Entry information : LminDiOx04(Lemmin27g0604260.t1)
Entry ID 18798
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminDiOx04(Lemmin27g0604260.t1)
Name LminDiOx04(Lemmin27g0604260.t1)
Class Alpha-dioxygenase    [Orthogroup: DiOx001]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminDiOx04
start..stop
S start..stop
LminDiOx03 1243 0 1..635 1..635
LminDiOx01 1239 0 1..635 1..635
LminDiOx02 1225 0 1..635 1..635
CescDiOx03 960 0 3..634 2..628
Literature and cross-references LminDiOx04(Lemmin27g0604260.t1)
Protein sequence: LminDiOx04(Lemmin27g0604260.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   635
PWM (Da):   %s   71200.85  
PI (pH):   %s   6.87
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MPLFSLLVHP SLRAEYNRMT LGHKILFLAV HGIDKLGLWH RLPVILGLTY LAIRRTLHDN YNLLPVGKVN SAIPDPSAHP FRSSDGTFTD LSKPEAGSQN TFFGRNIPPV DQPDKIMDPD  PFVVATKLLE RRSFIGTGKQ FNIIAASWIQ FMVHDWIDHL ESTRQVELVA PKEVASGCPL KAFRFLATEN ITAADGTEGI QTGHKNIRTS WWDGSVLYGS NEGVGNQVRT GIDGKLSIGE  DGLLLHDEEG RAISGDIKNS WAGVSILQAL FAKEHNAVCD ALKKERPEFD DEQLFQHAKL VTSAVIAKIH TIDWTVELLK TDTLNAGMHG NWYGLLGKRF KSIFGHIGGA TLGPILSGLV  GLKEPNDHGV PYSLTEEFAS VYRLHPLLPD TLQVRNINAP PGANKAPSLL KEINMEELIG IRGEKTLSEL GFERQLVSMG HQACGALELW NYPSFFRNLI VQNTDGSERP DNVDLSALEV  YRDRERSNAR YNQFRRSLLM IPISRWEDLT DNAEIIATLR EVYGDDVEKL DLLVGLMAEK KIKGFAISET AFFIFLIMAS RRLQADRFFT SHFNEKTYTK KGFEWVNKTE SLKDVLNRHY 
PELTSKWMNS TSGFSVWDAP KEKSSWVPLY LRIPK 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGCCAAGAAT TCTTATTCTT TAGGAGATCA ACATCTCCGT CATCATTTTC AAGGTATTAA AAGTCTCATG ATCGATCATT TTCAAGGTTT TAAAAGTCAG ACGATTCGGA ATGCGAGGAT  CGCTATAATT CTCAAGAATC GTTGCGCATC ATCTCACATT TTCACTTGTA GATATTTTGA AATTAAAAGT CTTCCACGGC GTAAGATCAT CATCATTGTT ATTATCATCG TCGTTGTCAT  TGCCATTGTC TTCGTCACCA TCATCATCAT CATCGTTATT TGTCGTCATT GTCATCATCA TCATCATCAT CGTCGCCATT GTCGTCGTCA TAATCATACT GATCAATATC ATTTAGATAA  ATTATTGGTT TGATATTACA TGCTCTTGGT TTCGTTTGAG AGTAAATTTT AAATTTCATT ATTGAAGAAT ATGCATCAAA AGCTTCATCA CCAAAAGGGG ATTTCATCTC TTCTGCATTG  ATCTCCTTTG GATGCCATCG GGCGTTTTAG AGGCCATCAC CCAACGTTCT CCTCTTCCTA TAAATCTCTC ACATAATCAC ATTTTACAAG TTTCATATAT AGAAAATATT TGTCTTTATC  CCCCCCCCTC TCTCTCTATC TCTCTCCGTC TCTCTCTCTA TCTAGAATTG CGCCATTCGG GTGTACAGCT TGCAGATTCG TCACGGAGCG TAGTAGAGTT CATGTGCCGA CGCTAATTAT  TCACAATTCG TGGCAACTCA TCCACCGTCC GATCAGATCT GGCTATATCC AACGGCCATG AGTCCGTGAC TTTCCTTGCC CTTGAAAGGG ACACTTTATT TCGACCCATC CTGACCCGCT  GACACTACTC GACACGCGCC CCATATCCAA TCGTCTGGAT TCCCGGTTGA GAAGGACCGC TAGAAATGCT CTGCCGCCCA TGGAGATATC GTCTACAGCC TCTGTGTGTG TGTGTGTGTG  AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAC GTGTTAACCG CGAGATGATG AAGGAGAAAA ATCGCGTTCC CATGATGATA TGATCTTCGT GACCAAGGAT CCCAGGAGCG  GCTCTCCGCC CATGCCCTGA TTTCTTCAGC TAGTCATCGA AGGAAATCTG AACCTATCGA GCGGGCCCGC CTGGAAGAAG AAACTCCGTG AATTGCCGCT CTGTGTGGCC GTAACTCCGT  GAGAAGGCGG GACCGGAGAA GGCGGCAGCG GCGCCGGTAG ATGAAGCAGA AAAATCTGCC TCCGAAGAGC GAAGTAGCGC CGCGAGACCT CACGGCGCCG CCCGTCTTCG TGGCAGCAAG  GAGGCCGCAA GCGGGGGCCG CAACGCCGCA AGACCTCGCG AGGCCGCCGG CTAGAACTGC GGCTCCGCCT GCAGTGCCGC GATATCGCCG GAAGACCGCG GTGCACCGGC GGCGTTTTGC  CGGCCTGCCG CCTGCAGTTC ATAAAAGGAA AAAAAACTAC TGTTTTTTTT CAAAAGAAAG ATAATTTCAT GAACGCAACA ACCGGCGAAT AATCTATCTC TCTATCTCTC TCTCTCTCTC  TCTATCTGAT GTAAGCGGTA TACTTTCCAA ATCCTTCTGG ATTCAATTTA GACCATCACG CGGCACGTGA CTGGTGAGAG AGGAAGACTC GTGACTCGTG ACTCGTGACT CGTGAGTCGT  GAGTCGTGAC TCGTGACTCG TGAGTGGTGA GAGAGGAAGA GGAGTCGTGA GTCGTGAGTG GTGAGAGAGA TGCAGATTGA ATTTAGGGCT CTTTCAAATA AAATGCTGTT TATTCTGACA  AAGGAAGGCG TGGGTGGAGA AAGAGAGAAA TTAAGACGAA GAAACGAAGA ATAAGAGGAA AAGTCAAAGA GAGGCAGATT GAGAGACTTG TATATACAGG CTCAGGAAGG GAGGGAGGAA 
AATGCGACGT GCCCACAAAC TTCTCTCAGG GAGAAGTAGA TACACAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGCACGACC 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGATTATCCT TTCCTCTATT GGTCTTTAAA TAAACTCTAT TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTACTATTC TATCTATCTA CTATTCGAGA  AGAAGGCACA TAAATATTCA GTGTCAAGGA TTTTGTAATG CTACCCATAA GACACAATAG AACTGGTTGA CATATCCTCT TATCTTTTAT CCTTTATCCT TTAATATGGA ATTCAAAATT  ATTAGTTTCA TGAATATCAA AAGGCACTTA GACTATCTAA ATTCACAAAA TTGACAAAGG TCAATCCAAA ATCAAGCATT TGATGTCCAA GGATCACACA CCTTGCTCAC ATGTTCTTAA  GATCTCATGC TATCCATGAT AGACATGGTA ATTGCATCAA CTATCATATT TTTTCGTCGA ATTTCTACAA GAGGATGCAT GCTAAGACTT TAAGGGTCGT GTATTGAATA TTTAAGCCAG  TATTCATTTT GTTAAACTTT AGGATAATCG GTATTATGCC TACAAAAGCC CGCAGAACTT AAAAATTTAA GGGGCAGAAG GCATTACGAT ACTCGCTTGA AAGGGTCAGA TTTCCTTCGA  TGACTGGATG AAGAAATCAG GACATGGGCG GAGAGCCGCG CGTTACCACG ATCCTCTGTG TGTGTGTGTC CCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCCA GAAGTGTGAC GTTCGGGTGA  ACAGTTTGCA ACCTTGACAG CTAGTGTTCA TATGCCTCTT TCTCTCTCCA TCTCTCCCTC TCATGCTGTA GACGCTGAAA TGGCAAACAG TATCTCCTTT GTCTGCAGAG CATTTCTATC  TGTCTTTCTC AACCGCAAAT ACAGACAAAT GGATATGCGA TCACAAGTGA GAGGAAACGG GTAGAGACAT CGAGTAGTTA TAGCAGGTCA GGACGGACCT AAATAAAGTC AGATTTTAAA  ATAAAGTGTC ACTTTCAAGG GCAAGGAATG TCATGGCCAT TGGATAGTGT ATCCAGATCT GATCGGACGG TGAAGGACTC GCCATGAATT GTGAATAATT AGCGTCATCA TATGAACACT  ACTACACTAG GTAACAAGAT TGCAAGGTGT TCACCTGAAT GGGGCAATTC TGGGTAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGCGAGA GAGACTGGTG GGGGGCTTGG GGTTTATGAA  AAGGGAGACA GAAAAATATT TTTTATATTA ATTCAGAAGA GACTAAATCC CCTTTTGATA CAAAAAAAAA TCTTTAACGA TGAAACATAA AATTTTGTCG AACAAAACCA AGTGCATAGA  GTATTAAACA AATAATTTAT GTAAGTGATA TCAATCAATA TGGGTGACTC CCTTCAATGA CCTTTCACAA CAGGATGATA ACGACGATGA CGATGACGAT GGTGATGAGG ATTCCAACGA  TAATGATGAT GATGATGAAG ACAACAATGA CGACGACGAC AACCATGAGG AAGATGATGA TGATGACGAG GACAATGTCA ACAATAATGA CAATGACAAT GATGACAATG ATGACGACGA  CGACGATGAT TATGATGATG ATGCTGATGA TGATAATGAT AATGACAATG ACGACAACGG TGATGATGAT CCTGTTTTTT ACACCATGTA AGAATTTTTA TTTCAAAATA TCTACAATAG  AAGATGTGAG AAGACGCTCA ATGATTCTTA AGAATTATTG TGATCCTCGT GGTCTGAATG GCTTGATATC CATGAAATGA TCGATTATGA GCCTTTTGAT CTCTTGAAAA TGATGACATA  GACGTTGATC TCTTAAAGAA TAAGAATTCT TGGTTTTCTT CTTCTTAATG TCCGAGTCGT TCTAAAGGAA TAAGCTGACG ATTCAAGAAG AACACAAAAA TCTTGAATGT CAAGGATTTT 
GAATTGCTCA CTAATCTTCA ACCAATTTTT TTTAATTTCC CAAGTTCTTC TTCTCAATTT TCTTCACGTG ACTGTTGGGT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTCTCT TCAGCCTTCT CGTCCATCCG AGCCTCCGAG CGGAGTACAA CAGGATGACC CTCGGTCACA AGATCCTCTT CCTGGTATGT ATCTCATGGG ACTCGTCAAA GATTATCTTG  AGCACAACTC ACCCATACCA CAAAAATAAA CTCTCTCTCT CTCTCTTTCT TCTTCATCTA TATTTTTCTC TATCTAACAC TTTCTTCCTC CATCCTCAGG CGGTGCATGG CATCGACAAG  CTGGGGCTGT GGCACCGGCT GCCAGTCATA CTCGGCCTGA CCTACCTTGC CATCCGGCGA ACTCTCCATG ACAATTACAA CCTCCTCCCC GTCGGCAAGG TCAACTCCGC CATCCCCGAT  CCATCCGCTC ATCCCTTCCG CTCCAGCGAC GGCACATTCA CCGACCTCTC CAAGCCCGAA GCTGGAAGCC AGAACACCTT CTTCGGTAGG AACATCCCCC CCGTTGACCA GCCCGACAAG  GTAGAAAGAA ACTCTCTCTC TCTCTCTCTC TACAAATTGA CACTATTTCT TTTTCCAGAT TATGGACCCC GACCCGTTCG TTGTGGCCAC GAAGCTGCTG GAACGGAGGA GCTTCATCGG  GACTGGGAAA CAGTTCAATA TCATAGCAGC TTCTTGGATC CAGTTTATGG TTCATGACTG GATTGACCAC CTCGAGTCCA CCCGCCAGGT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTATCCATTT  CTATATCACT ATTTGCGTAC CTATACTTAT CTCTTTCTCG GAATATATAT GTATATGAAT TTTATCTCTC GATTTATGAC AATCTCTCTC TTGTCCTAAT CTCTCTATAT ATCCTTCTCT  CTATCACTAT CTGTTTACCT GTACTTATCT CTCTCTCTCT CGGTCTATCC ATGTATTGGC CATTCTTAGC TGTCGATTTT TCTTTCAGTC TCTCTTTCTT GTCTACCTAT ATTTATCTCA  CTCTGACTCT GTCTCTCTCT GTCTGTCTCT CTCTGTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTATATATAT ATATATATAT ATATATATAT CCTTCTCTCC GTCACCATCC  GTCTACCAAT ACGCATCTTT CTCTCTCGGT CTATTTATCT ATATATCATT CTCATCTATC GATTTATCTC TCTCTCTCTC TCTCAATCAG TCATCGTTTC TATCTCTTCC TGCTCAGGTG  GAGCTCGTGG CGCCCAAGGA AGTCGCCAGC GGCTGCCCAC TAAAGGCCTT CCGATTCCTC GCCACAGAGA ATATCACCGC AGCCGACGGA ACGGAGGGCA TTCAAACCGG TCACAAGAAC  ATCCGAACTT CATGGTGGTG AGTAAAAATA CAGAAGAAAA TAAAAATAAA TAAATAATTG AAAGATAATA GATGAAATAT GGGATGAATG AAGGGATGGA AGCGTGCTCT ACGGGAGCAA  CGAGGGAGTT GGAAACCAGG TGAGGACGGG CATCGACGGC AAGCTAAGTA TCGGAGAAGA CGGCCTTCTC CTTCACGACG AGGAGGGACG CGCTATTAGT GGAGACATCA AGAACAGCTG  GGCTGGCGTC TCCATCTTGC AAGCTCTCTT CGCTAAGGAG CACAACGCTG TCTGCGATGC CCTCAAGGTA AAAACATCAT CATCATCCAT CATCACCCAT CATCATCATC TATCATCATC  TTCCTCATGA TGATGATCGC AGAAAGAGCG CCCGGAGTTC GACGACGAGC AGCTGTTCCA GCACGCGAAG CTGGTGACCT CCGCCGTTAT CGCGAAGATC CACACCATTG ACTGGACCGT  CGAGCTCCTC AAGACCGACA CCTTGAATGC CGGAATGCAC GGCAACTGGT GACGTCACTT CTCTACCTCT ATCTCCATCT CTATCCCTTT CAAGTGGGAT CGAAGCTGAG AATTTTGTGG  TAGGTATGGG TTATTGGGGA AGAGGTTTAA GAGCATCTTC GGGCACATTG GAGGAGCTAC GCTGGGGCCT ATTTTGAGCG GGCTCGTGGG GCTGAAGGAG CCGAACGATC ACGGCGTTCC  CTACTCGCTA ACAGAGGAGT TCGCTAGCGT TTACAGGCTG CACCCTCTCC TACCAGACAC CCTCCAAGTT AGGAACATCA ATGCTCCCCC TGGTGCTAAC AAAGCCCCCT CTCTACTTAA  AGAGTAACTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTA TTACATAAAC ATTTATCCTC GTTGGATATT ACCCTTCTTG GTGAACAGGA TAAACATGGA GGAACTGATT GGAATCAGAG GAGAGAAAAC  TTTGAGCGAG CTGGGTTTCG AAAGGCAGCT GGTTTCTATG GGCCACCAAG CTTGCGGCGC GCTGGAGCTC TGGAACTACC CCTCCTTCTT CAGAAATCTC ATAGTTCAGA ACACCGACGG  AAGCGAGAGG CCAGACAACG TGGATCTTTC CGCCCTCGAA GGTAAAATCT GCGATAATTC TGCCGGGGTA TACAATTTTT AACAAGGGTT TTAGTAATAT TTTGAATAAC TGATGGAGAA  ATGTGATACT CGCAGTGTAT CGTGATAGAG AGAGAAGCAA CGCAAGATAC AACCAGTTCA GGAGGAGCCT GCTGATGATC CCCATCTCTC GATGGGAAGA CCTGACTGAT AATGCTGAAA  TCATAGCAAC GCTGAGGGAA GTCTACGGGG ATGACGTAGA GAAGCTTGAT CTCCTCGTGG GTCTCATGGC GGAGAAGAAG ATCAAGGGCT TCGCTATTAG CGAGACGGCC TTCTTCATTT  TTCTCATCAT GGCCTCTAGG TACGACTCTC CCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TAAACTATTA GAAATGGAAA ACTAAAATGC GTTGAATTGG GAATTTCAGG AGGTTGCAAG CTGACAGATT  CTTCACCAGC CACTTCAACG AGAAGACTTA CACCAAGAAG GGGTTTGAAT GGGTCAACAA AACAGAGAGC TTGAAGGACG TTCTCAATCG CCATTACCCG GAGCTCACCA GCAAATGGAT 
GAACTCTACC AGTGGGTTCT CTGTGTGGGA TGCGCCCAAA GAGAAGTCCA GTTGGGTTCC CCTCTATTTG AGGATCCCCA AGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTCTCT TCAGCCTTCT CGTCCATCCG AGCCTCCGAG CGGAGTACAA CAGGATGACC CTCGGTCACA AGATCCTCTT CCTGGCGGTG CATGGCATCG ACAAGCTGGG GCTGTGGCAC  CGGCTGCCAG TCATACTCGG CCTGACCTAC CTTGCCATCC GGCGAACTCT CCATGACAAT TACAACCTCC TCCCCGTCGG CAAGGTCAAC TCCGCCATCC CCGATCCATC CGCTCATCCC  TTCCGCTCCA GCGACGGCAC ATTCACCGAC CTCTCCAAGC CCGAAGCTGG AAGCCAGAAC ACCTTCTTCG GTAGGAACAT CCCCCCCGTT GACCAGCCCG ACAAGATTAT GGACCCCGAC  CCGTTCGTTG TGGCCACGAA GCTGCTGGAA CGGAGGAGCT TCATCGGGAC TGGGAAACAG TTCAATATCA TAGCAGCTTC TTGGATCCAG TTTATGGTTC ATGACTGGAT TGACCACCTC  GAGTCCACCC GCCAGGTGGA GCTCGTGGCG CCCAAGGAAG TCGCCAGCGG CTGCCCACTA AAGGCCTTCC GATTCCTCGC CACAGAGAAT ATCACCGCAG CCGACGGAAC GGAGGGCATT  CAAACCGGTC ACAAGAACAT CCGAACTTCA TGGTGGGATG GAAGCGTGCT CTACGGGAGC AACGAGGGAG TTGGAAACCA GGTGAGGACG GGCATCGACG GCAAGCTAAG TATCGGAGAA  GACGGCCTTC TCCTTCACGA CGAGGAGGGA CGCGCTATTA GTGGAGACAT CAAGAACAGC TGGGCTGGCG TCTCCATCTT GCAAGCTCTC TTCGCTAAGG AGCACAACGC TGTCTGCGAT  GCCCTCAAGA AAGAGCGCCC GGAGTTCGAC GACGAGCAGC TGTTCCAGCA CGCGAAGCTG GTGACCTCCG CCGTTATCGC GAAGATCCAC ACCATTGACT GGACCGTCGA GCTCCTCAAG  ACCGACACCT TGAATGCCGG AATGCACGGC AACTGGTATG GGTTATTGGG GAAGAGGTTT AAGAGCATCT TCGGGCACAT TGGAGGAGCT ACGCTGGGGC CTATTTTGAG CGGGCTCGTG  GGGCTGAAGG AGCCGAACGA TCACGGCGTT CCCTACTCGC TAACAGAGGA GTTCGCTAGC GTTTACAGGC TGCACCCTCT CCTACCAGAC ACCCTCCAAG TTAGGAACAT CAATGCTCCC  CCTGGTGCTA ACAAAGCCCC CTCTCTACTT AAAGAGATAA ACATGGAGGA ACTGATTGGA ATCAGAGGAG AGAAAACTTT GAGCGAGCTG GGTTTCGAAA GGCAGCTGGT TTCTATGGGC  CACCAAGCTT GCGGCGCGCT GGAGCTCTGG AACTACCCCT CCTTCTTCAG AAATCTCATA GTTCAGAACA CCGACGGAAG CGAGAGGCCA GACAACGTGG ATCTTTCCGC CCTCGAAGTG  TATCGTGATA GAGAGAGAAG CAACGCAAGA TACAACCAGT TCAGGAGGAG CCTGCTGATG ATCCCCATCT CTCGATGGGA AGACCTGACT GATAATGCTG AAATCATAGC AACGCTGAGG  GAAGTCTACG GGGATGACGT AGAGAAGCTT GATCTCCTCG TGGGTCTCAT GGCGGAGAAG AAGATCAAGG GCTTCGCTAT TAGCGAGACG GCCTTCTTCA TTTTTCTCAT CATGGCCTCT  AGGAGGTTGC AAGCTGACAG ATTCTTCACC AGCCACTTCA ACGAGAAGAC TTACACCAAG AAGGGGTTTG AATGGGTCAA CAAAACAGAG AGCTTGAAGG ACGTTCTCAA TCGCCATTAC 
CCGGAGCTCA CCAGCAAATG GATGAACTCT ACCAGTGGGT TCTCTGTGTG GGATGCGCCC AAAGAGAAGT CCAGTTGGGT TCCCCTCTAT TTGAGGATCC CCAAGTGA 

Retrieve as FASTA