Entry information : LminPrx92(Lemmin39g0758710.t1)
Entry ID 18890
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx92(Lemmin39g0758710.t1)
Name LminPrx92(Lemmin39g0758710.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx165]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx92
start..stop
S start..stop
LminPrx96 671 0 1..325 1..325
LminPrx62 600 0 1..323 1..323
LminPrx64 589 0 1..325 1..325
LminPrx63 589 0 1..325 1..325
Literature and cross-references LminPrx92(Lemmin39g0758710.t1)
Protein sequence: LminPrx92(Lemmin39g0758710.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   325 (301)
PWM (Da):   %s   34769.12 (32395.9)  
PI (pH):   %s   6.04 (6.04) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-325
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSSATWGCCV VLLLTLQVAS PAAASHSLKM GFYEKSCPQA EHIVREAVGK AVAANAGIGA GLIRLHFHDC FVRGCDASVL LEGDDSERMH PANLNSLRGF EVLDEAKAAL ESQCPNTVSC  ADVLAFAARD AAEFTGGIYY EVPAGRRDGR VSIKSDADVL PSFTADAQTL RDAFDKKGLS LKDMVALSGA HSLGISHCSS FSNRLYSFNA THSQDPSMDA HLADYLKSRC PFPGTERNTV 
PLDAATPNLL DVQYYRNLKK GKGLLTSDQT LWASSLTADT VESFSKKPNL WAENYGEAMV RMGAIDVLTG NEGEIRVKCS VVNCS 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAATCGAAG AAGTGATCTT TGTCAAGCAA CTTGAAGGCT TTGTCAAAAG AGGAGAAGAA GACAAGGTCT ACAGACTGAA GAAGGCATTG TATGGTTTAA AGCAGGCTCC ACGAGCATGG  TACAGTAAGC TTGACAAGAG TTTCAAAAAT TTGGGCTTTG TGAGAAGCAA TTTTGAGCCG GCTGTGTATA TGAAACACTT GCAACATACA ATTATTTTGG TGGGTGTCTA TGTGGATGAC  CTTCTAATCA CCGGCTCCAC AGTGGAGATA ATTGAAGAAT TCAAGGGCAA GATGAAGTCC TTGTTCGAGA TGTCTGATTT GGGTCTTTTG ACCTCTTATT TGGGAATTCA GGTGCATCAG  TCTAGTGACG AGATAGTACT GTCTCAAAGG ACTTTTGGAC TGAAACTTCT CAAACAATTC AGCATGCTCG ACTGCAATTT GTCTCTAACA CCCCTGGAAG TGAGACTTTA TTTTGAGAAA  GAAGGTGCAA GCCCAGTGGA TGCTACTGTA TACAGAAGTA TACTTGGATC TCTCAGGTAC CTCACTCATA CTCGTCCTGA TTTGTTGTTC TGTGTGGGAC TTCTCAGCCG TTATATGGAG  AATCCCACAG TTGAGCATAT GAAATGTGCT AAAAGGGTGT TGAGATATGT GAAGGGTACT TTGGATTATG GATTGAGGTA CATAAAGGTG AAAGATTTTG TTTTGTCTGG TTATTCTGAC  ATCGATTGTG CAGGAGATCC AATAGATGGG AGAAGTACAT TTGGCACTAT GTTCTTCCTC GGAGGAAATT TGATTACCTG GATGTCTAAG AAGCAAAGAT GTGTAGCTTT GTCTTCTTGT  GAAGCTGAGT ATGTGGCTCT CACACTAGCT TCATGTCAGG CAGTGTGGCT CAGCAATTTG ATTGGTGAAA TGTTGAAGTG TGTGATGAAG CCAACGAAGA TTCTTGTGGA TAATAAATCG  GCAATTGAAT TGGCCAAAAA TCCTGCATTT CACAGCAAGT CGAAGCATGT GAAAATCAAA TTTCACTATG TGAGAATGTG TCTTGAAGAG AGAGATTATG ATCGAGCATA TCCCCACGGA  GAAGCAAAAG GCCAACTTTC TTACGAAGTC ATTGGGACGT GTTAAGTTCC AAGAAATGCG AGATATGGCA GGTATTTGTG ATGTTAGAGA TCTGCTGCGA GTTTAAAGGG GAGATTGTTG  GGATTAAAGC TCGCAGAAGA GTGAATCAGG CGGAGATTCA CCGGACTGAA GCTCGATTTG GGATTTTTTT TCTCTTATGT TTTTCAGGTT TTAATCATGG CCGTCCATCC GTAGGTTATA  ACGATGGAGA TTAAATTGTG GAGATAGCGT GGATGATGAG CTCTGATTGG TCCAGCAGGA AGACGGTTGG AGTCTCTCTC CTCTTGGCAA GAACCGGCTA CTTACGGCAT GGTGTTCGAC  CTATGCCTAT AAAAACGGGT TATGGGACCC ATGTGTCACT ACTGAACATT TTCTGTGATT TGTCTTGATT CTTGAATTGA AGTTCTCGGA GGTTTCCATT GTCAATCTCG TCCTCTCTTC  CTCTTCTTGA TTTCTACACG TTCTTCATGA CCCTGACAAC AATCAGCGTT GGCCTCCATG AACTAGACGC CGGGTGAACA GCTCTAGAAA TATCAAATAT CAATTGGAGA GAGAGAGGAG  AGATGTAGAA ATATCAAATG CTCCCGCCCA CTTCATTTTT TTTCGCCTGC CCGGTCAAGA AAAGAAGGCG GCGATTAGAA CAGGTCAGTT TCTTATCGCC TGTCCGGTTC AATAATTCTG  GTTGTTGGAG CCCCTATTGA ACGAGTCACG TACGTCTATT ATTCCTGGAT CCTCCATAAA TAAGGGCCAT GCAATAGGGG GACTCCTCAT CTCACAGCTC CCACCTCTCC GAGCTCATCC 
AACCTCTATC AACTCCATCT CCTCGGCCAT CATTCTTCTC GAGCGACAGC AGAAATAGGC TTGGGAAGGA ACGTGGACCA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGCTCCCTTG GATCCTCCAT TAATGCTAAC TAAATTCCAA TAAATGCATG AATATCTTCC TGAAATTTGC TGTGTGAGAG AACTCTGTGG ATTGCGGCTG CTGCTTCGAG AGAACTCTGT  GGATGCCGCC AAATCGTTCT CCGTCGAACT AGCATATGAT CGTCAGTCAA ACGAGGTTCA AATTTTTCAG ATATTATTTA TTTTTATCGG AGATTTTATG TGAATTATTT CTAAATGTTA  CAATAAAAAA ATGATAGATT ATGTTACAAA TTTTTATTTT CTGCATTTAT TATTGTTGTA GGAAATAATC TTGATATCAA GTTTGATGAT CTCAGCAAGA GATTGGGAAA ACAGCCCACC  TAAGAGACTT AGGCGACTTG ATCAGATCTA TCATGAGTCA GAACAGATTC ATCTAGATCC CAAAGTGTGT ATGCTGAAGC AGGAAGAACC TGCAAATTTT TCTCAAGCTG TCAAAGAAGA  GATTTGGAGG ATCTCAATGC AAGAGGAGAT AGATGCCATT GACAGAAACA AGACATGGGA TCTGGTGAGT CCTCCATAAG AAACAATTGT AAACCCATTA GTTTGAAGTG GGTTTTCAAG  GTACAGAAAA ATTCTAGAGG TGACATCGTG CGACATAAGG CAAGGCTAGG GAAGGGTGGA CGGGACGCGA CGCGATTTTC GTCCCGGGAC GGGAACCCCG TCCCGTCCAC CCCCTGGATG  ACCCAGCCTG GGATGGCTGG ATGCTCGTCC CGAATGCCCC AATAAGCCTG TAAATTTTAA TGGGCTAATA TTGTTAACTT TTTATGATTT TAAAATGTTT AAAATTATAT TTTAATAGGT  TTCTAAAAAC TAAAAGTCAT AAAAATGTAG AATGAAGGAA GAAATATTCT GTTAATCAGA ATAAATTATA AAAATTTATG AAGATTTAGT ATATGGTGTT ATACTCAACA AAAGATTTAT  ATATATATAA AGATATAGAT GACTGAAAAA TAATATTAGC TTACAGTTTG AATAAAATAT AATTTACATT TTAAAATTTA TAAAATATTT CTATAATTAC GAAATAATTA AAATATAAAA  CCTAAAAAAT ATGGAAAATA TTATGAAGAC ATCACTTTTC CTTTAACCAT ATTGTCTAAA AACATGAGTT CATTTAAAAC CAGACAAAAA TTCAGACGGA AACCATAAAA ATGCATTCCA  TTAAGTATGT GCTTCGAGAT CCTCTATTCA TCTAGAACAT TGTTTGGTAT ACGTCAGAGT AGGCCCACTA GGCCCATCGT GCTCATCTTG CCTATTAACT TCTCTCACCT CGTGTCACTT  CAAGATGAGA GGATTTGATT GGCTAAAAGG AGGTTAAGAA AGAATGTAAA GATGTTGGAG AGAAAGATAT GGAGATAGCT CGAAGGGAAA AAGCTTAGAG AGGAAGATAG GGAGATAGCT  CGAAGGGAAA AGCTTAGAGA GGAAGATAGG GAGATAGATC GAAGGGAAAA AGCTTAGAGA GATAGAGAGA GAGACACCAG AAGAGAGAGG TTTTGAGGGA GAACGAGGAG GAAGGACTTA  GAGAGCGATT GAAAAAGAGG CGAAAGATAG TCGAGAAGGT CTAGGAAAGA TACTGAGAAG AAAAGTAGAT AAGAAGCAGA TAGAAGAGGG TTGAGAGGAG AGATCGAGAA AGGAGAATGA  GAGATTGTGA AAGAGGTTTT AGATAGATAG TCAGGCAGAT GAATGGAAGA GAGAAGAAAG GGGACTGAGG GAGAAAAATA GATATAAGGA GAACGTGAGA GAGGGAGAAT AGAAGATGGG  AAGAAGATGA TTAAAAGAGC AAGAAAAATA GGAGGATGAG ATCAAGAGAT AGAAAGAGAA AAGAAGAGGT TGGGAGAGAG ACTTGGAGAG AAGGGTTTGA GAGAGAGGTG AGAAGGGAGA 
GAATACCTTA CTAGGAGATT GGTGGAGTGT CACTCTCAAT CTCGATCCTT GCTCAGCATT CTGGCGAGTG TAGCCAATAG 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGTCGG CTACGTGGGG ATGCTGCGTC GTGCTCCTGC TGACCCTCCA GGTCGCTTCT CCTGCGGCCG CCTCTCATTC TCTGAAGATG GGCTTCTACG AGAAGAGCTG CCCCCAGGCT  GAGCACATCG TTAGAGAAGC CGTGGGCAAA GCCGTTGCGG CCAACGCAGG GATAGGCGCA GGACTCATCA GGCTGCACTT CCACGACTGC TTCGTCAGGG TAACCTACTC ATCCCCAAAG  CTCCTCCTGG CTCACCCCAA AATCCACCAT TTGAGCATAT TCCCATTTCG GACGATCAAG CAATGAATGG CTGGGCTAGA GATATCTGAG TATTAATAAA TGGTGTTGCG CTGAAAGCAG  GGCTGTGATG CTTCGGTTCT CCTGGAGGGC GACGACTCTG AGAGAATGCA CCCTGCCAAC TTGAACAGCC TGCGGGGTTT CGAGGTGCTC GACGAGGCTA AGGCTGCGCT GGAATCTCAG  TGCCCCAACA CCGTTTCCTG CGCCGACGTC CTGGCCTTCG CCGCCCGCGA TGCCGCCGAG TTCACCGGCG GCATCTACTA CGAGGTCCCG GCAGGGAGAC GCGACGGCAG GGTATCGATC  AAATCCGACG CGGACGTTCT TCCCAGTTTC ACCGCCGATG CCCAGACGCT ACGCGACGCC TTTGATAAGA AAGGTCTGTC GCTGAAAGAC ATGGTGGCGC TCTCCGGCGC CCACTCTCTC  GGCATTTCCC ATTGCTCGTC CTTCTCCAAC AGGCTCTACA GCTTCAACGC CACCCACTCG CAGGATCCCT CCATGGACGC CCACCTCGCA GACTACCTCA AGAGCCGCTG TCCGTTTCCA  GGGACCGAGC GCAACACCGT ACCGCTTGAC GCGGCCACTC CAAATCTCCT CGACGTCCAA TATTACAGAA ACCTCAAGAA AGGAAAGGGA CTGCTCACCT CCGACCAGAC GCTCTGGGCC  AGCTCTCTCA CCGCGGATAC GGTGGAGTCC TTCTCCAAGA AGCCCAACCT TTGGGCCGAG AACTACGGCG AAGCCATGGT GAGGATGGGC GCCATTGACG TCTTGACCGG AAACGAGGGC 
GAGATAAGGG TCAAATGCTC GGTTGTGAAT TGCAGCTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGTCGG CTACGTGGGG ATGCTGCGTC GTGCTCCTGC TGACCCTCCA GGTCGCTTCT CCTGCGGCCG CCTCTCATTC TCTGAAGATG GGCTTCTACG AGAAGAGCTG CCCCCAGGCT  GAGCACATCG TTAGAGAAGC CGTGGGCAAA GCCGTTGCGG CCAACGCAGG GATAGGCGCA GGACTCATCA GGCTGCACTT CCACGACTGC TTCGTCAGGG GCTGTGATGC TTCGGTTCTC  CTGGAGGGCG ACGACTCTGA GAGAATGCAC CCTGCCAACT TGAACAGCCT GCGGGGTTTC GAGGTGCTCG ACGAGGCTAA GGCTGCGCTG GAATCTCAGT GCCCCAACAC CGTTTCCTGC  GCCGACGTCC TGGCCTTCGC CGCCCGCGAT GCCGCCGAGT TCACCGGCGG CATCTACTAC GAGGTCCCGG CAGGGAGACG CGACGGCAGG GTATCGATCA AATCCGACGC GGACGTTCTT  CCCAGTTTCA CCGCCGATGC CCAGACGCTA CGCGACGCCT TTGATAAGAA AGGTCTGTCG CTGAAAGACA TGGTGGCGCT CTCCGGCGCC CACTCTCTCG GCATTTCCCA TTGCTCGTCC  TTCTCCAACA GGCTCTACAG CTTCAACGCC ACCCACTCGC AGGATCCCTC CATGGACGCC CACCTCGCAG ACTACCTCAA GAGCCGCTGT CCGTTTCCAG GGACCGAGCG CAACACCGTA  CCGCTTGACG CGGCCACTCC AAATCTCCTC GACGTCCAAT ATTACAGAAA CCTCAAGAAA GGAAAGGGAC TGCTCACCTC CGACCAGACG CTCTGGGCCA GCTCTCTCAC CGCGGATACG  GTGGAGTCCT TCTCCAAGAA GCCCAACCTT TGGGCCGAGA ACTACGGCGA AGCCATGGTG AGGATGGGCG CCATTGACGT CTTGACCGGA AACGAGGGCG AGATAAGGGT CAAATGCTCG 
GTTGTGAATT GCAGCTGA 

Retrieve as FASTA