Entry information : CescRboh04(EVM0014503.1)
Entry ID 18793
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CescRboh04(EVM0014503.1)
Name CescRboh04(EVM0014503.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Colocasia esculenta    [TaxId: 4460 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value CescRboh04
start..stop
S start..stop
SpolRboh04 1585 0 29..932 8..921
PnodRboh06 1486 0 33..932 24..924
AtrRboh04 1479 0 4..932 1..917
PnodRboh08 1477 0 33..932 24..924
Literature and cross-references CescRboh04(EVM0014503.1)
Protein sequence: CescRboh04(EVM0014503.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   932
PWM (Da):   %s   104088.35 Transmb domain:   %s   o378-397i518-540o560-582i743-760o
PI (pH):   %s   9.42
Sequence
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EEGDARSALI TMLQSLNHAK NGVDVVSGTR VKTHFAKPNW RNVYKRIALN HQDQRIGVFY CGAPAPTKEL RQLAQDFSRK TSTKFDFHKE NF 

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Remarks
Promoter
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CCCTGAATAG AGACCAAATG GGGACAAAAA ATTCGATCTC TATATTTGGG ACCGAATTAT TTTGGTCTCT ATTCGGTCCC TAAATAGAGA CTGATAGGGA CCGAAATTAT TCGGTCTCTA  TATTTGGGAC TGAAATTTTT AGTCTCTATT CGGTCCCTAT TTTGGGACCG AATAGGGATC GAAAATTTCG GTCTCTAAAT CGGTCTCTAT ATGCACTTTT TCTTGTAGTG TTTCCACTCC  ACACACTGAT GCGTTGGTCG TTTCGGCCAC CATCAATCAT TGTACCGTGC GCTAGATTCT AGTGGATAAT GGAAGTGCCT TGGATGTGTT AGCTTACGAT TGCTTTTTGC TTATGGGTTT  GAAGACCGAC CAGCTCACCC CAATAGAGTC GCCTCTGTTC GGCTTCTCAG GAGTCTCGGT TCAACCCATG GGCCGAGTGC GCCTCCCAAT CATGCTTGGG ACGGCTCTGA AGAATGTAAC  CAAGATGGTA GACTTCTTGG TTATCCGAAG CATGCCCGAT ACAATGCCAT CCTCGGCAGG GGCCTGATTG GACGAATCAA AGCAGTACCT TCATCTCTCC ATCAGAAGAT AAAGTTTGCC  ACCCCGTGTG GCATCGGTGA GGCGCTCGGT AATCAGCGCG AGTCACGACG ATGCTATGTC CTCTCTCTGA GAGACAAACA GCCCCTCGCG GCTCCAGAAG CCATACCCCC GCTAGCCGAT  CAACCTTCCA CCAGCGGGGG AACTCCGGCC GAAGACCTGC TTCCAGTTCG GGTGGACGAC GATCCCGAAC ACGTTCTTTA TATTGGTACA CTACTACCAG AAGCCGAACA GCAGCGCTAT  AAGGCTTTCC TGCTAGCCAA TTTGGACGTG TTCGCGTGGT CAGACGAAGA TCTGCCCGGT ATTTCTCTGG AAGTGATGGT GCATCATCTA CGACTGGACC CAAAAGTGCC CCCGGTCCAG  CAAAGGCAGA GAATCGTCAA TCATAAATGG CAGATCGCGA TCCAGGATCA CGTCGTCAAA AGCTGAACTA TTGGGCTCCT CCGGGAAGCT CAATGCCCAA ATGCATTTCC AATGTAGTCC  TTGTACGCAA AGCCATGGCA AATGGCGAGT GTGCATAGAT TACAAGGATC TCAACAAAGT CACGCCCAAG GACAACTTCC CTTTGTCGCG CATCGACCAG CTGGTGGAAG CTACATCCGG  ACATGAGCTC CTCAGCTTCC TAGATGCTTA TTCTGGTTAC CATCAGATCA ACATGCATCC TCCGGACCAG GACGCCACCA TGTTCGTCAC CGACCTTGGC CTCTAATGTT TTACAAGGAT  GCCTTTTGGC CTGAAGAACG CAGATGCGAC ATACTAGCAG CTGGTCAACA AGATGTTCGA GCAGCAAATC GGGCGTAATA TGGAGGTCTA CGTCGACGAT ATGCTGGTCA AAACGCTCCC  GAGCGCCGAC CACATCATCG ACCTCGAAGA AACCTTTGCA ACCCTGCGAA GGTATAATAT GAAGCTCAAT CTCTCGAAGT GTGTGTTCGG AGTTTGCTCG GGTAAGTTCC TCGTTTTCCT  CATTTATAAT AGGGGAATAG AGCCAACCCC AAAAAAATCC AAGCCATACT AGAGATGAGC AGTCCCAAAA TAGTGCGCGA CGTCCAGCAG CTCACTGGAC GCCTCGCCGC GCTCAACTGT  TTCATGACTC GAGCAGCAGA AAGGAGTTTT AACTTCTTCA AATTGCTGCG ATTCCCCAAA GGCACCTCAC AGCAAGGGGG ACATGTACGG TGGACCAAGG ACTGTGAAGT AGCCTTCACC  GAGCTGAAGG CGTATCTGGC AGCCCTACCT GTTCTCTCAA AACCTGTGCT CGGGGAGCCT CTGTTCGTAT ACCTTTCGGT CACCGAACAC TCAATCAGCG CGGTGTTGAT TAGGGAAGAG 
GCAGCGGCGC AGCATTCTAT CTACTACATT AGCAGGGTCC TTCAAGAAGC TGAAAGAAGG TACCCTCGAG CAGAGAAGCT C 

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Terminator +
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GTTCAGCAAC CCATTCAAGG AACCTTTTGT ATCATCAGTT ACCACGTGAC TATAATCCTT CGCTCGTACA ATGCTCCCGA GTGCACTTAG GGTATGGTCA ACTATCAAAC CCTAATGTGT  GTACTCACTT GGTTTAGATG CCGCATAACT ATATCAGAAA ACTCTTTTCT GATAAGTAGT CTTGCCCTGT CCAGGGACTA TCAGGCATCC TTCCCTAGAG CATTCACTCT CCTATTACCG  AGAGCGAGCG ATCCCATATT GACCACACAA TCACCTTCGA GGGTATTCCG CTAGATCCGA ATACTTAACT GATTAAGACC TCATGGCTAG AGATCTATAA GTCAAGGTCA AAACCCAGAA  GTCCACCAAC AAGGTGTCCT TGATGTCTCA GGTCTAAGGA CCAATCACGC CACTGTGACA ATGAATCTAG CTGGTTGACA GTAAGGTAAT ATTACCATCC AGCGATTCAT AATGGATCAG  TTCAGTGAAC TCATTCTCCA ATGAGCACCT ACAGATTCAC CTTAGTGTCT CCACACAAGT GACTATGAGA CCAGTCACCC TCATCATATG AGCAGGTGCA ACCTATACTA GTCTAACCGG  ATATTCAATG TCCTTCTTGA ATATCCTCCG ACTAGGAACA ATAAGAATAT ACGTTTAAAG GATATTAATC TCATTGTTAT GATCTCATCA TAATTAATAT CCATTGCGTA TATTCATGGA  CTTCATAATG AACGATAAAC GAATTATACA TAATGAATAT AAAGCCTTAT TATTATTATC AAAGAAAAAA TTGTACAAGT TATGATTGGC TTGAGGACAC CCATAACTAA CAAGTCCCTC  TGGCAACCAG TGCCCTCATC CAGGGCACGC GCGACGGTTT CTTGCAGAGG ACCCTCGGCG TCCAGCAGCC CGCTACCCTC GCCGAACTAC TCTCCATCGC ACAGCGCCAC GCGGCGAGGA  GAGCCTGGCG GCGAGTAGGG TCGAACAGGG GGAGCAGTCG GATAAGAAGC GGCCTTCCGA GAACGGTTCC GACCGAGATC GGAAGAAGGG ACGACGCAAT GGCGATTCTC CGCGCCGTCC  GCGCCCCTTC ACCAACTACA CCCCCCTTAC CGTGGCACCC GAACAGATCT TGGCGGAGAT CAGGAATGAA GCATTTGTTC GGTGGCCACA GAGAATGCGC TCCGACCCCG GAAGCGCGAT  CAGAATAAAT ATTGTCGCTT TCATCGCGAC CATGGCCACG ACACCTCCGA GTGCCGCCAG TAAGGACGAA TCGAAGACCT TATCAAGCGC AGCTATCTTG GACGGTTCGT GCGCCGGAAT  GAAGAGCGCC CTAGACGCCG AGACCGCACT CCCGAGCAGC CATCAACAAC GAGCCCAATG GGCAGGAGAT CAACGTGATC GCGGGAGGCT TCGGCGAGGG CGGAGAAAGC ACTCGAAGCC  GACGCGACTA CGCAAGGCGA GTGCATGTCG TAGATAGGCC TTCGGCACCT CGGCCGGCTC CATATCCTGC CAGTCCTGCA CGCGCACAGC CCGAGGAGGC TATAACCTTC TCGGATGAAG  ATCTTTTAGG GGTTACGACA CCACACACTG ATGCGTTGGT CATTTCGGCC ACCATCAACC ACTGTAATGT GCGCCGATTC TGGTAGATAA TTGAAGCGCC CCTGATGTCT TGGCTTACGA  CTATTTTGTC CTCATGGCCT GCGAACCGAT CAACTCACCC CTGTAACTCG TCAATGTTCG GCTTTTCGGG AGTCTCGGTC CAGCCCATGG GAAGAGTTCG CCTTCCGATC ACCTTGGGAA  CGCTCCAAAG GCTGTGACCA AAATTTTGAC TTCCTGGTCA TCAACAACAT GCCTGGATAC AATGCTATCC TCGGCAGAGG TCTGATCTGG CGCATCAAAG CAGTACCTTC GTCCCTCCAT 
CAGAAGATAA AGTTTCCTAC TCCGAGCGGA GTGGGCAAAG TGCTCGGATG TCAGTGCGAG TCTCTTCGTT TCTATGTCCT C 

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DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATCTCTCCTG CGAGGTGAGG AGACAGTAAA AAAGAAAGGA GGTGAGAGAC AGAGAGAAGA AGACGAAGAA GCAGCAGCAG CAGCAGCTTC CCTCTGCTTC AGTTTCTGGT TCTGGTCTGG  GGTGAGAGGG AGGGTGTGTT GTGCTACACC TACTGCAGCA GTTAGCACCG GAGATTTCAG AGTTCTTTAT CAGTGCCTGT TAGGGTTTGG AGGTGGCGGA AGGAACAGCT GGTCGGAATA  CTACTTGAAG AGAAGGGGGG AGCCACCGTA GGATGCAGAA GATGGGGACG GACGATGGGC GGGGATCGGA GCGCCACCAG CTCGACATCT CCTTCGAGAC GGAGAGCGTG GGGAGCGACC  GCGTGCCCTA CAGCGGTCCC CTCAGCGGCC CCCTCAGTGG GCCGCTCAAC AAGCGCGGTA ACCGGAAGAG CGCCCGCTTC AACATCCCCG ACACCCAGGG GTCCGCCAAG GACGCTGGGG  ACGAGTACGT GGAGATCACC CTCGACGTGC GGGATGACTC CGTGGCGGTG CACAGCGTGA AGGCGGCGGG AGGGGCAAGT GGGGAGGCCG AGGACCCGGA GGTGACGCTG CTCGCGAAGA  CGCTGGAGCG GCGGTCGGCC TCGTTCGGGT CGTCGGTCAT CCGCACCGCG TCGTCCAGGA TCCGGCAGGT GTCCCAGGAG CTGAAGCGGT TGGCGTCCAC CAGCCGGCGG CCGGGGGCGG  GCGCCACCGG GGCCGGCGGC CGTGTCGACC GGACCAAGTC GGCGGCAGCT CACGCGCTCA AGGGTCTCAA GTTCATCAGC AAGACCGACG GCAGCAACGG GTGGCAGGCG GTGGAGAAGC  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GAATTCTTTA CGTAAGGAAG CTGTGCTATC TGTAATAAAA ACCTGATGGC AGAAATTTTC TGCACATTTT TTTA 

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CDS
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ACTTCCACCA AGTTCGACTT CCACAAGGAG AACTTCTGA 

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