Entry information : LminPrx80(Lemmin36g0729390.t1)
Entry ID 18878
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx80(Lemmin36g0729390.t1)
Name LminPrx80(Lemmin36g0729390.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx108]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx80
start..stop
S start..stop
LminPrx79 587 0 1..317 1..318
LminPrx100 533 0 1..317 1..318
LminPrx102 483 7.99e-174 5..317 6..319
LminPrx101 480 1.25e-172 1..317 1..319
Literature and cross-references LminPrx80(Lemmin36g0729390.t1)
Protein sequence: LminPrx80(Lemmin36g0729390.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   317 (293)
PWM (Da):   %s   33445.7 (30830.3) Transmb domain:   %s   i7-24o
PI (pH):   %s   5.28 (4.71) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-317
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAKIRSLCPA FILVSLLFMS SVHAQLRADF YSVTCPDLQT IVRGGMQAAV ASDPRLPASM IRLFFHDCFV NGCDASVLLE DSPTFTGEQS AIGNRNIRGM DVVETIKSSV EASCNSTVSC  ADILALATRD GVVLSGGPSW AVPLGRLDAR TASLSAANSN LPGPSSSLST LITIFANQGL NLRDLVALSG AHTFGVARCA AFRNRIYNDA NIDPAFAALR QADCPRSGGD GNLAPLDVLT 
PTAFDNAYYA NLLSRKGLFH SDQELFNNGT ADPIVLSYAS NMAVFFSDFV SAMIDMGNIS PPPGSNVEIR KVCSIVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CGAACAGTAG AGTACATTTC TGAAAAATAC CGCAGGCATA TGGACTACGG CTAACTTTGA ACAGGTGAAC GAGAGCTGTA AAGAACAACT CTGTCAGGAT AGTATAGGTG TACAGAACAA  CGATTCTAAA CGTTGAGCGT TGTTCGAATC ATTTTTAAAA TGGATATATT GTTTCAATCG GGAGATTTGT AGCCAATATT GGGTGGCGGG TTTCCTGTGT TCTTGACAGA TTTCTTCATG  TGCCTCGAAC TGGCTGATGC CCCCAAAAAA AAAACCCTAA AGTCGTATTC GTAGATACCG ACTTTTACGT ACAACATCGA ATGGTTCACG TGATTCTTCT TTGAGCTGTC TGCATCCTGG  ACATGAAATT ATACACAACA TTTTCGTTCG ACGTCAAGCT TTTCTTGGTA TAGCCAATAT CTAATTCGGA ATTATCTACG GTTTGATTTG TGTATATTCC ACCATCTCAC GATTAGGCGG  AGAAATAATC TTCAGTATTT CGTTATCGTG TAATGGAGTA AATCTGCTCT ATTACTCTTC ACTTATCAGT TAATAAAATG ACGATAATGG CGGAGATATT GCGATTTCAG GCATACAGGT  CTAGCTGTTG ACGTTCCAAA AATATGTGAT AATTCCATTA CATAGGATCA TAACCTTAAC TATCTATCTA TCTATTTCTC TCTCCTGCTT TTTGTTGAAA GATCAAATGC CTACATGCGT  ATCCAGGAGC ACCCCTCCGC GCTTTATTGA GTATTAACTG ATGAGGCCGA CTTCTGATCA CTTCATGGAC ATATCCTGAA GGCAGGTCCA ATATGATGAT AATTTATCTT CTTATGCCTC  CGATATTTTT TGTCATAACT TCTCATACTT GCGGGGTTTC CCTCCGCATC GCTCTGCATA CCATTCTGCT TCCATTTGTT TGTCCGTCTG CAAACCCTGT CCACTCGTTC GATTTTCTCT  TCCGAATGAA GCTATGGACC GTCAAGAACC TTTAAGCTTG GGATAAGGTC TACGCGTTAT GGCCCACGAC TTGAGATTTC CGAACGTCCA TTCCATTCCT ACCCCGTCCA GTCTGTCACC  ATGAAGAAGC AGGCGAACCA GGTGAACTTT CCCTTGGTCA ACCAAGACCT GCTTCCGGCC AAGCCTCGCT TGGAAGATTT TTTTGACGGG TTTTGGTCCA AACCCTTTTC ACAGTTAACG  TTGATGGGAA CCGCATTATT TGATTCACAA AGTCAGATTT AAGACTGTCC ATTCTCCTCC TACCTTGTCC AGACCGTCAC TATGGAACGG TCTACTGGTC AGCCAGGACC CTGCTCCCCG  CCAAGCTTCT TGGGTGAAGA ATAACAGCCC AATACCTATG GCCTTGGGAT TTGGGAAGGA TAGTTTCGGT GGGATTTTCC ACCCTTTTAC GCCATTCTGC TATGGGCCCA AAACAAGTGG  GAAAATCAAC ACGATTTCTC TGTTCAAACG AATATCTCCA AAATCCTTGC TGCCGGCTAG TTCAGGGCAT TTTGCAGACG TCGATGGTCC TCGTTTGACC CTATTCCATG ACGTCGTTCT  TCTCCTACAA CCTTCGTCAA ATAGTTGAAG GTTGAAACGG GTAATGACGT AGACGTTTTG GGGGTGAGTC AAGTGATCTT TGGGGAAGTT AATGCAGAAA ATGACTCGCA CCACATCGCA  AGGTAAGAAT CGTCGATGGG GCGATAGTCT CTCTCTCTCT TTCTCTCTCC CCTCTCTCTC TCTCTCTCCC TCCCTCCCTA CAGCCTGGCT CAAAGCGACA CCTGAGACTA TCCACCGTGA  CCCGTCCACC CCCCTGCATC AGGAAAATAC GCAATGACAT GGACTACATT CGCGCTGCCA TCTATTTAAG TCGCCAAAGC CCCCTAACGC TCCATCTCAC CCCACCCGGC CCTCAGTTTC 
AGAGGAAGAG ATCTTGAGAG GGAAAAGGAG AGAGGCCAAA AGCTACTCCG ATCTGAAAAG GCCTCTTTCA TCCCATAGAA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGAGCTGAAC ATATTGCGAT CTGGTTCTGG ATGGAATCAT GGAAGGATAA TCTGAGTAAT GTGAGAAGAA ACCCCAAGAG AGTCTTTCGT TCCGTCAAAT ATAAATACCA TAGTTTGTCA  TCAAATAAAG CCATACCCTG AGAGCTAGTC ACCAACATGC AGCCCATGTC CTCTGCACTG TTGATTGGTT GACTCTTCGT TCATACGTCT TGTTCTATAG ACGATTGCGC AAACGATAAT  GAACAAAATT TCAAAAAAGG GGTAGTCGAT ATGTCTGATA TTCTTCTCTT GGCACTACAT GCATGCCTCC TTATGTCCAT GGTAGATTCC AATTTTCATG GGTCGTAAGT CGAAGAATAG  CCCGCAGGAT AGTCTTCCTT CTGGTTTAAT GCGATAGCAG ATAATAGCAA CCCTATCAAA ATATCAAGAT TCAAAGAGTG ACCGATTATT ATTGTAATGC TGTCAAGAAG GTAGGTGGAT  ATCCCTTTTC TTCAACTGAT CATTAATAGT GCCGACTTTC TCTCTCTCTT TTCAACAGAT TTAGGTTTAG ATAGTTTTTT TTACTATTAC TAAGACAGCT GATCGGTCTA TTCCTTATTA  ATGCATGATT ATCATTTCTG AACCGGCATT TTGGTTCAAT ATATTGCAAT GAACACAATT TTGAAGATGA TGCGTCGTAA TCTTTCAAGA GATATGACTT GAGACAGATC TTGGAGAATA  AACTCCGGAA TATTCGTACG TCGTTCTTCT TCCCATTTAA TATTTGTCTT GGGGGCATGA AATTGATATG CAACTGATCT GATCAGACAA GCTCTCAAAG CACAAGTAGT TTAGGGTGCC  TTTGTTAGTC GATTACACCG CCTTTTTTAA GACACCAGTA GCCTACGAGG AAAAAGAGAT AGAGGCAGAA CTAAGTGGGA AGGTAGACAT GTTAAACTTA GAAACTATGT TCAAATAAAG  TTCTTCCAAA TGTGATTGCT TGTTGGGTCA TTGATTCACG ATAATGATTG GCTTGTCCAA TATTATCCAT GATGGCCTCC TCATAGTTCT TTGTGACCGC TTAACTTTTT ATTGATGGAA  TCATCACATA CCTCGAGGCG CCATGGATGC GGAAGAGCAT GTTCTAGAGA GATTTTGTAT TGTTCGTCAA AGTTCTTCGT GATGATCACC GCAAAACGAG CAAAGCTCAT ATGTAGGGAG  ATCCTCAGGA GAGAGAGCAG GACGCCGATA TTGCTCGATG CCAGTGAAAA CCACAGGAGA AAGGATTTTT AGTAGATGCT CCAAAACCAT CCACAACCTT TAACCTTCTC CCACGCTCCT  TGTTGAGCAT TAAATTGCTT AATTAAATTG AGCGTAAGAA ATGCTCAACA ATATCCCAGT TGACCTATAT TGATACTTTC ATGATCAATA TATGTGAGGA GTAATACAAC CTTTAAAGTG  GCCACTTGAT CGTCACACCT TTCTCAAGTA CTAATCAAGG CAGTAATACA TCTTTAAGAC GTAAGTCCCA ACAATCCAGT AAACACTCTT GATTGATACT AAAATGAAGC ACTTGTGTAG  TATACACAAT AAAATGAACT CTCCATGTCA TGATAATTAA TGGAGTTTAT TTTAACAAAA TAAAACAAGA TTTGAATTGA ACCATAAATC AGAGACACAA CGTGTTATCA CAAATACATC  ACTATCTTAA GGGAAAAAGC TCACTGCACA TAATAATAGG AATTGGCTAA ACCCATATTA AAGACATGTC CACAATAGGT AACGAGTGGC AGTGCCTTAG TAAGTGGGTC AGCTAGCATC  GCATTAGTCC CAATGTGCTC AATAAACGCT AATTTGTCTC TGATCATTTC TTAAACAATC AAGAACTTAA CCTCCATATG CTCGCATGCT CTAGAGGTTT TGTTGTTGTT GGTGAAGAAT 
CAGGCGGAAA CTTCATTGTC ACACTAGATC TGATTGGGTT TCGTGATCTT ATGACTCCCA TATGTGAAAT GAAATTTCAT 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAAAA TCCGAAGTCT GTGTCCAGCC TTCATTCTTG TCTCCCTCCT CTTCATGAGC TCGGTACATG CCCAGCTTAG GGCCGACTTC TACTCGGTCA CATGCCCAGA CCTTCAAACC  ATCGTCCGAG GTGGCATGCA AGCCGCCGTC GCGAGCGACC CGCGATTGCC CGCCTCCATG ATCCGCCTCT TCTTTCACGA CTGCTTCGTC AACGTACGAG CGATCCTTCT TAAGACGAGG  ACGAAATGGG ACCTCTTCAT TCCTCCTGAG AGCTGCTTCT AATTCTTCAG TGCTCCCTGC AGGGCTGCGA CGCGTCGGTT CTCCTCGAGG ATTCACCGAC GTTCACCGGC GAACAGAGCG  CCATCGGCAA CAGGAACATC CGCGGTATGG ACGTCGTCGA GACCATCAAG TCTTCTGTCG AGGCATCGTG CAACAGCACC GTGTCTTGCG CAGACATCTT GGCCCTCGCC ACAAGGGACG  GTGTTGTCTT GGTGAGAGGC TTTGCATGTA TTTTACCCTT TCCTCAAACT CTCTGTCCCC AATCGGGAGG AATAACCTCT GGTTTTTCAA ATGCAGAGCG GAGGGCCTTC ATGGGCCGTG  CCTCTGGGGC GGCTTGACGC GCGGACGGCG AGCCTGAGCG CGGCCAACAG CAACCTCCCC GGGCCATCTT CTAGCCTCTC CACCCTCATC ACCATTTTCG CCAACCAGGG CCTCAATCTG  CGGGACCTCG TCGCCCTCTC CGGCGCGCAC ACCTTTGGAG TCGCTCGCTG CGCCGCCTTC AGGAACCGCA TCTACAACGA CGCCAACATC GACCCCGCCT TCGCCGCTTT GAGGCAGGCC  GACTGCCCGC GGTCGGGCGG CGACGGCAAC TTGGCCCCTC TCGATGTCCT CACCCCGACG GCCTTTGACA ACGCGTACTA CGCGAACCTC CTCTCCAGGA AGGGACTCTT CCACTCCGAC  CAGGAACTCT TCAACAATGG CACCGCCGAC CCCATTGTCC TCAGCTACGC CTCTAACATG GCCGTCTTCT TCAGTGACTT TGTTTCTGCC ATGATCGATA TGGGTAACAT CAGCCCCCCC 
CCTGGATCCA ACGTAGAGAT CAGGAAGGTC TGTAGCATAG TAAACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAAAA TCCGAAGTCT GTGTCCAGCC TTCATTCTTG TCTCCCTCCT CTTCATGAGC TCGGTACATG CCCAGCTTAG GGCCGACTTC TACTCGGTCA CATGCCCAGA CCTTCAAACC  ATCGTCCGAG GTGGCATGCA AGCCGCCGTC GCGAGCGACC CGCGATTGCC CGCCTCCATG ATCCGCCTCT TCTTTCACGA CTGCTTCGTC AACGGCTGCG ACGCGTCGGT TCTCCTCGAG  GATTCACCGA CGTTCACCGG CGAACAGAGC GCCATCGGCA ACAGGAACAT CCGCGGTATG GACGTCGTCG AGACCATCAA GTCTTCTGTC GAGGCATCGT GCAACAGCAC CGTGTCTTGC  GCAGACATCT TGGCCCTCGC CACAAGGGAC GGTGTTGTCT TGAGCGGAGG GCCTTCATGG GCCGTGCCTC TGGGGCGGCT TGACGCGCGG ACGGCGAGCC TGAGCGCGGC CAACAGCAAC  CTCCCCGGGC CATCTTCTAG CCTCTCCACC CTCATCACCA TTTTCGCCAA CCAGGGCCTC AATCTGCGGG ACCTCGTCGC CCTCTCCGGC GCGCACACCT TTGGAGTCGC TCGCTGCGCC  GCCTTCAGGA ACCGCATCTA CAACGACGCC AACATCGACC CCGCCTTCGC CGCTTTGAGG CAGGCCGACT GCCCGCGGTC GGGCGGCGAC GGCAACTTGG CCCCTCTCGA TGTCCTCACC  CCGACGGCCT TTGACAACGC GTACTACGCG AACCTCCTCT CCAGGAAGGG ACTCTTCCAC TCCGACCAGG AACTCTTCAA CAATGGCACC GCCGACCCCA TTGTCCTCAG CTACGCCTCT 
AACATGGCCG TCTTCTTCAG TGACTTTGTT TCTGCCATGA TCGATATGGG TAACATCAGC CCCCCCCCTG GATCCAACGT AGAGATCAGG AAGGTCTGTA GCATAGTAAA CTGA 

Retrieve as FASTA