Entry information : LminPrx03(Lemmin1g0021780.t1)
Entry ID 18801
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx03(Lemmin1g0021780.t1)
Name LminPrx03(Lemmin1g0021780.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx065]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx03
start..stop
S start..stop
LminPrx04 665 0 1..324 1..324
LminPrx26 634 0 1..324 1..324
LminPrx25 624 0 9..324 2..317
LminPrx19 568 0 1..324 1..324
Literature and cross-references LminPrx03(Lemmin1g0021780.t1)
Protein sequence: LminPrx03(Lemmin1g0021780.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (300)
PWM (Da):   %s   34673.67 (32104.3)  
PI (pH):   %s   8.32 (8.20) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-324
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNQRRAGPLL ALVLAFCTTS LLEAQLQVGF YKTTCPQAEI IVREEVTKAF RLDGGITADF VRMHFHDCFV RGCDGSILLD STPGNPAEKD SRINNPSLEG FDIIDNAKTR LEATCKGTVS  CADIIAFAAR DSVRLSKGIH YEVPSGRRDG RISLSTETFT NLPGPSSDLA QLTQNFARKG LTQADLVTLS GAHSIGKADC ASFSKRLYNF NATVQTDPSL NPAYAAQLKQ ACPPGATGIS 
VPMDPPSPLV LDISYYKGLL ENRGLFTSDQ ALLSSPATAS QVKANRNNNF LFTKNFPAAM VKMGNIGVLV GTAGEIRLNC RVAN 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TAAAATTCTA CAAACACTCC ATTATCGATT GTATAATTAT GAATTTAGAG TATATTTTTA GTGATCTCAG GTACATATAA AATATTTTGT AATTAAAGAG GATAAAAGTA TGAATCTAAT  GTAGAAGATT GATATGAGAG GATTTTCAAA CCTTGTTCAT TACCTATGTG CAATTGATCT AGTCCTTGAT ATAGATGAGA ATTGTTCACG ATGTTGGGAT CAGAAGTCAT ATGGTGTGTG  GCACCACTAT TAGGATACCA AGTTGATGGA GCCAGTACCT TTGAAGATGC TGAATTATTA AGCATGAGGA GGATGTTGGT CGTGATTTTT CTTCTACCAA GCTTGCATGA TTTTATATGT  TTGATTGTTG ATCTACTATT CTTGGATGCT TTTATATGTT TGATTGTTAT TCTACCAAGC TTGGATGCTT TTATTGAATT TTTTATGGCA TTTATGTTCT TTGCGGCCAA ATTGTCCACA  AAGTTGGCAC CTGGACGTGC AGCGATTAGT TCTGCCTTGC CTACATCTAT ATCTTCCTCC ATTATGATGC CCTCTTCTTT GATCATTGTT TGACACATTT GAGTGTGCTT GATTAGCTGG  AGAAAATTTA TTAGACGATT TATTCTGCTC ACATAAGGTA TGTAATCTGA CTGTTGGGTT CTAATTTCCT ATGTGGACAC ATATACATGA AATTGTAAAT CATATGCTAT CATTAGTCCC  ACTCAAGTTA TTCACTCATG TTTATTAAAA AGACTAAGGC ATCTCAAATG AGTATGGGGT TATATATAGG TTTAGAGACA GTCTATTACA ATTAGATGGG CATAATTATA ATTAGACTCA  AGAGGCCCTA TAATTATAAT TATACTCTTG CCTCTATAAA GGAAGTCATG GTTACACATG GTTGAGGGAC TCATTGAGCA CTCATCACTA TTGGGTTCTC AACTCTCATT GTGCCAACTC  AAAAGACCTT CCGACAAGCA GCATTCCCTT AAGATCCAAC ACTGACTTGG GCAATAACGT CTTCTAGGGT GAGTTTCCCG GTATGTGTAT TGATCTCTGC GACAAAAGCT GCATACACAG  ATCCAAGCCT GTGGATGAGC GCGAAGATGA CTGCCGACCC TTGAAGTTTC TCTCCCGCAG CCGACAACTC ATCAATGGTC CGGATACCTT TAATCGAGTG CTTCCCGAGC TTCTTTCGAA  GTTTTCTTGT TAACGACGAC TGGGAAGAAT GATTCAGATA GTGATGCTTT GATGAGAGAT AAAACCCGTT GATCAATCCC CCACCAATTT TGGTACGCTT CGTTTATTTG AAAATGCTTA  TTTCGATCGA CAATAGAAAT AGGTGGTGGA TATTGTTCAA GAAAGTGATG TAACCCGCAT CCATTGAGTA CTTAAAGAAG CTGTCTTCCA TAACGGGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGTCT  GAACTTTATC AGATCGAACA CGCATAGTAG CTGTGTTGGG GGGGAAATGT TGTTGGCGTT AAAGAGGCTA CGACTTTTTC GAGATCTTGC GGAGTCAAAG CCTGTGCCAG CCATGAAATT  TCTCGGAGAT CAAGGAACTA GAGTCACGCA ACGTCGAATA ACCTACCATG AAATCCAAGG CGGTCAAATT TTCCGGGAAG GACGTGATGC TACTCTCTTT TGAACTCTTT CCTCGCCCCC  TTCCCTCCCA AACTGCGGCG ACCGTCTACT AGGCGTCGGT AGGTTGAGAT GTGACCTAAA AGAGAATGGT TTCTTCTCAC GCGGAATGAT ACGTAGCGAC CGCCGAACGA TTAGATCTAT  CCATTTGCTT ATTCCATGTT TATCGTAGCT TTGACCGAGC GGGGTCAGAC AATTCGTAGA ATAAGGCGGA GAATATTTGT CGGGTGGCCT ATAAATAGGC TTCCACGGTC CAGGCAGAGA 
GTTCAAGAGA GTTGTGCCGA GTGCCGAAGA ATTCGAGAAA TAGCTTCCTA GAGAGCGGTG GAAGTCTTGC GAGTAAGAGC 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGGTTGCCAC TACCTCGGCA ACGTCGTCCG TGTATTTGGT CCTCTAGTCT CTTACTATTC TGCCCAGCTG ACCTGTCAAA GAGGGACATG TTTTTCTCTG TTAATTCAAT AAATCTCCTC  TAAGTCGAGA GCCATGTCCT CATACTCCCT GAATTGAAAT AAAACGGGCT TTCAGGTGGG AGGGCGAGGG AGTCTTGAAG TAGCTCGCTC ACTCTTTCTT CCACCTCTCT TATTTCTGTC  CTTCCAAAGA GAAAAATGTC CAAGCTTTGA GATCCTTCTC ACCACGTTGT ATCATCTACC CGACTTTGTT CATCTTCTCC TCGCCGACCC ACCTGACCAA TGTCATAAAT GTGAATGCGT  GAGAGGATTT ATGGATCGCA TTGGAAGCGT TCTCTAATGG ACTCGATTTT GTGAGATGTG TCCGAAGAGA GATTCTTCCC TCCCTCCCTC CCTCCCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC  TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCGA CAAGGTTAAA CATACATTGA GAAATTATCT ATTTTTTTTT ATCAGGAATA GTGATGTTGG GGCCAAACTG CATTGGGAAT  TCTCATAGAA TATCTGAGAA GGTTAGGAAA GATCATATCT ATTCAGCGGG CGATTTATTT GGATGAAGTG ACCGAGTTGA TCAAACCCTC GATTGAATAT TACTATTTGT GTAATAATCA  AAATTTGACG AGAAAGCTAG TGTGCACGTC TATGCTCTGA CGTCAAAGTC AGTCTTGTCT TCATCAGAAG GTGTAAGTCA AAGTCACCAC ACCATAAGAA GTCAATCAAG TCCTTAGTAA  GTGGCATGTA AGAATAATTA CATCCATACA TAGAAATATG AAGTATTCAT ACATAATTAA CAAAGATAGT AACTATAGGA ATCATTTTTG ACATGCACAT CAAGTTTATC ATGAATAAAT  ACCTTCTTAC CTTTGTATCT GATGTATACA TGGTTTAAAT CTCATGGATT ATCTTCTCTA TTTAGCATAA TTATAGGACA TAACACAATG ACATTCAAAT CTAATTTTAT TCTACCACCG  ATGCCGCACT TTATCTCCAA GATGTGTTGA GTTAAGAGGG TTCATTAATG CATTAATTAG GCGTATTTTG AAATTGACTC TCCCTCAATG TCTCACACGG ATTTGAAGAG ACTCTTTTAA  TTGTATACAT TCATGAAAAT CATTTGACCT ACGTTAGAAT TTGGTAACGA TGTTTATGGG AAGATCAAAA TTCTCCCCGT CTTACTTTAA TTGAGTGTTT TATATTCTTT AATGGGAGGA  TGAAAATATG CATGCTTGTG AGACAGACGG TAGATCACTC AACTAGACTC ATTTGACCTT TTCAAGGTCA AATGAGTCAT AACGGACTAA TATTTTTGTT TCTCATACTT TTCAGGAATT  TTAAAATGTG ATGGATGTGT TGTAGAGCAA AAATAATTTG GAGGAAGAAG ATAAAAGAAT AAAAAAGAAG AAGAGAATAT GTCTACATAC ACATATTTTA TACAAAATAA TCTCTTTATT  TTGGAAAAAA AGTTGCCGGT CCAGCACCAT GTGGAACCTG TAGGCTAAGG TGGTTATGCA TTGTTTGGTT GGAGCTCATT GTTAGGCGTG AGGCTAGTGC CCTCCTGGAT AGATAAGAAG  AGATAATTTT TGAAAGGGTT TAAAGACGTG AATTTATATA CCCTTATCTC TCACTCCTTT GCTCAATGTT GGACTATTTT GTAGTTAAAT GGAGGTGATG ATGGCCACGA TGATGATAGT  CAATGATTGG TGTTGTGGAG CATCGTATGG GCAAGTAAAG ACATTTGCAT AATCGGATGA ACAATTATCA ATGAAGCAAG AACCGATGAC TTCTGGTTGT GGGACACCAA ATAGTGCATT 
GGATTGCATG TCGACCATTT TATCAAGCAA TTTAAAACTT TGGATCAATC TCATCTGTCC AGACTTATGT GGTGGAAAAT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATCAGA GGCGAGCGGG ACCGCTGTTG GCTCTTGTGC TTGCATTCTG CACGACTTCT CTGCTAGAAG CTCAGCTTCA AGTGGGCTTC TACAAGACCA CTTGCCCTCA GGCCGAGATA  ATCGTGAGGG AAGAAGTCAC CAAAGCTTTC AGACTGGATG GCGGTATTAC GGCGGATTTC GTGCGCATGC ATTTCCACGA TTGCTTTGTG AGGGTAAGCA TGTAATCATC AGCGCTCACT  AGAATTCATG GTTATCTAAA TAAAAAACCT TAACCTTCTC CGTTTAGGGT TGCGACGGTT CAATCCTCCT GGACTCTACG CCGGGAAACC CTGCGGAGAA GGACTCGCGC ATCAACAACC  CTAGCCTGGA AGGCTTCGAC ATCATTGATA ACGCGAAGAC GAGACTCGAA GCCACCTGCA AAGGCACAGT CTCATGCGCC GATATCATTG CATTCGCTGC TAGAGACAGT GTCAGATTGG  TATAACACCA TCGTCACGGA ATTATCCGCG GTTTATCAAT CTGATCTCTC TCTCTCTCTC GCTGTTCTAC TAATGATTAT CTTCATCACA CGCGCAGAGC AAAGGTATAC ACTATGAAGT  GCCTTCCGGA AGAAGGGATG GAAGAATCTC CTTGAGCACG GAGACGTTTA CGAACTTGCC GGGCCCGTCA TCTGACCTTG CTCAGCTCAC TCAGAATTTC GCCAGGAAGG GCTTGACGCA  AGCGGATTTA GTTACCCTCT CTGGTGGGTT TATATGCAAT CCCTGCGAAC GCGTAACCAG ATGATAAATT GTCAAGTAGC CGCGGTAACT AAGTAATGGT GTTTCACAGG TGCTCATTCC  ATCGGTAAAG CCGACTGCGC CTCGTTCAGC AAGAGGCTGT ACAATTTCAA CGCCACCGTG CAGACGGACC CGAGCCTGAA TCCAGCCTAC GCAGCACAGC TCAAGCAGGC GTGTCCCCCG  GGCGCCACGG GGATAAGCGT GCCCATGGAC CCTCCCTCTC CCCTGGTCCT GGATATCAGC TACTACAAAG GCCTGCTGGA GAACCGCGGG CTGTTCACGT CGGATCAAGC CCTGCTGTCC  AGCCCCGCCA CGGCGAGTCA AGTAAAAGCC AACCGGAACA ACAACTTCCT CTTCACCAAG AATTTTCCGG CGGCGATGGT AAAGATGGGT AATATTGGCG TGCTTGTGGG GACGGCAGGC 
GAGATCCGTT TGAACTGCAG GGTCGCCAAT TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATCAGA GGCGAGCGGG ACCGCTGTTG GCTCTTGTGC TTGCATTCTG CACGACTTCT CTGCTAGAAG CTCAGCTTCA AGTGGGCTTC TACAAGACCA CTTGCCCTCA GGCCGAGATA  ATCGTGAGGG AAGAAGTCAC CAAAGCTTTC AGACTGGATG GCGGTATTAC GGCGGATTTC GTGCGCATGC ATTTCCACGA TTGCTTTGTG AGGGGTTGCG ACGGTTCAAT CCTCCTGGAC  TCTACGCCGG GAAACCCTGC GGAGAAGGAC TCGCGCATCA ACAACCCTAG CCTGGAAGGC TTCGACATCA TTGATAACGC GAAGACGAGA CTCGAAGCCA CCTGCAAAGG CACAGTCTCA  TGCGCCGATA TCATTGCATT CGCTGCTAGA GACAGTGTCA GATTGAGCAA AGGTATACAC TATGAAGTGC CTTCCGGAAG AAGGGATGGA AGAATCTCCT TGAGCACGGA GACGTTTACG  AACTTGCCGG GCCCGTCATC TGACCTTGCT CAGCTCACTC AGAATTTCGC CAGGAAGGGC TTGACGCAAG CGGATTTAGT TACCCTCTCT GGTGCTCATT CCATCGGTAA AGCCGACTGC  GCCTCGTTCA GCAAGAGGCT GTACAATTTC AACGCCACCG TGCAGACGGA CCCGAGCCTG AATCCAGCCT ACGCAGCACA GCTCAAGCAG GCGTGTCCCC CGGGCGCCAC GGGGATAAGC  GTGCCCATGG ACCCTCCCTC TCCCCTGGTC CTGGATATCA GCTACTACAA AGGCCTGCTG GAGAACCGCG GGCTGTTCAC GTCGGATCAA GCCCTGCTGT CCAGCCCCGC CACGGCGAGT  CAAGTAAAAG CCAACCGGAA CAACAACTTC CTCTTCACCA AGAATTTTCC GGCGGCGATG GTAAAGATGG GTAATATTGG CGTGCTTGTG GGGACGGCAG GCGAGATCCG TTTGAACTGC 
AGGGTCGCCA ATTGA 

Retrieve as FASTA