Entry information : LminPrx45(Lemmin15g0383040.t1)
Entry ID 18843
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx45(Lemmin15g0383040.t1)
Name LminPrx45(Lemmin15g0383040.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx065]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx45
start..stop
S start..stop
LminPrx17 650 0 1..324 1..324
LminPrx19 647 0 1..324 1..324
LminPrx46 642 0 1..324 1..324
LminPrx18 641 0 1..324 1..324
Literature and cross-references LminPrx45(Lemmin15g0383040.t1)
Protein sequence: LminPrx45(Lemmin15g0383040.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   324 (300)
PWM (Da):   %s   34974.62 (32289.2)  
PI (pH):   %s   8.31 (7.98) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-324
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSWRRGGVLL ALLLAFCMTR PLEAQLKVGF YKATCPKAEL IVREEVAKAF RSDNGIAADF VRMHFHDCFV RGCDGSILLD STPGNTAEKD SPINNPSLEG FDVIDNAKIR LEATCKGVVS  CADIVAFASR DSVRLSKGIY FDVPSGRRDG RVSLSSETFA NLPPPSFNLD QLTQNFARKG LTQEDLVTLS GAHSIGKADC SSFSSRLYSF NSTVQTDPSL DPVYAAQLKQ KCPPGTTGTN 
VPMDPPSPLA LDSSYYKGLM ENKGLFTSDQ ALLSSPATAR QVRANRNNNF LFSKNFAAAM IKMGNIDVLT GSAGEIRVNC RVVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTTTGGTCGA CGTTACGGAT TATGTTTAGT TTTGACAGGG ACAAAGGTAG TGGTTAGCTT ATTGTGCTAA TTTTTGAATA AAATTATCGG TCATCATTCG TTGGCAATGC ATATTGAAGT  AAAAATGCCG ATATCAGCCT TTCAACTTTG GTTTTCATGA CGGGAAAGGA GAGCAATTAA TTTTAAAAAT TTTTTTATTT GAAAATTTTC TTTTTCCTCG AAACATTGTT TACTCTTTCA  ATAACAGGTC GCGAAATAGT GTTTTAGATT TTAAAGTTGA ATGAACGATG AGGATCGATA CTTGGGTTTT TATCTGACAT AGAGCTTGCC ATTCTTTTCA AGGAAAAGAT ATTAGAAGAG  AAACTTTATC CATTTTTTTT AAAATTGAGG AAATTTATCC ATGAACAGTA TTAGGGGGTT TGTGACTTTA TTTTTGTCAG CAGCTGATGT CCTTTTGGAG GTTAGGGCAC ATAGGAGAAA  TAGGATAAGG AAAAATGAAG AGTGGCAGGG GGAAGCTCCC ACCTCCTTGG GAATAAGTTT GCGCTTGAAG ATTGTTATCA TTACCAGGTG TAAGATGCCT TAAATAGGGT ATGCTACACT  ACCACCTGTT ACAACGGTAA TCTGACTGAG CTCATAAAAT ATATCCTAGC AAGGACTTTA ATGTAAAAGG TAGATAAGTA AAATATAGCT AATAAGTCCA TCTTACAGCA GTTTTGATAG  TTTCGTGTGG TATTTTTAAT ATTTTTTGTT ACTTTGGTGC GGTTATTCTC CTGTAATTAT GATTGGCTTT CTATGTTTTT CCTTATTGAA GTTTACTATT CTGTTTGTTG AATGGTACGA  CCAGTAAATA AACACTGACA TATATGTTTA AGTTCTGTAA TTATTTCGGT TTTAGTTTCC CTGAAATGAA TTTCATGAAA AACTGTTACT TTGAGCATTT AGTCTATACT GAACTGGGGC  ATACTTGTCA CGAAAACCGA TTTTCAGGAG CATTTTTTTT AGGAGAGAAG TAGTTCAAAC CAGGACCAGA TAAACCTCAA ATATGAACTC TTAnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnTCGATCT  TTTCTCTTCA TGACCAGGCT TCTTGTCTGA AATTATCTTA CCGCGTCCTC TCTCTCTCTC TCTCATGTTT CGGCTTTGGT AGATTCTGAT GAGACATTGA AAACTCTGCG GACATCCAGT  CACGCGGAAG GTGAAATGCT GCTTACGTAA TGACCACCGA ACGACAAGTA GTACCAATTT TATGCTGCAC GTCCATCCTT TCCTCTACTC CGTGAGATCC AGAGGGGATC CAGCGAAGCT  TTGACCGGGG AAAAGGCAGA CAAGCGTTGA ATATATGGAG CGAGATGAGA TTTCTATGCA CTGCAGGGTT CAGGTCACGT CCTGTGGCCT ATAAATAGGC TTCCACGGTC CGAGCAGAGA 
ATGCAAGAGA GTTCTCAGGC CCTCGAGAAA TTGAGAAGTA GGTTCCTTGA GAGAGAGAGA GAGAAGATCA ACGTGTGAAG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAATTTACA GTATCTTTGA TCAACGTCGT CCTCATTATA CACGGTTCTA TGGCCTCCTC ATGCTCTCCG CCACCCGATT GAGGCCTACC GAAATTGCGC ATACTTTCTG TTATGTTTGT  AAATGTAGAA ATGAAATAAA AAGGTCAATT TTGGCTTATC TACGGAAACA GTTCTTCCAC ACTGCTTATC GTTTCGCCGT TCTTCAAGAA AGCGAGAGAA CCGATGCTTA TTTTAATATA  TGAACGTCGG TCTCAGGTCT ACTCAATTTC CTTGCTCAAT TTTGGAGAAG CTATCGACTA TCAACGTCAA CTGATTCAAA AATTTTGATA CCGACCTTTG TCGACTGGCG ATTTCATGAA  GAAATAATTG AATAATGTTT GTTGGGAACT CTATGATCCC GTCATGATAG GTTCCCATCA GTTTCAGATG CCTCGCTTGA AATGATAACT TGTGCTCAAA CATATCATGA CTCATGAGGC  ATGGGATATC GGAGAAGAGA ATTTCATGGA GAAGAACGAG TTATGGTGTG AGAACTTCAA ATAATCTAAG AATCTTTGAC AAGAATGTTT TCTCTTGCTT CTGTAGTTGG CTACAAAAAT  GAGGAGCTAT GGAGAAGATA TCCTTTGAAG GAGCTATGGA GTAGAGTCTT CCTCCAAAAG TTTGATTGCG TTGTTGCTGT GAGGGAAGAA CCAAAAGATC TACACACTTA AAGTGATTTG  TTGGCATATT TCATTGCTCA TGATGAACGG TTGAAGATAG CTACTTTCAC TGAGGAAAGC ATTTCGTCTA AAGCTTAAGC ATCAAAAGGG AAATGAGAAG AAGAAGAAGA AGAAGGTACA  AAAAATAATC CTCAAAATGC TATAGGCCGT GGACATGATA TTTTTGTGGT AGTGTTTGGG AAGTTTTCGT GGACAAAGAA ATTTAGGTGG TTGTAAATGT GGAAACCATC AATTAGATAG  ATGCTTATAA TGTAGAGGAT GTCAACATGG ACATGAAAGA GGCTTTCAAG GACACAATTT GGTTCAAGGA ATTGAAAGAA AGACGCAAAG ACAGTATGAA AACCATGCAA TGACGCTACT  GCAAAATTAA TGTAAACATT GAAGCTTTTT CCCAACAGAA GGAAAGTAAA CGAGAAAATC CAGCTGAGAC TGACCGAGCT AATATTTTCC TTTCAAAGGA CAAATCCAAG ATTGGATCAT  CGATTGTGCA TGTACCAATC GTATGGCACA TGATAAGTAT TTGACGATAT AGAATACTAG TCAGTCAGAA AAGATGATGA AAATACTGCA CGGATTGAAG GCATCAAAAC TTTTGAGATT  CAGACAAAAT GGGGTATCGA AAAGGAATAA CATGATTCCT ATTATACTGA AAATTTTACT CATAATCATT TGAAATTGGG AAAATTATGA AATGGGGTTG TAAATTCTAT TCTAATGATG  AAAAATGTGT TTTTTGAAGC AAGAATAACA GTATGCCTCT CATCCAAAAG TCGGAGGAAG AATATTTCTA CTTAATATTG CATGTGTTTG AATTTTTATG TTTGTGGATA AGATCAATGA  GTTTATGGTC TTGCCAAAAA AAATATGAAC ATTCATTCAA ACAGTGACTG TCTTTTTAAA GCTATGCATT ACACATCTAT CTGTCTACTT GAGATAAAAT TACAAATTTT TAAGGCACTA  CTTATGAGAT ATTTAGATGA TATCTCGAGT TTCTAAACCT AGGGAAATAT AAATTAAATC TATAAACTCA ATGCATTTAA ATATCTCAAA AAATAAAATA AAATAAAATA ATGCAATTTA  GAGGTATGAT ACGTGTGAAT CAGTCAATTT GCCTTCCTGT TCTGATGCAA TTGGAGAAAA GTGGGTTTAG AAACTTAAGT TAAATCATGA TGGTCGTTTG AAAGCTTACA GTTTATGCTA 
TATTGTGTTT CTCAAATGCA GTGGAAGGTT ATCCACATTG ATGGTAAATC ATATTTAATG TATATTATTT TGATAATATG 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGTTGGA GGCGAGGGGG TGTGCTCTTG GCTCTTCTGC TTGCATTCTG CATGACTCGG CCGCTTGAAG CTCAGCTTAA AGTGGGCTTC TACAAGGCCA CTTGCCCCAA GGCCGAGCTA  ATTGTGAGGG AAGAGGTCGC CAAAGCTTTC AGAAGCGATA ACGGGATTGC GGCAGATTTC GTGCGCATGC ATTTCCATGA CTGCTTTGTG AGGGTAAGCA TCTCGCTAAT CTTCACGACA  GTCGTCGGTT GGGCTTGAAC GAGGTAGACG TCTCAGTTCA CGACTTCACG GTAATAAATC TTCGCATTTA CTGTTTAGGG TTGCGATGGG TCAATCCTCC TCGACTCTAC GCCGGGCAAC  ACGGCGGAGA AGGACTCTCC CATCAACAAC CCTAGCCTGG AAGGCTTCGA CGTCATTGAT AACGCGAAAA TCAGGCTCGA AGCGACCTGC AAAGGCGTAG TCTCGTGCGC CGATATCGTG  GCGTTCGCTT CCAGAGACAG CGTCAGACTG GTATATTCTT GCCCAAGAAA ATTATCGGTC GTGTATTGAT CTGATCTATC TCTTAATGCT TTCTCTGGTT TTATCTTCCG CGTTACACGC  AGAGCAAGGG AATCTACTTT GACGTGCCAT CCGGAAGAAG GGACGGAAGA GTCTCCTTGA GCTCGGAAAC GTTCGCCAAC TTGCCTCCGC CTTCGTTTAA CCTTGACCAG CTCACCCAGA  ATTTCGCCAG GAAGGGCCTT ACACAAGAGG ACTTGGTCAC CCTATCTGGT GCGTATACAT GGGAAATGGC CAACCATGCC TCTAACGAGA CGAGAAGTAA ACTAATAAAC GAACGTGCTA  TTTTTCTTGT TGTTGTTCAA CAGGTGCTCA TTCCATTGGC AAAGCCGACT GCTCCTCGTT CAGCAGCAGG CTCTACAGTT TCAACTCAAC AGTGCAGACG GACCCGAGCC TGGATCCGGT  CTACGCGGCA CAGCTGAAGC AGAAGTGTCC CCCCGGCACC ACGGGCACGA ACGTGCCGAT GGACCCTCCC TCTCCTCTTG CCCTGGATTC CAGCTACTAC AAAGGCCTCA TGGAGAACAA  GGGGCTGTTC ACGTCGGATC AGGCCCTACT GTCCAGTCCC GCCACGGCGA GGCAAGTAAG GGCCAACCGG AACAATAACT TCCTCTTCAG CAAGAACTTC GCGGCGGCGA TGATCAAAAT 
GGGCAACATC GACGTCCTCA CCGGAAGCGC CGGCGAGATC CGCGTCAACT GCAGGGTCGT CAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGTTGGA GGCGAGGGGG TGTGCTCTTG GCTCTTCTGC TTGCATTCTG CATGACTCGG CCGCTTGAAG CTCAGCTTAA AGTGGGCTTC TACAAGGCCA CTTGCCCCAA GGCCGAGCTA  ATTGTGAGGG AAGAGGTCGC CAAAGCTTTC AGAAGCGATA ACGGGATTGC GGCAGATTTC GTGCGCATGC ATTTCCATGA CTGCTTTGTG AGGGGTTGCG ATGGGTCAAT CCTCCTCGAC  TCTACGCCGG GCAACACGGC GGAGAAGGAC TCTCCCATCA ACAACCCTAG CCTGGAAGGC TTCGACGTCA TTGATAACGC GAAAATCAGG CTCGAAGCGA CCTGCAAAGG CGTAGTCTCG  TGCGCCGATA TCGTGGCGTT CGCTTCCAGA GACAGCGTCA GACTGAGCAA GGGAATCTAC TTTGACGTGC CATCCGGAAG AAGGGACGGA AGAGTCTCCT TGAGCTCGGA AACGTTCGCC  AACTTGCCTC CGCCTTCGTT TAACCTTGAC CAGCTCACCC AGAATTTCGC CAGGAAGGGC CTTACACAAG AGGACTTGGT CACCCTATCT GGTGCTCATT CCATTGGCAA AGCCGACTGC  TCCTCGTTCA GCAGCAGGCT CTACAGTTTC AACTCAACAG TGCAGACGGA CCCGAGCCTG GATCCGGTCT ACGCGGCACA GCTGAAGCAG AAGTGTCCCC CCGGCACCAC GGGCACGAAC  GTGCCGATGG ACCCTCCCTC TCCTCTTGCC CTGGATTCCA GCTACTACAA AGGCCTCATG GAGAACAAGG GGCTGTTCAC GTCGGATCAG GCCCTACTGT CCAGTCCCGC CACGGCGAGG  CAAGTAAGGG CCAACCGGAA CAATAACTTC CTCTTCAGCA AGAACTTCGC GGCGGCGATG ATCAAAATGG GCAACATCGA CGTCCTCACC GGAAGCGCCG GCGAGATCCG CGTCAACTGC 
AGGGTCGTCA ACTAA 

Retrieve as FASTA