Entry information : LminPrx08(Lemmin1g0032090.t1)
Entry ID 18806
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx08(Lemmin1g0032090.t1)
Name LminPrx08(Lemmin1g0032090.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx050]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx08
start..stop
S start..stop
LminPrx09 549 0 1..326 1..326
LminPrx07 498 1.46e-179 1..326 1..325
LminPrx22 486 4.89e-175 1..326 1..325
LminPrx[P]21 470 1.71e-169 68..326 1..260
Literature and cross-references LminPrx08(Lemmin1g0032090.t1)
Protein sequence: LminPrx08(Lemmin1g0032090.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326 (307)
PWM (Da):   %s   35214.84 (33152.8)  
PI (pH):   %s   6.18 (6.04) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-326
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRWIAVAFLM TLTPALCSGN GLRIGFYDET CPSAEELVSE AVAAAFEKDP GVAAGLIRMH NHDCFVRGCD ASVLLKSTKG DAERDARPNL TLRSEAFAVI DAAKAAIEEE CPGIVSCADI  LTFAARDSAA HAGHIFYDVP SGRRDGLVSH ISEVDLPSPF EDAATLIRRF AEKNLTADDL VTLSGAHSIG VAHCGTFRNR IFLNTSTHID PTLSLSYGEL LEAKCTRTPS PTTTVRLDMI 
TADLLDNKYY VGLQNNLGLF TSDHALTTVH ELNEAVDENA KFHGLWVRKF KLAIVKMGAI EVLTGRHGEI RKKCSAINGR HSVDVE 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACTCTAT TTTTTCACAT GCATTTATTT ATTTATTATT CAAAGATTGA CTCTGTGATT TTAGGTCGAG TGAGACGACT CCAAAGTAGT GAGTTAACTT TCCATGTTTT GCCTTTTTAA  CCATAACTCT CTATGTTCAA CCTATTTAAC CATAATTTTA AATTAAACAT AGTAAAAAGT TCAAAATCTA TTGAAATTCA AAAATCAACT CTTCCATGCT AGTTTGTTGA ATTTTGCTAC  CTTTCGTCTC CATTGTTACA CACTACTTTA ATCAATTATG GTTTTCATGA TTAGAATTGA GATTCAAGAT TTATTGAGGT AAAAAGAGTC AACATAAAAA TTAAAGTCAA CACTTCTCTC  AAAATTAACT TTCTCTTGTT TGAACCCTAA TTTCTCACTC CTCTCTCTAT ATTTCATATT TAACTTACAA AATGATGCTC TTACTTTCTG ATTTCCTTGA GAATCAAGAT GCAAAGTGAT  TCTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAATG TTCGAGGATG AATCCGTATG AAGATGACAT GAGAGCTGAC  GTGCCGTGAT GCCAGCCCCA TTATCACCAC TTCTATTGAA ACCTTGATCT AGTAAGACAA ACCAATTACA TATACTAAAA TATATTATAT ACAAGTATTA CAAGTATACA TAGTGAGAGA  CATGGATAGA ATCAACAAAA TTGTAATTGC GTAAATAGAT TTGAGCAAAG AATATAAAGT AAAAATCTTA ATTTTTCACA GGTTCTATAA AAACTATGAA ACAAATGATG CATGTCTACG  AACATCTCAA CATTCATGGT TGTATAAGCT ACACCTGGAC GTTTTAGAAG CACATTTTTT ATCAAATAAT GTAATTTTCA GCTTCGTATT CTTACAAAAT CGTTCTACAA ACTAACATGT  TCGATGTAAT TGTTAAATTA TTTTTATGCC TTGAGATGGT TAATTAAAAT TCCGATGACA AGATGTCAAT AATATGAGTC ATAAAAGTTC AATTTCATGA TTTTTGAAGT GGGTGATATG  TATTTTGTTT GAGTCATGGG TGATTTAATA ACAGGGGAAA TTGAGTTCTT TGCTTAATTA GGTCAGTCAA AGATCTAGGG AAGCACGTGT AAACTAGCGT GTTCATTGTT GACTATTTCT  CGGTCAACTG TCTGAATTTT GCACGGCATA AAGGTTTTAT ATCTATTTAT AGTAGGATTA TGTGGGGTGG GGAAGAAATC GGAAGCATGA GCTTTTTGGG AGGAATGGTC AACTACGGGC  TGAGATCTAT CGTGGTCGAG TTGCGCTCTC TCTCGCTCTC CCTCTCCGTA CACCATCTGT TACAGGAGCG GATAAGAGAG AAGTCTCAAC ATCCAGTAGT TCTTTATGTC CCTTATCTCT  CTAGAGAAGT CAGTCTATTA CAGTATATTT TTAGAAAACA CTTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCGATCGA TCTATTTATC TATCTATATA CCTATCTATC TATCTATCTA  TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTACCTATC TACCTATCTA CCTACCTACC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA  TCTATCTACC TATCTATCAA TACGCCTCGT AAGAGTCGGG CGGTGAGTCC GGGATTACCG GTAAAGTAGA AGTCAAACCC CCCAGGGTCA CTATCTTGAG GGAGAAAGAG ATGAGAGAGA  GAGAGAGGGA GGGAGGGAGG GAGGGAGAGA GAAAGAGAGA GAATTGACGT GGTCTATCGA TAGAGACAGG GTTCACATTG TGTTTGAATC GCGGCGAGAA AACGGTATAA AACGCAAGGG 
AGATACGGAT TGAGCGGATT AGTCTCATAT TTCGTAGAAG TGGCGACAGA ATTGGTGTTA TCCACCGATT TGGCTTCACG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTCTTGGCCT GTCTTCGTTG AAGCAGCTTC CTAGCTCCAC TTGGTTATTG TCTTGGTTTC CCTTTGAATA CTTAGTCTTT GATGGGAAAT GACAAGAAAT AAAGTTGTTC TAATAATTTA  GTATGATTAT ATGAGCTAAA AATTTACACA TTTTAAAATA TTACTTTGAG GCTGTATTAT ATACTCATCT ACTTATTAAA AGTTATTATT AATTTATGTA GATAATTGGC TACTAGGCCC  TTCGAATTGG TACCCTTATT TGATACTCCG AGTGGCGCTC TGATACCATG TGGAAGGTAA AGGGGAGTGC CCGAGAAAGT AAGTGGGATG ATGCCGGAGC CCCCCCACTA TCTAGGTTGG  AATAGCGGTG TTCACATGTA TTGAAGAAAG GCATGACTTA TATAGGAAGT CACACAAGTA AAATAATAGC AAAATATCCA TAGACTATTG AGTTACTAAA ATATCTTTAA AAGTTACAAA  TGAACAAGAC CCTCCTATAC TCTATCAATC CCACCTCAAG CTAGAGAATG GTTATTTTTT CCATCTATAA CTTGGACATG AACATCATAT AAAGTTACAA ATAAAAAAAT AAAGATGGAT  AAGTAGTATA GGCTTATAGA CTAGAACAAT TTGTCAATGC ATGCAAGAGA GGTGAATTTA AGTGGCATTT ACAATTGTGG CGGTGGAAAC TAAAATTTTC AACATACATG ATAACATATA  GTGGCACTTA TGTAGGTCAT GACATAAAGT GGTGCTCGCA GTAGGTGCCC CAATGGGTCC AATGATAGAG TGTCCTAGTG AGCCAAGATG AGAAGACCTA CTAAACCCAA AAAGGGGAAG  CCTTGGTTGA CTCTTAAAGA GTGGACTTGA TGGGCCCAAA AGAGTGGTTC TAGTAGGCCC TAAAGTGCAA GCCCTGATAG ACTCAAAGTA AGCGACCTTG TGGTCCCAAA GCACGCAACC  ATCATATACC CAAAAGAGCT TAACATGGTG GGCCTAAAGT CAGTGACCCT AATGGGCCTG AAGTGAGTAG CCTTTGAGTG GCCCAAGTAG TGGTGTACTG AAGTGGGCCC TATAGGTGAC  CCTAGATGGG CCTAAAATAA GGTGGATAGA ATTAGGCCCA TTAGGTGACC TAGGATGCGC CTAGGACAAG GTGGACTCAA GGGGCCCAAA GTATTCATGA TGTAAGACGT GGGTAGAAAC  CCTAGTACTG ATCACTGGGA GGGCATGCAA CGATAGAGAA GGCTCGAAAG TGAAACCGTA AACTCTAAGT AAGACCTCCT AGGACTCTAT ATGAACTATC CTATGTCCAG GCAGGCGTGC  TGGAAAAGCT GTGCTGGGGC CGAGGCGACC CAGGGAGACT CAAAGTAATG ACAGAAAGAG TCCCTCTCGA TCCACGTCTG GTAAGTGGCG GAATTGTTGT CGTGGCGTAG CCCTAGGCTG  CAGCTCACGA ACTGAGTTGG ATCTCATGAT CGCGTCAGAA ACTCAATCCT AGAATCTGTT CTAGCCTATG TACGTTCATT CGATGGCGCT GACAACGAGA ATAAAAAACA ATTCAAAAAG  TAATTAAACT TTTAAATGGC AGGGAAAACG AAGCTAACTT GCGGGGCAAG CGAGCCTTGT CGGTCGCAAT GATGCGGAGG CTTGGCAATT GATAGGGTGG GTGGCGTCGG GCAGCATAGA  TCCTTGTAGG CGAATCGTTG TTGGCGCGAT GTACGGTGTC GATTGTCGTC GGTGTCGGCA CGTCAAGTGC GAGCTCGACA AGTACGGGCC GCAAGTGGTG GCGTCAGCAC GCTAGGGGCG  TGCACAAATC GGCACGTGGG TGGGTGCTGG TGGGCGGTGC CAAGGGGTGT CGACGCACCC GAGGGGCCTG TGCATGGGTG CATGCGGCGC AAGGGTGCGC GCGGTGTGCC TGACGGTGCA 
TCGGGGCACA CAAGGCAGAC CGGCCTGTGC GGGAAGCATG CAGTACGCAG GGGATGTAAG CGTGTTGGGC GCAAAATAAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGATGGA TTGCGGTGGC CTTTTTGATG ACTTTGACTC CGGCTCTCTG CTCCGGCAAT GGCTTGAGGA TTGGGTTCTA CGATGAAACA TGCCCCTCGG CGGAGGAGCT GGTTAGCGAG  GCTGTTGCCG CCGCCTTTGA AAAAGATCCA GGCGTGGCCG CCGGACTCAT TCGAATGCAC AATCACGACT GCTTTGTCAG GGTAAGTGTT CTTCTTCTTC TTCTTCTTCT TCTTCTTCTT  CTTCTTCTTC TTCTTCTTCT TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TATCTATCTA TCTATCTATC TCTCTGTCTA TGTCTCTCTC TGTCTCTCTG  TCTCTCTGTC TCTCTGTCTC TCTGTCTCTC TCTCTATAAC ACGCTAAATA GGACACATTC TGGTGACATA AACTTCAGGG TTGCGATGCA TCGGTGCTGT TGAAATCCAC CAAGGGAGAC  GCCGAGAGAG ACGCGCGCCC CAACCTAACC CTCCGCTCCG AAGCCTTCGC CGTGATCGAC GCCGCAAAGG CGGCCATCGA GGAAGAGTGC CCGGGCATCG TCTCCTGCGC CGACATCCTC  ACCTTCGCCG CCCGCGACAG CGCCGCCCAC GCCGGCCATA TCTTCTACGA CGTCCCCTCC GGCCGCCGCG ACGGCCTCGT CTCTCACATC TCCGAAGTTG ACCTCCCCTC CCCTTTCGAA  GACGCCGCTA CTCTCATCAG ACGGTTTGCC GAGAAGAATC TCACAGCCGA CGATCTCGTC ACCCTCTCCG GCGCGCACTC CATTGGAGTC GCCCACTGCG GGACCTTCAG GAACCGCATC  TTCCTAAACA CCAGCACGCA TATCGATCCC ACTCTGAGTC TCTCCTACGG CGAGTTGCTG GAGGCGAAGT GTACACGTAC CCCCTCGCCG ACGACGACTG TGAGGCTGGA CATGATCACA  GCAGATCTTC TCGACAACAA GTACTACGTG GGACTCCAGA ATAATCTCGG GCTGTTCACT TCCGACCATG CGCTGACCAC TGTGCATGAA CTTAACGAGG CGGTGGACGA AAATGCCAAG  TTCCACGGGT TGTGGGTGAG GAAGTTCAAG CTTGCAATCG TCAAGATGGG AGCAATCGAG GTGCTGACTG GCCGCCATGG AGAAATCAGG AAGAAGTGCA GCGCCATTAA TGGCCGCCAC 
TCGGTTGATG TGGAGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGATGGA TTGCGGTGGC CTTTTTGATG ACTTTGACTC CGGCTCTCTG CTCCGGCAAT GGCTTGAGGA TTGGGTTCTA CGATGAAACA TGCCCCTCGG CGGAGGAGCT GGTTAGCGAG  GCTGTTGCCG CCGCCTTTGA AAAAGATCCA GGCGTGGCCG CCGGACTCAT TCGAATGCAC AATCACGACT GCTTTGTCAG GGGTTGCGAT GCATCGGTGC TGTTGAAATC CACCAAGGGA  GACGCCGAGA GAGACGCGCG CCCCAACCTA ACCCTCCGCT CCGAAGCCTT CGCCGTGATC GACGCCGCAA AGGCGGCCAT CGAGGAAGAG TGCCCGGGCA TCGTCTCCTG CGCCGACATC  CTCACCTTCG CCGCCCGCGA CAGCGCCGCC CACGCCGGCC ATATCTTCTA CGACGTCCCC TCCGGCCGCC GCGACGGCCT CGTCTCTCAC ATCTCCGAAG TTGACCTCCC CTCCCCTTTC  GAAGACGCCG CTACTCTCAT CAGACGGTTT GCCGAGAAGA ATCTCACAGC CGACGATCTC GTCACCCTCT CCGGCGCGCA CTCCATTGGA GTCGCCCACT GCGGGACCTT CAGGAACCGC  ATCTTCCTAA ACACCAGCAC GCATATCGAT CCCACTCTGA GTCTCTCCTA CGGCGAGTTG CTGGAGGCGA AGTGTACACG TACCCCCTCG CCGACGACGA CTGTGAGGCT GGACATGATC  ACAGCAGATC TTCTCGACAA CAAGTACTAC GTGGGACTCC AGAATAATCT CGGGCTGTTC ACTTCCGACC ATGCGCTGAC CACTGTGCAT GAACTTAACG AGGCGGTGGA CGAAAATGCC  AAGTTCCACG GGTTGTGGGT GAGGAAGTTC AAGCTTGCAA TCGTCAAGAT GGGAGCAATC GAGGTGCTGA CTGGCCGCCA TGGAGAAATC AGGAAGAAGT GCAGCGCCAT TAATGGCCGC 
CACTCGGTTG ATGTGGAGTG A 

Retrieve as FASTA