Entry information : LminPrx100(Lemmin40g0763150.t1)
Entry ID 18898
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx100(Lemmin40g0763150.t1)
Name LminPrx100(Lemmin40g0763150.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx108]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx100
start..stop
S start..stop
LminPrx79 564 0 1..318 1..318
LminPrx80 545 0 1..318 1..317
LminPrx29 503 0 1..318 1..319
LminPrx101 501 0 1..318 1..319
Literature and cross-references LminPrx100(Lemmin40g0763150.t1)
Protein sequence: LminPrx100(Lemmin40g0763150.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   318 (294)
PWM (Da):   %s   33842.74 (31211.3) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   5.66 (5.01) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-318
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAKIRSVSLV FILVAHLFMC SVDAQLREDF YSLTCPNLQT IVQGVMQSAV ASDPRLPASM IRLFFHDCFV NGCDASILLE DTPTFTGEQN AFPNRNSIRG MDVVETIKSS VEASCSNTVS  CADILALATR DGVVLSGGPS WTVPLGRRDA TTASQSAANT NLPGPSSSLS SLIASFANQG LNLRDLVALS GAHTFGVARC AAFRNRIYND ANIDPAFATL RRATCPQSGG DSNLAPLDVL 
TPTAFDNAYY TNLLSRQGLF HSDQELFNNG TADPIVRSYA SSMAVFFSDF VSSMIKMGNI SPLTGSNGEI RKLCSSVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCACGCCG CTAAACGGAT TCTTCTTGGC TTCTCCCTTT CTGCTTGTGG GAGCCAGCGA GAGGATGCCC ACGGGCCCGC CGCGTTGAAA GCCAACATCC TCGAGCTCCC CGTTTCTCGC  GGTGGGAGTG GCATATGGAC CCGCATGTTT AAACTTAGTA GAGCTTTGAT GACTAGGGTA GGTCATTTTG AGTGTCGGGA GTGGCGATCA GACTCGACTC CTGTATTACA GCCAAGTCGG  CGATCGACTC GACGATTGAA CAGGTGAACG AGAGATGTAA AGAACAACTC TGTCAGGATA GTGTACAGAA CAACGATTAT AACCGTTGAG CGTCGTTCGA ATCCTTTTTA AAATGGATAT  ATTGCAACGA TCGGGACATT TGTAACCAAT ATTGGGTGGC GGGTTTCATG TGTTCTTGAC AGATTTCTTC TCTCTCCTAC TTTTTTATGA AGGATCAAAT GCCTACATGC GTATCCATGA  GCACCACTCC TCCGCGCTTA TCACTTCTCG GAAATATCCT GCAGGAAGAT CCACTAAGTT GAAAATTTAT CTTCGCATGT CTGGGATGTA TATTCTCAAA GCTTCTCATG CTTGCGTGGT  TTCCCTCCGC ATTGCTCTGG ATAGCATTCT GCCGCCATTT GTCTGTCTGT CTACATAACC TGTCCTCTCG TTCGATCTTT CCTTCCGAAT GAAGACATGG ACCGTCAAGA AACTTTAAGC  TTAGGATAGA GTCCACACGT TATGGCCCAC ACGTTATGAA CCGTATTATT CGCCTCGCGA CTTCAGATTT CCGAACATGC ATTCCATTCC TGCTCCGTCC AGTCTGTCAC CATGGAGAGG  CAGCTGAACC AGTTGAACTT TCCCTTGGTC AACCAAGACC CTGCTTCCCC GCCAAGCCTC GCGTTGGAAG ATATTTTTGG CGGTCCATTG TCCAAGCTCT TTTCTCATTT ATATTGACGG  GAACCGCTTT ATTTGCTTCA CAAAGTCAGA TTTAAGAGTG TCCATTCCCC TCCTACCTTG TCCAGACCGT CGCCATGCAT GACCAGGGAA CGCTCTCCTG GTCAGCCAAG ACCCTGCCAC  TGGCCAAGCT TCTCGAGGGA AGATGCCAGG CCCTCATGCT CTCGCACCAA CCATTACAGA CGGACGAGAG AGCAACCACT GAAGAGCTTT TTTTTTCTTG TATTCCTTTT TTTTAAAAGA  TAATTGCAGA AGCCTAATAG CTATGGCCTT GGGAAGGATA GCTTCAGTGG GATCTTATCC TCGTAAATGC TGATTTTCGA CCCTCTTACG CCATTCTGCT ATGGACCCAA AACGAGTGGC  AAAATCAACA CGCTTTCTCT GTTCTAACGA ATATCTCCAA ATTGTTGCTG CCGGCTAGAT CAGGGCACTT TGGAGACGTC GACAGTCATC GTTTGACCTT ATTCCTCGAC GTCATTCTTC  TCCTACAACC TTCATCAAGT GGATGAAAGC TGAAACGGGT AATGACGTAG ATGTTTGGGT GGCGGGTCAA GTGATCCTTG GGGTGGTTAA TGCAGAAAAT GACCGTAATA CATCGGAGTC  GTCACTAGGG CGAGGGTGCG TCAGGGCGCG TCAGGGCCGT ATAATGACCA AAAAGTGACG ACAAGCGTTC CACAAAGTTA TCGCAATAGA TATTTTCTAC TTCGCAAATC GGTAACTAGT  CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTTTCT CTCTCTCCGT CCAGCCTGGC TCAAAGCGAC ACCTGAGACT ATTTACCGTG  ACTCGTCAAC CCCTCTGCAT CAGGGGATTA CGCAATGATA TGGACTACAT TCGCGCTGCC GTCTATTTAT GTCCCCAAAC CCCCGTGATG CTCCATCTCA CACCACCCTG CCCTCAGTTT 
CAGAGGAAGG GGTCTTGAAA AGGAGAAGGA GAGAGGCCAA AGGCTACTCC GATCTGAAAA GGCTCTTTCA TCCACTGGAA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGGGCTGAAC AGATCGCGAC CTTGTTCTGG ATGGAAGGAT AATAAACCCC CAGGAGAGTC TTTCGTTCCG TCAAATACAA ATACCGTAGT TTGTCATCAA ATAAGGCCAT ACCCTGAGAG  CTTGTCACCA ACATGCAGCC CATGTCGTCT GCACTGTTGA TTGGTTGACT CTTCGTTCAT ACGTCTTCGT TCAAACGATA ATGAACAAAT TTTCAAAAAA AGGGGGTACT CCATATATCT  GATATTCATA CCTCCTCATG CCCATACGAG ATTTTCATTC TTTACCTGCT GTCGTCCATC TCAAACTCCT CTATATTCTC ATGGGTCATA AGTCAAAGAA CGGCCTGCAG GATAGTCTTC  CTTCTGATTT AATGTGATAG CAGATAATCG CGACCGTATT GAAATATCAA GATTCAAAGA CTGACCGATT ATTAATGTAA TGCTCGCAAG AAGGTAGATG GGTATCCTCT TTCTTCAACT  GATCATTAAT AATGGAGGCT TTCTCTTTCT CTTCGACTGG TCCTTATTAA TGTATGCCTC TCATTTCTGA ACCAGCATTT TAGCTCAGTA TACTGCAATG ATAACAATGT TGAAGACGAT  ACGTCGTAAT CCTTCAAGAG ATATGGCGAG AGAGACGGAA ATCTTGGAGA ATAGAGTCCT GGAATATTCG TTCGCCATTC TTCTTCCCAT TAAATTTTTG TCTTGTGGGC ATGAAATAAG  CTACTGACGA AAGATTGGGA ATAAGAAAAA GTCATAGCAG TGCTAAGGAA CAGTGTTCGC CTTTGCTTTC CTGTAACATT TGTTCACGAA GATCTGTCTC AATGCTCCAC GAGAAGATTG  ATATGCGACT GATCTGGTTG GACAAGCTCT CAAAGCACGC GGGTCAAAAT AGTTTAGGGT GCCTTTGCTT GTGGATTACA CCATCTTTTG TAAGGCACCA GCAGCTTATG AGGAAAAAGA  GATAGAGCCA GAACTAAGTG GGAACGTCGA CATCTTTAAC TTGGAGACTA TGTTGAAACG AAGTTCTTCA AAATGTGGTT GCTCGGTGGG TCAGTGATTC ATCATAACCA TTGGCTTGCC  CAATATTATC CATGATGGCC TCCTCGAAAT TCTTTGCGAT CACTTAACTT TTTCTCTATG GAATCTGAAG GAGATAATCT TAAAATAGTC TTGATTTGAA TAAGTCAGAA GAAGGTGGAG  GGGCGTGGAA GTTTTCTCGC GTTTAAGGTT GTCAAGTCAG TGACCGTATG AAGGGGTAAA AGGGATATTC CGTTAGACTA GGAGTAGTGG ACCAGTAGGG ATTTTAGGTT GGGGAAGTGC  CTATAAATAT GTAAGTATGT TTTCTGTTGA AGGTATGCTG TGTGCATCAA GGTATCCCTC CTCTCTCCAT TGCCTTCTCG CTTGCTCTCC TTCTCCCTTC TCTGCATGAG TTGCTGAAAA  AGAGAGAGAG AGAGAGCTTA TTTCCAACAA TTCGTATCAG AGCTTGTGTT CGTGGGATCT TAGAAGCATG GAGATGACGA GGAGAAGAGT CGAGATTGTG TCAAAGGCGA GCAGAAGGTT  CTGTGTGGAC AGAAATATCG TCAACAGTGG AGTGCCCGGA GTGATGGGTG AGTCGACGAT CTTTCTTTTT TCCCTATGTT CTTCGAGGAT GAACATCCTC GATGCGAAAT GAGGACAATG  TTTGTGGAAG CTCTGGATCT GTTTGAGGAG AAAGAACAAG AGATGGAGGC AGAGAAGCCA AAGCTTGCCA CGGTGGAGAG GACAATGAGA AAGGAGGAAA CTGCACCAAG GGCGGCGCAG  ATGGTGCTTG TGACAATGCA AGAGGCACCG GAGATGGCGT GTCCAGCACT AGAGACGGAT CACAAGACAA TGAAGATCAT GGAGAAGTGA GACATCAGTC GGATCATGGC GATCTGCGAC 
TATGATGATG CAAGCTATGA GATCATGATG TTTGACTTGA GATTGCTAGA CTTTGAGAAC ACAAAGAGGA GGCCAGCGAG 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAAAA TCCGCAGTGT GTCTCTAGTC TTCATTCTTG TCGCCCACCT ATTCATGTGC TCGGTAGACG CCCAGCTTAG GGAAGACTTC TACTCGCTCA CATGCCCAAA CCTTCAAACG  ATCGTCCAAG GTGTCATGCA ATCGGCCGTC GCGAGCGACC CGCGATTGCC CGCCTCCATG ATCCGCCTCT TTTTTCACGA CTGCTTCGTC AACGTAAGAG CGATCCTTCT TATGACCAGG  ACGAAATGGG GCCTCCGTAT TCCTCCAGAG AGCTGCTTCT AATTCTTCAG TGCTCCCTGC AGGGCTGCGA CGCGTCGATT CTCCTTGAGG ATACACCCAC GTTCACCGGC GAACAGAACG  CCTTCCCGAA CAGGAACTCC ATCCGCGGTA TGGACGTTGT CGAGACCATC AAGTCCTCTG TCGAGGCATC GTGCAGCAAC ACCGTGTCTT GTGCAGACAT CTTGGCCCTT GCCACAAGGG  ACGGCGTTGT CTTGGTGAGA GAATTTGCAT GTATTTTACC CTTTCCTCAA ACTAATCGGG AAGAACGACC TCTTGTTTTT CAAATACAGA GCGGAGGGCC TTCATGGACG GTGCCCCTGG  GGAGGCGTGA CGCGACGACG GCGAGCCAGA GCGCGGCCAA CACCAACCTC CCCGGGCCAT CTTCCAGCCT CTCCAGCCTC ATCGCCAGCT TCGCCAACCA GGGTCTCAAT CTGCGGGACC  TCGTTGCCCT CTCCGGCGCG CACACCTTCG GAGTCGCTCG CTGCGCCGCC TTCAGGAACC GCATCTACAA CGACGCCAAC ATCGATCCCG CCTTCGCAAC TTTGAGGCGG GCAACCTGCC  CGCAGTCGGG CGGCGACAGC AACTTGGCCC CTCTCGATGT CCTCACCCCG ACGGCCTTTG ACAACGCCTA CTACACGAAC CTCCTCTCCA GGCAGGGACT CTTCCACTCC GACCAGGAAC  TCTTCAACAA TGGCACCGCC GACCCCATTG TCCGCAGCTA TGCCTCTAGC ATGGCCGTCT TCTTCAGTGA CTTTGTTTCT TCAATGATCA AGATGGGCAA CATCAGCCCC CTCACTGGAT 
CCAACGGAGA GATCAGGAAG CTCTGTAGCA GCGTAAACTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAAAA TCCGCAGTGT GTCTCTAGTC TTCATTCTTG TCGCCCACCT ATTCATGTGC TCGGTAGACG CCCAGCTTAG GGAAGACTTC TACTCGCTCA CATGCCCAAA CCTTCAAACG  ATCGTCCAAG GTGTCATGCA ATCGGCCGTC GCGAGCGACC CGCGATTGCC CGCCTCCATG ATCCGCCTCT TTTTTCACGA CTGCTTCGTC AACGGCTGCG ACGCGTCGAT TCTCCTTGAG  GATACACCCA CGTTCACCGG CGAACAGAAC GCCTTCCCGA ACAGGAACTC CATCCGCGGT ATGGACGTTG TCGAGACCAT CAAGTCCTCT GTCGAGGCAT CGTGCAGCAA CACCGTGTCT  TGTGCAGACA TCTTGGCCCT TGCCACAAGG GACGGCGTTG TCTTGAGCGG AGGGCCTTCA TGGACGGTGC CCCTGGGGAG GCGTGACGCG ACGACGGCGA GCCAGAGCGC GGCCAACACC  AACCTCCCCG GGCCATCTTC CAGCCTCTCC AGCCTCATCG CCAGCTTCGC CAACCAGGGT CTCAATCTGC GGGACCTCGT TGCCCTCTCC GGCGCGCACA CCTTCGGAGT CGCTCGCTGC  GCCGCCTTCA GGAACCGCAT CTACAACGAC GCCAACATCG ATCCCGCCTT CGCAACTTTG AGGCGGGCAA CCTGCCCGCA GTCGGGCGGC GACAGCAACT TGGCCCCTCT CGATGTCCTC  ACCCCGACGG CCTTTGACAA CGCCTACTAC ACGAACCTCC TCTCCAGGCA GGGACTCTTC CACTCCGACC AGGAACTCTT CAACAATGGC ACCGCCGACC CCATTGTCCG CAGCTATGCC 
TCTAGCATGG CCGTCTTCTT CAGTGACTTT GTTTCTTCAA TGATCAAGAT GGGCAACATC AGCCCCCTCA CTGGATCCAA CGGAGAGATC AGGAAGCTCT GTAGCAGCGT AAACTGA 

Retrieve as FASTA