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Entry information : PnodAPx03(Potnod000004g0082940.t1)
Entry ID 18736
Creation 2023-05-22 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-05-22 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PnodAPx03(Potnod000004g0082940.t1)
Name PnodAPx03(Potnod000004g0082940.t1)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx2002]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Potamogeton nodosus    [TaxId: 99363 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PnodAPx03
start..stop		 S start..stop
PnodAPx06 865 0 1..436 1..433
PotacuAPx06 858 0 1..436 1..432
SpolAPx02 652 0 30..436 33..435
InAPx06 642 0 1..436 1..423
Literature and cross-references PnodAPx03(Potnod000004g0082940.t1)
Protein sequence: PnodAPx03(Potnod000004g0082940.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   436
PWM (Da):   %s   47174.77 Transmb domain:   %s   o416-435i
PI (pH):   %s   7.47
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAERLCSSSP ITSFSSSSSS ASATINGALR RTVALRSTAS CSSSSYSRPP FCLKSSSFLH STPPLTITRK RCDLVGRRLC SSSSSGASVT TCFASDPAQL KSAREDIKEL LKTTFCHPIL  VRLGWHDAGT YDKNVEEWPK RGGANGSLRF EIELKHAANA GLVNALKLIQ PIKDKYPGIT YADLFQLASA TAIEEAGGPK IPMRYGRVDV TGAEQCPDEG KLPDAGPPSP ATHLRDVFYR  MGFNDKEIVA LSGAHTLGRS RVERSGWGKP ETKYTKDGPG APGGQSWTVQ WLKFDNSYFV DIKEKKDEDL LVLPTDAALF DDPSFRIFAE KYAEDQDVFF KDYAEAHAHL SDVGAKFDPP 
EGFSLDTGSK DAAPEKFVAA KYSSGQRELS DAMKQKIRAE YEAVGGSPDK PLSSNYFINI MILVAGLAIL TSLIGN 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAAAATACA AACCCACACT TAAGTAATGA TCGTGTCCGA CATCAAGAAG ACTTCATAAA AATAACAAAT ATGAGCTGAA AAAATTAGGA ACTTCCTGCT AAGGACAAAA TGAAATTCCT  CATCAATAGC TTTACTGAAC TAATAGTCAA GTTCTCGTTT ATCGCGAGGT AAAAATCAAT GTTAAGTTCT CGTTCATAGC GAGGTAAAAA TCAATGTCAA GAGTAACCTT TTAGTTTTAG  TCACTTTCAA GTTATGGATC AGAAAGGTAA TGGAAATGTC ACTTAGATTG GGTAACTAGT AATCAACATA TCGGTAAATG GAGATCAAGT TTTGGATGTC GACAGATATA GAAAATTCAT  TTAGTAGAAG TTAAACAAAT AGCAACCCTT AGGTCATGAT CATGTCTGGA TCAAGAAGAC GTACTTAAGA AAAATATCCT AATGGGAGTT GAAAAAATTT GGAAGTTCAT CTTGGTAAGG  TCAAAATGAA GTTCTGCGTC AATAAGGTTA CTAAGCAATC ACTAGTCATG TTCTCGGTTA ATTCAAGGTA AAAAATGGTG CCATGTAGGC TAAAGAAAAC AAAGTCTCGG GAGTTAAGCA  AAGAGTAACC TTCTAGTGTT ATTCATCATC AAGTTATGGA TCCAAAAGGT AAAGGAAAAG TCATTTGATT TGGGTAATTA GCAGTCAACA TATCGGTAAA TAAAGATCAA GTTTTTGGTG  TGGAATGATA TAGAAAATGC ATTTAGTATA AGTTAAACTA ATATGAACCC TTACTTAAGT CATGATTACC AACGTTCAAA GTGCGCTACG CCTCTACCTG TACTAATGCG AATGGTGTAT  GCGATGACAA TGGACTTGAG GCGGGCTTGG TGGTGGAGCT CGTGGGTTTG CTTGTCAGTT TTACGGAGGA ACAGTAAAAG TGTGAAACGG ATCCAAGATA CATTCTGAAA AGGAGGGAAT  AACATTTTGG TACAAAGAAT GACACATCTC TAAATTTCTT TAAAAGTCAG CATCTATAGC ATCTATAGAG GGAAGAACAT TTTGGTATAA AGAATGACAT ACCTCTAAGT TCCTTTGAAA  GTTGGGACAT ATCTTCAATT TTTTTCAGAA ATTATGAACC TAAATCTAAT GTTAATTAAA TCTAAGATTT TTTTTTTCTA AACTGTTACT TAAGTTAGGA CCTAGACCTA ATTTCCCAAA  AAAAACTACA TGACCAGCAA AAGTCAGTTT GACTGTCTAA GCTGACGTAA TCGGACGGCT ACAACTACAA CGATACAAGA TCGGAACTCC AGAGGGTAGT TGTTGGATGG ACGGAGTCGA  AGCGAACACA CGTGTCACTT TCCAACTGGA TGCCACACGA GTGGAGGTAA GCGACAACTT TTCATCTCCT TCTCCTTTCG GCTCCTCCAG TACACTCCGA CACAGAAGAG CAGCAGCAGA  AATGGCAGAG CGGCTTTGCT CTTCTTCCCC GATCACCTCC TTCTCCTCCT CCTCCTCCTC CGCCTCCGCC ACCATCAATG GAGCTTTAAG AAGAACCGTG GCTTTGAGAT CCACTGCCTC  TTGCTCCTCC TCTTCCTATT CCCGTCCACC TTTCTGTCTA AAGTCATCGT CTTTCCTTCA CAGTACTCCA CCGCTGACCA TCACCAGGAA AAGGTGCGAT TTGGTTGGAA GACGTCTTTG  TTCTAGTTCA TCATCCGGTG CTTCAGTTAC TACCTGTTTC GCTTCGGACC CCGCGCAGCT GAAGAGCGCG AGGGAGGACA TCAAGGAGCT TCTGAAGACC ACCTTCTGCC ACCCTATCCT  CGTAAGTTCA GATTACTGTC CTATCGAGTC CTCTCATTAA AATGATTCTT TAGGAATTTT GGTTGTTTAT TTATTTTGTG TGGAAAAAGG TTCGACTTGG ATGGCACGAT GCGGGAACAT 
ATGATAAGAA TGTGGAGGAG TGGCCGAAAA GAGGAGGGGC AAATGGAAGC TTGAGATTTG AGATTGAACT GAAGCACGCG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGGGATAGCA TGTACAATTT ACAATAGAAG CCTAAGACAA ATCTAACAGA GCAAGAATTA CTTAGTGGAG ATTGTTAAAT TACCAATTTA CCTTCTATAT ACCAAGTTTA TTACAGACCG  AGATCACGTC TAGGTAAAAA TCGAGATTAA TCTCGGAAGG AGATCACCAA CAGCACTACG GCACTAGAGG AGCTCAGTGG TGGAGGAGGA GTAACCCAAA TGCTCAATTC GAATCGGTGG  TTTCGTCCAC TGCTCTTGCT GAAGTAGGGA TCAACTGTAA CTAGTCTCTG GTGAACAGCT CCCCCAGCAC TTCTTGTACC ACTGTTCTTG GAAGGATACA AGCCTCATAT CTTAATGGGT  TGGATTTCAG GAACAACGTC ATCAGTTGTG TGTCGTATCC TGTGATCTAT GCTGCAGACG TGGGTAACCC TTTTGGTCCT GTCGATGATG GTACCGCTCT CTGCTTGTTT TGTTGCAATT  GGGTATTTCG AACATGAATT TGGGGACATC AAATAAGTCA AATTGGGTGA TTGGCGTTGC TATTGGTATT GTTGTTCTAC AGTTGCTTCA GATTCTGCTT TCTCGGTTGG AAAAAGAATC  ATTAGTGATA GGGGGACTAG ACATCGGAAA GATCGGTGGA ATCATCAGTT TGTTTCAATG ATTGGTATTA TGCTGAACAA ATGATGAAAA ACCTAAACTT AAATGAAGAT GTTAGCGATG  AAGAAAAATA ACTTTATTTG TAATTTTGTC ATTAGTTTGT AATTTTATTC TAAATTGTAA TTTTTAGACT TTAAGTTATT TAACTTTGTA ATTATAAATT TTGTATCGTT AATTTATATT  CTTATTTTTA ACTTGTAACT TCTATCCAAA ATTTTTAATA AAGAATTATT TTTTATCCAA AATTTTAAAT TTATTTTTTA AATATTCAAA GAATTATCTG CCAAACTAGC CTGTTTGGCG  ACTACGAGCC AGTTCCACAT GACGTGTTTG TTTAACCTAT TAGGAAATTG GCTCGACTCG TTACGAAGAA TGAGCCAGTT TGAACATGTC AGCCTAACGG CCTGTTTGGG TCATTTAAAA  CGAACCAGTT TTGGTCCAAC CCAAATTACA CCTTTAAATA AGGATAAGAA TTGTAACTTT TGAAATTAAA TTTTCTAAGT TTATTAAAGT TAGTTTTTCT TTAATTTCAA AAATTATGCT  TATATTGATA TTTTTTATAT ACATAAGATT TGGTAATTTT GAAAATTAAA TTTCTTAAGT TTATTAGAGT TTTTTAGGAA AATTATTATT ATACCAAATA ACGATAAGAT TTGGTAACTT  TCGAAATAAA ATTTCTTAAA TTTATTAGAA TTTATTTTTT TTAATTAAGA AAATTATGTT TATATTGGTA TTTTAAAATA AGGATAAGAT TTAAAATTAT ACTTTAAATA ACGAAGATAT  AATTGAATAT TTTATTAATA GAGTATTTTA CCCTTACAAT TATTTAATCT TTAAGGATAA TATTAGAATA ATTGTGACAA ATATGAGTTT AGTCCATAAC TTTTCTCATA TAATAGATAA  CTTTTCTCAT ATAATAGATA ATCTATGATA GACCATGGAG GACAAGAAAG TTTACTATGA TCTATTGTAG GGGTGTCGAT GGATATGAAC AAGGAAGAGG TATTATTACT CTTGTCCTTA  CCTGCTACGA AAAATCTATG ACAGTTTCTT ATGTTTAGGT TCCTCTTGCA ATATGCTGCA GAATTTTTAT TTTTTTTTGC CAATTCTCCC AATATGATTT CCTTGATCTT GCACTTCTCT  AAATTTTAAC TCTAAATTTT AACTTTGTAT CATCATTCCA TTATTCTTCT TTACTCTTTA GTGGTATCCA ATTCATTTCT TTGGGTCTGG TTATCAGAGT AAATGCGTTG GTATTTTGAT 
AATTTGACAG AGACCGGACC GTCGGCTTCT GATGAGTCTT AATTTGACCG TCGGCTTCTG ATGAATTTTC CATTTCTTTG 

Retrieve as FASTA  
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGAGC GGCTTTGCTC TTCTTCCCCG ATCACCTCCT TCTCCTCCTC CTCCTCCTCC GCCTCCGCCA CCATCAATGG AGCTTTAAGA AGAACCGTGG CTTTGAGATC CACTGCCTCT  TGCTCCTCCT CTTCCTATTC CCGTCCACCT TTCTGTCTAA AGTCATCGTC TTTCCTTCAC AGTACTCCAC CGCTGACCAT CACCAGGAAA AGGTGCGATT TGGTTGGAAG ACGTCTTTGT  TCTAGTTCAT CATCCGGTGC TTCAGTTACT ACCTGTTTCG CTTCGGACCC CGCGCAGCTG AAGAGCGCGA GGGAGGACAT CAAGGAGCTT CTGAAGACCA CCTTCTGCCA CCCTATCCTC  GTAAGTTCAG ATTACTGTCC TATCGAGTCC TCTCATTAAA ATGATTCTTT AGGAATTTTG GTTGTTTATT TATTTTGTGT GGAAAAAGGT TCGACTTGGA TGGCACGATG CGGGAACATA  TGATAAGAAT GTGGAGGAGT GGCCGAAAAG AGGAGGGGCA AATGGAAGCT TGAGATTTGA GATTGAACTG AAGCACGCGG CTAATGCTGG TCTGTGTTAT TATGTATTTA TACTTTGTAC  ACGTGATCTT TGTCCCAATT TTTTATAGTT GTTGGAACTT GGAATACTTG AAAGTTGATA AGTTCCGAGA AAAGTACTTT TAACACAATA CCAAAATGGT TCGTAGTTGG ATGGTTGTAC  TTGAATACCA GATTAGTGCC AAATCACATG TACAGAGGTT AGATAGCCTT TATTTCTGAG TACACTCTAT TGTGTTTATT GTCTCTATGA TAAATTAATG TTAACATCGA CTATATGTGG  GGAGTATTAA CAATGTTGGA AACTTAATAA GCTTTTACTG AGATAGTTCT CTTCAACTAA TTCAATCGAT TAAGTTGAAT GTTCACACTT TTGACCATGA ATGGAGCAGG CCTTGTGAAT  GCCTTGAAGC TTATTCAGCC TATCAAGGAC AAATACCCCG GTATTACATA TGCTGATTTG TTTCAGCTGG CTAGTGCCAC TGCTATTGAG GTTTGTGTAA CCGCCGAGTG AAATTGTGTA  GCTCTTCTTG GTTTACTTGG TGTACTCATA AATTCTGCAA TTCAGGTTTG CTGAATGAGT AAATTACTTC TTTCTTTTTG GTACTTTTAG GAGGCTGGAG GTCCCAAAAT TCCAATGAGG  TATGGAAGAG TTGATGTTAC CGGAGCCGAA CAGTGTCCAG ACGAGGGGAA GCTTCCTGGT AAGAAAGTTT CTTGAAATAA ACAATAAAAT GTCACTCGTT TAATTTTATA TAATGTAAGC  TCCAAATACA CATCTTGAGA TGGCTAATAC TGGAACGTAG TCAATCTTTT TGCTACTGAA AATTGAAGTT GATGCATATA TATATTTCCA AACATATATA GACATATAGG CAACGATGTC  CTTTGATATT TCTTTTAAAT TCATAGACTG CATTTGAACA AGGACTTTCT TGGTAAGCTC GACTTTTTAG TGAGTTCGAA CATCTAAGGG AGAGCCTGTT TGATATTTTT CTGGTCCTCT  GATTGTAAAA ATCGTCTTCT GGCTTTTCAG CCGGGCCCTT ACCTTTGGTA CTCAAACTGA TGGCTACCTG TGCTCCTATA TATTAGGTAT ATCATTCTAT GATGATGTTG CGTGAGTTAG  CTAAGCTAAG ATAACTGGTG CATGTATTGG TGGATTACAA GATATACGTG GTTTATTCCG AAGTCATTCT ATACTATTTT CTCAAATTAT AACTTGTGAA CATGTGAATG ATTTCTCTCA  AGATAAACTT TTGCTGATCA TTTTTTAGTG AACCACAATT CTTGCTTTAT GGTAATCTGA AGCACTTGTA TATATAATAC TGTATCTAAA ATGTCTTCAT TCATTTTAAG ATGCTGGCCC  ACCTTCACCT GCTACTCATC TGCGTGACGT CTTCTATAGG ATGGGTTTCA ATGACAAGGT TTGTATATTT TCCTATAATA CCATACTATA TTTGAGGATG CATATTTATA ATTTTGGCAC  TCAAGCATTA TGTTAAGCTA CATATCTCAA TTCCAGGAAA TAGTAGCACT ATCTGGTGCA CATACGCTTG GCAGATCTAG AGTTGAACGT AGTGGATGGG GCAAGCCAGA AACCAAGTAC  ACAGTATGAT ATTTTCTCCC TTGACAACCT CAATTTATAT CATTTCAATG AAAATGATTT TTTTTTCAAT CTGTTCTTCC CATGTGGACA TTATTGGGTG AAGTCAAAAT AATGCTTTCA  TTACTGTGAA CCTCTTCATG ATATTGCCAA TATCTTCTTA TTCTTCCTGA ACTCCACTTG TTCTAAAATC TGCAGTTCTT GAGAGCATTT TATACACAAA TGAAATGCTC ACTCTGCAAA  GTATATCAGC GTGGCTAAGC ACTTTTCCTG CTCACTTTGT GAATAGACCG AGAAAATTTT ATAAGTTATT TTACATTAGC TTCTTGTTCG AACACCTTCT CCAATATTGC GAAGGCCGGA  TAAATACCTT CTTTCATATG TACATATGAT ATGATACGTA GATGCAAAAT ATTTAGCTTT CAGGCTTTAC TACCCAGTTG ATGACATATT CCTATTGGAC TACAGAAAGA TGGACCAGGG  GCACCAGGAG GACAGTCTTG GACAGTGCAG TGGCTGAAGT TTGACAATAG CTATTTTGTT GTAAGATCCG TAGTTTTGAA GTACCATCTT TCGTATCCTT GTAATTGCTT TTTAGTGATT  CTGTATTTTG CAACATGGTT AGGATATCAA AGAGAAAAAA GATGAAGATC TGCTGGTTCT GCCTACTGAT GCGGCTCTTT TTGATGATCC TTCTTTCAGG GTAATTGCAA ATGATACATT  TGCATTTCTA CAAATCCAAT TGAGTGCGTG CTATATGATG ATTCCATTTT GTTTTTGCTT CAGATTTTTG CGGAGAAATA TGCAGAAGAT CAAGATGTCT TTTTCAAAGA CTATGCTGAA  GCTCATGCTC ACCTGAGTGA TGTTGGTGCC AAGTTTGATC CTCCTGAGGT ATGCCTGAAG AGAATGCTAC TGTCCAGTCT TTCTTTTGGA ACTAAAAATA GGACGGTAGC AACCGAAGCC  TTTTGGTCAT CTACAAAAGT ACTGAACGGT TCTGATCTTC TGGAAATGAT TGATCAGGGT TTCTCTCTAG ATACTGGCTC CAAAGATGCA GCTCCAGAGA AATTTGTTGC GGCAAAATAC  TCCTCCGGGC AGGTAAGCAA CTAGCCTGTA TGCCATCTCA TTTCGTTTTG TAGTTTTGAA GCTCTTTGTG GCATTTAGTG ACACCTTCGT TATGGTTCTA AGTAAATATA CGTACTTTTA  TGATTGCAGG ACTAAGAAAA CAAATCATGT TTTGTTCTGC TGCGTCTTTT AATAATTCAA GATGAAGCTT TTCCAAAGAG TGTGATCAAT AAATGGTTTT GGACAATGTT TAAGAGAGGA  ATAAAAATAA AACAAATAAA TGTTGCATTT GAATTGCAGA GAGAGTTATC GGATGCCATG AAGCAGAAAA TCCGAGCAGA ATATGAAGCT GTTGGTGGCA GTCCAGACAA GCCTTTGAGT 
TCAAATTACT TTATAAACAT CATGATATTG GTCGCAGGGC TAGCAATTTT GACATCCTTG ATTGGAAACT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGAGC GGCTTTGCTC TTCTTCCCCG ATCACCTCCT TCTCCTCCTC CTCCTCCTCC GCCTCCGCCA CCATCAATGG AGCTTTAAGA AGAACCGTGG CTTTGAGATC CACTGCCTCT  TGCTCCTCCT CTTCCTATTC CCGTCCACCT TTCTGTCTAA AGTCATCGTC TTTCCTTCAC AGTACTCCAC CGCTGACCAT CACCAGGAAA AGGTGCGATT TGGTTGGAAG ACGTCTTTGT  TCTAGTTCAT CATCCGGTGC TTCAGTTACT ACCTGTTTCG CTTCGGACCC CGCGCAGCTG AAGAGCGCGA GGGAGGACAT CAAGGAGCTT CTGAAGACCA CCTTCTGCCA CCCTATCCTC  GTTCGACTTG GATGGCACGA TGCGGGAACA TATGATAAGA ATGTGGAGGA GTGGCCGAAA AGAGGAGGGG CAAATGGAAG CTTGAGATTT GAGATTGAAC TGAAGCACGC GGCTAATGCT  GGCCTTGTGA ATGCCTTGAA GCTTATTCAG CCTATCAAGG ACAAATACCC CGGTATTACA TATGCTGATT TGTTTCAGCT GGCTAGTGCC ACTGCTATTG AGGAGGCTGG AGGTCCCAAA  ATTCCAATGA GGTATGGAAG AGTTGATGTT ACCGGAGCCG AACAGTGTCC AGACGAGGGG AAGCTTCCTG ATGCTGGCCC ACCTTCACCT GCTACTCATC TGCGTGACGT CTTCTATAGG  ATGGGTTTCA ATGACAAGGA AATAGTAGCA CTATCTGGTG CACATACGCT TGGCAGATCT AGAGTTGAAC GTAGTGGATG GGGCAAGCCA GAAACCAAGT ACACAAAAGA TGGACCAGGG  GCACCAGGAG GACAGTCTTG GACAGTGCAG TGGCTGAAGT TTGACAATAG CTATTTTGTT GATATCAAAG AGAAAAAAGA TGAAGATCTG CTGGTTCTGC CTACTGATGC GGCTCTTTTT  GATGATCCTT CTTTCAGGAT TTTTGCGGAG AAATATGCAG AAGATCAAGA TGTCTTTTTC AAAGACTATG CTGAAGCTCA TGCTCACCTG AGTGATGTTG GTGCCAAGTT TGATCCTCCT  GAGGGTTTCT CTCTAGATAC TGGCTCCAAA GATGCAGCTC CAGAGAAATT TGTTGCGGCA AAATACTCCT CCGGGCAGAG AGAGTTATCG GATGCCATGA AGCAGAAAAT CCGAGCAGAA 
TATGAAGCTG TTGGTGGCAG TCCAGACAAG CCTTTGAGTT CAAATTACTT TATAAACATC ATGATATTGG TCGCAGGGCT AGCAATTTTG ACATCCTTGA TTGGAAACTA A 

Retrieve as FASTA