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Entry information : CescRboh01(EVM0028142.1)
Entry ID 18790
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CescRboh01(EVM0028142.1)
Name CescRboh01(EVM0028142.1)
Class Respiratory burst oxidase homolog     [Orthogroup: Rboh004]*
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Colocasia esculenta    [TaxId: 4460 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value CescRboh01
start..stop		 S start..stop
PnodRboh01 1036 0 129..876 95..808
LminRboh03 993 0 30..877 1..768
LminRboh05 973 0 30..877 45..812
NnRboh08 958 0 142..876 77..812
Literature and cross-references CescRboh01(EVM0028142.1)
Protein sequence: CescRboh01(EVM0028142.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   877
PWM (Da):   %s   97024.79 Transmb domain:   %s   o349-368i486-508o534-556i698-715o
PI (pH):   %s   8.3
Sequence
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Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEATAPTHAA SCSPNCSPSS ASYCTPRTHL SESPYKEMPM VQIHFHSQDS PRSSGSSSPS HSFSFGSSGG SSTKDSPEQM QLSPPTSPDQ PAASGVLLHC SSSSSSSPLL LEDDAEGGGG  CIPALRGGGG GCAAAVERSE RAIEKLMDHV TRRQIQWREV EERFDGLAAA GAAGLLPAVN QLDFKFCIGM EETPEFAEEL LRALRWGQDG LHGNRNITKP ELYEYWRRIN DPRPSSMIQI  LLDMCRSMNG TVTEKAIKDV ILLSASANQL SMSQQEAGEY ARLIMEELQF SSQGYVEMPN LEALLHRDPS GRHQEQTPRT PTTPAPDSDR RRRHPRPPSA LEVLARAHWR RVWAVSLWLA  ACAALFAWKF QQYRRRAAFE IMGYCLCAAK GAAETLKLNM ALVLLPVCRN TVTWLRRHRW LSYAVPFNDN VNFHKLIAGG IVVGVILHGG THLACDFPRI AGADRAVFRQ TIAADFQHRQ  PSYAEILVTT EGATGIAMVL LMGAAFGLAT RAPRRDPGSL PGPLRRLAGF NTFWYSHHLF VVVYVLLVVH SMFLFLTKDV SEKTTWIYIA IPVMLYTGER AVRAFRAETY DVKIMKAATY  PGKVLSLKLQ KPAGFKYQSG MYIYMQCPKI SKFEWHPFSL TSAPDEDHLS VHIRTLGDWS YEIYSLFQEA LVSGGAFPKV CIDGPYGAAS QDHAKYDVVV LVGLGIGATP FISVLKDIVH  RRPHQQLADD GGESGGGGVP GKAYFYWVTR EQGSFDWFRD VMKEISSADQ KQVVIEMHNY LTSVYKEGDA RSTLISAIQA LYYAERGVDV ISRTPVQTSF ARPNWSRVFS GLASRHQGQT 
IGVFYCGPLA LARELERLCH AMTAKSFTRF VFHKENY 

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Remarks
Promoter►
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AAATAATAAA CATAAGCAAG AAGAATAATA GTAGATAGAT AGATGAGTGG GTAAGTTGGT GGTAGGCACG AAGGCCAAAC CCACTCCCAT CAAACGCCTT CTAATAATGC TTCTTTCTCC  CCCCTCCCTT CCAAGGTCAA GTCCACCCTA TCCTTCTTCT GGTCGGCGTT GCCACGTCCC TCTGGACCAC ACGTTAGATC AATCCCCATC GTAACCCAAT CATACAGTGC CACGCAAGAT  TTCTTACTTG ACGTGGCATG CTGCAAGTGA ACGTCGCTGG AATGCGGTGC CTATGAAGGT GCTTGCTCCA TGCGAGCTAC CTCCCCATCT CCCTTCCAAT CTTTCTTTCC AACTACGTCA  CTAGCTGGCT CGTTAGCTCA CTCACCCCCC ACCCCCTCAT TAAAGAACAT AAGACATTTG CATGTTAGTG AACCAGATAG AAGAATGCGA ACAATGGCCT TTTGGTAATT TAATAATTTA  TTTGTGAATA AATTGTCCAT CGATACATGT ATTAATGTAT AAGATTTTTA ATTTAAGAGA TAAAGTTATT AAATTTATCG TACCGAGAGT TTGAGATAAA ATTATCAATA CTTATTAATA  TTTATTAGTG ATAAAATTTT GATAAATTAC TTATATGATC AAATAATCCA TTGAGTTATA TGACTGATAG CTAGAAGTTA TTAGGACTTA TCAAATTATT AAACTGACTA GAATACAATA  GATAGACAAG ATCGATGGGA AAATTAGTAG AAATGAGAAG AAGAAGAATA AGGAGGAGAA GAAGAGAGAA TTGAGTCAAA CACGGGGATA AGTAGATGAA TATATAGGTA GATAAAGAGA  GATAAATTGG TGAAAACTTA ATTTTTTACT GTTCTTGAAC TTAGTAAATT AAATTTAAGT TATTTATTTT TAAAGATAAA ATAATTCAGA ATTCCTATCA ATGTTTAATT TATTTTTTAA  TTTAGAATTG TAATTTATTA CAGTAAATAT TATTAAATTA TGTTACAACA AAGACATCTC TATTATAATC AAAGATTTCT AATTAATTTA ACTTATTTTT AACTATAATT GAAAATTGGA  AGGAAAAAAA TTGTACCTTC TCCCGACATT TCTAACAAAA AGAAAAGTTG CTCCTCCTCC ATTTCTCTCT AGCAAATGAT GGAGAGGAGA GGGCAGAGAG CACGCGGCCG CAAGAAAAAA  GACAAATCCA GTCGCCGACA GAGAAGAGGG ATTCGCCGCC GGTAGCCATT GGTCAAGACC TTCGTCTGTT TCCTCCCCTG CGCGTGCAGA GTTAGGAGTG GACTTCCTGC GTAAGCGGGC  AGTTGTTGTG GCCATATTTT GAGAAGGTTC ATATGCCTAC AAATACCTGC TCTCCTTCTC CGGTCTCTCT CACCTTCCTC CAACTCTACC AGACGCCCCA GAAGGATAAG AACCCGCACC  ACCAGAGAGG AAGAATCTCC CCGCAACCAA TAACAAGTGC GTTTGTTTAG AAGACATTAA CCCAACCCTC TTGTTTGAAT CCTTCTCTCT TCTAATCCAT CTCTCTCTTT TGTTTATTGG  GCATGTCCCT GCATGTGTAC TTAGATAAAT CCCCTAGAGA GAGAGAGATC AGTTAGGTGA AAGATGAGTG GGGAGCTCCT GTTCTACGAT GTTGTATCCA GAATGCCATA ACTGTAGATA  GCCATCTCTG TGAGTGAGAC CTGCAGGGTT TTGGGATTAA CCCATTTTAG AAGACAACCC ATCCTGTGGA TTGAGTTCCT CTTCTGATCC ATATCACAAC TTGTTTAATG GGTATTTGTC  CCAGTGCATG TTTGATTAGA TAGTTCCCAC AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG ATCAGTTGAT GAATGAGTGC CTGCATCTGA GAGCTGTTAG AATGCTATCT CCTGTTGGAG AGCTCAGGGT 
CTTAGATTCT TCCTTCTCTT CTGTTCTTTG AGATTGGAAA GCCCATTTGG GTTTTTCCAA GGGAGTTGTA TAGAGGAATT 

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Terminator +►
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Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAACTATTAA CTATATACTT ATTTTTTTTC ATGGTTAAAA ATCTTATTAA TGTCAGGGGG GCGAAAAAGA GGGATAATAG TTAGTCCTCA TTTGATGATA AGATGTTATA AAATTTGGAA  ATTTGGGAAT CAAAAGCTGG AATAGCTCAG TTGGTTAGAG CGTATGGCTG TTAACCATAA GGTCGGAGGT TCAAGCCCTC CTTCTAGCGT ATTTCATTTT TTAAATGAAT AATATCATTT  AATTTTTTAT TTCTTTTGAC AAATATTTAT TTTATATTTA AGTGTATAGA AAATTATCCA ACTTGCAGTA TATTTTTATG TGATTGGTAA CGTCTGTTCA CTTCTATTCG GATTCCTCGG  CATTTATCAA ATATCTATTC ACAGAGAAAG ACTTTGTGCA CTTTCCCATT ACACTTTTTC ATTGCACTTT GGCCTTCCTA TTGGCCAATA CACTAGAGGC ACATTATGCC AATCCAATGA  AAAGCAAGAA GTGCATGGAA AAGTGTAATG AAAAAGTGCA CAAAGTCTTT CTCCTATTCA CAAGGACCTT TTTTTTTTCC GACAGGGCTA TTCATAAGGA CTTGCTCATT TCTCGTTGTT  TTTCATATGA TAACAAAATA TCCAACATAT ACTTTGACAT TTAATAAATT CTTAATTATA GGCTTACGTT ATTATTCCAA ATAAACATAA CAAAAATTGC GTAAATTTAA AGTTTTTAAT  ACTTAGAAAC GAGAAATTGA TCAAACTTTT TTCATCATTC CGATTACCAC TCTCGTTGGA TCATAGGCAT GAAACTTTAG CTTATTGCAT AGAACTTCGA ATTTAACTTT GTTTTGTTAT  TATTTATTTT TAATTAGAAT AAAATAGTAA AATTAATTAA GAATTTCTAA CAGGTATTTA ATTTATTTTT TAGTCTCTAA CAAAATTATA ACTTATTACA ATAAATATTA TTTCTAATTA  CAGTATACAT ATTACACTAA AGATCTTCTT ATTATAGTCA AAAAAAATTT AATTAATTTT TTAAATAAAA TATCTAATTT AAAATTAAAT AAATGTAAAA ATGTGACCAC CATAACAGAA  GCAACATCGC ATCGACCCAT CAGTACAGAG CTCAAAACTC GCGGCTTTTG TGTTGGGCGG GATGTGGAGA AGACCTCTGT TCGCCTTCTC CCGCCGGACG CGGCGGCGCT TCTCCTCATC  CTCCTCCGCT GCCGACGTCC CCGTCCTCTA CTCCTTCCTC CAGCCCACCA TCTTCCCCCT CCGGCGGCAG CCCCCTTCTC CCCCTCCTCC TCCTCCTCCT GCCTCTCCTC CCCCTCGCGG  CAAAACCCTA GGAACCGCAG ACCAGGCCGC CCTCGAGTCC CACCTCCAGG CCTCCCTCCA CAGCCACGAC ACCGACGAGG CATGGCGGTC CTTCAAGGCT CTCGCCTGCG CCACCCGACC  CCCGGCTGGA CGCCTCTCCA ACGCCCTCAT TGCCCACCTC GCCTCCCTCA GGGATCTCCA CAACCTCAAG AGGGCCTTCG CGGCCGCTGT CTTCCTCCTC GAGAAGTCGC CGGGGTCCCT  CGACGCCGAG ACCCTCGGGG CGCTCTTCCG CGCCATGGAT GCGGCGGACG CTGCCGCCCC CGCCTTCGCC CTCGTCCGGG CCATGTTGAA AAACCGTTTT TTCGCGCCGT TCGACGAATG  GGGTTCCATC CTGATCCGGC TCGCCGGGGG GAGCGGCAGC TTCGATAAGT TCGTCTGCAT CTTTGAGGAG AACTGCAGGA TCGCTCTGGA AGAGAGGATC GATTCGATGA AGCCCGACTT  GGGCGCCTGC AACGCGGTTC TCGAAGGGTG CTGTCGCGAA TTGGGATCGG TTGTTGATGC CGAGAAGGTC CTGGAGATCA TGTCCGCCCT GGGTGTGCCC CAAGATGCTC GGAGCTTTGG 
GTCTCTGGCG TACCTCTATG CCTCAAAGGG GTTCCAAAGC AGGATCACCG AGCTGGAAAA ACTGATGTCC GGATTGGGAA 

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DNA ►
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAAGCCA CTGCGCCCAC CCATGCTGCT TCTTGTTCCC CAAACTGTTC TCCTTCATCT GCTTCTTACT GCACCCCAAG AACCCACCTC TCAGAAAGCC CTTACAAGGA GATGCCCATG  GTGCAGATCC ATTTCCACTC CCAGGACAGC CCCCGTTCCT CTGGTTCCTC CTCGCCTTCC CACTCCTTTT CCTTCGGTTC ATCCGGAGGC TCCTCGACCA AGGACTCGCC GGAGCAGATG  CAGTTGTCTC CCCCGACGAG CCCTGATCAA CCTGCTGCAA GCGGCGTCCT CCTGCACTGT TCTTCCTCTT CGTCTTCCTC GCCATTGTTG CTGGAAGATG ACGCCGAGGG CGGCGGGGGG  TGCATCCCGG CGCTGAGGGG AGGAGGCGGT GGCTGCGCCG CGGCCGTGGA GCGGTCCGAG CGCGCCATAG AGAAGCTCAT GGACCACGTC ACACGCCGGC AGATCCAGTG GCGAGAGGTG  GAGGAGCGGT TCGACGGGTT GGCCGCCGCC GGCGCGGCCG GTCTCCTGCC GGCGGTCAAC CAGTTGGATT TCAAGTTCTG CATAGGTGAT GATGAGTAAA AAAAAAGACG AAATTTTTAT  CAAAGAGGAG TTCTAATTTG CACGTAAATA GTAGAATATG CATTGCATAG TGGAGAATAC TATCTGATCA CCTCTCTGTT TCTTCTTCTC CAGGCATGGA AGAGACTCCA GAGTTTGCAG  AAGAGCTCCT GAGAGCGCTT CGATGGGGAC AAGACGGTCT CCATGGGAAC CGAAACATCA CAAAACCAGA GCTTTACGAG TATTGGCGCC GCATCAATGA CCCTCGCCCA AGCTCCATGA  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TTGCAGGGGT CTTCTACTGT GGACCATTGG CGTTGGCGAG GGAGCTGGAG AGGCTGTGCC ATGCGATGAC GGCCAAATCC TTCACCCGAT TCGTTTTCCA CAAGGAAAAC TATTAA 

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CDS►
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