Entry information : LminPrx02(Lemmin1g0014500.t1)
Entry ID 18800
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx02(Lemmin1g0014500.t1)
Name LminPrx02(Lemmin1g0014500.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx019]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx02
start..stop
S start..stop
SpolPrx35 537 0 21..322 22..323
CescPrx85 497 1.46e-179 22..323 10..311
PtPrx08 477 3.44e-171 20..322 28..330
CescPrx86 474 3.45e-170 14..321 6..313
Literature and cross-references LminPrx02(Lemmin1g0014500.t1)
Protein sequence: LminPrx02(Lemmin1g0014500.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   323 (300)
PWM (Da):   %s   35871.13 (33364.8)  
PI (pH):   %s   7.22 (6.98) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-323
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDRSFRFTAV LQVLLLLSSS GNAELSRSYY AQSCPRAEEI VKEQVKQLYE KHGNTAVSWL RNLFHDCMVG GCDASVLLES TSVSSSEKTS LRSFGMRNFK YVATIKEALE RECPATVSCA  DIVALSARDG VALLGGPYIR MKMGRKDSKR SYLEFVEKSI PNHDSNISLV LSRFQSLGIE TEETVALLGA HSVGRVHCVN LVHRLYPTID PTLDSDYAEY LKGRCPTAQP DPSAVAYGRN 
DRETPMIIDN MYYKHLLQHK GLLLVDQQLA SDPSTAPFVV KMAADNAYFH QRFAEAILKL SENNPVLGEL GEVRKDCRFV NSG 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATTTATTACA TTGGGATGAC TATACCAAAT GATATATCAT CACATGATTT ACTACGTAGA TTTTTAAATC CAACCTTTTA TGTAAGAAAT TTGACTCCAT CAATGGTGTC ACACTAAGAG  GGTTTCAATA TATTATCATA GGGACATATG CAAGCACGTA CTAGTTGTTT TGTAGATCAT TGCAGTTCTT TACACTAAGA CTATTAGATA ACATATCACC ATATGAATTA CTATGTGTTG  ATCTAAGAGT ACATTATTTT CTATTATGAC CATATATTGA ATCAACAATT TTATAACACC TTGTCTACAA TATATCTACA ACAAAGCATT ACAAGTTAAG ACCTATGATG TAAGTACATC  GTCAAATAAG ATAAATTGTG ATGATGTGAT TATGGTAGTA ATCGACACAT GTCATAGGGT ATGTAGATTT AGTCATCATG TACAAGTCAT CACACTCTTT ATGTTGAGAA GATAGGATAA  AGAGTGTATT GTTCACTAAT AGTAACACTT GTATAATAGA CCATCTTTAA GAAATTAATA GACACTACAA AAAAATTAAG GAACTCAATC AAACTGATTC TAAAAGATTG ATGCTAGTGG  ACAACTCATT TTCCCTTTTT ATGTTTGTGT AACGATTAGA ATCACACAGC TCAACTCATA TTTTCATGAA AATTATTTGG AGGCCAAGTC TTTCGGGGGC ATAGGCCATG AAAAAGGTGT  TGAATTCTAA TAAAATTAGC TAACCATAAA AGTTGGGTGA CCGCTCAAGA CGACTAAATA TTCAATGATT CAACAAAATA CAAAAAATGA GAATCTCTAT TCAACCATTC TCTCACCTTA  AAGAATCCCC AAGCCAACCC ATCATTGTTA GCATACTCCA ATATCTCAAG GCTATTTGTG TCTTGCTTTA CATAGAAAAC CTCCAATAGA GTCCTATAAT GAAGTGGATC ATTCTGAATG  GACAGTTGAA GGTGCTACTC TTTTAGATAG TACATTTCAA GGTAGAGAAA CAATGCACTA ATGTGATCCC TTGATCTACA GCTAAAAACT AAATTTCATG ACATAGCTCA TAATGTTTGA  AACATTATGA TATGTGGACA CACATTGCCA GTACTAGCCA ATATAGAGTG CTCATAATGT GGGCATAGAT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT GGTGGAGGAA CCATCATTTC  GTCGCCCCTA TTGACCTTCT CGCATAACAT AAGGATTAAG GAGGGAGTCG AGTCGTGCGA TACTCCATTC GGCAGCCCGT CGGTGGCATC AACTTAAGGG GACCGAATCA TAGCAACCGC  GGTGGAAAAG AAATGGGATT CCCCACGCGG AGCCGCTTTC TACGGATAAG CATGAGACAG CCGAAAAAAC TCGGCCGTCC TCGACAGAAT TGTCCCATCT TTTCTCATGT TCTGTTGCTG  ACTCCAGCTC TTGGATCGTG AGACCGTAGA CAGCCCCTCG TGGAAGCCAT CAATGATCAT CTTCTGGAGC TTCATTCAAT AATGGCCATG GCAAAAACAA AGCTTGGATC TTGGCCCCTG  CCCACCTTTT GATTCGCTTT GACTTCATTG TTTTTTAGCA GATCTCATCT ACTCTTCAAG TTCCCAGTGT CGAACGAAGA CCCCAGCTGC CCTTCCTGGT GCGGACTGGA TAATGATGGT  GCCGTGCCGG AAGAGGCGGC GTCATCGTGG GTAGGCCACG CTTTCTCCTC CATTCTGCAT CTAATAGTAG TAGAGTGCTA GAGTGGGACT TGGGAATTTC AGAGGTCGTC GATGCGTCGC  TCTCGAGTCT GTGGAGTTTG TCTTATTAGC TTCATGTTCT CGGATCAACC GCTGGGGCTG CTCAAAATAT TCCTTTGAAA AAGATCGTGC AACTTTCTCT TCGTCTGAAC GCGCAGCTTC 
GGCTCCTGCC TTCTCATCAG TAGATGGTAT TATAAAGAGG GGATGTGACT CTCAAGTCTT GCTCATCTCC CTGAGCAGCC 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGATAATAAA TCCGTGCAGC TGTCGTGTTG GATTTATGTT CTTCGATGAA CGATAATCAA TGATAAAGAT CCCACCTTTT CACTATCACG CTGCAGATTC ATGGTGAAAC TGGATTAGGC  ATACCTAGCC TAGATCGGCC ATCGATGGAG AACAGATGAC TAATGCCTTA ACCCTTCTCC TTTCTTCCCA CAGTCAAAAC CTCTCTCGTG TGGATAGAGT TCCTCCAAAG GGCCAGATGA  GTTTTGATAT TTTTCTGTTC ACAACACACT CCACAACTTT CTTTTAGTCA ACACAAATAC CACTAATTAT TCATGATTAC GTTAATGTAT ATTAAGATTA GTATAGTCAT CATTGTAGAG  TCTGACTCCT ACAATCTCCC AATTAGGGAT GGCCGGCAGA GTCGGGATGG GCCCGCTCAC CCATGTTACC CGATCCGACC CGTCATTATG GAATGGACGC GTGTTGGATC GAGTGGGCTG  GCAGGCTGGG TTGGGTTTTC CGAAACAGTT GACCCATTAA GTCAATTCCA AAGCGTCGTC AAAAACTGCG CTGGCAGCAG CTGCGGCTGT GGGAGGTGGC GCATGCAGCG GCAGCCGGCT  ACCTGCCAGC CGCCGCTGAG ACGGAAAGCT TCGCCGGTGG CTGCGGGAGG CACCCGGATG CCTCCCGCAG CCGCATGAGG CAGCAATGCC TTCCACCGCG GCAGCAGGAG GCACCGCATC  TGGCTACCTC CCCGTGGCCG CTGCGGTGGA AGGCTTCGTC GGGGGGCTGT GGGGAGGCAC TCGGATGCCT CCCGCAGCCA CTGCCGCGGG AGGCAGCGAT GCCTTCCTCT GCAACTGCAG  GAGGCACTGC ATCCAGCTAT CTCCCAGAGA CCACTGCAGC AGAAGGCTTT GCCGGCTGCT GCGGGAGGCA CCCTGATGCC TCCCACTGCT GCCGCCGCCG GAGGTAGCGA TGCCTTCCTC  ACAGCTGCAG GAGGTACTGC ATCCGACTAC CTCCCCACAG CTGCTGCGGC GGGAAGGCTT CGCATGTTAG TGCACACGGC CCACAAGGAA TGATCAAAAG ATGATAGAGA GAGAAAAAAA  CAATCACTGA TGAATCTATT GCAAGGAAGA ACAAGAAACA AGAAGCGCAC ACGCACAGGC ATTGTATACC CATAAGAGAA AAGAAAGAAA GCTTAACGAC TTCAACCGTC GCAGGCCCCA  CACATCAGCT GTGTCCTCAC CATCACCGTT ATAACTACGT AGGATTAGGG TACTGCGATC ATGATTGATC ACCGATGACC ATCGGCGATC ATGATCGCAT GATCGCGATC GGCGAAAATG  GAGGCGATTT TGGCGACCCA TTCATCGGCA ATTATTGCGA TTAATCGAGA GAAATTTTAA AGAAAATCAA AGAAAAAAAA CTCTCAGACT CTCAATTAGG GCTTCCCGTC TCCTCCAGCC  TCTACGGACT ATGGTGCAAC GGCAGATGGC ATTCCTCCCT CCGGCGAGTA TCCCTCCATG TAGGTCTCAG TCCGTCTCTC CCTCTCCCGG ATCCCTCCCT TTCTCACTCT GTCTCTCCCT  CTACCTCTCT CCCAATCCAT CTCACACTCT CAATCCGTCT CTCCAAGTCT CCCTCTCCTG GCTTCATCTA GCAAGGCGAA GGAGCGAAGG TGTCTAGCTA TTGAATATTG AGAAGGAAGA  AGACAAGAAG CGAGAAGTGG AGGTCAATGC TTGAAATTGT CATTCTAGAA TCGAAAGAGA TGGGGAATTA ATTTGACAGA TGGGTAGAGA TGGATTGAGA GGTCAATTAG TCTCTCAATC  AGTTTCTTCC CATCTCTCCT ATCCTCTCTA AATCTCTCAA TTACTCTCCC TCTTTATCAA CCGTGGGAGG CAAGAGAGAG AGGGGGAAAA GAAATCTCTC AATTCTCCTC CCTCGTCTCT 
CTCTTTGACT TCTTGCCCCC GAAATCAGAG AGAGGGGGGG AATAAAATTT AAGAGAGAGA GGCAGTGATT GAGAGGTCAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATCGGA GCTTCCGTTT TACTGCTGTC CTTCAAGTCC TCCTGCTGCT CTCCTCGTCT GGTATAAGCA AATATCTTGC TGCTCATCAT CATCATCATC ATGTTCTTCT TCAACATTGA  AGGAAATGCG GAGCTCAGCC GGAGCTACTA CGCTCAGAGC TGCCCGAGGG CGGAGGAGAT CGTCAAGGAG CAGGTGAAGC AACTATACGA GAAGCACGGC AACACCGCCG TCTCCTGGCT  GAGGAACCTC TTTCACGACT GCATGGTCGG CGTAAGCAGC TCATACCTCG CCTCCTCAAA ACCACAATCC GCAATATCTT AGAGAACGAC TTCTCAGGGA TGCGACGCCT CGGTTCTGCT  GGAATCGACC AGTGTCTCCT CTTCCGAGAA GACCTCGCTG AGGAGCTTCG GCATGAGGAA CTTCAAGTAC GTGGCCACCA TTAAAGAGGC CCTCGAGCGC GAATGCCCAG CCACAGTCTC  CTGCGCCGAC ATCGTCGCCC TCTCTGCCCG CGACGGCGTC GCCCTGGTAA GCAAGGTTCT ATTCTCTTAA ACTTAGAGAT TTGCATGAAG ATAACTCACC TCTCGAGCAG CTTGGAGGAC  CGTACATCCG TATGAAAATG GGGAGAAAAG ACAGCAAAAG AAGCTACCTA GAATTCGTGG AGAAGTCCAT CCCCAACCAC GACTCCAACA TCTCTCTGGT TCTCTCTCGC TTCCAGTCTC  TAGGAATTGA GACAGAGGAA ACCGTTGCAC TACTGGGTAA ACACCATAGC TCAGCAACTC TTCGTTCCTT CTTCTTCCTA GGTTTCTGAT GCTCAAATCG TCTCTCTAAA GGCGCGCATT  CTGTGGGCCG CGTGCATTGC GTCAATTTAG TTCACAGACT TTACCCTACG ATCGACCCCA CCCTCGACTC AGACTACGCA GAGTACCTGA AGGGACGGTG CCCGACTGCG CAGCCCGATC  CCTCGGCGGT GGCGTATGGC AGGAACGATA GGGAGACGCC TATGATAATC GATAATATGT ACTATAAGCA TCTGTTGCAG CACAAGGGCC TGTTGCTTGT GGATCAACAG CTTGCCTCGG  ACCCTTCTAC CGCCCCGTTC GTGGTGAAGA TGGCCGCTGA CAATGCCTAC TTCCATCAAC GATTCGCAGA GGCGATCCTG AAGCTATCGG AGAATAACCC GGTGCTCGGC GAACTGGGAG 
AAGTTAGAAA GGACTGTCGT TTCGTCAACT CCGGATAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATCGGA GCTTCCGTTT TACTGCTGTC CTTCAAGTCC TCCTGCTGCT CTCCTCGTCT GGAAATGCGG AGCTCAGCCG GAGCTACTAC GCTCAGAGCT GCCCGAGGGC GGAGGAGATC  GTCAAGGAGC AGGTGAAGCA ACTATACGAG AAGCACGGCA ACACCGCCGT CTCCTGGCTG AGGAACCTCT TTCACGACTG CATGGTCGGC GGATGCGACG CCTCGGTTCT GCTGGAATCG  ACCAGTGTCT CCTCTTCCGA GAAGACCTCG CTGAGGAGCT TCGGCATGAG GAACTTCAAG TACGTGGCCA CCATTAAAGA GGCCCTCGAG CGCGAATGCC CAGCCACAGT CTCCTGCGCC  GACATCGTCG CCCTCTCTGC CCGCGACGGC GTCGCCCTGC TTGGAGGACC GTACATCCGT ATGAAAATGG GGAGAAAAGA CAGCAAAAGA AGCTACCTAG AATTCGTGGA GAAGTCCATC  CCCAACCACG ACTCCAACAT CTCTCTGGTT CTCTCTCGCT TCCAGTCTCT AGGAATTGAG ACAGAGGAAA CCGTTGCACT ACTGGGCGCG CATTCTGTGG GCCGCGTGCA TTGCGTCAAT  TTAGTTCACA GACTTTACCC TACGATCGAC CCCACCCTCG ACTCAGACTA CGCAGAGTAC CTGAAGGGAC GGTGCCCGAC TGCGCAGCCC GATCCCTCGG CGGTGGCGTA TGGCAGGAAC  GATAGGGAGA CGCCTATGAT AATCGATAAT ATGTACTATA AGCATCTGTT GCAGCACAAG GGCCTGTTGC TTGTGGATCA ACAGCTTGCC TCGGACCCTT CTACCGCCCC GTTCGTGGTG  AAGATGGCCG CTGACAATGC CTACTTCCAT CAACGATTCG CAGAGGCGAT CCTGAAGCTA TCGGAGAATA ACCCGGTGCT CGGCGAACTG GGAGAAGTTA GAAAGGACTG TCGTTTCGTC 
AACTCCGGAT AG 

Retrieve as FASTA