Entry information : LminRboh05(Lemmin23g0543480.t1)
Entry ID 18917
Creation 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminRboh05(Lemmin23g0543480.t1)
Name LminRboh05(Lemmin23g0543480.t1)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh004]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminRboh05
start..stop
S start..stop
LminRboh03 1505 0 45..812 1..768
CescRboh01 939 0 43..812 28..877
PnodRboh01 925 0 103..811 96..808
ToriRboh11 868 0 126..812 86..799
Literature and cross-references LminRboh05(Lemmin23g0543480.t1)
Protein sequence: LminRboh05(Lemmin23g0543480.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   812
PWM (Da):   %s   91063.87 Transmb domain:   %s   o298-320i436-458o473-495i
PI (pH):   %s   9.6
Sequence
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Remarks
Promoter
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Terminator +
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TTTGGATTTT TTAATTTCTA TAATAATATC CTAAATTAAT AATTTTATTT TAATATGACA ATTAAATTTG AGGTTTTTAG TTTTAATATA TTTAATTATC TAAAATTAAT TTTATTGCGA  TTTTCTGAAT TATTGAAATA TTATTTACTT AATTAATTGA CATTTATTGA AATATTAAAT TCTCAAAAAT CGATGGTATA TATAGTTGGA TGTTCTACTG AAACCCTGGG GGTTTTGGGG  GGAAATCGGA AATGAACGAG GAGAGGTGAG ATGCGGAGGA GCTCTCTCTT CGTCTTGTCT CGATTGTCTC GAAGCTTCTC TTCCGCTGCC AGGAGGGCGG CGGCGCCGCC ACCGCCCCCC  GGCGAGGTTT CCGTTCTCTA TTCTTTCCTC CAGCCGTCCG TTTTCCCCCT CCGGCGAAGA ACTCCGCCGG AATCGCCGCC GTCCGGCGAA ATCTCGTCGC CGCAGATCTC CGTTGGGGAT  AAGGATTCCC TGGAATCGGA CCTCGAGGAG TTCCTGAAGA AGAACCAGAC GGACGAGGCA TGGAGATCTT TCAAATTGCT CACCTCGAGG TCCTTCATCC CCTCCAGGCA AGCTTCCAAC  TCCCTGATCG TTCATCTCGC TTCTTTAAGC GATCTCCACA ACCTGAAGAG GGCGTTCGCC TCTGCGATCT TCCTCCTGGA GAACGCTCCC GGATCTTTGG ACTTCGAGAC GGTGGAAGCG  CTCTTCCGAT CTCTGGATTC CGCCAATGCT GCCGCCCCTG CTTTTGCCCT AATCCGATCC ATGCTCAAGA ACCGGTGCTT CGCTCCGTTC CATCTCTGGG GGGAGATCTT GCTCCGGCTA  GCCAGGAAGA ATAAAGCCGT CGATAAATTC CTCGTAATCT TCGAGGAGAA TTGCCGGATC GCAGTCGCAG AAGGAATCGC ATCCATGAAG CCAGATCTGG TCGCCTGCAA CGAGACTCTA  GCCGCCTGCT GCCGCGAATT AGGCTCCCCG GCCGACGCAG AGAGGGTTCT GAAGATCATG TCCGCCATTG ACGTGCTTCA GGATGCTCAG AGCTTTGGTG CTCTAGCGTA CCTCTACGCC  TGGAAGGGAC TGAAGAACAG GATCAACGAT CTAGATAGCC TTCTGTCCGG AATTGGCCTC ACAAAAAGTA GCATAATCTA CAGCAATCTT GTGAGAGGCT ACCTCAGATC CGGAGACTTC  GAATCCACCA TGGAAATCAT CCTCGAAGCT CTCAAACTCC ACCAGCACGG AGTTCCTCTT CTGGACGAGG AAACCTACTC CGAGCTATCA AAATCCTTCG TGAATGATGG AAGAATCAAG  GATTTGGCGC ATCTGATCAT CGAATCCCAG AAACTGGAGT CATCTTCTTC CTCGATCGAC AACCAGGCCG ATTCCATCGG ATACAGAATC ATCACCGCCT GTGTGAATCA AGGAATGGTG  GATAAAGCTC ACAGCATCCT CGACGAGATG AACTCCGCCG GAGGTCCAAT CGGAGTGGGT GTCTACTCCT CGATCCTGAA AGCTTACTGC AAGCTGCGGA GGACCGCAGA AGCGGCGGAA  ATGGTGGAGG AGATCTCCGC CGCCGGCCTG CAACTCGACG CAGAAAGCTT CGACGCCCTA ATCGACGCCT CAATGTCCTG CCACGACTTT CAATCTTCCC TCTCTATCTT CCGAGCCATG  AGAGAAGCTC AGATCTCGGA TCTGAAGCAG AGCTACCTCG CGATCATGAC AGGGCTGATG GAGAACCAGA GACCGGAGCT CATGGCAGGG TTCCTCGACT CCGTGGTGGA CGACCCGAGA  GTGGAGATCG CGACCCACGA CTGGAACTCC ATTATCCACG CCTTCTGCAA GATCGGGAGG CTCGAGGACG CGAGGAGGAC GTACAGGAGG ATGATCTTCC TGCAATTCGA GCCCAGCGAG 
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DNA
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CTCATACCAC ATTTATTTTC CACAAGGAAA ATTATTAA 

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CDS
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