Entry information : LminPrx96(Lemmin39g0758960.t1)
Entry ID 18894
Creation 2023-06-12 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-06-13 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: LminPrx96(Lemmin39g0758960.t1)
Name LminPrx96(Lemmin39g0758960.t1)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx165]
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Monocotyledons
Organism Lemna minor    [TaxId: 4472 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value LminPrx96
start..stop
S start..stop
LminPrx92 671 0 1..325 1..325
LminPrx62 598 0 1..323 1..323
LminPrx64 587 0 1..325 1..325
LminPrx63 587 0 1..325 1..325
Literature and cross-references LminPrx96(Lemmin39g0758960.t1)
Protein sequence: LminPrx96(Lemmin39g0758960.t1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   325 (301)
PWM (Da):   %s   34796.13 (32422.9) Transmb domain:   %s   o404-426i
PI (pH):   %s   6.04 (6.04) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-325
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSSATWGCCV VLLLTLQVAS PAAASHSLKM GFYEKNCPQA EHIVREAVGK AVAANAGIGA GLIRLHFHDC FVRGCDASVL LEGDDSERMH PANLNSLRGF EVLDEAKAAL ESQCPNTVSC  ADVLAFAARD AAEFTGGIYY EVPAGRRDGR VSIKSDADVL PSFTADAQTL RDAFDKKGLS LKDMVALSGA HSLGISHCSS FSNRLYSFNA THSQDPSMDA HLADYLKSRC PFPGTERNTV 
PLDAATPNLL DVQYYRNLKK GKGLLTSDQT LWASSLTADT VESFSKKPNL WAENYGEAMV RMGAIDVLTG NEGEIRVKCS VVNCS 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAATCGAAG AAGTGATCTT TGTCAAGCAA CTTGAAGGCT TTGTCAAAAG AGGAGAAGAA GACAAGGTCT ACAGACTGAA GAAGGCATTG TATGGTTTAA AGCAGGCTCC ACGAGCATGG  TACAGTAAGC TTGACAAGAG TTTCAAAAAT TTGGGCTTTG TGAGAAGCAA TTTTGAGCCG GCTGTGTATA TGAAACACTT GCAACATACA ATTATTTTGG TGGGTGTCTA TGTGGATGAC  CTTCTAATCA CCGGCTCCAC AGTGGAGATA ATTGAAGAAT TCAAGGGCAA GATGAAGTCC TTGTTCGAGA TGTCTGATTT GGGTCTTTTG ACCTATTATT TGGGAATTCA GGTGCATCAG  TCTAGTGACG AGATAGTACT GTCTCAAAGG ACTTTTGGAC TGAAACTTCT CAAACAATTC AGCATGCTCG ACTGCAATTT GTCTCTGACA CCCCTGGAAG TGAGACTTTA TTTTGAGAAA  GAAGGTGCAA GCCCAGTGGA TGCTACTGTA TACAGAAGTA TACTTGGATC TCTCAGGTAC CTCACTCATA CTCGTCCTGA TTTGTTGTTC TGTGTGGGAC TTCTCAGCCG TTATATGGAG  AATCCCACAG TTGAGCATAT GAAATGTGCT AAAAGGGTGT TGAGATATGT GAAGGGTACT TTGGATTATG GATTGAGGTA CATAAAGGTG AAAGATTTTG TTTTGTCTGG TTATTCTGAC  ATCGATTGTG CAGGAGATCC AATAGATGGG AGAAGTACAT TTGGCACTAT GTTCTTCCTC GGAGGAAATT TGATTACCTG GATGTCTAAG AAGCAAAGAT GTGTAGCTTT GTCTTCTTGT  GAAGCTGAGT ATGTGGCTCT CACACTAGCT TCATGTCAGG CAGTGTGGCT CAGCAATTTG ATTGGTGAAA TGTTGAAGTG TGTGATGAAG CCAACGAAGA TTCTTGTGGA TAATAAATCG  GCAATTGAAT TGGCCAAAAA TCCTGCATTT CACAGCAAGT CGAAGCATGT GAAAATCAAA TTTCACTATG TGAGAATGTG TCTTGAAGAG AGAGATTATG ATCGAGCATA TCCCCACGGA  GAAGCAAAAG GCCAACTTTC TTACGAAGTC ATTGGGACGT GTTAAGTTCC AAGAAATGCG AGATATGGCA GGTATTTGTG ATGTTAGAGA TCTGCTGCGA GTTTAAAGGG GAGATTGTTG  GGATTAAAGC TCGCAGAAGA GTGAATCAGG CGGAGATTCA CCGGACTGAA GCTCGATTTG GGATTTTTTT TCTCTTATGT TTTTCAGGTT TTAATCATGG CCGTCCATCC GTAGGTTATA  ACGATGGAGA TTAAATTGTG GAGATAGCGT GGATGATGAG CTCTGATTGG TCCAGCAGGA AGACGGTTGG AGTCTCTCTC CTCTTGGCAA GAACCGGCTA CTTACGGCAT GGTGTTCGAC  CTATGCCTAT AAAAACGGGT TATGGGACCC ATGTGTCACT ACTGAACATT TTCTGTGATT TGTCTTGATT CTTGAATTGA AGTTCTCGGA GGTTTCCATC GTCAATCTCG TCCTCTCTTC  CTCTTCTTGA TTTCTACACG TTCTTCATGA CCCTGACAAC AATCAGCGTT GGCCTCCATG AACTAGACGC CGGGTGAACA GCTCTAGAAA TATCAAATAT CAATTGGAGA GAGAGAGGAG  AGATGTAGAA ATATCAAATG CTCCCGCCCA CTTCATTTTT TTTCGCCTGC CCGGTCAAGA AAAGAAGGCG GCGATTAGAA CAGGTCAGTT TCTTATCGCC TGTCCGGTTC AATAATTCTG  GTTGTTGGAG CCCCTATTGA ACGAGTCACG TACGTCTATT ATTCCTGGAT CCTCCATAAA TAAGGGCCAT GCAATAGGGG GACTCCTCAT CTCACAGCTC CCACCTCTCC GAGCTCATCC 
AACCTCTATC AACTCCATCT CCTCGGCCAT CATTCTTCTC GAGCGACAGC AGAAATAGGC TTGGGAAGGA ACGTGGACCA 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGCTCCCTTG GATCCTCCAT TAATGCTAAC TAAATTCCAA TAAATGCATG AATATCTTCC TGAAATTTCC TGTGTGAGAA AACTCTATGG ATTGCGGCTG CTGCTTTGAG AGAACTCTGT  GGATGCCGCC AAATCGTTCT CCGTCGAACT AGCATATGAT CGTCAGTCAA ACGAGGTTCA AATTTTTCAG ATATTATTTA TTTTTATCGG AGATTTTATG TGAATTATTT CTAAATGTTA  CAATAAAAAA TGATATATTA TGTTACAAAT TTTTATTTTC TGCATTTATT ATTGTTGTAG GAAATAATCT TGATATAGAG TTTGATGATC TCAGCAAGAG ATTGGGAAAA CAGCCCACCT  AGGAAGACTT GATCAGATCT ACCATGAGTC AGAACAGATT CATCTAGATC CCAAAAAGTG TATGCTGATG CATGAAGAAC CTGCAAAATT TTCTCAAGCT GTCAAAGAAG AGATTTGGAG  GATCTAAATG AAAGAGGAGA TCGATGCCAT TGACAGAAAC AAGACATGGG ATCTGGTGAG TCCTCCATCA GAAACAATTG TAAACCCATT AGTTTGAAGT GGGTTTTCAG AGTACAGAAA  AATTCTAGAG GTCATGTGGT GCGACATAAG GCAAGGCTAG GGAAGGGTGG ACGGGACGGT ACGCGATTTT CGTCCCGGGA CGGGAACCCC GTCCCGTCCA CCCCTGGATG ACGCAGACTG  GACGCCTGGG ACGGCTGGAT GCTCGTCCCG GACGCCCCAA TAAGCCCGTA AATTTTAATG GGCTAATATT GTTAACTTTT TATGCTTTTA AAACGTTGAA AATTATATTT TAATAGGTTT  CTAAAAAATA AAAGTCATAA AAATGTAGAA TGAAGGAAGA AATATTATGT AAATCAGAAT AAATTATAAA AATTTATTAA GATTTAGTAT ATGGTGTCAT ACTCAACATA AGATTTATAT  ATATATATAT ATATAAAGAT ATAGATGACT GAAAAATAAT ATTAGCTTAC AGTTTGAATA AAATATAATT TAAATTATAA AATTTATAAC ACATTTATAT AATTACAAAA TTATTAAAAT  ATAAAACCTA AAAAATATGG ATAATATTAT GAACACATCA CTTTTCCTTT AACCATATTG TCTAAAAACA TGAGTTCATT TAAAACCAAA TAAAAAATTC AGATGGAAAC CATAAAAATA  ATCCAAAAAC ATGAGTTCAT TCAAAACATG ACTCAACGTC GTCTCATCGA CCGAACATTT AAAACAACAA TAAAAATTGA ACAATATTCA TGAAAACCTA AAATCAACAT TCACCATCAA  TGTATTGCTC TTCTTCCGCG TCATCCTCGT CATCACTTTC ATTCTCTTCA GATCGGAACC AACACTTCAA CGTCATTAGT ATCTTGATGC TCTCTGCATT TAATCTTGAC CTCTTATATG  TCACAATCCC GCGACCTGCA GAAAAAAAAC GCTCAGAGGG GGCGCTTGAA GCACAAATTG CCAAGAACTC CTTTGCAATC TTTGCCAACT TCAAATAGTA GCATTGACCC AATCGCCTCC  ACCAGTTCAA AGGTTGATCT TCGTCTTCAA TACCTGGAGA ATTCAAGTAG GCATCGAGTT CTTGAGTAGG ATTTGCCTTG GCCACCTGTT CTCGACGAGG CCTATAAATT TGAACAGCTT  TGGACATGAA GTTTCTAGTG GATACTTCTA TTATTGTAGA GGTACTACTA GTTGGTTCAG TCGTGTCGTT GTTGTTCCCT GCAGCAATTA AAAGGCCACG AACATAATCT AATACATGTT  GACAATATGA TGTATCGATA AGTACAAGCT TCATAGATGG ATCGAACATC GCCGCAATTG CGAAAGGTTT GTTGCGCTTG AGCTTTGTCT CATATTTTGC TAGCTTCTAC TTCATTGCCT 
CACAACAGTA AAAATAATAT ATCCCTGGAG CTTTGTAATG ACCTCATCGA GGTGCAGAAA AAGTGTAGTA ACACATGAAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGTCGG CTACGTGGGG ATGCTGCGTC GTGCTCCTGC TGACCCTCCA GGTCGCTTCT CCTGCGGCCG CCTCTCATTC TCTGAAGATG GGCTTCTACG AGAAGAACTG CCCCCAGGCT  GAGCACATCG TTAGAGAAGC CGTGGGCAAA GCCGTTGCGG CCAACGCAGG GATAGGCGCA GGACTCATCA GGCTGCACTT CCACGACTGC TTCGTCAGGG TAACCTACTC ATCCCCAAAG  CTCCTCCTGG CTCACCCCAA AATCCACCAT TTGAGCATAT TCCCATTTCG GACGATCAAG CAATGAATGG CTGGGCTAGA GATATCTGAG TATTAATAAA TGGTGTTGCG CTGAAAGCAG  GGCTGTGATG CTTCGGTTCT CCTGGAGGGC GACGACTCTG AGAGAATGCA CCCTGCCAAC TTGAACAGCC TGCGGGGTTT CGAGGTGCTC GACGAGGCTA AGGCTGCGCT GGAATCTCAG  TGCCCCAACA CCGTTTCCTG CGCCGACGTC CTGGCCTTCG CCGCCCGCGA TGCCGCCGAG TTCACCGGCG GCATCTACTA CGAGGTCCCG GCAGGGAGAC GCGACGGCAG GGTATCGATC  AAATCCGACG CGGACGTTCT TCCCAGTTTC ACCGCCGATG CCCAGACGCT ACGCGACGCC TTTGATAAGA AAGGTCTGTC GCTGAAAGAC ATGGTGGCGC TCTCCGGCGC CCACTCTCTC  GGCATTTCCC ATTGCTCGTC CTTCTCCAAC AGGCTCTACA GCTTCAACGC CACCCACTCG CAGGATCCCT CCATGGACGC CCACCTCGCA GACTACCTCA AGAGCCGCTG TCCGTTTCCA  GGGACCGAGC GCAACACCGT ACCGCTTGAC GCGGCCACTC CAAATCTCCT CGACGTCCAA TATTACAGAA ACCTCAAGAA AGGAAAGGGA CTGCTCACCT CCGACCAGAC GCTCTGGGCC  AGCTCTCTCA CCGCGGATAC GGTGGAGTCC TTCTCCAAGA AGCCCAACCT TTGGGCCGAG AACTACGGCG AAGCCATGGT GAGGATGGGC GCCATTGACG TCCTGACCGG AAACGAGGGC 
GAGATAAGGG TCAAATGCTC GGTTGTGAAT TGCAGCTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCGTCGG CTACGTGGGG ATGCTGCGTC GTGCTCCTGC TGACCCTCCA GGTCGCTTCT CCTGCGGCCG CCTCTCATTC TCTGAAGATG GGCTTCTACG AGAAGAACTG CCCCCAGGCT  GAGCACATCG TTAGAGAAGC CGTGGGCAAA GCCGTTGCGG CCAACGCAGG GATAGGCGCA GGACTCATCA GGCTGCACTT CCACGACTGC TTCGTCAGGG GCTGTGATGC TTCGGTTCTC  CTGGAGGGCG ACGACTCTGA GAGAATGCAC CCTGCCAACT TGAACAGCCT GCGGGGTTTC GAGGTGCTCG ACGAGGCTAA GGCTGCGCTG GAATCTCAGT GCCCCAACAC CGTTTCCTGC  GCCGACGTCC TGGCCTTCGC CGCCCGCGAT GCCGCCGAGT TCACCGGCGG CATCTACTAC GAGGTCCCGG CAGGGAGACG CGACGGCAGG GTATCGATCA AATCCGACGC GGACGTTCTT  CCCAGTTTCA CCGCCGATGC CCAGACGCTA CGCGACGCCT TTGATAAGAA AGGTCTGTCG CTGAAAGACA TGGTGGCGCT CTCCGGCGCC CACTCTCTCG GCATTTCCCA TTGCTCGTCC  TTCTCCAACA GGCTCTACAG CTTCAACGCC ACCCACTCGC AGGATCCCTC CATGGACGCC CACCTCGCAG ACTACCTCAA GAGCCGCTGT CCGTTTCCAG GGACCGAGCG CAACACCGTA  CCGCTTGACG CGGCCACTCC AAATCTCCTC GACGTCCAAT ATTACAGAAA CCTCAAGAAA GGAAAGGGAC TGCTCACCTC CGACCAGACG CTCTGGGCCA GCTCTCTCAC CGCGGATACG  GTGGAGTCCT TCTCCAAGAA GCCCAACCTT TGGGCCGAGA ACTACGGCGA AGCCATGGTG AGGATGGGCG CCATTGACGT CCTGACCGGA AACGAGGGCG AGATAAGGGT CAAATGCTCG 
GTTGTGAATT GCAGCTGA 

Retrieve as FASTA