Entry information : LminPrx19(Lemmin3g0075350.t1)
Entry ID 18817
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx19(Lemmin3g0075350.t1)
Name LminPrx19(Lemmin3g0075350.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx065]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx19
start..stop
S start..stop
LminPrx17 663 0 1..324 1..324
LminPrx18 659 0 1..324 1..324
LminPrx46 653 0 1..324 1..324
LminPrx45 633 0 1..324 1..324
Literature and cross-references LminPrx19(Lemmin3g0075350.t1)
Protein sequence: LminPrx19(Lemmin3g0075350.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (300)
PWM (Da):   %s   35033.6 (32362.2)  
PI (pH):   %s   8.14 (7.68) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-324
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSWRRGGVLL ALVLAFCMTR PLEAQLKVGF YKTTCPKAEL IVREEVTKAF RSDNGIAADF VRMHFHDCFV RGCDGSILLD STPGNTAEKD SPINNPSLEG FDIIDNAKTR LEATCKGVVS  CADIVAFASR DSVRLSKGIY FDVPSGRRDG RVSLSSETFT NLPPPSFNLD QLTQNFARKG LTQEDLVTLS GAHSIGKADC SSFSDRLYNF SSTAQTDPSL DPAYAAQLKQ KCPPGTTGTN 
VPMDPPSPLA LDSSYYKGLI ENKGLFTSDQ ALLSSPATAR QVRANRNNNF LFSKNFAAAM IKMGNIDVLT GNAGEIRVNC RVVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TATAGATACT CATGTTTACC TTGTAAGTGT ATATATCTAT TTTTCCTATC ACATGCATTA ATGTCTCCCA TCATATTTTT TTCCATGTCT TGAGTGAAGA GAAAACTAGA GAATAACATA  GAATTGTTGA TAATCTATGG ACTAGCCATA CCCATCAAAT AAAAAATTAT GAAGAAAGAG AAGAAAAAGA AATTATCCAC GCTACTTTTC CATTTTTCTA ACACATTTTT ACTAGTTGGA  GCAATTTATA GAGGAAATTG GCAGTTTTTC TTCGAATGCC TCCTGCCCGT AAATGTACTT TGAATCAGGA TCCACATCTA GAAAGAATGG TCTGGTACCC TTGTTTCCAA TCGTCTATAT  GTTCTGCAAC TCTCCTACAT CGTCAGGGAG TTTAGAGTTT TACTAGAACA ACTTTCATGT AAGGGGTGAT CGGAATTCTA CATACCCATC CTACATTGAA CATTGACCCG CAACAACCGT  TCAAAAGAAT ACTATTAGAT GAGCATGAAT CTTGCCTACG CCCGGGACTG ACAGTTAGGC TACTACCCAA ATCTTTCCGC CGACCTTGTT TGACCAAAGA TTGAGAACAA ACTCTCATCA  CCGGATATTG CTGCCATGTG TATCGGGAAA GAAAGTCGCT GTTCATCTGG GGCTTACGGT AGAACCTTTG AAAGGATGAT GATGTGGATT TGAGCGATTT GTTATCGCGT GTTCATTGGT  AGACGTGTTT TCCGCTAACT CGATTCATTG GATCATGATT CATGACTGGC ATGGTTCTTT GTGCTGGAAG CTGTCGCCCC GGAGCGTTAG ATTTCGGCCT TCAAAGAATT TGTCTCTTTC  TGGAATTATG GTGCATATCA TCCAAGAATC CTCGATACTC GAGTACAACT TGTGCCTCTA CCCCGCCAAC CTTCTCCGTA GGGCGTCCAT CAGATAGGCA GGCCCAAGCG TCGCATACTG  GGCGTCGGCT TTGATGTCCT TGTGTGGGAA AGTCGGAACA GCATAAGCAA ATAACGCCAA AGGTTTTCAT GGACGAAAAA GTTGAACATT CATGGGATAA ACATGTCTTT GACGATCTGC  CCAATCACCA TATGCCGACA TGCACTCTAC ATCTCAGTCC CTTAATAAGA GAACATGCAC TTCAACTCAT CACCATGAAT ATCTTCAAAA TAAAATGGAT TTCTTGAACA AGTATCGCAT  AGTTTTTAGC CCCCATGAAT GAAAGAAAAA TATTCTTTGA AAGATGGCTT ATATCTATGG CTAGTCCAAC ATCTAATTTC TGGAGCGATA GTGTCATAGG TCGATAATTT GTCCAAAGCG  ATCCATATAC CGCCTTCGTT GAAGCGGCTG AGACTTCGTC GCAATCTGGC GGCTTCAAAT CCTGTACAGT GTACCCGCCG CGAAGTCTCT TGAGAAGAGA AGATGAGAAC GTCACTCAAC  GTCGGAGCAA CCTACCCTGA AATTGAGCGC GGTCAACATT CTGGGAAGAG CGTGGTTCTA CAGTCGCTTT CGAACTTTTC TTCACTTGGG ATAATCATTC CGCGTCCTCC TCTCTCCAAG  TCGCCGCGAC GATCTTCGGG CTTTGTCAGC TTCTGGTGTG ACATAAAATA CTCTGATTTC CAGTCATACG GAGTGGGAAT GCTGCTTACG TGATGACCAC CGAACGACAA ATACTACCGA  TTTGATTCTC CGCATTCATC GTTTCCTCCT ACTCCGTGAG GTCCAGAGGG GATCCAGCGA AGCTTTGACC GATGAAGAGT TAGACCAGTA GTTGAGTATC GGGGGCGAGA TGAGATTTCT  ATGCATTCAG GTTTCATATC AAGTCCTATG GCCTATAAAT AGGCTTCCGT AGTCCGAGCA GAGAATGCAG GAGAGTTTTG AAGTCCTCGA GAACTTGAGA AGTAGGTTCC TTGAGAGAGA 
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAAGATCG ACAAGTGAAG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAATTACAC TATCTGATCA ACGTCGTCCT TACTATACAT GGTTCCGTGG CCTCCTTATG CACTCCGCAT CATGATTGAG GCCCCTCAAA TTAGCGCATA CTCTGTTCTT ATCAACTATC  TACGTAACCC TTCGTCAACT TAAGAACATT AGTAGTTTAA TCTATTGTAA ACATGAGGAT GTTTTCATGA AGAAATAAGA GAATAATTTT TCAATCTTCG GATAAACCTT CTCTGCGGGC  AGACATGGTA GCCTGCCTGA AGCGTGTTTG CTCCTCCAGA ATGCGAGAAC GAACTGCTTT TAAAAATTGG ACATTGAAAT CCTCTTTGCA TGATCCTTTT TCATTCGGAC TTTTCTTGAT  TTGGGCGTCT CTGACTTATT TGTTTGATTA TTGCACCCTC ATTTGATCGT GTATTGATGC AGTTGTCCAT TATTTCACTG TTAAATTTAG ATAGTCACCG AAATTTTATG ACGGGTTGAA  TTGAGTCTCT TTATCGATTA ATCTTTATTC ATGGATAATA TCTCTTCTGT ATGTGATTTT CCTAATAATG ACAATCATGG ATGAAACTTG AGAAGCTTTT AACATACATC GGGTTTTATT  TCCCGATTGA AATCACATTA CTCATCAATT TCAAATAACA TTACTATTCA AATCCAAAGA GGTCGTAGAC TTCCTTGAAG GAACAGTTGG ATACATGTTA AGAGAAAGAC AATACAAATT  AAATAAATTT GTTGAATCAT CAAGCTGTTG GATCATATAA AAAACCAAGT CATTAGTCAA GTGAGCCACA AAGTAGTTGA TTCATTAATC ATCAGCAAGA GCATCAGTTA TAGGTGAGTT  ACTCGGCTGA TGAGAAGACC TTGATAAACT TGTGAGATCA ACCTATGGAA GAGAAGACGG TGTATTGAAC TAAAGAAAGG GGGGGGGGGA TCTCCGCATA TATAGTGAGG AGGAAACCCT  ACGACAGAAA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAACAA GAAGAAAACT ATAATAACGC CACTAAGGCC CATAAGTCTC ATATATAATC  ACACTCTCCA TCAAGCTAGA GCATATATAC GAAACAAGTC TAACTTGCAA GAAATGATGT GGTAGGAAGC TGTGCTCAAC CCTTTGGGGG GTATGTTAGC TAGTTGGCTC TTCTGGCCAG  CATGGGAAGT GGTGATAAGG TCAGCGAATA CCTATCGCGA ATAGCACATC AGTTGATCTC AATGTGTTTG GCACCCTCAT GAAAGGTGTG ATTATTGGCG ATGAAGATGT CTATTTAATT  GTCGTGGTAC ATCTGCATAG CCTCCTGCAC TGAAAAACCA AGCTTATGAA GTAAAGAACA TACCTATAGC ATCTCGGATG AGACATAAGC TATAGCCTAA TACTCCGCTT TGACTATCAA  AAGGGAGACA ATTCCCTGCT TTTAAAGTCG CCAAGTGACA AGGTTCCGAA CAACAAAGGT GTAGAACTCA GAAGTAGTTT TTTGGTCACC TTAATCGTCT GCATAGTCAA AGTTGGAGCG  TCCCTCAACC CGAAGATGAT AGTGGCCCTG ATAGAGAAGG TAACAACCAA GAGCATGCTT GAGGACGTCA AGAATGTGAA GCACCGCTTG CCAATGAATC TCCTACGGTA AATGCATGAA  CTGGATGGGA AGAGCCACCA TGTATGCAAT GCTTGGCTAG GTCATCGTCA ATAAATAAGT TTCCATGTGA GGCATTGAGA ACCATTTACA TTTGGACAAT CCCAGAAGCG AGGTTTGTTA  TCTATAGGAG AAGAGCGAGG TTTGCGGCCC AGTAATTCAA TGTCCTCAAG CATATGAAGA ACATACTTCT GTTGGTTGAG AGCCAACTTC CCACATCAAT AAGCAAACTC AATGACCAAA 
AAATACTTGG GAGTCCCCAA GTCCGGATGG TAAGATTCTT ATGCAAGTAG TTTTCAACAA GATAAATCCC TTCAACATCG 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGTTGGA GGCGAGGGGG TGTGCTCTTG GCTCTTGTGC TTGCATTCTG CATGACTCGG CCGCTTGAGG CTCAGCTGAA AGTGGGCTTC TACAAGACCA CTTGTCCGAA GGCCGAGCTA  ATTGTGAGGG AAGAGGTCAC CAAAGCATTC AGAAGCGATA ACGGAATTGC GGCAGATTTC GTTCGCATGC ATTTCCATGA CTGCTTTGTG AGGGTAAGCA TCTCGCTAAT CTTCGCGACA  GCTATGAGGT GGGCTTGAAC GAGATGCACG TCTCAGTTCA TGGTAATAAA TCTTTGCATT TACTGTTTAG GGTTGCGATG GGTCAATCCT CCTGGACTCT ACGCCGGGCA ACACGGCGGA  GAAGGACTCT CCCATCAACA ACCCTAGCCT GGAAGGCTTC GACATCATTG ATAACGCCAA AACTCGGCTC GAAGCGACCT GTAAAGGCGT AGTCTCGTGC GCCGATATCG TTGCGTTCGC  TTCCAGAGAC AGCGTCAGAC TGGTATATCC TTAGTGAAGG AAATTATCGG TCGTGCATTG ATCTGATCTA TCTCCTAGTG CTTTAACTGG TTTTATCTTC CTCGATATTC GCAGAGTAAG  GGAATCTATT TTGACGTGCC ATCCGGAAGA AGGGATGGAA GAGTCTCCTT GAGCTCGGAA ACGTTCACCA ACTTGCCTCC GCCTTCGTTT AATCTTGACC AGCTCACTCA GAATTTCGCC  AGGAAGGGCC TCACACAGGA GGATTTGGTC ACACTATCCG GTGCGTATAA ATGCGAAATG CCAACCATAG ATCTAACGAG ACGAGAAGTA CACTAATAAA TGAACGTGGT ATTTTCATGT  CGTTATTTAA CAGGAGCTCA TTCCATTGGC AAAGCTGACT GCTCCTCGTT CAGCGACAGG CTCTACAATT TCAGCTCCAC TGCGCAGACG GACCCGAGCC TGGATCCAGC CTACGCGGCA  CAGTTGAAGC AGAAGTGTCC TCCCGGCACC ACGGGCACGA ACGTGCCAAT GGACCCTCCC TCTCCTCTTG CTCTGGATTC CAGCTACTAC AAAGGGCTGA TAGAGAACAA GGGGCTGTTC  ACGTCGGATC AGGCCCTACT GTCCAGCCCC GCCACGGCGA GGCAAGTAAG GGCCAACCGG AACAATAACT TCCTCTTCAG CAAGAATTTT GCGGCGGCAA TGATCAAGAT GGGCAACATC 
GACGTCCTCA CGGGGAACGC CGGCGAGATC CGCGTCAACT GCAGGGTCGT CAATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGTTGGA GGCGAGGGGG TGTGCTCTTG GCTCTTGTGC TTGCATTCTG CATGACTCGG CCGCTTGAGG CTCAGCTGAA AGTGGGCTTC TACAAGACCA CTTGTCCGAA GGCCGAGCTA  ATTGTGAGGG AAGAGGTCAC CAAAGCATTC AGAAGCGATA ACGGAATTGC GGCAGATTTC GTTCGCATGC ATTTCCATGA CTGCTTTGTG AGGGGTTGCG ATGGGTCAAT CCTCCTGGAC  TCTACGCCGG GCAACACGGC GGAGAAGGAC TCTCCCATCA ACAACCCTAG CCTGGAAGGC TTCGACATCA TTGATAACGC CAAAACTCGG CTCGAAGCGA CCTGTAAAGG CGTAGTCTCG  TGCGCCGATA TCGTTGCGTT CGCTTCCAGA GACAGCGTCA GACTGAGTAA GGGAATCTAT TTTGACGTGC CATCCGGAAG AAGGGATGGA AGAGTCTCCT TGAGCTCGGA AACGTTCACC  AACTTGCCTC CGCCTTCGTT TAATCTTGAC CAGCTCACTC AGAATTTCGC CAGGAAGGGC CTCACACAGG AGGATTTGGT CACACTATCC GGAGCTCATT CCATTGGCAA AGCTGACTGC  TCCTCGTTCA GCGACAGGCT CTACAATTTC AGCTCCACTG CGCAGACGGA CCCGAGCCTG GATCCAGCCT ACGCGGCACA GTTGAAGCAG AAGTGTCCTC CCGGCACCAC GGGCACGAAC  GTGCCAATGG ACCCTCCCTC TCCTCTTGCT CTGGATTCCA GCTACTACAA AGGGCTGATA GAGAACAAGG GGCTGTTCAC GTCGGATCAG GCCCTACTGT CCAGCCCCGC CACGGCGAGG  CAAGTAAGGG CCAACCGGAA CAATAACTTC CTCTTCAGCA AGAATTTTGC GGCGGCAATG ATCAAGATGG GCAACATCGA CGTCCTCACG GGGAACGCCG GCGAGATCCG CGTCAACTGC 
AGGGTCGTCA ATTAA 

Retrieve as FASTA