Entry information : LminPrx06(Lemmin1g0025360.t1)
Entry ID 18804
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx06(Lemmin1g0025360.t1)
Name LminPrx06(Lemmin1g0025360.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx011]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx06
start..stop
S start..stop
LminPrx23 625 0 1..336 1..336
LminPrx05 551 0 1..335 1..324
LminPrx24 541 0 1..335 1..324
CsPrx46 389 1.64e-136 35..335 22..323
Literature and cross-references LminPrx06(Lemmin1g0025360.t1)
Protein sequence: LminPrx06(Lemmin1g0025360.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   336 (315)
PWM (Da):   %s   36045.3 (33852.2)  
PI (pH):   %s   7.88 (7.68) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-336
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRNACFVCVL GQLLFLGSIG AANGNDQRQG PRQGGSGLAL GFYRKTCPSA EQIIREVVWK NTETNPVLPA KLVRMFFHDC FVRGCDGSVL LDSTANSTSE KEAIPNRTLA GFEVIEEAKA  EVEKACPGIV SCSDVLALAT RDSVSFQLKR KAWDVETGRR DGFISLASDT AGNLPGPNQN FSSLLRIFQS KNLSLKDLVV LSGGHTIGVG HCSIINRRLY NFTGNGDADP ALDPAYAALL 
KSQCLPGDTV ATVGMDPGSS DAFDNRYFAA LKQGKGFFTS DAALLTDWRS KRIVDEMLRP FEFLPEFGLS MKKMGAIGVL TGAAGEIRRL CAVVNS 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCAACTTTAA TAGTTGACTT CAGTTCTATT TTATCTTCTT CCTTTCTTCT TTACTTTTGA TGCATTCACT TAAGTCTTGA AACATTAAAA TAAAAAAAAA TATGATCAAA TAAAAGTGGT  TGACCTTAAA GAAGGTCAAA CACACTTAAG ACAAATAATT ATCAATAAAA TGGTTTAAAA TATGGATGTG TGATTTGACA TGCTAATAGA GAAAATCTAT TAATTAAATG ATAACATGTA  TCATAAACAA CATATACTCA CATGTACATT AGACATAAAA GATTATGGCC TTTTACAAGA GAATCTTGCT CTCTCTCTCT CTCTCTCACT ATCTATCTCT CTCTCTCTCT CACCTACGAA  TTCGTGCTCC TGCGCGAGAG CTCCATTCGT GGCCCAAACG TTTGCGACTT TGTCACAGCC ACCTGCAACT TGACAGAGGT CCCAGCTGCC GCACAAAGTC GCCTGCAACC TCTGCGAAGT  GACATTGTCG CTGGAAGGGG AGCGCAAGTG TCGGGAGTTG AATCGACTCG TTAACTCATT GTCGACTCAG CTCCTAATCA CTCGCAGTTG ACTCAAAATC GACTCGATTC CCAAATGAAT  TGAGTCGGCC AACCCTAATA GTAAGAGAAG ACTTAAAAGA AATCACATTA TTGGTTGTCA CATGCGTAGA CGTGGCTTCA CGTAGTCCAT TATAATGCAA TCATGATCTA TGGCCAGGAT  TAAATCCTCG ATCTATTAAC CGCAAAAGAA ACTTAGCAGC ACGCTCCTCC GTTAGATTGA AATCAAATGG TGGGATCAAC CCCATTCATC CCTTTCATCC TCTTTCAAAC CAAAGAATTT  TTGTGTGGTG ACAAGGATGA ACCAGATGAA CCAGATGAAC CAGCTCGATA AGATAACTCG ATGGAGTCAA GTTTTCCGAA CTGCTGGAGA ATTGATGGCC TCTACGGAAC ACGTAAAGAA  GAAAAGGATT AGACAATCAT CTCGCTTTGT TTTCTTGATT CTTTTTCACC TTATAATAGC CATGTAGGAG ACTAGAAGGG AAATGAAAGG TAGCAGAGAA ATTTTGAAAC TCCTGCCGTG  ATGGCCTTTC CTCCCCCCTT CTTTCTCTCC TGCGCTCTTG AAGGCCAGTC CCCTCTTTCT TCCCTCATGA TAATACTCTG TACGCCCTAG CCGGTAAGGA GAAATTAGAC GTGGACTAGA  GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GATTGTGTGT GTGTGTGTAT TCCAACCCTA GAGAGGAATG TTTACAAAAC  TGTCCTTACC GGCTAGGGCG TACAGAGTAT TATCATAGTA TTTCGTCATC AAGTTAGCCG ATTTGAAGTT TTCACGTTCT TTGACAATAT AATATGTCCG AAGGCTAGCG GCTGCGGAAG  AGGGAGGTGG AACTGGGATA AGATCGATGA AGGGGATCGA GCGTCTGGTC TTAATCTACT TGAAAACGTG GGCGATTTAG AACGACGTTG ACTTTCGATG CTTTTAGCGC AGGAACCCGA  GGCGACTGCA AGCTGCCATT ACGAGTTTTC TTAGAATACG GGGGATCCAA GGATTGTTGC GGATGAAATC CTTACATCCA AGGCTGAGAC CTGGTAAATA ATTAGTTCGT GCAGCGTCGT  GATCGCTGGT GACGTCTCTG GATTCGTCGC ATCTGATCGT CTCCGCTCAA CGTCGGCAGC TACTGCACGC GTACTCTCTC TCTGATTTCC CCCTCTCTCT GATTTCCTCT CTCTCTCTCT  CTCTCTGTAC ACGAGCTTGC ATGAGTAGTC ACACGGCGAG ATAATCTTCG TTTGTGTTAC TCGGAGTCAG CATCCCTTCT TGCTGAATCA TCGTTTCAGG TACAAGGATC GAGATAGGGA 
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGACGAAGC CAAAGTCTAT AAGAGGATGG TATGAGACTG AAACAAAAGA GAGAACAAAG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAAGACTGG TACTAGGCCC CTCTAGTCAA CTCCATTATT GTACACGACA GAATGGAGAG GAGAAATAAA GAATAAAAAC ACTAGATTTG GCAAAATTCT GAAGTTCCTG AAGGTGAGAA  AAAGAAGAAA CTCCTCACAC TTGCCCCTCA AGAACAACCC AAAGAACCCC CAGGAACTCA CCCCCATGAA GATCATGTTC TAAGGACTTA GACTCTCTTG GTTCTATTGG ATGCATTCCA  GATGAAGAAA ACTCCTCACA CTTGGCCCTC TGGAACAACC CAAAGAATCC CTAGGAACTC ATCCCGGTGA AGATCATGTT CTAAGGACTT AGACTCTCTT GGTTCTATTG GATGCATTTG  AGAGGAAGAA AATGTCTCAT TAAAGTTTTT GGGCCTTTCT CTCTCCATAC CTAGGTTTGC ATGCACACGG ATCGAGGTGT ATTTAGCTCC CTCATCATGT GAATAGATGA GCTGACCTCT  TCTTTGGTGA GTGCTTTCTT CTTTGGTGAG TTAGTATTTT TTGGGCCATT GTAGGAGTTT CTCTTCATTT TGCCTCCTAT GAAGCACAAG CCTAGGTTAA TCGATAGATC TATACTTGAA  CATCATAAGA TGATGTGCTA AAGGCACTAG AGATGAACTC TATCTGGTTG ATTGTTCTTT TTCTTAAAGG AGAATGACCC ATTGGGTGTA TATGGGTATA AAAGTATACG TAGCGAGAAG  GGATTGACTT CTTTGAAACA ATATCGATTG TAGTGAAGTT AACCACCATT AAGCTTGTCA TCCCTATCGT ATTCATGAAA AATTGGCACA TCTTTCAAAT TGATATTTGG AGGAGGAAGA  AATACAAGGA GGTATGTCCC TGATATGGCA TTCAAGATGA CAATGAGGCC GGAATACAAC TGGTCTGCAA GCTTCACAAA TTAATTTCTA GGCCACAACA ATCATCAATG AAATGGTATT  CAAAGATACT AAATCCTTGG TTGATACTAG TTTTTGCCAA TCAAACTTAG GTCATTCTCT CAAAATTCAT CATCTCTCAT TTCTTTCTTC GTGAAATAGA GGCTTTTAAA GGGCTCTTAA  GTTCTAAGTT CAAGCTCAAG GACCTTGGAT TACTTAAATA TTACCTCTAT CTTGGGCAAG GGATCATTTT GTGTAGCTCA AGGACCTTGA AGACTTTTTC GCATAGTTTT TATACTTCCA  CTAAACTGCC TTCTGCCACA AGTATATTGT CTTGCTTCCC TCTAAGAATA GTTTTTGGAT TATTGACTCT AGGACACCCT TCCATATGTT AGGTTGTAGA TCCTTGTTTT TCGCTTATCC  TCTATTTTAG ACTTTTCCTC CTTATCCATT AAGGATGTAT AATCTTGTCC AATTTTAGGC CGAGGCCCTG TGTTTTTGAG TCCTAACCTT TCCTTGGACC ATTTGCTCTA TGTACTTGAC  TTTCCCATTA ACCTTTTTTG CATTAGTGTC TTTACTGGAG AGATCTCTTC ATCCATCTTA TTTTATATTT TCCTTTATAT TTTTTCTAGG ACTTGTGAAT AGGGAATAGA ATTGGTTTGA  GTCAACAAAA TGGCAAAGGT GCCAATGTAA CTATGGGGGA TGAACTTCCC TCTAGACTCA CCTCTTTTAC TTATACCATA AACTCTTCTT GCCTTTGGCA TTCTCATTTC GATAACCGTG  AAATACCCCA AATTCTATGA GTACCTCTTT ATTTGTTTTA GTATGAGTTT TGTGACTTAG GTAAACAACA GTGTGCTAGC TATCATTGTC TTGTTCTTAT TCATAGTCAT AAATCTTATG  ATCTCCCTCA TTGTGACATT TGGGTCATGG CCTGAATCAC TGACATTTAC ATTGTACAAG ATCTTTCTCC TAACCTTGAT AAGATTTTAC CTCATGTTAT CAAGGGTATC CTTACTATTT 
ATGCTCACAC TCATAAAAGG ATCCTTCTAT ATCTTCATGT GTCTTAAAAA TATATGGTTT CTTCTTATGT CATTTTTTTA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGAATG CCTGCTTCGT CTGCGTGTTG GGCCAGCTAT TGTTCTTGGG AAGCATTGGC GCTGCCAATG GCAACGACCA GAGGCAAGGC CCTCGGCAAG GTGGTTCCGG CCTCGCACTA  GGGTTCTACA GAAAAACGTG CCCTTCGGCA GAGCAGATAA TCAGAGAAGT CGTGTGGAAG AACACCGAGA CCAACCCCGT CTTACCTGCT AAGCTCGTTC GGATGTTCTT CCACGACTGC  TTCGTCAGGG TACAGAATAT AGAACCCTAA TGTGCTCTGC ACTTCATTTT TGTACGCTTA TCTTCCCTCC TTGCAGGGCT GCGACGGCTC AGTTCTTCTG GACTCAACGG CGAACAGCAC  CTCGGAGAAA GAGGCTATCC CCAACAGGAC GCTGGCTGGC TTCGAAGTGA TAGAGGAGGC GAAAGCAGAG GTGGAGAAGG CTTGCCCGGG GATCGTCTCT TGCTCCGACG TACTCGCACT  GGCCACCAGG GACTCCGTCT CCTTCCAGGT ATCAGTCCTC TTCTATATCT GAAACCTTAA ATGAAGTCTG AGTCGTCTTC CTCGTGGCTC AGTTGAAGAG AAAAGCGTGG GATGTGGAGA  CGGGGAGGAG GGACGGGTTT ATCTCGTTGG CCTCGGACAC AGCGGGGAAC CTCCCGGGAC CGAACCAGAA CTTCTCCTCT CTTCTGAGAA TCTTCCAGAG CAAGAATCTT AGCTTGAAGG  ACCTCGTGGT GCTCTCCGGA GGGCACACCA TTGGAGTAGG GCATTGCTCG ATAATCAACA GGAGGCTCTA CAACTTCACC GGAAATGGCG ACGCCGACCC GGCGCTGGAT CCAGCCTACG  CCGCTCTGCT GAAGAGCCAG TGCCTGCCGG GGGACACCGT GGCGACTGTC GGCATGGATC CGGGCAGCAG CGACGCCTTC GATAATCGCT ACTTCGCGGC GCTGAAGCAG GGGAAGGGTT  TCTTCACGTC CGATGCCGCT CTACTGACGG ACTGGAGATC GAAGAGAATC GTGGATGAGA TGCTCCGGCC CTTCGAGTTC TTGCCAGAGT TCGGGCTGTC GATGAAGAAG ATGGGGGCTA 
TCGGGGTTCT CACCGGCGCC GCCGGAGAGA TCCGGAGGCT CTGCGCCGTC GTCAACTCCT AG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGAATG CCTGCTTCGT CTGCGTGTTG GGCCAGCTAT TGTTCTTGGG AAGCATTGGC GCTGCCAATG GCAACGACCA GAGGCAAGGC CCTCGGCAAG GTGGTTCCGG CCTCGCACTA  GGGTTCTACA GAAAAACGTG CCCTTCGGCA GAGCAGATAA TCAGAGAAGT CGTGTGGAAG AACACCGAGA CCAACCCCGT CTTACCTGCT AAGCTCGTTC GGATGTTCTT CCACGACTGC  TTCGTCAGGG GCTGCGACGG CTCAGTTCTT CTGGACTCAA CGGCGAACAG CACCTCGGAG AAAGAGGCTA TCCCCAACAG GACGCTGGCT GGCTTCGAAG TGATAGAGGA GGCGAAAGCA  GAGGTGGAGA AGGCTTGCCC GGGGATCGTC TCTTGCTCCG ACGTACTCGC ACTGGCCACC AGGGACTCCG TCTCCTTCCA GTTGAAGAGA AAAGCGTGGG ATGTGGAGAC GGGGAGGAGG  GACGGGTTTA TCTCGTTGGC CTCGGACACA GCGGGGAACC TCCCGGGACC GAACCAGAAC TTCTCCTCTC TTCTGAGAAT CTTCCAGAGC AAGAATCTTA GCTTGAAGGA CCTCGTGGTG  CTCTCCGGAG GGCACACCAT TGGAGTAGGG CATTGCTCGA TAATCAACAG GAGGCTCTAC AACTTCACCG GAAATGGCGA CGCCGACCCG GCGCTGGATC CAGCCTACGC CGCTCTGCTG  AAGAGCCAGT GCCTGCCGGG GGACACCGTG GCGACTGTCG GCATGGATCC GGGCAGCAGC GACGCCTTCG ATAATCGCTA CTTCGCGGCG CTGAAGCAGG GGAAGGGTTT CTTCACGTCC  GATGCCGCTC TACTGACGGA CTGGAGATCG AAGAGAATCG TGGATGAGAT GCTCCGGCCC TTCGAGTTCT TGCCAGAGTT CGGGCTGTCG ATGAAGAAGA TGGGGGCTAT CGGGGTTCTC 
ACCGGCGCCG CCGGAGAGAT CCGGAGGCTC TGCGCCGTCG TCAACTCCTA G 

Retrieve as FASTA