entry ID 18517
Creation 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-04-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffRboh03-1B (Nasoff1819g0417230.t1)
Name (synonym) NoffRboh03-1B (Nasoff1819g0417230.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffRboh03-1B
start..stop		 S start..stop
NoffRboh03-1A 1815 0 1..906 1..908
AlyRboh03 1745 0 1..906 1..906
AtRboh03 1743 0 1..906 1..905
TsRboh03 1734 0 1..906 1..913
Literature and cross-references NoffRboh03-1B (Nasoff1819g0417230.t1)
Protein sequence: NoffRboh03-1B (Nasoff1819g0417230.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   906
PWM (Da):   %s   102419.71 Transmb domain:   %s   o350-372i493-515o535-557i717-734o
PI (pH):   %s   9.91
Sequence
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SGTRVMSHFA KPNWRNVYKR IAMDHPNTKV GVFYCGAPAL TKELRHLALD FTHKTSTRFS FHKENF 

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Remarks
Promoter►
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ATTGTTATGA TATAATTATT TTTAATTAAT TATATCCTAC TTTTTCAAAA AACCATTTTT ACGTTTCCAC ATATTTCGAT TTCGCATATC CGTTTTCGTT TATATGCTTC ATAGATAATA  AATTAAATTA TAATATAATT TTGTTGTAAA ATTTACTTCA ATATATTAAT TATTATTATT TATTATAAAT TTGATCAGAA TGTCATGAAT TATTTTAACT CGTCTTTATC TTTCCTAACT  CGTTTAAGCC GATATGATAT ATTATAAAAA TTATATGAAT TTTTAATAAT ACCCTAATTA TGTTTTGTAA TTTGAAAATA GACTCTTTTT ATTTTATTTT CTTTTCTTCA AAAATTAACT  TTTTTATATG TGATATAACA TGTTTTCCAA ATTTTAATTA AATTTCCAGT ATTTAATAAA TAAATAAAAT TGAAATAATA ATGAAAACAA TATTAATAAT GATAATAATA CTTATTATTA  TTATATTTTA AAACTTGAGA TATATATATA TATATTTTTA TCAAATTTCT ATATTAAAAT TCACCTATAT ATCAGAGTTT ATAATAGTAT AAATATATCT TTTAATATTT ATATATTTTA  TATAAAAAGA TACAATATAA AATTAGTGAT TTTTAATTTT ATCGGTTTTA TTCTTATCTA ATCTCAAAAT ATTATAATGG TATTGTTATT TTTATATTTA ATTTTGATTG GTATATTTTT  AAATACATGA ATAAAAAACT GGAAAATTTT GAATCTATTT TATGTTTTCT TAATCAAATA GTATTATATG TAATTTTAAA AACTAATGAT GATATTAATT AACATTATTT GCATTAAATA  ATATTTTAGT TTCTCTCTTC CAAAAGTTGT ATTTAATTTT TAAAACGTAG TTTACTTATT TTTTCAAATA TTTTGAAGTT ATTAAGTTGT CTTTTAATTA AAATATAAAA CTAAAAAGGT  ATTTTCAAAT TATGAAAGAT AAACAGGTAT TTCCACAAAA TTTCACAAAA TTGTAATATT TATAGATATG GATAATTTAA ACATTGATGA TAAAATTAAT TTTTTGTAAT TAAATAAGGG  ATAAATTTGA ATTTATTTTT ATGAGAATAA TAAGTTTATA ATATTATTAA AATATGTTTC TTTTACTATA TTAATATGAT TATTATTGTA TTTTAGTGTT TTTATTTAAA AATAGTAAAT  AATATATTAT TTAAAACATA TTTATTCTGG AAATATCAAA TAAAAATAAA TAGATTTGAA ATTAAAATAA TAATAATTCA AACTTGAAAT ATCTATATAA CAGATTTGTT TTGCTATTTA  TTAGGGAATT AATTAAATAA ATCGAAATTA CTATAATTAT TATTAAGATA TGAATTTTTT TAAAGGATTA TCGATCTCAA TATATGTAAT ATTACATATA AGGTTATTTT GCTATTAGAT  ATACTTAACT AATAGTATAG AGATAAGTTT CCAACATTCT CGATGGACTT TTTAAAAAAA CCGTGGACTA TTGTTTCTTA ATTATAAAAA ATCTCAACTT CATTATATAT AGTATTTTAT  TTTTCTTAAT GTTTGAAAAA TGTTGATGCA TTACAAATGC ACGTTACAAC AACAACGATC AGTTTGGTTT TCTAAATGTT TTTTTTTCGC ATCATAGATG ACAAATATGG TGGGCCAGGC  CAAGTCGGGC CACGTCTCTC TTCTTTATCT CTTTTCACTA TATAAATCCA TTTTCATTCT CCTATCAAAA TAAGTTAAGA TCGTTTACTT TCCCAGAACT TTTCAAAGAG AAACAAAACA  AATATATAAT TTCCAAGAAA ATTTCATCTA ACCCATTTTC TCGAGAACAA TATTCTGTCT GCATTTACAA AAGTTCCTTA CATAACCAGT TCTGAATCTC TTCTTTCACT TTAGTTGTAC 
ACATTCTTCA TTTTTGCAGC ATTTTCTCAC ATTCCAATCT TCTTTTTTTT TTTTTCTTTT TCTCTCGAGT GTCAAAAATA 

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AGGAGATACA GAGTTTTAAG GGATAAACGA AAAGAGAGAA GAAGCATGAG TTATATTTCT TGTAATTTCA CTTTCCTTAC TATAATTTTT TCTTTACTAT GTATACATAA TATCTTGACT  GTAGATTTCC CTTACGCTTT TTGGTTGTTA ATTGTGTTTT TTTTTTCTTT CGAAAGTGTA ACCTTAATTA TTATACTCTA CAAAAAATGC TGCAAAAAAG AAGCAAATGT TTTACAAGTG  GAATTTGGAA AGAATTGCGA GATTATATAT ATATATATAT ACAAGGGAAT GTTATAGGAG TGTTGAGCCT GCAAATGATA TAAGAAGTAA AACACAGAAA TTATTTTGTA GCCTAGACTC  TTGCTTTGAA GGTGTGATTA GTTGTGTTTT TTTTCCATGA AGTGTTATTA TGTGAGACTC ACAGATATTT CACCCTTATT CAGGTTTTCA CTATCCAAAA GACCAAAGCT ATTTTCTCGA  ATACTTTTCT CATTTCTCTT GATGATATAT ACAGTCGAAA CCGAACCAAA AACGAGAAGA TGTCTGATTC AATTAACACC AAAATGATAA GACGTTACCA ACTTTATTCC ACTCTCCACT  ACACCAAAAT GGCAAAATCT ATTCCAATAC AAGAACCAAA ACTAACTTCT ATCATTAGTA TTACCTTACG TATCACAATT GGAATCATCA AAGCAAAAGT GAAAAAGCAT CACTAAAATT  TTCTTCCAAT TACTCAAAAG TCAAAACTGT GGAGAGGTTT ATATATTTGG AAAAATATAT TTAAGAGTAA AGAAACAATA ATATTATTGT GTTATTCTCA TACAAATGAT GTTTAGAAGA  AATTATGTAT GTTAAAAATA ACCTAGTTTT ATAGGCTCTC TTCTTTATTT TTCCCAACTC TTTTCGTCAA TATCAAAATG AAGTGAAGAT ACTAATCAAG TTCTAGACTC TTTTTCATAG  CTTCGTAAAC CATATATGTA ATGCTTGCAG CAGGAACAAC CTTGAGAAGG TTTGGTAAAA GCCCTTTGTA TAGTGCTCTG TAACCTTCTT CACTTATTGT CCTCCTGAAT ACTCCAGACA  TCGATGTCCT TGCTCGTTCC GCTTGCATTC TGTGTGACAG TAACAAGCAT ATATTTCATT TGAAGATACT TCAAATACCC ACAAGAACTG ATATTGCGCT GAGAGAGAGA ATGGTATAAA  CATATAGACT ATGAAATTAC CTTGTTCTCA CAACCTGCAA GGGATAAACA CAGGTTGCTC CAAGAGCTCC TGAGATTGTT CCACATCCTA GTTGAATAAG CGGACCTGGT TCTGAAGACC  AAAACCAAGC ACAGAATTTA TGATTCTACG TTCATGCAGA TTCAAACAGA ATAGGCAAAT ATAGCAATTA AGAGGTTTTA CCGGCGTCTT GAAGAATATA TGTCCTGGAC AAGTCCTTCA  ATGTCTCGTA TGCAGCAAGG TCGATACCCG CATAAGGAAT AATCCCAAGA AGAGAAGGGA AAAGACCTTT GTAAAAGGCG CGTGGACCTT CATGAACCAA TATGTCTTTG GTGAGTGTTC  CAAGCCTGGG AACAACAACA CCTGCTTGGC TCGTGCAAGT CTGCAACCGA GTTTTCACAA GATCTAAAGG GTATATAGAG GCTTGAGCCA CTGCACCAGC CATACCTCCT GCAAATAGTC  TACCGGTTGT GCCTATATCC GCTTTGTCTT CACCCATGTT TTCACCGATA GTGTTTTTGA AAAGCTCATA TGCATAAAAC TTGATGGCAC TCTCTGGAGC TACCTTCACA ATATTCAACC  CATTACCTCG AAAAAATCCC CGAACCCCAC CCTGCTTCCA TATCATCTTT ACGGCTTCTC GGATTTTAGC ATCGGTTTTC TGAATTTGTA AAAGAACTTT TAAGCGATCT AGAGGTGCAG 
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DNA ►
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CDS►
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ACAAAGGAAC TAAGGCATTT AGCTTTAGAT TTCACCCACA AGACAAGCAC CAGATTCTCT TTCCACAAAG AGAATTTCTA A 

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