Entry information : LminPrx40(Lemmin10g0267550.t1)
Entry ID 18838
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx40(Lemmin10g0267550.t1)
Name LminPrx40(Lemmin10g0267550.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx131]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx40
start..stop
S start..stop
LminPrx[P]50 504 0 1..326 1..308
LminPrx76 468 1.78e-167 1..326 1..325
LminPrx69 465 1.96e-166 1..327 1..327
LminPrx67 463 9.79e-166 1..326 1..325
Literature and cross-references LminPrx40(Lemmin10g0267550.t1)
Protein sequence: LminPrx40(Lemmin10g0267550.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (303)
PWM (Da):   %s   35040.76 (32194.3)  
PI (pH):   %s   8.14 (8.39) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-329
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASRSVFWRS LACTIILGVV LEEVDAGGLK IGFYEKTCPW AESVIKKTVA GALVDDPTVA APLLRLHFHD CFVRGCDGSV LLNSTKVNTA EKDAMPNLSL GGFDVIDSAK AVLESMCPGV  VSCADIVAFA ARDGIELTNG PSWEVETGRR DGLVSKASEA VANLPSSFAN INELKGNFAK KGLNAKDLAT LSGAHTIGNS HCRSFSKRLY NFTGKGDRDP SLNPVYAQTL RAQCRQGDDS 
SVVEMDPGSA LTFDNSYYSR VTAGKGLFVS DAALLQDKVT RSAVQQYAKG RSSFFRDFGA AMVKMGRIGV LTGTQGEIRK NCALVNIRQ 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATAGTCAAAA CACGATCATC CATCCCCAAG GTGTCTTTGG TGTCTCAGGT CTAAGGACCA CTTACACGAC CGTGACATGA ATCGACCTGA TTGACAGTTA GGTATAATAC CATTCAGGGA  TTCATACGGA TCAATTCAGT GAACTCTTTC CCCAAAGAGC ACCCACTATC TATCCTTGGT GTCTCGACAC CGATGACCAC ATGATCAGTC ATACTCATCA CATGAGTCAG ATTAGATAGT  GCTATTCTTT CCGGATAATT CGATGTCCCT CTCGAACATC CCTCGAATAG GAATATTTAC AGCATATGTT TAAAGACTAG TGATCTCTGT ATTATGATCT CATCATAATT CACTTAGTCA  TTGCATAAGC TCATGGACTT CATTGCAACT GTCACACTAG AATGGCAATG AATAAAGTTT CATTTCAACG AACGTAAACG AGACATGGAA GTGTAACTTG GCTCATAGGC CATATAATAT  CCAACACAAA TGTGGTATCA TTAAATCATG GGAAGAAAGC ATAAAATCAA TTGTAAGGAT AAAAGATCAA ATAAGAACAA TTAAAACTAA ATTTGGGTCA TTGGATGTGT CTTCAAATAG  GTATTATGAT AGTCCAATTT GACAATGAAC ATTCTTCGGA GAGGAGAGTG AGAGGGGAAC TCCTCCACTT CCATTATCTC TAGCACCACC GCTCTGTCAT GAGACGGCTG ACCAAGATCA  CGTTGATCGA TAAACTATCG AATGGTTGCT CGATCAGGAC CAGTGGGGCC CAATAATCAC CCCAATAATG CTCATCACGG GATAATATTT TGATCTGATC CAATCTTCGA ATCCTGAACT  CTTGACTGGA CTGGTCACAG ACAGATCATC CGGTCGATAA AAGAAAGATG AATCCTAAGT AGGTAGCTCC AAATCAGCAG GTTTGGTCCT CAATGTTGGG CCCAGAAGGA TACCAATTAT  GTACAATGAT TGTGTTGTTG AATGATTCAA GGAGGAGACA AGGAAGAGCT CACGAGAACT TGAACAGGGT GCTTACAAGT CACCCACTCA CACTCAAAAG AATGGAAGAG ATGGAAGGGA  GAACCAAAAT AAAAATAAAA CTACAAGAAT CTTCTTTTAC ATTGCATATT GCCTAGGATG ATTGGACTTT ATAATCTTTA TAGGCTTAAA TTGGACTTGA CGGTCCAATA GGATGATTTC  TTAGTCAACG AGAAAACTAG ACAAGGTGCG TAAAGTTTAA GTCCGTAAGA TAAGAGTCTG GTAAAGTAAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG  AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGGGGGGGGG GGGGGGGGGG GGGGGGGGGG GAGAGAGAGA GATTTATCTT CTTCTGGTGA  TGTGGCAGTC ATTTTCAACA TGTTTTGGGC TTGCAATAGT TCAAGTAGAG ATAGGATGGG TCATCCTTCA TCTTTTGAGA AATTAATGGG ACATCAAAAG AGATTTGGAA CACTATTTTC  TTCTAAGTGA TGGGCAGCAT TTTGTGAGTT TGGTACAAAA TTGATGACAA GGGGAAGAAG GTTGATGAGA TGATGAACAT CACACCCATT TGACCTGAAA ACTGATGTGG GTATTTATCA  GGAAGGCAAA TCAGGCCTGT CACAGTCCGT TCCACTGTCT ACCATCGGTC TCCTAAACGC GCATTGGACT TCTCTCCCTT TATTGTCGGT CATAAGCGCG TGCAGAGCAC AAAGATTATG  AATATTCTTG TATCTCGTCT GCTTCCTGGC GTCTGTTAAC AGAAAACCTT GGGCAGGATT CAACGGGGAG AGAGAAAACC AGAGAAAATT CGAATTCAAA CAAGAAACGT AGAAGGATAA 
GAGCTCAGAT CGCTCGGGAC GCGCATAAAT ATGACTGGTG TTCAACATTC AAAACGGCGG AGAAGGAGAG AGAGAGAGAG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAGAGAGAGA GAGAGACGGG TAGAGAGAGA AAGATAAAAT GCACTGTTAT CCTATATTTT CGAATATCTG ATATAACGTA AAAAATTTAA CATAGAATCA TCAAGATCAG TGCCTGATAC  TCTAATTTTT TTCAATTTCA AAATTGAAAA AAAAATTAGG GCCTTTGTTC ATCTTTTCAA TAGATTTTTT AACTCTGATT AGGGCCTTTG ATTCAGCAAA GTGCATTCTA CAAGTAATGC  TGATGGAGGA AAATTGAGTG GAGAAGACGA ACATAAATTG GGATTCTTGG GATTGAAATC ATTAGTGGTT TGATGATGGA AAAATCAATA GAAAAGATCA ATATATTGTC TGATTCGAAG  TAATTGAAAT GAATTATTAT TTCATTTACA ATTAAGAGGG CATAAAGTAT TTTTTTTAAG ATATCTACTT GATTTCTTAT TTTCGCTTAA TTTTATTGAT CATACATACT ACCAATAGAC  AAGAATTTTA TTCTAGTTTG GGGTTAGTCG CTAGGATAAA TTCCAAGGGT ATATCCACCC TTGGGTTTCA TCACTTATAC GCACTCTGAC CAAGTTATGA TCCTTTGAGG ATTGTGACAA  GGTTGCAAAA ATGTTCTTGT GATCCTCTCC TTGCAACCCA CTCGCTCTCC CAAAGTTGTC TCAATGAGAC CTCACCAGAA GACCTCTGCC CTAACTTCAC CCATGTGCCC GTGTTTGATG  GGGCGCACAG CGATGGGGTG CTCAGCGACG TGGCAGAGGG TACCACAGGC ACGGGGGCAC CTCGTCTCAC GAAAGAAGCG GTCAGCGACT CATCTCCCAC ACCTACCCAT TCGACGCAGT  CGAGTCTCTC GCTGCCCATG GCAGTTGATG GGGACCACGT TGAGAATGTT CGATGGAGAT TCCTCTCCAC ACGAAGACGA ATGAAGCTCA AGCTTGTGGA GGTGTCTCAA TGACAATAAA  AGTAAAACAG ATGAGGAAGA CATACCTGAA GTCGTTGAAG CCATCCATAG GAGAAGCTTA GGAGCAGGAG AAGCTTCAGG GAGCAGTCAT GTGGGTTGAC ATAAGGTGAG AGTGAAGCTT  TAGAGTGATG AGATCTCAAA GAGTCCTCAA TGCATGTGTA ACCCAAGGAT TGCGACCCCT TTATATATAG GTGTCTAATC ACAATTAAGC TCATCATCCA ATTGTGTGAG ACGTGTCTCT  ACACATATAT AACCCCATAC TTTATTGAGA AGTCTTTATC CCCTTAATAA ACTTAATTGA ATCACTTGAT GGGATAAAAT GATAGCAACA TGATGTAAAA CTGCATAATT TGTCCACATA  GGGAAATTAA AACCTAACAG ACCATGGTGA TCCCCCACAG CCGTCCGCTA ACCACCAACG ACATCGAGGG GACCACCCTA TGTATGGCCG TCACTGTAGC TCCAGGAGCC GGCCGCCCAT  AGAGTTCCAG GGGCAGCACC CGCGACAACG CCTATTTCTA CTTTTAGGGA AGTCGGTTCG GTGATCGTGG CCCGCCACCT AACCCTTTTC CTGCTTTCTC TTTCCATTCC TCTCTCCTCC  TCTCTACAAA TATAATATCC CCATCGTCGG AGAGAACTAT AGCATTATTG GGTTGAAGTT TGAGTTCCTG GAAGGAATCG GCTCCTTTGT GATGGCACCC TAGTGAGCAT CCTTACCTCC  GCCTCTCCCC TCCCCGTCTT CTTCTTTCTC TCTCCCCCTC TCCTCCCCTT TGTCCCCCAT CAGTGTCTCA ATAAGATAGT GCATGGAGTC AAAAGATAGT TACCCCGAAA TAAATAGAGT  AATAGTACTC GATGATTGGA GTAGAGTGTG TGGGTGTTGT GAATGATTTC TCTCTTTGTT GATGTTTGGA TGAACTCCTC TTTTTATGTG AGCCTTTGCC TCCTTTAATG GGTTTGCCTT 
AATTTATGGA TATTGAACTC CTTAATGACA TTCAGCTTTA ACATGCCATC TAGATTTCTT ATAAGGCCTA AAACACACAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGTCGA GAAGTGTGTT CTGGAGGTCC TTAGCTTGTA CGATTATACT AGGCGTTGTA TTAGAGGAGG TGGATGCCGG GGGACTGAAA ATCGGATTCT ACGAGAAGAC GTGCCCCTGG  GCGGAGAGCG TCATTAAAAA AACGGTGGCC GGTGCCCTCG TTGACGACCC AACCGTGGCA GCGCCGCTAC TCCGGCTGCA CTTCCACGAC TGCTTTGTCA GGGTAGGCGG AGATAACTTA  GCGCAAAAGA GATAGCTCGA ATTATATGAT TCTTCGTTCT TTCTGATGAA GCAGATAGAG GATATCATGT CATAATTTTT CCCTTTCAGG GCTGTGATGG GTCTGTGCTG CTCAACTCCA  CCAAGGTCAA CACTGCGGAG AAAGACGCCA TGCCCAACTT AAGCCTTGGC GGGTTCGACG TGATCGACTC CGCCAAAGCG GTCTTAGAGT CGATGTGCCC GGGGGTTGTC TCCTGTGCCG  ACATCGTCGC CTTCGCCGCC AGGGATGGAA TCGAACTGGT AATCAATCAA TCCGCAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATATA GATAGATAGA  TAGATAGATA GATAGATAGA TATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA CACATTTCTG ATGCCTTCGC GAATTTTCAG ACCAACGGGC CTAGCTGGGA  AGTTGAGACG GGACGGCGAG ACGGACTCGT TTCCAAGGCC TCCGAGGCCG TCGCCAACTT GCCGTCTTCC TTCGCGAATA TCAACGAGCT GAAAGGAAAC TTCGCAAAGA AGGGCCTCAA  CGCCAAGGAT CTCGCGACAC TCTCAGGTCC GTGCTTTCCC CAACGAGCCC AATAGTCCTC ACAGTACTAA ACTAAACCTG CCGTCGTCTC AGGAGCCCAC ACCATCGGAA ACTCCCACTG  CAGATCTTTC AGCAAGAGAC TCTACAACTT CACAGGAAAG GGCGACAGAG ATCCGTCTCT CAATCCTGTT TACGCCCAGA CACTAAGGGC GCAGTGCAGA CAAGGAGACG ATAGCAGCGT  TGTGGAGATG GATCCGGGAA GCGCTCTGAC CTTCGATAAC AGCTACTACA GCCGCGTGAC CGCCGGAAAG GGTCTCTTCG TCTCCGACGC CGCGCTGCTC CAAGACAAGG TGACCCGGAG  CGCGGTGCAA CAGTACGCCA AGGGCCGCTC CAGCTTTTTC CGCGACTTCG GTGCCGCCAT GGTGAAGATG GGCAGGATAG GCGTCCTTAC CGGAACCCAA GGGGAGATCA GGAAGAACTG 
CGCTTTGGTC AACATAAGAC AATGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGTCGA GAAGTGTGTT CTGGAGGTCC TTAGCTTGTA CGATTATACT AGGCGTTGTA TTAGAGGAGG TGGATGCCGG GGGACTGAAA ATCGGATTCT ACGAGAAGAC GTGCCCCTGG  GCGGAGAGCG TCATTAAAAA AACGGTGGCC GGTGCCCTCG TTGACGACCC AACCGTGGCA GCGCCGCTAC TCCGGCTGCA CTTCCACGAC TGCTTTGTCA GGGGCTGTGA TGGGTCTGTG  CTGCTCAACT CCACCAAGGT CAACACTGCG GAGAAAGACG CCATGCCCAA CTTAAGCCTT GGCGGGTTCG ACGTGATCGA CTCCGCCAAA GCGGTCTTAG AGTCGATGTG CCCGGGGGTT  GTCTCCTGTG CCGACATCGT CGCCTTCGCC GCCAGGGATG GAATCGAACT GACCAACGGG CCTAGCTGGG AAGTTGAGAC GGGACGGCGA GACGGACTCG TTTCCAAGGC CTCCGAGGCC  GTCGCCAACT TGCCGTCTTC CTTCGCGAAT ATCAACGAGC TGAAAGGAAA CTTCGCAAAG AAGGGCCTCA ACGCCAAGGA TCTCGCGACA CTCTCAGGAG CCCACACCAT CGGAAACTCC  CACTGCAGAT CTTTCAGCAA GAGACTCTAC AACTTCACAG GAAAGGGCGA CAGAGATCCG TCTCTCAATC CTGTTTACGC CCAGACACTA AGGGCGCAGT GCAGACAAGG AGACGATAGC  AGCGTTGTGG AGATGGATCC GGGAAGCGCT CTGACCTTCG ATAACAGCTA CTACAGCCGC GTGACCGCCG GAAAGGGTCT CTTCGTCTCC GACGCCGCGC TGCTCCAAGA CAAGGTGACC  CGGAGCGCGG TGCAACAGTA CGCCAAGGGC CGCTCCAGCT TTTTCCGCGA CTTCGGTGCC GCCATGGTGA AGATGGGCAG GATAGGCGTC CTTACCGGAA CCCAAGGGGA GATCAGGAAG 
AACTGCGCTT TGGTCAACAT AAGACAATGA 

Retrieve as FASTA