Entry information : LminPrx23(Lemmin4g0104100.t1)
Entry ID 18821
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx23(Lemmin4g0104100.t1)
Name LminPrx23(Lemmin4g0104100.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx011]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx23
start..stop
S start..stop
LminPrx06 642 0 1..336 1..336
LminPrx05 536 0 1..335 1..324
LminPrx24 521 0 1..335 1..324
EcamPrx176 387 1.71e-135 1..335 1..325
Literature and cross-references LminPrx23(Lemmin4g0104100.t1)
Protein sequence: LminPrx23(Lemmin4g0104100.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   336 (315)
PWM (Da):   %s   35725.19 (33462.0)  
PI (pH):   %s   7.92 (7.68) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:22-336
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRNACLIFML AQLLFLGSIG AANGDDQRQG PPQGGAGLAL GFYRKTCPLA EQIVREVVWK NTGTNPVLPA KLVWMFFHDC FVRGCDGSVL LDSTANSTSE KEAIPNRTLA GFEVIEAAKA  AVEKACPGIV SCSDVLALAT RDSVSFQLKR KAWDVETGRR DGFISLASDT AGNLPGPNQN FSSLLGIFQS KNLSLKDLVV LSGGHTIGVG HCSIINRRLY NFTGNGDADP ALDPVYAALL 
KSQCAPGDAV ATVGMDPGSS DAFDNRYFGA LKQGKGFFTS DAALLTDWRS KRIVDEMLQP FKFLPEFGLS MKKMGAIGVL TGAAGEIRRI CSVVNS 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CACACATATA TATATTTGAT ATATTAAAGG AAACAAGTTT TCTAGATTGC TCACCTATAT CTACACCGAT TGATCCTAAT CATAAACTAA CTAAAGATGA TGAGGCTGAA AGCATAAATG  AAAAATCTTT GCAACGATTA ATAGGTAGAT TAATTTACTA ATCTCATACT CGACCAGATA TTTCAAATTC TGTGAATTGC TTAAGTCAAT TTATGCAATA CTCTAACATT CATCATTTTT  GCAAGCTACT CATTGGATTT TGAGATGTTT AAAGGAACAT TTGGCTTTGG TTTATTTTAT AAATAAGAAT CATTAAAATT ATCTAAATAT ACTGATTCTA ACTATGCTAG CTCTCTCCTT  GATCCAAGAT CAACTACAGG AATATGTTCC TATTTAAGAG AGAATCTCAT TAGTTGGATG AGTAAAAAAC AGAACGTGGT ATCTACATAA AATGCACATG ATGAATTTTG AGCAATTTCA  CAAGGAATCA GAGAACTCTT GTGGATAAAG AAGATTTTAG ATGAATTAAA ATTTTTTATT CTTTTACCTA TTCAATTATT CAGCGATAAC TAGTCTGCCA TTAATATTGC TCATGACCCT  GTTCAGCAAG GGAGGACCAA ACATGTAGAA GTGGACATAC ATTTCATCAA GGAGAAGCTT GACCTCGGCA TTGTCTGCGC TCCCTATATT AAGTCTGAAG ACTAATGTGC AAATATACTC  ACCAAGGGAT TACCAAAGCT TCGATTTCAG GCGTTAAGAA AGCAAGCTTG GGATGAAGAA CCTTCACCCA AGAGCTTGAG GGGGAGTGTC AAATGAAGAG GTTAGTCAAC TTATGTTTTC  ATTAAATAAA AGTTGGTCAT GAGTCTAGGT TAGGAGTCAT TTTATGTTTC GGATTCTAAC TCTCGGTATT AATCGGGTTG GACCCGATTG GGTCCAATAT TACTGGTGCT GAGGTGTATA  AATAAGAGTT TAGGGGGGAG GTTAGGGGCC CATATGAATC AATATACTCC TCAGGGATTT TTTTCCTGTT TTTCTTTCTT CCTCCAGTCT TGCCCTAGGG TTTCGACCAG AAGAGGGGCT  GATCAGAGGA GACTTGGAGG AGATCGTGAG AAGACTGAAA GTCAACGCTA AATCTCACCG ATGGTAATAA TGCCATGTTG GAGACTAGAA GGGAGATGAA AGATAGCAGA GAAATTTTGA  GACTCCTGCG GTGGTGGCCT TTCCCTCCCC CCCACCTCTT TTGTGCCCTC TAACGTGATG GCCTTTCCTC CCCCCTTCTT TCTCCCCTGC GCTCTTCTGC CATGAAGACC ACCCCCCCCT  CTCTTGCTTC TTTCTTCCCT CATTTTTCCC CCTCCTGCGA TATTAGGATG GATCTGATAG AGAGAGAGTA TTCGAACCCT AGAGAGAAAT GTTTACAAAA CTGTCCTTAC CAGCTAGGGC  GTCACCGAGT TACCCGATTT GAAGTTCTCC GTTCTTTGAA GAGGGAGGAG GAACTGGGAT AAGATCGATG AAGGGGATCG AGACTCTGAT CCTAATCTAC ATGAAAACGT GGGCGATTTA  GATCGAGGTC GACTTTCGAT GCTTCAGCGC AGGAACCCAG GGCGATTGCA GGCTGCCATT ACGAGCTTTC TTAGAATACA GAGGATCCAA GGATAGCTAC GGATGAAAAC CTTGTATCGA  AGGCTGCGAC CTTGTAAATA ATTAGCTCGT GCAGCGTCGT GATCGCTCGA GGTCTTGGGA TTCGTCGACT AGCAGGTCGC ATCTGATAGT CTCCGCTCAA AGTCGGCGGC GGTCTACCGC  TTCGGCAGCT GCTGCATGCG CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CCCGATTTCC CTCTCTTCCC GATTCGGAGT CATAATCCCT TCTTGCTGAA TCATCGTTTC ACGGTACAAG GATCGAGATA 
GTGGGGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGACGA AGTCTATAAA AGGAGGAAGG TATGAGACTG AAACAAAAGA GAGAACAGAA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAAGACTGT GACTAGGCCT CTCTTGTCTA CTCCATGATT GTACACCATG GAGAAGAGAA ATAAAGAATA AAAACACTAG ATTCAGCAAA ATTCTTAACT TCATAAATGT GAGAAAAAGA  AGAAACCCCT CACACTTGGC CCTCAAGAAC AACCCAAAGA ACCCCTAGGA ACTCATCCCC ACGAAGATCA TGTACTAAGG ACTTAAACTC TCTTGGTTCT CTTGGATGCA TTTGAATGCA  CATGGATCGA GGAGATGAAT TTAGCTCACT CATCATGTGG ATAGATGAGC TGATCTCTTC TTTGGTGAGT GCTTTCTTCT CTAGCACCAC AAGTATTTTT TGGAGTAAGT ATTTTTTGGG  CCATTGTAAG AGTTTCTCTC CATTTTTCTC TCGATAGATC TACACTTGAA CATCATAAGA TGATGAGCAC CTATATTCAA TCTAGAAGCA TAACAACGAC TTCGTCAAGA TATGGCTTTG  TGGTATCCAT CTCTCAAACG ATATGGTAAA GTTTTTTATA TAACAAATTT CCTTAGTGAC AAATGGGAGG AACTCAAGAT TTGTTCGATA GAAAGGATGA TGCTTAAATC TATCAATTAT  GGACATAATT ATGCATCATT CGCCAAGAAG ATAATTCGGT GAAAAAATAT TTCATCATGC TTAAGATGAC TTACATAGTG CTTTGTTGCC TTATTCTGGC AAAAGAGGAT ACTCAAAAAC  TCACCTCAGT TACTTCATGA CATGATGTTT ATTGTGATAT CCAACAACGA TAAAGTTCAT GACAATAAAT ACCCATCTTG AAACAATTCA AGCTTCTTCA CTCACTACAA GATACTAGGT  CACAAGATGG AATCATATTA CAATCTGCAC TATTATCCAC AATGTTAAAA CCTCATCTAG TCTACGAGGT TATCTCTCCA CCTAACCTTC TAGAGAGTGT ATAATCATCC AAGGATTACA  GCACTGAACA TGTTCATAAT GGAACCAATT GAATCTTCAA TAGTTTTAGC TTCCTTAGAC GGCCAACCAA GATTCTCGGC ACGTTGTTTT TTCTATCCAT ATATTATTCC CCACATAAAT  CTTTATATAC ATATGCATGG ATCTTGGATT CAAGAAAAAC ACGACACATC TGCTCACAGA TAAGTTGCTT CTCTTCTACA ATACTTCCCA TTCCCATTTC ATTGATTATA TTGCTAGATG  GGACTCTATT TGATGTGTCA TTGAGAGGGG AGGTCCATCT TGGCTCTTAT ATGTTTCTTT GAAATGTTTT ATTTGTGCTA GAGATTTGTT TTAATCCGAT GGCTATTACT AACACAACTT  TCTTAACCTT AACAACTTAT TATAAAAAAA ATCATGCTAC TACTCATAGC CAATAAAAAA AAGTTATTGG TGGGGCTGAG AGATGAGACA ACTTGTATGT CTTGAATCCA AGTAAGGATG  TCAATCCTCA TTTACCTATA TATTATCATG TATTATGAGT CCATGTTTCT CCAATGACTT GGCATAATCA AATTCAAACA CCTATCACAC TTTGTATTAG ACACCCTCAG TAACAGACTA  GAGTAGAAAA GTTGTCAACC AATATCTCAA TGTCATGTCT TTCATCTAGA CAAGAAATAT CAGTTGCCTT TTAAGAGCAA TGGGAATGTT ACAAATAGGT TTGAAACCAT GTACATTTTG  ATATGTGGGA ACATGGATTC ATGGATATGT TCTCTCTAAT ATCAATGATT CCACTCTTTT ATATGGAACC ACTTCATGCA TAATATTTAT TAATCTCAAA AAGTAATTTA ACAATTTATA  TTTATGATTT CTACCCGACA TGACAATCAA TAAAACAATT CAGGTCAGTG AATGCTGAAG AACTGAAATT CAGACAATTG TTTGTTGAGG AAGGTATTTT TCATCAATAC TCATGTGATA 
ACTACCCCCC CTCCATATTC ATTGATGAAG TGGAAGAAAC GACATCTATG TATGTGATGA TTGTTTTTTA AAAGATCTAT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGAATG CTTGCCTCAT CTTCATGTTG GCCCAGCTAT TGTTCTTGGG AAGCATTGGC GCTGCCAATG GCGACGACCA GAGGCAAGGC CCACCGCAAG GTGGTGCGGG CCTCGCGCTA  GGGTTCTACA GGAAAACGTG TCCCTTGGCG GAGCAGATAG TAAGAGAAGT CGTGTGGAAG AACACCGGGA CCAACCCCGT CTTGCCGGCG AAGCTCGTTT GGATGTTCTT CCATGACTGC  TTCGTCAGGG TACAGAATAT AGAACCCTAA TGAGCTTTGC ACTCATTTTT TTACGCTTAT CTTCTCTCCT TCAGGGTTGC GACGGCTCAG TTCTTCTGGA CTCAACGGCG AACAGCACCT  CGGAGAAAGA GGCTATCCCC AACAGGACGC TGGCTGGCTT CGAAGTGATA GAGGCGGCGA AGGCAGCGGT GGAGAAGGCT TGCCCAGGTA TAGTCTCTTG CTCCGATGTG CTCGCACTGG  CCACCAGGGA CTCCGTATCC TTCCAGGTAT CAGTCCTCTT CTATATTTGA AACCCTAAAT GTAGTCTGAG TCGTCTTCCT CGTGGCTCAG TTGAAGAGAA AAGCGTGGGA TGTGGAGACG  GGGAGGAGGG ACGGGTTTAT CTCGCTGGCC TCGGACACAG CGGGGAACCT CCCGGGACCG AACCAGAACT TCTCCTCTCT TCTGGGAATC TTCCAGAGCA AGAATCTAAG CTTGAAGGAC  CTCGTGGTGC TCTCCGGAGG GCACACTATT GGAGTAGGGC ATTGCTCGAT AATCAACAGG AGGCTCTACA ACTTCACCGG AAATGGCGAC GCCGACCCGG CGCTGGATCC GGTCTACGCC  GCTCTGCTGA AGAGCCAGTG CGCGCCGGGG GACGCCGTGG CGACGGTCGG CATGGATCCG GGCAGCAGCG ACGCCTTCGA TAATCGCTAC TTCGGGGCGC TGAAGCAGGG GAAGGGCTTC  TTCACGTCCG ATGCTGCTCT ACTGACGGAT TGGAGATCGA AGAGGATCGT GGATGAGATG CTCCAGCCCT TCAAATTCTT GCCGGAGTTC GGACTGTCGA TGAAGAAGAT GGGGGCTATC 
GGGGTTCTCA CCGGCGCCGC CGGGGAGATC CGGAGGATCT GCTCCGTCGT CAACTCCTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGAATG CTTGCCTCAT CTTCATGTTG GCCCAGCTAT TGTTCTTGGG AAGCATTGGC GCTGCCAATG GCGACGACCA GAGGCAAGGC CCACCGCAAG GTGGTGCGGG CCTCGCGCTA  GGGTTCTACA GGAAAACGTG TCCCTTGGCG GAGCAGATAG TAAGAGAAGT CGTGTGGAAG AACACCGGGA CCAACCCCGT CTTGCCGGCG AAGCTCGTTT GGATGTTCTT CCATGACTGC  TTCGTCAGGG GTTGCGACGG CTCAGTTCTT CTGGACTCAA CGGCGAACAG CACCTCGGAG AAAGAGGCTA TCCCCAACAG GACGCTGGCT GGCTTCGAAG TGATAGAGGC GGCGAAGGCA  GCGGTGGAGA AGGCTTGCCC AGGTATAGTC TCTTGCTCCG ATGTGCTCGC ACTGGCCACC AGGGACTCCG TATCCTTCCA GTTGAAGAGA AAAGCGTGGG ATGTGGAGAC GGGGAGGAGG  GACGGGTTTA TCTCGCTGGC CTCGGACACA GCGGGGAACC TCCCGGGACC GAACCAGAAC TTCTCCTCTC TTCTGGGAAT CTTCCAGAGC AAGAATCTAA GCTTGAAGGA CCTCGTGGTG  CTCTCCGGAG GGCACACTAT TGGAGTAGGG CATTGCTCGA TAATCAACAG GAGGCTCTAC AACTTCACCG GAAATGGCGA CGCCGACCCG GCGCTGGATC CGGTCTACGC CGCTCTGCTG  AAGAGCCAGT GCGCGCCGGG GGACGCCGTG GCGACGGTCG GCATGGATCC GGGCAGCAGC GACGCCTTCG ATAATCGCTA CTTCGGGGCG CTGAAGCAGG GGAAGGGCTT CTTCACGTCC  GATGCTGCTC TACTGACGGA TTGGAGATCG AAGAGGATCG TGGATGAGAT GCTCCAGCCC TTCAAATTCT TGCCGGAGTT CGGACTGTCG ATGAAGAAGA TGGGGGCTAT CGGGGTTCTC 
ACCGGCGCCG CCGGGGAGAT CCGGAGGATC TGCTCCGTCG TCAACTCCTA G 

Retrieve as FASTA