Entry information : PnodAPx01(Potnod000002g0048370.t1)
Entry ID 18734
Creation 2023-05-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-05-22 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PnodAPx01(Potnod000002g0048370.t1)
Name PnodAPx01(Potnod000002g0048370.t1)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx2001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Potamogeton nodosus    [TaxId: 99363 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PnodAPx01
start..stop
S start..stop
PnodAPx02 502 0 1..247 1..247
PnodAPx10 497 0 1..250 1..250
PotacuAPx05 497 0 1..250 1..250
PnodAPx09 493 3.83e-180 1..250 1..250
Literature and cross-references PnodAPx01(Potnod000002g0048370.t1)
Protein sequence: PnodAPx01(Potnod000002g0048370.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   254
PWM (Da):   %s   27908.2  
PI (pH):   %s   5.63
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAKCYPKVDE EYLKAVDKCK RKLRGLIADK NCAPLMLRLA WHSAGTYDVK TKTGGPFGTM KLTAELAHGA NNGLDIAVRL LEPLKEQFPV LSYADFYQLA GVVAVEVTGG PDVPFHPGRK  DKDEPPVEGR LPDATKGTDH LRDVFVTQMG LNDQDIVALS GGHTLGRCHK ERSGFEGPWT ANPLIFDNSY FKELLSGEKE GLLQLPTDKA LLTDPIFRPL VDKYAVDEDA FFADYAEAHQ 
KLSELGLVYA CCRF 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTGCTAAATT CCAAAAATGC AACAATAATC TCATTAGTCA TTACCCAGCT CTTAGAATTG TGTCAAGAAG CACTGTTACT CCATCAGACT CCCAAAATCT AACTTAAGTT TCAATTTAGA  TCATCATCTT TGTAGTGGTT GGGGCGTTGG GCATTGGATT TCCCTTCTAT ACAAATAATC TTAAAAGATT CAAAGAATAA CATGTATTCG TACAAAAGTT CCTATTCTTT GATGTTGCGG  AAATAACCCT CGGATCCGAA AATACAAAGG CGACTAACGA GTAAAGATCG AAGACAAAAT TGGACCCCAA AATAGACTTT ATTCGCACTA AATAGATCCA AAATTACAAG AGAAAATTAC  AGGGCCGAAA AATAGGCGAA AAACTGAGAA GAAAAAACCT CGCCGGAAAA AGTCGCCGGA CCGCCGCCGG ACCGCCGCCG GTGATCGCCG CCGGTGAGCT TCTCCACCAA CTCCGGCGAG  CTCCTCCTAA CTTCTTCCCC GCGCCTCCGT TTCGCTCCCA ATAAGAGGCA AAATGATCCT CTTCTCCTCC TCTCTCGATT CCTCTCCTTA GATCAGGAAG ATCACTCGAG TTTTGGATGA  TTCAAGGGAG GCCGATGGGT TCTCTATTTA TAGGCTTCGA TTTGGCTATC TTCCAGGGCT TTCCGCGGCG ATCTCGCGTG ATGGGAGGCA CAGATTGATG ACATGGAAGC TTCTTCGCGC  TTCTCGCGCC TTGTCGCGGC GGATCCAGCC GCTGCCGGTG ATCTCGGCAC TGTTCACGGT CGCCGGTCGG GAGGAAGACG ACGCTACTGT GCGTCGCGGA TCCGAAGGCG GATCTTCGTG  GGTCCGACCC GAATCGGAAG AGATATAAGA TTTGACCCAC ATTATCACTG AAAGAGAAAC GTGTATTGTA TCGAATCCCC AAAATTAATC CTGATGGCAA AATTTGCTGG TATCTTTTGG  TTTTTCTTGG TCAGACTGAT TATATTTCAA ACTGACAGAA GTTCAAAACA CATGTCGTTG CGAGCATAGT AACCAACCTG ATGTCTCACG TACAACTGGA ATTTTACATC CGATTGAGGA  AGCAATTCTA ATTTCTTTTT ATTATCTGAG ATGAAATGCA TCCAGGTGAT ACAGTGTTAT CTGGTATAAA AATGTAAAAT ATCATGCTAA CATGAAATAT TTATCAAACT CGATGACAGG  TTGCATAAAT TAACAGCATT TCTTTCCAAA GCTCCTTAAT CAATGGAAAA GAAAATACCT TGTTTTAGGG ATCCCTGTTT CTAGAGGATT ATGTTTTCAG CTTCAATTTC GTTAGTCATT  ATGTATTTAT CTGAGAGCAA ACCACGATCT CCATTATTTC TTTATGACTA AACTATCAGG AAAATATTCG TATTTTTAGT GCAAGCAACA AATCACAACA TTAAAACCAT TACATGAATA  CAAGACGCAT AAGCTTGAAG GAACAAGATG GCAATAGAAA GCATTGACAA TTACGGATAA CCATCGTAGA ATTAAAGTAC TGAAAATTTT AATCAACCAT CAGCAGCTTA ACTATTGACG  TTTCTGAAAA CTAGTAAACA ACTAATGTGT CAAAATAACT ACTACACAAA ATAAGAGGAA ATTAATATTC CATTTCTATG CAAATATCGT CAACTTAATG GAAAAGGAAG AAGCAAATGC  TTCCTTCGCA GTTCTCTTCG CCTTTGACGA ACTTAGAAGT GATTTGACAT GTGAAGATCA CGAAATCAAG GAATACAAAT TTATCTTTAA ACCTTCAAAT TAAACCAGCC TAATACATCC  TTTAAAATTA ACTATCGGAG TCACAATGTT CCAATAACCT AAGAATTTTA GCTCAAACTA AGTGATAAAA GGGGGAAGGA GATAGGACAA CCTCTCATCC AACTACAATC TTCTACATTA 
TAATAAAAAT GAAAAAAAAA TATGTACAAC CACGGAAAAG AGAACAACAA TATTTCAGAA CTCTTACAGA GGAACCAAAA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTTGTTATT GTGTACCTGG AAATTGATGG TAGTAGCAGT TGAAGTAATC TTTTTGGATG CAATATTTTG TATGTTGATA TGGATAGATA AAAAATATAT CTTATTTTAT TTCAGGTACT  GATCATTTGA GGGACGTTTT TGTAACTCAA ATGGGTCTCA ATGATCAGGA TATTGTAGCT CTTTCTGGTG GGCACACTCT GGTAAGTCTG CTAATACTTT CTTTTTTCTG TTTGTATCAT  CAAACTTCAT TTGTCCCTTT TATATGGTAT TTTGGGTGCC TCTGATTCTC TTATTCTAGA TTACCACATT TTTCTTATTA AAGCCTCTAA TGTGCCGATT TTACAGGGTC GATGTCACAA  GGAACGGTCT GGTTTTGAGG GACCCTGGAC TGCCAACCCT CTAATATTTG ACAATAGCTA CTTCAAGTGA GTCTGTCATT TAACTTGTGT TTATGACACC AATGATTCGA TGTGGTCCAC  GGGAGAGGAA AAGTATTTGA TAATCTTTTA CGCAGGGAGC TACTTTCTGG AGAGAAAGAA GGCCTCCTTC AGCTGCCAAC TGACAAGGCG CTCCTGACTG ACCCTATCTT CCGCCCACTT  GTTGACAAAT ATGCTGTGGT ACAAATCTCT CTTTCCACGA AGTTCTAGGT TCTAGTGTAT GTATATGTCG CTAACTTCTC TTTGGCGATG CATTTCATCA TCTGTAGGAC GAGGATGCGT  TCTTTGCTGA CTACGCTGAA GCGCATCAAA AGCTCTCTGA ACTGGGGTTA GTTTATGCTT GCTGTCGATT TTGATCTGTG CTTACCACTT TCTAATAAAC GCCTTTTGCT TCATTTTTTC  TTCCAGATTT ACGGACGCCT GAAGTTCTGA GGATATGCAC AGCAGTATCA GTCATCAAGT TGGGTTGTCT TTTTGCAATA AAAGTAAAGC CTTGGCTTGG ACCCTTATTT TCCGTAAAAA  CTGCAACTTT ATTAGTTGTA AGCTGGTGAT TCCTCGTTTG AGCAATGGTA ATTTTCTTAA TGGTTCCTGT GTCAAACTCT TACTGTTGAC TGTGTCGTAT GTTTTCTAAA AGCTGTGTTA  ACATGATAAC CTCTTGCTCG GATGCCAACG TAGTGCAAGA TCCAAGTTGT CACGACAAGA CGTAGTAGGG GTTTGTTATT TTCTAACAAT TTCTACAGTA ATATTGCACA TTTGCACCTA  AGAGTTCTAC TTGCAAAGTG TAAGTGTGAA ACAACGAAAA CATTATCAAC CATTCAATAA ATATCAGGAA ATTGAACCGA AAACTATATA AATTCTAAAA AAAACAAAAA ATAGGGCGTG  CTTCGGACGG CGTAACATTC CATTCTCAGT AGAAACCGAA CAACTTAATT TCTTCACTTA CCGAGCCGTT GGCAGCATCT CAGGGTCACC AAAAGAAAAA TCTCGCCTTG TTTCTGTGTC  CAAGGAGTCG ATGTTGATAA CAGACGTCAT GGAGTTCCCT GGTATTAGAT GGATATCAAC CTCGGATGGC TCAGATCCCC TCTCAATGGA GATTGCCTCC TGAATCTCTT TGAGAACTTC  GGATATCGTC GGTCTCTGCG CACCGTAAGG TTGGACGCAG CAGATGGCCT TCTCCGCGAT CTTCCACATC GACTGGATGT TGAAATCATC CCCCATGGAA GGGTCGATAA TGGCCTGAAT  ATTTCCACTT TCAATGTGTG TTTTTGCCTG AAATTTTCGA CACAGTAGTG TTCTCAGGTT ATATAAGTGA AAATGAAAAG GCTTGTGATG TAAAATACTA ATTTAGGTCA ACTGAACTAA  CCCATAAAAC TATGTTTCTG CAGTTGACTC CGAATCTTTC ATTGGATATT GCTTCTTGTC CTGATATTAA CTCGAGAAGT ATCACGCCGA AGCTATAAAC GTCACTTTTG TCTGTTAATT 
GTTGTGAGAT GTAGTATCTG CACATGTACA TCAAATCCTT AACAGTTTTC CAAGTTGAAG ATACCAGCAG TGAGGGTATC 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGAAAT GCTACCCGAA GGTTGACGAG GAGTACCTGA AGGCGGTGGA TAAGTGCAAG AGGAAGCTCC GAGGGTTGAT TGCCGATAAG AACTGTGCGC CGTTGATGCT CCGTCTCGCG  TAAAGTTTTA CCGGCGATTT TTCATCTTCC TGTCTTGATT ACTGGGATCG TATGTCTGAG ACGTCTCGAT GCTTCAGGTG GCATTCGGCG GGAACTTACG ATGTGAAGAC GAAGACGGGA  GGACCATTCG GGACGATGAA GCTCACGGCC GAGCTCGCTC ACGGGGCCAA CAACGGACTC GATATAGCTG TTAGGCTTCT TGAACCGCTC AAGGAGCAGT TCCCTGTTCT TTCTTATGCT  GATTTTTACC AGGTTCGGAT TTAGGCACCT GATCTGCTTT TCTGTACTGT TGCTCGTGGT TGTTTAAGTT GTTTTCTCGA TGCAGCTTGC AGGGGTGGTC GCTGTTGAGG TCACTGGAGG  ACCTGACGTT CCTTTTCACC CCGGAAGGAA GGTAACGCTG TTTCTCTTTG TCGATCATCA ACCTAGAGAT TTATCAACAT TCAAGCCTGT TGCCGTTTAT TTTTCGAAGT TATAGTCGTG  AGTTGCTTTG GCTGTTTATG ATTTAAAGGG GTCGATCATA TAGATACTAT TAAATCAAAA CTTTGCATTC AGAACGTGGG TAAAGTGAAT ATCCTCATCT CTGTAATATC AAAACTTTAT  ATTCAAGTCA TGACTAAAAT TCTGTCTTCC TCTTTCTGTT ACTTGGTGTG TCAATGTTAA CGATGACATC TGATAATAGA TGGCCGTGAT TATAAGCTCT GTTGTTTTTC CTCTCATTCC  CAACGTTATT TGGTTAACAA CCTAACTAGC ATCATCAAGC AGGTGACATT AAGGTTAAAT GTGGTCTTAG TTGGTTAGGT GCCAAGGTGA AATCGATGCA TTCCGTGCAG TAACTGTGAG  TTTAGGGGTT CTCTCCCAAA GCCAGACCCG AACTCTTCTC CGAGAAGACT GCTTTCTGTT CACAATTATC AACTTAACTA GAGCCTGTTA TAGCTGATCA ATTTGTTGCA TGATTTGACA  GTACTTATCT TCCTTAATCC GTGAACATTA CCTGGGTTTT CATTGTGAAA TTCTATTTTA TTGATGTAAT AACATGTGCA TGCAGGTGTA GTGATGCTTT TTTTTTTTAC TTCCTTTTCT  ATTTAATATA TTCTTTGTGA ACTACTCGGG CTTTCTTTGG AATTGCTAGA CTGATTATGC TTCTCATTGA TTCAGAGTTT TCTTGCTTGT CGTAGTAATA TAGAAAACCA AATTTCTGTT  TGACATGTTC TGCTGTTCTA ACTCAGGATA AGGATGAGCC ACCAGTCGAA GGTCGTCTGC CTGATGCCAC CAAAGGTATG CTCCACTTTG TTTTTACTCA TGGGCATTTT TTGTTATTGT  GTACCTGGAA ATTGATGGTA GTAGCAGTTG AAGTAATCTT TTTGGATGCA ATATTTTGTA TGTTGATATG GATAGATAAA AAATATATCT TATTTTATTT CAGGTACTGA TCATTTGAGG  GACGTTTTTG TAACTCAAAT GGGTCTCAAT GATCAGGATA TTGTAGCTCT TTCTGGTGGG CACACTCTGG TAAGTCTGCT AATACTTTCT TTTTTCTGTT TGTATCATCA AACTTCATTT  GTCCCTTTTA TATGGTATTT TGGGTGCCTC TGATTCTCTT ATTCTAGATT ACCACATTTT TCTTATTAAA GCCTCTAATG TGCCGATTTT ACAGGGTCGA TGTCACAAGG AACGGTCTGG  TTTTGAGGGA CCCTGGACTG CCAACCCTCT AATATTTGAC AATAGCTACT TCAAGTGAGT CTGTCATTTA ACTTGTGTTT ATGACACCAA TGATTCGATG TGGTCCACGG GAGAGGAAAA  GTATTTGATA ATCTTTTACG CAGGGAGCTA CTTTCTGGAG AGAAAGAAGG CCTCCTTCAG CTGCCAACTG ACAAGGCGCT CCTGACTGAC CCTATCTTCC GCCCACTTGT TGACAAATAT  GCTGTGGTAC AAATCTCTCT TTCCACGAAG TTCTAGGTTC TAGTGTATGT ATATGTCGCT AACTTCTCTT TGGCGATGCA TTTCATCATC TGTAGGACGA GGATGCGTTC TTTGCTGACT 
ACGCTGAAGC GCATCAAAAG CTCTCTGAAC TGGGGTTAGT TTATGCTTGC TGTCGATTTT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGAAAT GCTACCCGAA GGTTGACGAG GAGTACCTGA AGGCGGTGGA TAAGTGCAAG AGGAAGCTCC GAGGGTTGAT TGCCGATAAG AACTGTGCGC CGTTGATGCT CCGTCTCGCG  TGGCATTCGG CGGGAACTTA CGATGTGAAG ACGAAGACGG GAGGACCATT CGGGACGATG AAGCTCACGG CCGAGCTCGC TCACGGGGCC AACAACGGAC TCGATATAGC TGTTAGGCTT  CTTGAACCGC TCAAGGAGCA GTTCCCTGTT CTTTCTTATG CTGATTTTTA CCAGCTTGCA GGGGTGGTCG CTGTTGAGGT CACTGGAGGA CCTGACGTTC CTTTTCACCC CGGAAGGAAG  GATAAGGATG AGCCACCAGT CGAAGGTCGT CTGCCTGATG CCACCAAAGG TACTGATCAT TTGAGGGACG TTTTTGTAAC TCAAATGGGT CTCAATGATC AGGATATTGT AGCTCTTTCT  GGTGGGCACA CTCTGGGTCG ATGTCACAAG GAACGGTCTG GTTTTGAGGG ACCCTGGACT GCCAACCCTC TAATATTTGA CAATAGCTAC TTCAAGGAGC TACTTTCTGG AGAGAAAGAA  GGCCTCCTTC AGCTGCCAAC TGACAAGGCG CTCCTGACTG ACCCTATCTT CCGCCCACTT GTTGACAAAT ATGCTGTGGA CGAGGATGCG TTCTTTGCTG ACTACGCTGA AGCGCATCAA 
AAGCTCTCTG AACTGGGGTT AGTTTATGCT TGCTGTCGAT TTTGA 

Retrieve as FASTA