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Entry information : PnodRboh05(Potnod000004g0074980.t1)
Entry ID 18765
Creation 2023-05-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-05-24 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PnodRboh05(Potnod000004g0074980.t1)
Name PnodRboh05(Potnod000004g0074980.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh002]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Potamogeton nodosus    [TaxId: 99363 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PnodRboh05
start..stop		 S start..stop
PnodRboh09 1722 0 1..914 1..917
AdurRboh07 1396 0 6..914 9..914
PtRboh02 1396 0 6..914 10..917
CcaRboh05 1395 0 6..914 9..913
Literature and cross-references PnodRboh05(Potnod000004g0074980.t1)
Protein sequence: PnodRboh05(Potnod000004g0074980.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   918
PWM (Da):   %s   103585.03 Transmb domain:   %s   o386-405i524-546o566-588i745-762o
PI (pH):   %s   9.35
Sequence
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*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGRCLRRCSS DTIPTTSFPL SLNTTPATSD GEEEFVEVTL DFKDDDTVVL RSIASASFPH PPPSPSVCVQ TSEYMTPSSS RSHSPSVVER SSSNRFRQFS QELKAEAVAK ARQFSHDLRA  EFRRFSWGSS KTTSVSAPIG VGIGGGQSGS AMEMAMAARA MRKRRAEVNR AQSGAAKALK GLRFISSTKG IDAWNEVQAN FDRLAPDGFL LRSDFAECIG MKDSNEFALE LFDALSRRRR  IKAEKISGDE LLDFFTQITD QSFDSRLQLF FDMVDKNEDG RITEAEVKEI IMLSASANRL SRLKEQADEY AALIMEELDP ERLGYIELWQ LETLLLQKDT YLNYSQALSY TSQALSQNLQ  ALRRGGTIRK LGNKVGYYLE ENWKRLWLLG VWIGIMIGLF FWKFFQYKRC DAFPVMGYCL TTAKGAAETL KFNMALVLLP VCRNTITWLR STKLSLAVPF DDNINFHKTV AAAIVVGIIL  HAGNHLTCDF PRLMRSSEVE YGPMKPYFGE EKPSYAALVR GPEGVTGVLM VVLMAIAFIL ATSWFRRSLL KLPKPFNRIT GFNAFWYSHH IFVVVYILLV IHGCFLYLVH EWYLKTTWMY  LSIPVLLYAG ERILRAFRSG YYPVHLRKVA IYPGNVLAIQ MSKPPAFRYK SGQYMFVQCP AVSSFEWHPF SITSAPGDDY LSIHIRQLGD WTRELKRVFS EACEQPVTGR SGLLRADETT  KKSMPKLMID GPYGAPAQDY RKYDVLLLVG LGIGATPFIS ILKDLLNIIK SEEQADSNSD LSQNTDASPW SFDSTSGNRV SPKRKKTLKT TNAYFYWVTR EQGSFDWFKG VMNEVADLDQ 
RGVIEMYNYL TSVYEEGDAR SALITMVQAL NHAKNGVDIV SGTRVRTHFA RPNWKKVLSR TCSKHPNARI GKFFLLQF 

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Remarks
Promoter►
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TTGCTGTATT AGAGAAGGTC GAAAAGAAAG AGAAGGGCAA GCCCGCAAGA GAAGTATATG GAAAAGGTTA ACATTAAATT GATAATTAAT TAATAATTAA AATTTTTAAT AAAATCTACG  GGTATAAACG GGTAACCGAT ATATTATACG GGTATACCCG ACCCGTCCCA CCAACATTCG GGTGGGGTTT GAGATTGAAA AATCAGACTC GTTAAATAAA TAGGTCGGGT GAACCCGTAC  CCGTTTATTC ACAGGTCTGA GTTAAACAGG TCGAGTTCAC CCGAATCTTA CCCGTCTGAC AGCCCTACTT TCGAGTCACT TTGCATTACA CGTCTTTGTT ACTTCTTTAG CATCACTAAT  TTTAACACTT AAATGTGATT GTACTTTCCA ATGATTTTCA AGAATTTACG AGTAATATAA TCTAAAATCA ATTAGTTTTA TATGTCCTAA AATCTATAAG TTGATATTTA TTTCTTAATC  TAAAATCAAT ATTCACTTAA AGGTACTTCT TATAGTTTCA AGGGATCTTA GATTCGAGAT TCTTCTCTCT TAATCAATCC TCTTCTTCTT TTCTATTCTC CGGTATAATG ATAATTACAA  AATGAGCAGT GTCTTATAGG CCGAAAATTT AGGCCGAATT TTCGACCTAC TCGGCCAAAT TACCAAAATG CCCTTCGGGG CATTTTGGTA TTTTCATTTT TATTTTTTTT TTAAAAATTC  CAAAAAAAAA AAAAATATGG GTAGTTATAA AATGAATTTA TACATTTTTA AAAAAATTTA AAAAAATAAA AACTTATAAA TAGTTTCGTT TTTTAATTTT GTTTCGTTTT TAAAAATTTT  TAAAAACGAA AAAAAATTAA AAACCGAAAC TTTTTATAAG TTTTTATTTT TTTAAATTTT TTTAAAAATG TATAAATTCA TTTTATAACT ACCCATATTT TTTTTGTATT TTTTGGAATT  TTTAAAAAAA AAATAAAAAT GAAAATACCA AAATGCCCCG AAGGGCATTT TGGTAATTTG GCCGAGTTAG GTCGAAAATT CGGCCTAAAA CTCGGCCTAA GAAGTATTTT CGATTACAAA  ATACCAAATG AGCATAATTC TTAAAAAATA TTTAAAAACT CTTGAAAAAT ACCAAATACA TTTAATCTTT ATGTAATATA ATTAACTCTT GAAAAAGAAG TACCAATGCA AAAAGAGAAT  AATAAGGAAA GATAAAAGAA TAAATGGAAA AGATACTCAA TTCCGTTACG GCATTTTCTC TCTATTTCCA CGTCAAATAA AAGCACCTCC TCTCTCCTCC TTCTTCTCTC ACAATTCCAC  AAACTCAAAA ACTGCACTCT CCCTCCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTGCGAA ACCATCAACA AACGTCCCAG AGAGAATATG ATGCCACCAT AGTCTCCCAC  TCCTCTTCCT TCTTCCTCAC GACAACTTTC TCTCTCTCAC ACTATTCTCT CCCTTCAATT CCATTCTAAT CACTAACAAA TAGGAAGTGG GTGGAGACGG ATAATAGTAG TTAAACAGAA  TGGGAAGGTG CCTCCGGCGA TGTTCGTCGG ACACAATTCC GACGACGTCA TTCCCGCTAA GCCTCAACAC TACTCCGGCT ACGTCAGACG GGGAAGAGGA GTTCGTCGAG GTGACACTCG  ATTTCAAAGA CGACGACACC GTTGTTCTCC GTAGCATAGC TTCTGCTTCC TTCCCACACC CTCCTCCTTC CCCGTCGGTG TGCGTTCAGA CATCGGAGTA CATGACGCCG AGTTCTTCCC  GCTCACATTC TCCGTCGGTG GTTGAGAGGA GCTCGTCGAA TCGGTTCCGG CAGTTCTCCC AGGAGTTGAA GGCAGAGGCG GTTGCGAAGG CGAGGCAGTT CTCTCACGAC CTTAGGGCGG 
AGTTTAGGAG GTTCTCTTGG GGCTCGTCGA AGACAACGAG TGTTTCCGCC CCCATTGGAG TGGGGATTGG CGGTGGACAG 

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Terminator +►
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAAAATGATC CTCTTCTCCT CCTCTCTTGA TTCCCCTCCT TAGATCAGGA AGATGCTTCA CGATTTGGAT GCTTCTGTCA GACCCCAACC CTACACACGA CTAACTTGGG ATCTGAGTTC  AGATAGTAGT AGAATTTCAC AAAAATTTGT CAATATTCCC TCTATTTTCA CAATCATCAA TACATGAGAA CTTACATTTC CTGCTGTCAC AATTCATCAC ATTCAATATC TATCAAGGTT  GTTTACCCTT GAAAAAAAAC AATTGAACTA TCATTCCTGC AACTTCAAGC TTAAAAGTCA TGCAGATAAA CTAAATCAAG ATTGTCGTAG ACAATAAAAC AACCAACATA AAATACCTAT  CTTTTATTTA GTTGCGGCTG CGCTTATATA GCTGCCTACA TACCCATAGA GGGTCACCTC CGTACCCACT ACGAGATCAA GCCACATGTA GTTCTATCAT TATTAATTCT AAATCATACC  TTTGCTTTAC TTACCTCATT TCAAATGCTA ATTTCATGCC TTAAAATGAA TCAATCATCG AAGCTCTATG AAGAACATAC CTGTCACTCA AATAAGCAAT TTCTGCATGT ACACTTTACT  AATTTAAGGC AACTGTTAGT AAATCACAAT GAATATTTCT CAATCACATA ATAATCGAGT ATATGATGAT AAATCAAAAG CTCAATAACT TTGATCACTT TAAATAAGGA AATTCATAGG  GTTCCTTTCT ATATCTAGTT TAGGCACATC AATTTAATAC AAATCAAAGA CTTCTATTGA TTTGTTGATT CCTATCATAT CATTATGATC ATCTATACAA TCTGATAAAA TTTAACTATT  AACAAAAGAC TTGTCTAGAG ATATAAATGC TTACCTTCAT GTAGAATTTA TGCTCATAAT CCTTTAATTG AATGCTAGGA CATATAATTA TGCTCTTATA ACATTTATTC GTGAAGATCT  TTTACCATAC ATCTAAACAT TTCCAAAATA CTCTTCTATC ATGATATGTA AAATAATCTC ATGATATTTA CTAATAAAAC CATTCATTTA TCCCTTTAAA TCATCTATAT GTCAGGCATG  CTTTTCTTTT TATCTATAAA CATATTCATA CATGTCACTC TCAATTATAC TTTCATGCTC TATAACTATA TATGCATGCC ACACACTATA CTCTATGTAT TATTCCTTTC TTTATTTTCA  TCTCATTATC TTTCTTAATC TTTCATCTTT TATTTCCTAT ATGATGCATG CTTTCATTTA TAACTTTAGT TTTCACTTTC ATTACTTCCA TCTCTGTAAC CACTCTGTTA GTATTTCATG  AGTGCTTCCG AAGGAACTCA ACTTTGCTAG CATTGGGTGT CCATGTTTCA CATCTCACTT AACACTAACA GCAGCATTGG AGATCCGTCC GGTTCGGACT CCCGGGTCTC TGCAGAATAC  CCCTATATGA CCCTCTCTGG CCCTCCTGTT TTAAGCATTG TCATTACTTC TCTCTTTCTT TCTCTTACCT TACTTTACTT TCACATGCTT TCTTAACAAA ATCACCATGA TAAGCACTAT  GATACTCAAG TCAATCATGA TATACTTTCT ATGATGCACA ACTTTACTCT TTCTTATGAT TTCTGTATGC AATACACTAA TTATTTTCTA TAACTTCACA CAGTGCAAGA TGTTTTCTAT  CATGCAAATA TACAACTATA TGGTGACTTG AAAATGATAT ACAAGTATGA ATATATTATT CTTTACTCTA TATGATATAT ATCATAAGTA TGCATACCAT GTATCAAATA TTCACCTTTC  CTTCACCACT ATAAAAAGGA TGTTAAACCT ACAAATCCAC ACCACTTCAT TTACTTTTAC CTTTACTCTA TTCTATTTAC AATCATTCTT AACAAGCAAG TTACATAAAT ATGACCTTAA 
CCCTTGCATG TCCTACTCAT GAGAATCTTT ACCATGCTAA AAATGTAAAC AAACATCTAT GTCCTTGTCA TCTATAATAA 

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DNA ►
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAAGGT GCCTCCGGCG ATGTTCGTCG GACACAATTC CGACGACGTC ATTCCCGCTA AGCCTCAACA CTACTCCGGC TACGTCAGAC GGGGAAGAGG AGTTCGTCGA GGTGACACTC  GATTTCAAAG ACGACGACAC CGTTGTTCTC CGTAGCATAG CTTCTGCTTC CTTCCCACAC CCTCCTCCTT CCCCGTCGGT GTGCGTTCAG ACATCGGAGT ACATGACGCC GAGTTCTTCC  CGCTCACATT CTCCGTCGGT GGTTGAGAGG AGCTCGTCGA ATCGGTTCCG GCAGTTCTCC CAGGAGTTGA AGGCAGAGGC GGTTGCGAAG GCGAGGCAGT TCTCTCACGA CCTTAGGGCG  GAGTTTAGGA GGTTCTCTTG GGGCTCGTCG AAGACAACGA GTGTTTCCGC CCCCATTGGA GTGGGGATTG GCGGTGGACA GAGTGGGAGT GCGATGGAGA TGGCGATGGC GGCTAGGGCG  ATGAGGAAGA GGAGGGCGGA GGTGAATCGA GCACAATCGG GTGCGGCGAA GGCGTTAAAG GGGTTACGAT TCATCAGCAG TACCAAAGGA ATCGATGCCT GGAATGAGGT CCAAGCGAAC  TTCGACCGTC TCGCCCCCGA CGGTTTTCTC CTCCGATCTG ATTTCGCCGA GTGCATTGGT ACTTTTTGTT CGTTCGTGAT TTGTGTGAAA TTTTCTCAGT TCAGATGTCA TTGTTGTTGG  TGACGTCTGA CGGTTTTGTT CGATGGATTT AGGTATGAAG GACTCCAACG AGTTTGCTTT GGAATTGTTC GATGCGCTCA GCCGCCGTCG GAGAATCAAG GCGGAGAAGA TTAGCGGAGA  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TCTTCTCCAA TTTTGA 

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CDS►
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