Entry information : PnodRboh08(Potnod000012g0187650.t1)
Entry ID 18768
Creation 2023-05-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-05-24 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: PnodRboh08(Potnod000012g0187650.t1)
Name PnodRboh08(Potnod000012g0187650.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Potamogeton nodosus    [TaxId: 99363 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value PnodRboh08
start..stop
S start..stop
PnodRboh06 1888 0 1..924 1..924
CescRboh04 1479 0 18..924 27..932
ZmaRboh01 1447 0 2..924 3..936
SpolRboh04 1443 0 20..924 8..921
Literature and cross-references PnodRboh08(Potnod000012g0187650.t1)
Protein sequence: PnodRboh08(Potnod000012g0187650.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   924
PWM (Da):   %s   104773.87 Transmb domain:   %s   o372-391i512-534o554-576i738-755o
PI (pH):   %s   9.71
Sequence
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Remarks
Promoter
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TACTTTCTTA CATTAACACA AGATAATGGA AACTATTTTC TGGATTTTTT ATGAAGAATA AATTTATTTT ATTTTTATTT AATAATCTTG ATTTTATGTA ATTATTAATT AAAAAATATT  TGTGCAACTA AAATTGAAAA TAACTTCTTT ACTATCTTCA TTGTGACAAT ATATTTCAAA TAAAATTAGT TGAAAAAATT TAGATCACTT ATACTTATGC AAATTGAAAA GTAGACTATT  ATACATGCTA AATATATTTA TTAAGTATAC TCACTGTAAG TATCTCTCTA CTAAATTTCA TTTAACATTT TCCAAATTTT TTCTAGACTT TCTTAGATTG ATACGAGATA ATGGAAATTA  TTTTTTCAGA TTTTTTAGAT GAAGAATAAA TTTATTTTAT TCTAGACTAT CGTACATAGA TTGAAATTAA AATTTTGAAA AGATAAAACA AATTGGCTCT TTTTTCATCT TTTTTATTAA  AACGTACATT TACTAACATA GATAAAGGAT ATCTTAAATT CTTATCAGAC ATGTGAGAGT ACTGCATATT ACATGATAAG ACCAAAGTTC GCAATCCAAA CAATAAGAGT TTCACATATG  ACCACTTTGC CGACCTACTA TGAATTTTCG CTTCTACCGA ATGTGCCAAC TCATTCCACG ATTTTCCTGA TGCCATTCCA GTCAAGGTAG AAAAAAGAAA CACAAGTCCT AATTACTGGG  CCCACGACCC ACTGATTTCA TGTGAGGATC AAGGAAGAGG AGGAAGGAGA AGATGGGTGG GTGGGCCCTG GGGAGTAAAG GAGGAGGAGG AAGATGTGAA GGAGGATATT ATATATATTA  TTTGTTATGT AAGTATGTAA TACAGTATGA ATCGAGTTTT TGACTTAACA CATGTTAAAT TACAATTTTA TATTTTTTGA AACTTATTGT TGAATTCACG GAAGAGGAGT AAAATGGTAA  TTTGGCATGC ATTAAGTCAA AAATTAGATA AAAAATTCAT CTATAAAACT TTTTTGAATA CAATTTATAG TCGTTACTTT GTGGAGTTGA TGAAAAATCA CTTCCCAAGC CAGCGACCTC  GCAGGCCACT GTTTCATATC TTCATGTTCG TTCCCCCCCC CCCCCCCCAC CTTGTCTTAA AATTTCATTC TGTGAGATGA TCAACGATTC TATTCTGATC GACGTATTTA AAAATCCCAT  GTCGAACTAG GGGACAAAGA TTTTATTTTA TTTTTTTACA GGTGAAAAGC ATCAAAAAAT TCTTTTACTC CCCGAGTTTT CCAAAAGTGG GAACATCCTA CCGGCCAAAT TATTCTTGGC  ATTACATATG TTTGACGCGT TTTTTCACTT TTTACTTTTT TTCTTTTTGT AATGTATCAG TATCAACCCA GTCATCCAGT CCTCCTTAAA ATAGATTGGG ATTAACCTAA GCAGAGGATT  ATCGTATCAA CAATTTCAAT TAAGCGCCAA CAACCACACC GTGGTCACCT TGGCCCTATC TGGCTACTTT GTCCCTTCTG GAAGAGTCTT ACTATCTGCC CTTGGTTTTT GACATATTCA  GAAAAGTCAA TTAGACCTTC ATAAAAAAAT GTCAATTAAA TCCCATCAAC TTCAGTGACA ATCACGTATT CCAAATCTGC ATGCAAACCT TACACTAAAA GGCATTTAAT ATAAACCCAA  TTATATTTAA TTATTAATAA TTTCTCCCAC CCAAAATCGT GATCAAAGTT TTGGTCTTCG ATCCTCATGC CAAAATTTAC CAAACCAACG ACTCCTTTTT TGATTGCCAA ACTTCATTTG  ACTCTTTCCA ACTTCTTCAG TTCTTCCTCC GTCCTTCCTC CATTAATGGA CTGGTCTTCT CCTCCTTCCT TTCTTCTTCC ACCTAAACTA CAAGTACATA AACACCAACA CCAATCGCTA 
CCATTACATA ATAAACCCAA TTCTTTCATT CTTTTCCTTG ACTTCTCATC ACTTCTCTTC CTCATCTAGT AACTTCCAAT 

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Terminator +
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GTGGTGACGA AAGAGCTGCG TAATCTAGCA CAGGATTTCT CGAGGAAGAC GACCACGAAG TTCGACTTCC ACAAGGAAAA TTTCTAATAA GTGGCTCCTA CCCTTTAGGC TTTGGCTTAA  CATATGTATA ACGTATTCCG TGTTACAGAA GTATATAGAT TCCCGTGTTT TCCCACCATC CAAAGCGGCT GCCACTTTAT TCAAGTGATA GTTGTTGACC ACCGGATCCT AGTGGCACTT  CCACCATCCC CGGGGAATAA ATATAGATTG TGGAAGGTAG GACTCTTTTC CTTCTGAATC TCAAGGATTA GTAGCTGCAG TTGGAGTTTC TGTTATTATC ATCCTCCGCT GTGAAATAGT  CATAGGATTG TTTTCTTTGA TTCTTTTGCT AGTTCTCAGC TCTCTACATA TGCTTTGTAC GAAAAGTTAA CTTTTAGCTA ATGCTGGTTG GTATTTAGTA ATTCAATAAA CTTCCTCAAG  CATTTTTCTT CATTTACATA CATAAATTCA CTCCTGAGAT TAAAATTAAT GCCAAGTGGA GCGGGTTGTT ATTTTATTGT AATTTGTGCA GGTAGATGAT ATAAATGTAA AGTCGAAGCT  AGAAATAATC TTGTTTTATG CCAACATGTA AAGGATAGAT AACTTCGTGT AGATGGAAAA CTTACGTATA TATGCTTGAT GCTTCACAAT GACGTTTTAT AAATCTTTGA CCTCAGTGTA  TTATGTCGAG CAGTTCCATG CAATAACCAC CCTAGATCTT CAAACAAGTA TAAAAAACAT CTCGACTAGA CGCAAAAAAA AGTGTTATGC ACAGGAATAT TGAATTTTAT ATTTTGCAAA  AGAGACAAAA AAAAATACTG TAACCAATAT GGTTAATCAC CATGCTTCTG TATATAACGA AAAACAAACG TGATTGCTCC TGGATCCAAA ACGACAAGAA GAAACATACT TCGAAGTAGC  AAGCAAACTC CAATCTCCAC GTGCAGGTCT AAGTGACTGT CATCCCGTTT CTACACAAGT GAAGGGACGA TATACCAGCT TAACCGCTCA AAGAAAAAAA TGCCATTATT TGTCAAATTT  ATAAGCAAAG AGCTCTGAAT TAGATTCTGA ACTGTGTTGG AAGATTTTAG TGTGTAACCT GTGTTAGTTA CTGAGCATTA ACTGGTTATT TGCTTTCTTT TTAGTCTCTG AAAACTAGGC  TTCATGGCCT GGTTACTGCT TGTTGAACTG ATGGAAAACA GAGGTTTCTT CAGCCTCCCA GTTGCAATAT TTTGTGAAGC TTGAGTAAGC GTGCACTGCT TTGGGTGCTC CAATCTCTCC  AAGATCCTTG ATGTCTTCTC AGTCACAGGT TTGCTTTGGG ATGATAAGAT ATGAGTTTCA ACTAGTGATC TCGAAAATGC CTGAGGTGAA AGATTATCTT TTACATTGTG GACTATAAGA  AGTTGTTCCC ACTCTGCAGT CATGCTTGAC ATGTCATCCT CGATCCAATC TTCAGAGGGT TTCATTTCAA TATCTGGAAT TTGATGGGTT GATGATTGTG TGAGCATTGA ATCCTCTAAT  CCTGGAGGAC CCCTATGCCT ATGACCAAAA TTGACATTAT TCTCTCGGAT TGCTCTGAAA GAAATTAATT ACAAGAATAA ATAAATGATT TTTGCTCAAA ATTGAAATAT TTTACATAAA  TGCATTTACC CTCTTGTTTA GAAGCAAGAT TCAACAATTC CATCCACAAA GTTGAAATGA AATAATCATT AACATCGCCA TGAATAATTG ACCAAAAAAA TCTTTTAAGA AATATAACTT  GAAAGTTCGA GTATGTAAAT AGCCAGCGGT CAACGGAATC TTATAAAACT CGTAAATTCT AAAGATAAGT ATCCTGAAGT TTAAGATACG TATTAGGTGT GATTTGGGTC AAGCTACCTA 
CCGGTTTCAA ATAGGAATGC ATAAATAACC TAAAACTGAT AAATGTGTCT TTTAGTGTAT TTGATTGCTA AATAAGGTTG 

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DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCAGAATT CCGGCGAGGA CGAGGTGATT GAGTTGGGAC GCCGGAGGAG AGGAGGTGAC CGGATGGCTT ACAGTGGACC CATCGAACAA AGTTCCTATT CTGGTCCATT TAGTGGTCCA  CTTGTACACA AGAAAGCCAC GACCAAGAAG AGTGCGAGAT TCAACATCCC GGAGACATCG TCGGAGGCCA GGGAGAAGCA GCGACGGGAG GAGGACCAGG ACTACATCGA GATCACTCTC  GACGTCCGTG ATGATTCCGT CGCGGTGCAC AGCGTCAAAC CGGCAGCTGG TGATGATTTG GAGGATCCAG ACGTGACCCT TTTGGCCAGG ACTCTGGAGG GGAAATCGCC TTTCGGAACG  TCGATGATGA GGACGGCGTC GTCTCGAATC CGGCAGGTGT CACAGGAGCT GAAAAGGCTG GCGTCCAGTG CTCTCCGACC GGGAGCCAGT GGAAGAATTG ACAGGACGAA GTCCGCCACG  GCTCACGCCC TTCGGGGTCT TCAGTTCATA AGCAAGACCG ACGGCGCCAA GGGATGGCCG GCGGTGGAGA AGCGATTCGA CGAGCTCTCC AAGGACGGAA TCCTCCAGAA ATCCCAATTC  GGGCAATGCA TAGGTAAAAA TTAAACACCT TGAATCACCT GATCTAACGG TTCTGGGGAA ATTAAACGCT CGCTAAAGTT TTAATCTTTG TGAAACTACA GGGATGAAGG AATCGAAGGA  GTTCGCGATC GAACTGTTCG ACGCTCTGGC GAGGAGAAGT TACATAACGG CGAACACCAT CAACAAGGAC GAGTTGAAGG GATTCTGGGA ACAGATCATC GACCAGAGCT TCGACACTAG  ACTACAGATC TTCTTCGACA TGGTCGACAA GAACGCCGAC GGTCGGATCG GAGAAGCCGA AGTCCGAGAG ATCATCTCTC TCAGTGCCTC TGCCAACAAG CTTTCGAAGA TCCAAGAACA  AGCAGATGAG TACGCTGCTC TCATCATGGA AGAACTCGAC CCCAACAATC TCGGATACAT TGAGGTAAAA AAAAACCCCG AAATTTCATA AAATAAAATC ACCTTTCGAT TGAATTTGAA  TTTGAATAAC CAAAGATTGA ACTTTTTTAA TGGATTTGAT TGAATTCAGA TATACAACTT GGAGATGTTG CTTCTGAAAG GGCCGAACCA CGAGCTGACA AGAACAGGGA ACAGCAAGAT  GTTAAGCCAA ATGCTGAGCC AGAAGCTGAA ACCAACAAAA GAACCGAACC CAATCAAGAG GTGGTACAAG TCGACCAAGT ATTTCATGGA GGACAACTGG AAAAGGGTTT GGGTTCTGGC  GATTTGGGCT ATGATATGTG CTGGTCTGTT CACGTGGAAG TTCATACAGT ACAAGCACAG AGCAGTTTTT CATGTGATGG GTTACTGTGT TTGTGTTGCA AAGGGTGGTG CTGAGATGAC  TAAGTTCAAC ATGGCTCTTA TCTTGCTTCC GGTTTGCCGG AATACCATCA CTTGGCTGAG GAACAAGACC AAGCTCGGCG TCGTTGTGCC CTTCGATGAT AACCTCAACT TCCACAAGGT  ATCGTCTATT CGTCTCCTTT CCAATCTCTC TCTGTGTCCA AAATCAAGTT TCTATTTCAC AGAACAAAAT AAAATTAATT TAGAGAAATA TGTGAAATTA TTCATTAACG AACTATATTT  TTTAATTCAA TGGGATCGAC AGAAGTATTT TTTTTTAATT TAAATCATGC AGCTCGACAG ACGATACATT GTTTAACCCT TTTTATTCTT TTACCTTTTA TCGTATTTTA CTTGTTTTTT  TTAAAGAATT TGTGGATTAA ATTTTAAAAT TCAACTTAAA ACCGGTTTAA TTCAAGTGGA TATGTGTTTA GACGGGGAAG TCACAATAAT TGACACCCAC CAATGTCCGT CAGATGATCT  ACAAAAGTCA AGAGCAAGGA AAATATTGGC AATTTCAGAT TACTGATAAA GAACAAAAGT AGCACAAACA AACCTTTGCA CGTAATTTTG ACTTTGAGTG CTAGAGGACA AGAGAATTTA  TGATTTGCTT CTTCATTTCA AGCAATGGAG ACAGATCACT TCGAACTTTC GGTTTACCAA TTCTTGTTCT ACCCTTTTTT CTTTGACAAA CAAATATTAT CCTGATTTAT GTGAAATTAT  CGAAAACACC CCTGACATTT GTGAAAATAT TCTTCAGGTG ATTGCCGTTG GAGTGGCCAT CGGCATCGGC CTCCACGCGA TCTCCCACTT GACATGTGAC TTCCCACGTC TCCTCCATGC  CACAGACGCC GAGTACGAGC CGATGAAGCA ATTCTTCGGC GACACGCGGC CACCGAATTA CTGGTGGTTC GTGAAGGGAA TCGAGGGTTG GACGGGAGTA GTGATGGTGG TACTAATGGC  CATAGCCTTC ACTCTAGCAA CACCATGGTT CCGTCGGAAC AGACTAAACC TTCCAAAACC GCTGAAAAAG CTGACCGGAT TCAACGCCTT CTGGTACTCC CACCACCTGT TCGTCATCGT  CTACGCCCTC TTCGTCGTTC ACGGCTGGTT CCTGTACTTG TCCAAGGACT GGTACAAGAA GACAACTTGG ATGTACTTGG CCGTGCCTGT TCTGTTGTAC GCCACCGAGA GGTTGATCAG  GGCTTTCAGG TCGAGCATTG AACCGGTGAA GATCCTCAAG GTTGCTGTTT ACCCCGGGAA TGTCTTGGCT CTTCATGTTT CCAAGCCACA AGGGTTCAAG TACAAGAGTG GACAGTACAT  GTTCGTTAAT TGTGCTGCTG TCTCCCAGTT CGAATGGTAC GTACGTGAGT TCTTATCTGC TTAATTGCAT CAATTAATGG GGAATTTAAC ATCATTATAT TATGTAATTG TAAGATAATA  AGAGTATTAT TAGTTGATCT TACATTCTCG ATTTTTAATT ATTAATTAGG CATCCATTCT CGATCACATC GGCACCCGGA GAGGATTACC TCAGTGTTCA TATAAGGACA CTTGGGGACT  GGACAAGGCA GCTCAAGACT GTTTTCTCTG AGGTGATTTT ATTACCAGAC TTCTTTTTTT TAATGTGAAA TTTTGTTAAA ATAAAATTAA TAATCATAAA AGAGTATGTT AATTTTGTAA  TCTAGAAATA ATCTTCAAAT TCAGTTTAGA AAGAAGAGGA AATTTGATTT TACTTGGTGA TAATACATCT ACGTGAAATA AATCATTTAT AAATTTTAAA TCATATGGGG TATTTGGGGT  ATTTGAAGAA AGAAGAAAAA TCAATTACAG TCTTGATTAT TTTAAGAAAC CAAGACAACT AGTCATGTTG GTCTTTAACT ACTTTCTTTT GTTTTCTGGG TGCTAAATAT TTTTTGAAAC  GACTAATGTT AAAGAAACAT GACGTCACTT TTATATATAC ACGATAAAAG ATAATGGAAA TTAGAAAGGA AAATCAAAGT ACCACTTGAT ATATCTCCGT GTTGACCTTT TCCTGGTTTT  ATTTGAATGG TTCATGAAGG TCTGTCAACC ACCACCTGCT GGCAAAAGTG GGTTGTTGAG AGCAGACTTC AACAGAGGAG GCGAAGGACC AAATCCAAAG TAAGTTACTC TATCTTTGAC  CGACCGACCT ATTTTGACTC CTGCATCTAC ATTATTATTG ATTTATAGCC GTAATAATTG GGGGAAATTA ATAAATGCAA TTGCTGGTTA ATTTCTTTTC AGGATAAATG AATCAAATAA  GTGTCAGTGA TCTAGATTTT AACAGTACTG TTGTTACAGT TTCCCTAAGG TTCTTGTCGA CGGACCATAC GGTGCACCAG CACAAGACTA CAAGAACTAC GACGTTGTGC TTCTGATAGG  ACTCGGCATA GGAGCAACAC CCTTCATCAG CATCTTGAAA GACATAGTCC ACAACATGAA GAAGAAGGAG GAGGAAGAGA GCAACATCGA GAGCGGCAAC AGAAAGAGCT CGTCGTCATC  CACGCCGTTC AAGGTGACCA GAGCTTACTT CTACTGGGTG ACAAGGGAAC AAGGTTCATT CGACTGGTTC AAGGGAGTCA TGAACGAAGT GGCCGAGAGT GACAAGAGGG GTGTCATCGA  GCTACACAAC TACTGTACCA GCGTGTACGA GGAAGGTGAT GCTCGATCCG CTCTCATTGC CATGCTCCAG TCACTCAACC ACGCCAAGAA CGGCGTCGAT GTTGTCTCCG GCACTCGCGT  GAAGTCCCAC TTTGCCAAGC CCAACTGGCG CAATGTCTAC AAACGTATCG CTATGAACCA CCGTGACCAA CGCATTGGTA CGTGACAACT GACAAGAACG CTGCTACTGA TGAGTCTTCT  TGAGTTATTG TTGTTTTTAT TGCTTTATTG ATTTTTGGGA AATGAAACAG GAGTGTTCTA TTGCGGAGCG CCGGTGGTGA CGAAAGAGCT GCGTAATCTA GCACAGGATT TCTCGAGGAA 
GACGACCACG AAGTTCGACT TCCACAAGGA AAATTTCTAA 

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CDS
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AAGGAAAATT TCTAA 

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