1. Browse the Database
  2. View Redoxidase
Entry information : LminPrx[P]50(Lemmin19g0454650.t1)
Entry ID 18848
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-06-20 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LminPrx[P]50(Lemmin19g0454650.t1)
Name LminPrx[P]50(Lemmin19g0454650.t1)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx131]*
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx[P]50
start..stop		 S start..stop
LminPrx40 504 0 1..308 1..326
LminPrx69 362 2.73e-126 1..308 1..326
LminPrx76 357 4.33e-124 1..308 1..325
LminPrx66 355 1.46e-123 13..308 13..326
Literature and cross-references LminPrx[P]50(Lemmin19g0454650.t1)
Protein sequence: LminPrx[P]50(Lemmin19g0454650.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   307 (281)
PWM (Da):   %s   32331.14 (29436.7)  
PI (pH):   %s   6.97 (7.63) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-307
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASRSLFWRS LACTIMLSVL LEEADAGGLK VGFYKKTCPW AESVIKKTVA SALVDDPTVA APLLRLHFQD CFVRGCDGSV LLNSTKDNTA EKDAMPNQSL GGFDVIDSAK AVVESMCPGV  VSCADIVAFA ARDGIELTNG PSWEVETGRR DGLVSKASEA VAAFLREYNE LKGERRAQGA TGSSKxxxxI GNQRC*QEQL TGKGDRDGRA DTRTQCRQGD DSSVVEMDPG SALTFDNSYY 
TRVTAGKGLF VSDAALLQDK VTRSVVQQYA KGGSNFFRDF GAAMVKMGRI GVLTGTQGEI RKNCALVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Incorrect prediction from Lemna.org. end of exon 3 and start of exon 4 are missing
Promoter►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGCCAATATC GCAAGTAATC TTTGAATCCC CTAAGTCCAA AACTTTCTTC GATGACTTCC CTCTTTTTGG TGATTTTCCC TTGTGCTTGG CGGTCAAGGG TGAGTGTATT GTGCTCTTAT  ATATTCAAAA GGGTGTACAA AGTAGGGCGT TCTTATATAT TCAAAAGTCC TCTAGTGAGG CAAATAGACT CTTTCTTGCC CTAATCACCT TGCTAAAATG AAATGCCCTG CAGGTGTGCC  CCACGTCATG TGTGCGCCAC GTCGGCCTAG TTGGCTAGCT AGTGTGGTGC CACATGGTAG CGCCACCATG TCATTTAGGA CCAAGGCTGG CTGCAACTTT TTGTCATTTT TAATACAAAA  ACTTTGAAAA TTTGGAAAAA AAATTCTAAA AAAAATCTAG AAAAATCTTA AAACTTAAAA AATTAATAAC TTCAAAAATA TATAAATCAT TAAAACATGA AACTTTAATA TTATTGTCTA  AGGTAAATTA TATTTTAATT GTTGAGGCCT CCAAATCGGA AAAAAAAAGT GTTAAAAACT TAATCAAACA TAGTTTGACT TAAGTCAAAC TCTTGTCTAG TCTACTTTAT TTATTATTTA  TAGCACTCTA GCTGGAAACA TTATAAAACT CAAAATATAA GGTTAATCTA GTGCTTGTTC GACTTGGAAA ACTTAAACAT CAACGATGTT TATAATTAAT CCTAAATGTA TGAAAAATAT  AACTTGAGTG AAATGACATG ATGAATGCGA AAATTCGATA AAATCATGAG AATGTGCGCT AATTCTGTGC AAGCAATGCA TGAAAGTATA TATGAATATT TTTTTATTGT ATATAAATGA  AACATTACCA ATGGTGTGCG TTGAGTGACA TATATAAGCT AAATACAAAA AATATATAAA TAACTCAAAT AATTTTGATA ATCTAATTCA CCTTTTTTCG AAGTTTAGAT CACACGCCCA  TATATTTTTT GAAAGTAAAT CTCAATCATT GAAATATGCA ATTATGGTAA CAAATGTGGT ATTATTTAAT CATGGGAACA GAGCATGGAA CCAATCGTAA GGATGAAAGA TCAAACAAGA  TCAATTAAGT ATGATGGTCC AATTTGACTA TGAAATTCTT TGGACAGAAG GAGAGTGAGA GAGAGAGCCC CTCTGCTTCC ATTATCTCCG GCACCTCTAC CCTGTCGTGA GACGACTGAC  CGAGATCACA CTGTTGGAGA AACTATCAGA TGGTTGCTTG ACCAGGACCA ATAGGGCCAA ATGATCACCA CAATCGTGCT CATCAAGGGA TAATATTTTG ATCTGATCCA ATCCCCAAAG  CCTAAACTCT TGACTGGACT GGTCACAAAC AAATCATCTA GTCAATAAAA GAAAGATGAA TCATATGTTG GTAGCTCCAA ATCAACATGT TTGGTCCTCA ATATTGGGCA CAGAGGGGTA  CCATGATTGT TTTGGGCATA CAATAGGCCA AGTAGAGATA GAATAGGTTT CCTTCATCTT TTGAGAAATG AACGGGACAT CAAAAGAGAT GTGGAAACGT AGATCTCCCC AGCCTCTAGT  AGGGACACTA TTTTGTTCCA AGTGATGGGC AGCAATTTGG GGAAGAAGGT TGATCACACC CATTTGACCT AAAAATTGAT GTGGGTATTT ACCAGCAAGT CAAATCAGGC CTGTCGCAGT  CCGTTCCACT GTCTGCCATC GGTCTCCTCC TAAACGCGCA TTGGACTTAT CTCCCTTAGT GGGTCATAAG CGCGTGGAGA GCACAAAGAT TATGAATATT CTTCTATCTC GTCTCTTTCC  TGGCGTATTT TAACTGAAAA CCTTGGGCAG GATTTCAACG GGGGGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGCAA GAGAAAATTA GAATTCAAAC AAGAAACGTA GAAAGAGGAA TAGCTCAGAT 
CGCTCTGGAC ACGCATAAAT ATGACTGGTG TTCAACATTC AAAAAAACGG TGAAGGAGAG AGAGAGCGAG AGAGAGAGAG 

Retrieve as FASTA  
Terminator +►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTAACACCGG AGCCAACATC GGAAACCAGC GGTGTTAGCA AGAGCAACTC ACAGGAAAGG GCGACAGAGA CGGCCGCGCA GACACAAGAA CGCAGTGCAG ACAAGGAGAC GACAGCAGCG  TTGTAGAGAT GGATCCGGGA AGCGCTCTGA CCTTCGATAA CAGCTACTAC ACCCGCGTGA CCGCCGGAAA GGGTCTCTTC GTCTCCGACG CCGCGCTGCT CCAAGACAAG GTGACCCGGA  GCGTAGTGCA ACAGTACGCC AAGGGTGGCT CCAACTTCTT CCGTGACTTC GGCGCCGCCA TGGTGAAGAT GGGCAGGATA GGGGTCCTTA CCGGAACGCA AGGGGAGATC AGGAAGAACT  GCGCTTTGGT CAACAAATAA TACAAAGAGA GAGAGGGAGA GTGAAGGGTA GAGAGAGAAA GATGAAATGG ATTATTATCC TATATTTTCG GAGATGTGAA ATAATGTAAC AAATTTAACA  TAGAATAATC AAGAACAATA ATGGCAATAA GGTATGTGTT CATCTTTTCA TGAGATTTTT AACTCTGATT AGGGTTTTAA TTCATCAAAA TGCATTTTAT AAGTAATAAT AATGGTGGAA  AATTGAGTAG AGAAGACCAA CATAAATTGG GATTCTCCGG ATTGAAATCA CAAGTAATGG TTTAATGGTG AAAAAATTAA TAGAAAATAT TAATATATTG TGTGGTTCAA AGCAATTCAA  ATAAATTATA GCTTCATTTA TAACTAAGAG GGCATAAATT ATCTGCGTGA TTGTTACTTG CTAGACACAA CATATACAAT ATGACTGTTA AGTCAGTTCA TGCATGGGCC GCAGGAAATA  CATTGGCTTG CTGCCTTACA AGTTTTTTCT TATCTCAAGA ATGTTCCTAG GGGAGGATTC ATACACCAAT GCCATGATAA TCTTTGGTTT GAAGCTTATT TAGATTCTAG CAACGTAGGG  AACATGAGTG ATTAAAAGTC TACACCTAAA TATTGCATGT ACCTCGAGGG AAAGATCGTC TACTTGTGCA CCCAAAAGAA AAAAAAATCC CTTTTTAGTG AAAAAGTAGA GTATTAGACT  ATGGCCAATA TTGCATGTGA GATGATCTTG ATCTGATTTC TACTTTAAGA AATCCACTTC ATTGTATGTG ACTCTATGCC CATGTATTTC GACAACCAAG CCACAATCAT CATCGCAAGC  AATTTGATCT TTCATGAGCA TAGAAAGTAC GTTGAGAGGG ATTGTCATCA CATTCACGAA GAAGTCCACA TGAGCTTGAT TACAACTCCA CATGCCTCGT TGGATCAACT CAATGTCATC  CTCACCATAG GCTTGATCAA TACCTCCTAC GATATCACTT GTCAAAAGTT TGTCATGTTC AACATCCATG CTCCAAACAT GAGGGGGCAT GGGAGTATAT ATGGGCCTAG TGGGCCTAGT  AAGCATTTCC CACTAGGAGT TCCTTATTCC TTACTATAGC TTGTATCTCA CTTTACCTTC TCACCTTCTC ACCTCTTTAA CTTCATGTAA GCCCCCCACC CCTCACTATA CAAGGGGATG  AGGCCCTTCT TGTTTAATTG AACATATTTT GCATCAAGTT TCACAGAGAA TATACATTTA GGGTTTAGAT AGGTTGTGAT GAGCAAAAAA TCACCGTTAG AATTAATGGT TATCAAATAA  TATATTGAGG ACTGATCTCC AACTAAAATA AGAAAATTAG TAGAGTGGAG AGTTTAGGTT GATCCACTAA GAGTCAAGTG AGTGAAAGCA CCCATTTTTT AATAGTTTTA CATGAGTTTA  AAGTGAGGAA AATGACTAAG AATGTAGGAC TGACTCTTTT CTTCTTCTTT TTATATAGTT TTTCTTAGAA TTTTATAAAC CAAGATAATA AAAAAATGCA TATAGTGAGA TTTTAATAAA 
AAAATGTATT TGTAAATATT TGTTTTCTTA CCTTAGTCGC GTCCACCATG TTTCAAGCGC ACTTGGGGGC AAAATCAACG 

Retrieve as FASTA  
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGTCGA GAAGTTTGTT CTGGAGGTCC TTAGCTTGTA CGATTATGCT GAGCGTTCTA TTAGAGGAGG CGGATGCCGG GGGGCTGAAA GTCGGATTCT ACAAGAAGAC GTGCCCCTGG  GCGGAGAGCG TCATTAAAAA AACTGTGGCC AGCGCCCTCG TTGACGACCC AACCGTGGCA GCACCGCTAC TCCGGCTGCA CTTCCAAGAC TGCTTCGTCA GGGTAGGCGG AGAGAAGTTA  GCGGCAGAGG AGATAGCTCG AATTCTGCGA TACTCTGTTT TTTTCTGATG AAAGAGATAG CGGAAATCAC GTTATAATGC TTCGCTTTCA GGGCTGTGAT GGGTCTGTGC TGCTCAACTC  CACCAAGGAC AACACTGCGG AGAAAGACGC CATGCCCAAC CAAAGCCTTG GCGGGTTCGA CGTGATCGAC TCCGCCAAAG CCGTCGTAGA GTCGATGTGC CCGGGGGTTG TCTCCTGTGC  CGACATCGTC GCCTTCGCCG CCAGGGATGG AATCGAACTG GTAATCAATC AATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA  TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TATATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATG GATAGATGGA TAGATGGATA GATGGATAGA  TGGATAGATG GATAGATAGA TAGATAGATA GATAGATAGA TAGATAGATA GACAACATTT CTGATGGCTT CGCGATTTTC AGACCAACGG GCCAAGCTGG GAGGTTGAGA CGGGACGGCG 
AGACGGCCTC GTCTCCAAGG CCTCCGAGGC CGTCGCCGCG TTCCTTCGCG AATATAACGA GCTGAAAGGC GAAAGAAGGG CACAAGGAGC GACAGGGTCA AGCAAATAG 

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGTCGA GAAGTTTGTT CTGGAGGTCC TTAGCTTGTA CGATTATGCT GAGCGTTCTA TTAGAGGAGG CGGATGCCGG GGGGCTGAAA GTCGGATTCT ACAAGAAGAC GTGCCCCTGG  GCGGAGAGCG TCATTAAAAA AACTGTGGCC AGCGCCCTCG TTGACGACCC AACCGTGGCA GCACCGCTAC TCCGGCTGCA CTTCCAAGAC TGCTTCGTCA GGGGCTGTGA TGGGTCTGTG  CTGCTCAACT CCACCAAGGA CAACACTGCG GAGAAAGACG CCATGCCCAA CCAAAGCCTT GGCGGGTTCG ACGTGATCGA CTCCGCCAAA GCCGTCGTAG AGTCGATGTG CCCGGGGGTT  GTCTCCTGTG CCGACATCGT CGCCTTCGCC GCCAGGGATG GAATCGAACT GACCAACGGG CCAAGCTGGG AGGTTGAGAC GGGACGGCGA GACGGCCTCG TCTCCAAGGC CTCCGAGGCC 
GTCGCCGCGT TCCTTCGCGA ATATAACGAG CTGAAAGGCG AAAGAAGGGC ACAAGGAGCG ACAGGGTCAA GCAAATAG 

Retrieve as FASTA