Entry information : PnodAPx09(Potnod000018g0322240.t1)
Entry ID 18742
Creation 2023-05-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-05-22 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PnodAPx09(Potnod000018g0322240.t1)
Name PnodAPx09(Potnod000018g0322240.t1)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx2001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Potamogeton nodosus    [TaxId: 99363 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PnodAPx09
start..stop
S start..stop
PnodAPx10 509 0 1..250 1..250
PnodAPx01 493 3.77e-180 1..250 1..250
PotacuAPx05 493 7.49e-180 1..250 1..250
PnodAPx02 490 1.81e-178 1..246 1..246
Literature and cross-references PnodAPx09(Potnod000018g0322240.t1)
Protein sequence: PnodAPx09(Potnod000018g0322240.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   250 (202)
PWM (Da):   %s   27492.05 (23356.4)  
PI (pH):   %s   6.17 (4.76) Peptide Signal:   %s   cut: 0 range:Ymax-201
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGKCYPKVDE EYLKAVDKCK RKLRGLIAEK NCAPLMLRIA WHSAGTYDVK TKTGGPFGTM KLKAELAHGA NNGLDIAVRL LEPLKEQFPV LSYADFYQLA GVVAVEVTGG PDVPFHPGRK  DKVEPPVEGR LPDATKGTDH LREVFVTQMG LNDQDIVALS GGHTLGRCHK ERSGFEGPWT ANPLIFDNSY FKELLSGEKE GFLQLPTDKA LLTDPIFRPL VDKYAVDEDA FFADYAEAHQ 
KLSELGFADA 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCGACTTGAC AGAAACGATG GATCGGGGGA GAGGTGGGAC TTTGCCGTTT TGGAGTTGAA GGGTGCGAGT TCTTTTAGTG GGGGCTTTGG ACAAGAGCGT TATCGGGTAC TCGGGTTTGT  CTCTTTGGCA TTTTCAATCA AAAAACAATT TATATAAAAA TATAATTTCC AAGACACTTT TTTGTCAGAA TCTAGCACAG TAAAAACAAA TAAAAGGTTT CAATTTGTAA TGTACGTGCT  CACCGCATGT GCAATTTGTC GTATGAAAAG TATTAAGAAG AAATTTCGGA TTTTTATTTT GATCTGCAAA CATAAAATAA TCTTTTTTGA TAAAAAATAA TAGCCAGTAA TTATTGAATC  TTTATTTATC GGTTGGATTC ATCGCCTCTT GGGTTGTATG TAATAGACGA GTGACCTTTT TTCCATTTGT TATAAGGAAA TTATTTTGAA AATAAATCCA ATTATTGCAC TTGAAAAATA  TATTTATTAG GTTTTTTAAA TTTATTCGTT TGCTATGTTT TTCTTTTTCC TTTATTTTCG TATAACTGGT TTTTACTTTT TCACACGTCA GGTACTTTGT AATGATACTT GAAATTAAGT  TATTAAGGTA AGAGCTTTCC GTATTAACCC AAAAAAATTC ACTTGGAACG GTATATTTTT TCTCAATCAG GTGTGATATC CTATTTAGAA ACCTACTAAT CTTATCCAGT TGAAATTAAA  ATTATATTTA ATTTTAATAA GGTAAAAATT ACAAGGGACC AATTTGTAAT TTCTTTCTCT ATTCCATTGA CTTGCAATTC CATCATATAT CTATAGGATT GATTGTCAAG TTAAACGAAC  CAAACTTTGC TCTAGAAAGA AACAAAGAAC AACATGATGT GAAATTTTTA CTTCCTACCT TGATTTTATA GACCACTATC GTCACTGTTT TGTTTTGTTG ACGTGGTAAT AAACCCATGC  TGAACGACGA CGTTTTCCTT GAGATCGGAC ACAGACCGAA CAGACATGTC AAGCGAGAGA AATATTGCAC TTTAACGTGA ACATGAGAGA GAACACGAAC ACCGACGTTG ACATCGAATG  TTTATGGAAA TATCAAAGAC ATATAAGAAG AGAAGTAGAA GAAAAAACTA AAAAAATAAA ACAAAGTGCC AGTTTTACCC ACTGGCTTTA AAAAACACCC ATCAAAGAAA GAGGGCATTT  CTCACAAAAT ATTTACCATA ATATATACTG GGTGTTAAAA ATTCTTGCGT ACAATACATT TTCCAATGTT TAATGCGAGA AAAATATTCA TAGATCATGA CATGAGAAAA AAGTACCAGC  GGAATTATAT AAGTATTTAA AGTAAATATA AATCGATTGA TGTTATTCTT ACTTTCTGTA TAAAAATAAT ATTATAACTT TATAAGTTAT CAAGTATTTT AATATAAATT TTTATTAGAA  TCGAGTCAAA TCAAGTTTTC AATGTTCAAG TTTTTTAGTT TAACTGATTA AGTCTAAAAT TTTATTAGCC CAGTTAACCA ACCAAGTTTC GTCGATCCAA CGAAAATTCT CAGTCGTCTA  CGGCCAAGAT CCGAAACAGC ATTTGAATCC ACCGGATCCT TCTTTACCCG ATCTCCTCCC GAAAGCTCTG TGACCAGTAA CCACTGTAAC TCTTTAAATC TATTCTATAA ATACACGAAC  CACACCATCG TATTGCTCCT TAAAACCCAA GTGCTCAGAC ATTATCATCG CCTTCCTCTC TCCGCATTTC TAGGGTTTGC TCGGTAAGGA AATGAGGCGA TAGAGGAAAA TGATTCAATG  TCTTCTATCT GATCGATATC GTTCCGATCT TGATCGTGCA GGGAATATCA CGATGGGAAA GTGCTACCCG AAGGTGGACG AGGAGTACCT GAAGGCGGTG GATAAGTGCA AGAGGAAGCT 
CCGAGGGTTG ATTGCTGAGA AGAACTGTGC GCCGTTGATG CTCCGTATCG CGTAAGTTTA CTGGTGATTT TTCATTTTAT G 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AATGTGGTCC TGTGGCAAAC TGTTACTGTT GATGAGTCAT GTTTCCCAGA AGTTGTGTTG ACTTGATAAT CTTATCTTGC TTGGATTGCC AACGTAGTGT AGCGACAAGG TGTTTCGACT  AGACTAGACA CGTAGTGCGT GGGACGTTAT TTTCTGACAA TTTCTCTAGA TTGTTTAGCT TAGCATTATC CCTGTACCAC ATGCTAAATG GAATCAGGGC TCGTCTAAAC TTCCTTATCT  ACCAGCCTCA CCTACAGGTT GATTTTTATT GCACACAAGT CTTGGTGACA TTATACCAGT TTCTCCGGTA GTTTTGGTTT GTTTAGGTTT CAATGTTATT TACAAGCTCA AAAGTAACAA  GAAGAATTGT GGTAACATTG TGAAATCCCA GCGACATTTT AAAGTGCACG TGATCTTTTC AGTCAAAGCT TACCTGATTT TGATGCACCG CTCATTAAAA AGTGAGGCCC CCAACTGCTT  TGGGAATTGA TATCTTCTCA AATTCAATAT GGATCTAAGA GATTTAAATT CGGAACTTTG ACAACTCTTT TATCTAAGTA CGTAATTTAG ATTAGTTTTA CTTTAAAAAT TAGTTTGATT  TTTTTAAAGA AGTATGTTAA TCTTAACCGC TGGTTTATTT ATAAGTGGTC TAGATTACGA ATTATAAGTG GTCTAGATTA CGAATTTGAC ACGATTACTG AACTTTGCTT TGGGGAACAA  CCGGACTGCT GAAAACCTCA ACAGCTCGCG GAGTGTAGTA CAAGTAGATT ATGCACGTAC ATGTAGCTAA TGAGATGATC AAATACAAGA AATTACAGAA TCAGAAAACA TGTCAATCAG  TGACAAATAC ATAAGATGTC GATCAAGAGC AAATAAGCAA TTTATCATGC TATGACTAGA ATCCAAAGGA GATAATATTA CAGAATGTAC TTTAATATTG GATTGCTAAA TTCCAAAAAT  GCAACAATTA TCTCATTACT CAGCTCTTAG AGTTGTGTCA GGAAGCATAT TCTGTAGTGG TTGGGCATTG GATTTCCCTT CTATACAAAC AGTCTTAAAA CATTCAAAGA ATAACATATA  TTCATACTTT GACCCACATT ATCATTAAAA GAGAAAAGTG TATTGTATCG AATCCCAAAA ATTAAACCTG ATGCCAACAT TTTGCTGGTA TCTTTTGGTT TTTCTTGGTC AGACTGATTG  TATTTCAAAC TGACAGAGTT CAAAACACAT GTCTTAGCAA GCATAGTACA ACAAAGAATG CACTAGGGAA TCTTACATCC TATTGAGGAA GAAATTCCAA TTTCTTTTTA TTATCTGAGA  TGAAATGCAT ACAAGTGACA CAGTGTTATC TGGTATAAAA ATGTAAAATA TCATGCCAAC ATGAAATACC TGTCAAACTC GATGACAGGT TGCATAAATA ATAATTTACA ACATTTCTTT  CCAGAGCTCC TTGATCAATG AAAAAAAGAC CTTGTTTTAG GAATCCCTGT TTCTAGATAC TGAAGGAGAT TATGTTTTTA GCTTCAATTT CGGTAGTCAT TATGTATTTT TCTGAGAGCA  AACCGTGATC GCCATTATTT CCTTATGACT AAACTATCAG GAAAATATTC GTATTTCTAG AGCAAGCAAC AAATCATAAC ATTAAAACCA TCACATGAAT ACATGATGCA TAGGCGTGAA  GAAACAAGAT CATCGGAAAA CTATCGTAGA ACTGAAGTAC TGAAAATTTT AAATAACCAT CAGCAGCTTA ACTATTGACG TTTCTGAAAA ACTAGCAAAC AACTAAAGTA TCAAAGTAAC  TACTGCACAA AATAAGAGGA AATTAATATG CCATTTCTAT GCAAATATCG TCAACTTAAT GGAAAAAGAG GAAGAAGAAG CAAATGCTTC CTCTGCAGTT CTCTTCGCCT TTGACGAACA 
AGTGATTTGG CATGTGAAGA TCACGAAATC AAGGAATACA AATTTATCTT TAAACCTTAA AATTAAACCG GCCTAATATA 

Retrieve as FASTA  
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAAAGT GCTACCCGAA GGTGGACGAG GAGTACCTGA AGGCGGTGGA TAAGTGCAAG AGGAAGCTCC GAGGGTTGAT TGCTGAGAAG AACTGTGCGC CGTTGATGCT CCGTATCGCG  TAAGTTTACT GGTGATTTTT CATTTTATGG TTTTGATTAT CAGGATTGGA GGTTTGATAT GTCTCGATGC TTCAGGTGGC ATTCAGCGGG AACTTACGAT GTGAAGACGA AGACGGGAGG  ACCATTCGGA ACGATGAAGC TCAAGGCCGA GCTCGCTCAC GGGGCCAACA ACGGACTCGA TATAGCTGTG AGGCTTCTCG AACCGCTCAA GGAACAGTTC CCTGTTCTTT CTTATGCTGA  TTTTTACCAG GTTCGGATTT AGGCACCTGA TCTGCTTTTC TGTACTGTTG CTTGTGGTTG TTTAAGTTGT TTTCGCGATG CAGCTTGCAG GGGTGGTCGC TGTTGAGGTG ACTGGAGGAC  CTGATGTTCC TTTTCACCCC GGAAGGAAGG TAACACTGTT TCTCTTCGTT GATCATCAAC CTAGAGATTT ATCAACATTC AAACCTGTTG CCTTCTATTT TTCGAAGTTG TAGTTGTGTG  TTGCTTTGGT TGTAGATGCT TTGACTCTTT ATGATTTACA ATGGTCGATG ATATAGATAG GATCATCAAG AGGGTGACAT TATGGTTAAA TGTGGTCTTA GTTGGTTAGG TGCCAAGGTG  AAATAGAGGC ATTCCGTGCT GCAACTGTGA GCCCGGGGGT CATCTCCCAA AGTCAGACCC GAACTCTTCT CCGAGAAGAC TGCTTTCTGT TCACTATTAT CAAGTTAACT AGACCCTGCC  ATAGCTGATC AATTCGTTGC ATGATTTGAT AGTAGTTATC TTCCTTAATT TGTGAATATT ACCTGGGTTT TCATGGTCAA AATCCCATTT TATTGATGTA ATAACTAATA ACGTGTGCAT  GTAGATGCAC TGATGTTTAT TTCTTTTTCT ATTTAATATA TCCTTTGTGA ACTACTCGGG TTTTCTTTGG AATTTCTAGA CTGCGTAAGT TTTTCCTGTA ATGGTTATGC TTTTCATTGA  TTCAGAGTTT TCTAGCTTGT CGTAGTAACC AAGAAAACCA ATTTTCTGTT TGACATGTTC TGCTGTTCTA ACTCAGGATA AGGTTGAACC ACCAGTCGAA GGTCGTCTGC CTGATGCCAC  CAAAGGTATG CTTCACTTTG TTTTTGCTCA TGGGCACTTG TTATTGTTGT TTTGTACCTG GAAATTGATG GCAGTAGCAG TTGAAGTAAT CTTTTTGGAT GCAATATTTT GTATGTTGAT  ATGGATAGAT AAAAAATATA TCTTATTTTA TTTCAGGCAC TGACCACTTG AGAGAAGTTT TTGTAACTCA AATGGGTCTC AATGATCAGG ATATTGTAGC TCTTTCTGGT GGGCACACTC  TGGTCAGTAT GTTAATACTT TCATTCTTCT TTCTGTATCA TCTAACTTCA TTTGCCCCTT CTAATTATAT GGTATTATGG ATGTCTGTGG TTCTCTTATA CTAGGCTACC ACATATTTCT  TATTGAAGCC TCTAATGTGT CCATTTTTAC AGGGCCGATG TCACAAGGAA CGGTCTGGTT TTGAGGGCCC CTGGACTGCC AACCCTCTAA TCTTTGACAA TAGCTACTTC AAGTGAGTCT  GTCATTTAAG TTGTGTTTAT GGCACCAATG ATTCTATGTG GTTCACCGTA GAGGAAAAGT ATTTGATAAT CTTTTACGCA GGGAGCTACT TTCTGGAGAG AAAGAGGGCT TCCTTCAGCT  GCCGACTGAC AAGGCGCTCC TGACCGACCC AATCTTCCGC CCACTTGTGG ACAAATATGC TGTGGTATAA CTCTGTCTCC TTCCACGAAG TTCTAGGTTC TCGTGTATGT ATGTATACGT  CGCTAACTTC TCTTTGGCGA TGCATTTCAT CATCTGTAGG ACGAGGATGC GTTCTTCGCG GACTACGCTG AAGCTCATCA AAAGCTCTCT GAACTGGGGT TAGTTTCTAT TTCCTGTCGA 
TTTTGATTCG GACTAAGCTA CTTTCTAATA AATGCCTTTT GCTTCACTTT TTCATCCAGA TTTGCGGATG CCTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAAAGT GCTACCCGAA GGTGGACGAG GAGTACCTGA AGGCGGTGGA TAAGTGCAAG AGGAAGCTCC GAGGGTTGAT TGCTGAGAAG AACTGTGCGC CGTTGATGCT CCGTATCGCG  TGGCATTCAG CGGGAACTTA CGATGTGAAG ACGAAGACGG GAGGACCATT CGGAACGATG AAGCTCAAGG CCGAGCTCGC TCACGGGGCC AACAACGGAC TCGATATAGC TGTGAGGCTT  CTCGAACCGC TCAAGGAACA GTTCCCTGTT CTTTCTTATG CTGATTTTTA CCAGCTTGCA GGGGTGGTCG CTGTTGAGGT GACTGGAGGA CCTGATGTTC CTTTTCACCC CGGAAGGAAG  GATAAGGTTG AACCACCAGT CGAAGGTCGT CTGCCTGATG CCACCAAAGG CACTGACCAC TTGAGAGAAG TTTTTGTAAC TCAAATGGGT CTCAATGATC AGGATATTGT AGCTCTTTCT  GGTGGGCACA CTCTGGGCCG ATGTCACAAG GAACGGTCTG GTTTTGAGGG CCCCTGGACT GCCAACCCTC TAATCTTTGA CAATAGCTAC TTCAAGGAGC TACTTTCTGG AGAGAAAGAG  GGCTTCCTTC AGCTGCCGAC TGACAAGGCG CTCCTGACCG ACCCAATCTT CCGCCCACTT GTGGACAAAT ATGCTGTGGA CGAGGATGCG TTCTTCGCGG ACTACGCTGA AGCTCATCAA 
AAGCTCTCTG AACTGGGATT TGCGGATGCC TGA 

Retrieve as FASTA