Entry information : LminPrx59(Lemmin25g0565120.t1)
Entry ID 18857
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx59(Lemmin25g0565120.t1)
Name LminPrx59(Lemmin25g0565120.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx014]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx59
start..stop
S start..stop
CescPrx22 412 9.85e-146 18..319 21..326
CescPrx81 412 1.54e-145 18..319 21..326
NtPrx61-1A 364 7.94e-127 5..318 2..320
SpolPrx36 362 3.54e-126 20..319 18..325
Literature and cross-references LminPrx59(Lemmin25g0565120.t1)
Protein sequence: LminPrx59(Lemmin25g0565120.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   319 (298)
PWM (Da):   %s   34430.46 (32330.3)  
PI (pH):   %s   5.72 (5.72) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-319
Sequence
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Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MPFPAILSAV LLLSSLSSCL GQLQVGFYRE SCPRAEDIVR SVVSGAAQSD SAIAAALLRL HFHDCIVDGC EGSVLINLPN GQQENRAFGH QGLRGFNVIE DAKAELEFEC PGVVSCADIV  ALAARDSVVL SNGPFYQVET GRRDGFSSSL PDAANLPDVA DPIDVLLFKF SQKGLSAQDL VLLTAAHTIG TTACFFMTGR LFNFRGTRRP DPSIAPQFLQ NLQRICPPGG NVNVRLGIDS 
GSERSFDINL YANIRSGFAV LQSDAELYRD PRTRDIIDFY IRFPSSFQRD FALAMVKMGR IGVISGFGGQ IRTVCSSFN 

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Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATTGATATTT TCATTTAATT TATTATTGAA AAATGAACAA TGTGGTGATA ATCAAATCAA CATAGACAAT CTTGGAAAAT ATGTGGCCAA CATAGATTAA AGCTATTTAT TTTATTTAAA  TATTTAAACA TCGTGTTATG CACGAGCCGG CCTCATTATG GTTTGATTAT CTCATGTCTC TATCAAGAAT TATGATATGT AATATCACAT TGAGAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGAG  AGAGAGAGAG AGAGTTTAAT GATAGTCATA AATGGCTATT ATTATCCTTA AACGAGCATA GGCCAATTAT TCTCCTCCAT GCAAGAGGAA AATGAACCAG ACATATACGC ACATGAATGG  AGATTGAGAG ATTTAAATGA TACTAATAAA TGGCATAAAC TCGTTCTATT AGTTAAGCTA AGTTAAGTTA TCCGAAGACA ATAATCTTAA ACGAGCATTA TTCTCTTACA TTAGAAAGGG  AGAATGAGCA TGGTAGATAG TTACATGGAT GGATGGACAG AGCGCGAGAA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGACGTTTA ATGACAGAAT  TATAGCTCAA TATTTTGCCA GGCTGGCCCG AGAAGCGCGA TGCGGTCGTC TAGCTCTCCA AGGAAACCAA TCTAGAAGCA CCCTTTATTC TCTCTCTATA ATGGACAGGG TTCACACCTT  GCAAAGCCCA TTGCGGGCGT CCACATCTTG TTTAACTCTC CTGCATATTC AGTGTGCAGA GAGACTGCCG ACTTCGAATA ATTCAAGAAC TGGCTTTCTT TGAGAGCTCA ACGATCTTAT  TTCATCCCCA CCCCTCCAGC CTGGCGCAAA TTCCGCTCTA ATTCTATGGG GCCTCTTTCT CTTTGTTTCC CCGTTTCTCG CTCTCTCTCT CTCTCTCTCA CACACACACA CACAAATATC  TATCTGTCTA TCTATCTATC TATCTCCCTC TATAGAATCT ATCCATCTCC CAGTCTATAG AATCTATCCA TCTATCCGTG TCGGCCGCGG GTTACGTGGC GCTCCGAGAA CTCTGCCGGC  GGCGGTCATC CAGTTCCTTC TCCTTCTCCT CCGCCACAGC TACGCCTCAT TTATGAAGCG GATGGACTGA CCCCGAGAGA GGTTGGAGCT TTTATTACGG CGCGTGGCCG CGGGCCCTTA  GATTTGGAGG AATTGGACCC AGAAGAAGAG GCAAAGGCAT CTTTTCTGTG AGGCCTTTCG TCGAACGAGT GAAGGCTGTG GAGAAGACAG CTCAGACCAC CGGCAGAGTT TCTGTGGTTC  GAGCGCAAAG AGGACCCCCC GTTATTTCTA TTAATTACAG AATAAGTCTA ATATTAGTTT TTTTGCGTTT ATATCCTTAA ATGGTTGAGA ACTTGAGGTG AAGCTATATA GCTTATGATT  CTTTGGGGTT TAGAAAAGAG TTTGCAAAAG TTGTGACTTG TGAGGGCTTT TGGGTAAATT TTGGTGCCGT GGCTCCCGCT CTAGCTTACA GACGACACGG AAAGGAAGCG GGGTGTTCTA  CGACATTTGG AACGCCTTCG TGCTGCCATT AACTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTAGCTTC TAGACGACAC GGAAGGAAAG  AGCGGATTCT ACAAGATACA ACATTTGGAA CACCTTCGCG GTGCCATTAA TTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTGTGT CTCTCTGTGT CTCTCTGTGT CTCTCTGTCT  GTGTCTCTCT CTTCTAACTC TCCATACGCC TGTCTTTGTC TGTCTGTCTG TCTCTCACAA CGCCAGAATC CATCCCGGTA ATGCTCCTAT AAGCAACCCA TCTTCTGACC CCGGCAGGCC 
AATCTCTCGA ACATCCACTG CCTTCCTTCT CAACCTCTCT TTCTCTCTCT ACATTCTCTC TCTATCTCTA TCTCTCTGAC 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GATCCCCAAA TTTATTAAAT AATTACGCGT TGACTCTGTG GTAAATAATA TTTACTCGAG TTTAATCCAT TACGTGGTTA AATATCATTA ACTAATTATT TTATTTGGAT TTTAAATGTT  ACCCAACCAC TTTGACGACT CTGGTCAACG TCTCCCTGAC CCGTTGACTC TAGTTGAAAA GTCAACGTCC GTCTGTGATT AAAAAAACCA ATGGGCCCCA TCGCGAGGAC ACGTGTGGAC  TTCTTGGGTA AAATCTAATT AATAAATTAA AATATATGCT GTCGGTGGGA CCTTTAGAAG GGTATTTTAG ACTTTTCCCA CTGAGCCTCT TTATGTCGGA TCCGACAAGT CCAACTAACA  GGTCAAAATA TTGTTTTTAC AGTTATAGGG AGTAAAAAAA TTGGTGGTTT AGTTTTGGGC CCATTAAGGC CCATTTATAA TCCGCGTCTT TGTCTGTGAC AAGGTTACAT GTGGGCCTGT  GGATTTTTTT GTGGGCCCGT GATAGTGACG GTCCAACAAC GTCTTAAGAC CTCTTTTAAC ACTCCTTCAC TTCATAGACT CTGTTCTTAA CCAATGAGAA GGATTGCTGA TGGGAGTGGG  GCCCACAGAA GTGGCCGAAA ATCGAGGGTG GGCCTGGCTT TCTTTGGGAA TTGAACGTGG GGGGTTAAAT TTGGGTCATA AACTCATAAT TCATTATGTG GCGCCTATAT ATTGGGTGAG  TATTTTGGCC CAATAGGCTA GACTGGGCCC AACCCAGTCA TGGATTGGGC CGGCCAGAAA CTCATGAATC AGGAGTTTCG GGCGGGCAAT TTCCTTGTTT GGGCCAGCGA CATCTAGGGT  TTGGGATAGA ACTATAAATA GTCGCCGACC GACTTTTAAG GCTTCCGGAA GAGGTGTATC GGACTGCGTT CTTCTCTGTC GACTGTGCAA GATGGTACTC CTCCGTCCTC ACAACTCTAC  GTAAATTTCC CGCTGATTTT TCGTGAGTTT TGATCTTTGT TTTGATGCTG TAATCGCCTA AATCTACTTT GTTTTTTTAT TCTGAGTAAT TTTTATCGGA TTTCACTGCT TATCTGTGCG  GCTACTGAGT TTCCTCTACG AAATAGCCAG TTCATTTCTT ATCTTGGCGG CGATGGAATT TTCCGTTCCA TAGATTCGCT GGTAGTCGTC ATCTACATGT CCCCCGAATT ACGATCGACA  CTGAATTCCT CGCTCATAAA TCTCAAAACT TGATGTTAAT CACGTTCATA CTTTATATAA CTCCCTGGTA GCAAATAGAC GAGATTATTG TGGCAATGCT TGATACAGCC AAAGCAAATC  CACGAGATCA AGGATTTTCT CCTGACCGCG AGGAGAAAGG ACGCGCGATC TGTGAAGATA AAGAGGAGCA AGAATGTCGT TAAATTCAAG GTCCGATGTT CAAGGTACCT GTACACGCTC  TGTGTTCTCG ACTCCGAGAA AGCTGACAAG TTGAAGCAAT CTCTCCCACC AGGTAATCCT TCGTCTCTCA TACGGTCTCT AATTTAGTTC ACATTTTCGA ACATATGAAA TTCTAGTACC  CTAACACCAG TTTTGATTTA AAAAACTGTA GAAATTCCCC CTCTCTATCT GTTCTTAAGG ATTCTTCCAT CTTTCAATCA TTCCCACATC TCATTAATGC CCGTATTTTA ATGGTTAATA  TTCTTATAAT CTACCTTTAA ATTCTTTAAA TGATTATGCA ATAATGTTTC TATTCTTTCA ATTCTTGATC ATTTCCTGTT TAAATTCTCC CCCTCTATCT GTTCTCAGCG TTTCTTTCGT  TCTTCAATCA TTCCCGCATC TTATTAGTGC CTAGATTCTT ATGATTCATG TTCTTATAAT CTACCATGCA ATTCTCAAAA TGATCATGCA ATTATGTTTC TGTTCTTTCA TTCCTTGTCC 
ATTTCCTGTA GAAATTTCAC CTCTTTATCT GTTCTTTGGG TTTTATCCAT CCTTCAGTCA TTCTCACATC TCATTAATGC 

Retrieve as FASTA  
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTTTCC CCGCCATTCT CTCTGCCGTT CTCCTGTTAA GCTCTCTCTC CTCCTGCCTT GGCCAGCTCC AGGTGGGCTT CTACAGAGAA TCCTGCCCTC GCGCTGAAGA CATCGTCAGG  TCTGTCGTCT CCGGCGCCGC CCAATCCGAT TCCGCCATAG CCGCCGCTCT CCTCCGCCTC CACTTCCACG ACTGCATCGT CGATGTTCGT CTTATCCCTT TATCTCTCCT CCATCCCTCT  CTCCTTCATC TCTCTATCCT CCATCTTAGT GTTCTGCATG CGAATTTTCA GGGCTGCGAA GGATCCGTTC TCATCAACCT CCCAAACGGG CAGCAAGAAA ACAGGGCTTT TGGGCATCAG  GGACTTCGCG GATTCAACGT AATTGAGGAC GCGAAAGCTG AGCTTGAATT CGAGTGCCCC GGGGTCGTCT CCTGCGCCGA CATTGTCGCT CTCGCCGCCA GAGACTCCGT CGTCCTCGTA  ATTTCTCTCT CTATCTCCAG CTTTCTCTCT CTAGATTCAA ACTGTTGTCT AAGGTGGTGT TCCTTCTGCT AGAGCAATGG GCCGTTCTAC CAAGTGGAAA CCGGCCGCAG AGACGGGTTT  TCTTCCTCTC TCCCCGACGC CGCGAATCTC CCTGACGTTG CAGACCCCAT CGACGTTCTT CTCTTTAAGT TCTCCCAGAA AGGCCTCTCT GCTCAAGACC TCGTCCTTCT CACTGGTCCT  TTCTCTCTCT TTCTCTCTCT AGCTCTCGCT ATCCCCAACG TTGTCCGCCT AGCTCTCTCT CTAAACCTGC ATTATCCTAT TAGAAAGGCC AAGACCTCTC CGGCCCTCTT TCTCCATCTC  TGTCGCCATC TCTAATTTTC TATTTCTAGC CCTCTCTCCA TCTCTCACTC TGCAGTACTC TTATCTAAAA AACCGTTATC CCCAAAACAA CCTCTCTCTC TCTCACTCTC TCTCTAAACC  GACATTAATC TCTTAAAATC CCTCTCTGCC CGAGACCTCC ACTGCTCCTC CGTATCTCTC TCTCTAAATC GACATTAATC TCTTAAAAAT CCTTCTCTGC CCAAGACCTC TTTCTCTCTC  TCTCAACCTG TATCACTCTC TCGAAATTAC CTCTCTAACC CGAGAACCTC GTCCTTCTCA CCGGTCCTCT TTCTATCTCC AACTTCCTCT ATCATTGCCT CCTCTCTCTC TCTCTCTGTG  TCTCTCTCTC ATTTTCTCTC TCTACGTTGC AGCGGCTCAC ACGATAGGAA CAACAGCATG TTTTTTCATG ACGGGGAGGC TCTTCAACTT CCGAGGAACC CGGAGACCCG ACCCTTCCAT  AGCTCCTCAG TTCTTGCAGA ATCTCCAACG CATCTGTCCC CCCGGCGGAA ACGTTAACGT GAGACTCGGG ATCGACAGCG GCAGCGAACG ATCGTTCGAT ATCAATCTCT ACGCCAACAT  ACGGTCAGGA TTCGCCGTCC TCCAATCGGA CGCCGAGCTC TATCGTGATC CGCGGACACG AGATATCATT GACTTTTACA TCCGCTTCCC CAGCAGCTTC CAGCGAGACT TCGCCCTCGC 
CATGGTCAAA ATGGGTCGAA TCGGCGTGAT ATCCGGCTTC GGTGGCCAAA TAAGGACCGT CTGTTCTTCT TTCAATTGA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCCTTTCC CCGCCATTCT CTCTGCCGTT CTCCTGTTAA GCTCTCTCTC CTCCTGCCTT GGCCAGCTCC AGGTGGGCTT CTACAGAGAA TCCTGCCCTC GCGCTGAAGA CATCGTCAGG  TCTGTCGTCT CCGGCGCCGC CCAATCCGAT TCCGCCATAG CCGCCGCTCT CCTCCGCCTC CACTTCCACG ACTGCATCGT CGATGGCTGC GAAGGATCCG TTCTCATCAA CCTCCCAAAC  GGGCAGCAAG AAAACAGGGC TTTTGGGCAT CAGGGACTTC GCGGATTCAA CGTAATTGAG GACGCGAAAG CTGAGCTTGA ATTCGAGTGC CCCGGGGTCG TCTCCTGCGC CGACATTGTC  GCTCTCGCCG CCAGAGACTC CGTCGTCCTC AGCAATGGGC CGTTCTACCA AGTGGAAACC GGCCGCAGAG ACGGGTTTTC TTCCTCTCTC CCCGACGCCG CGAATCTCCC TGACGTTGCA  GACCCCATCG ACGTTCTTCT CTTTAAGTTC TCCCAGAAAG GCCTCTCTGC TCAAGACCTC GTCCTTCTCA CTGCGGCTCA CACGATAGGA ACAACAGCAT GTTTTTTCAT GACGGGGAGG  CTCTTCAACT TCCGAGGAAC CCGGAGACCC GACCCTTCCA TAGCTCCTCA GTTCTTGCAG AATCTCCAAC GCATCTGTCC CCCCGGCGGA AACGTTAACG TGAGACTCGG GATCGACAGC  GGCAGCGAAC GATCGTTCGA TATCAATCTC TACGCCAACA TACGGTCAGG ATTCGCCGTC CTCCAATCGG ACGCCGAGCT CTATCGTGAT CCGCGGACAC GAGATATCAT TGACTTTTAC  ATCCGCTTCC CCAGCAGCTT CCAGCGAGAC TTCGCCCTCG CCATGGTCAA AATGGGTCGA ATCGGCGTGA TATCCGGCTT CGGTGGCCAA ATAAGGACCG TCTGTTCTTC TTTCAATTGA 

Retrieve as FASTA