Entry information : NoffFSD02-1A(Nasoff1150g0365290.t1 )
Entry ID 18933
Creation 2023-10-30 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2023-11-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-11-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NoffFSD02-1A(Nasoff1150g0365290.t1 )
Name NoffFSD02-1A(Nasoff1150g0365290.t1 )
Class FeSOD     [Orthogroup: FSD002]*
Taxonomy Viridiplantae (green plants); Streptophyta; Angiospermae; Eudicotyledons
Organism Nasturtium officinale    [TaxId: 65948 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type
Inducer
Repressor
Best BLASTp hits
Perox score E-value NoffFSD02-1A
start..stop
S start..stop
NoffFSD02-1B 570 0 1..304 1..304
AtFSD02 560 0 1..304 1..305
TsFSD02 489 6.2e-177 1..304 1..306
ThasFSD02 407 2.4e-144 2..270 1..274
Literature and cross-references NoffFSD02-1A(Nasoff1150g0365290.t1 )
Protein sequence: NoffFSD02-1A(Nasoff1150g0365290.t1 )
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   304
PWM (Da):   %s   34339.09  
PI (pH):   %s   4.65
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MMTVAVTATS SALSCPLLLP SQGSNRRMQW KRNVKRRCST KVAVSGVVTA GFELKPPPYP LDALEPHMSR ETLDYHWGKH HRTYVENLNK QIVGTDLDGL SLEEVVLLSY NRGNMLPAFN  NAAQAWNHEF FWGCIQPGGG GKPTGELLRL IERDFGSLED FVERFKSAAA SNFGSGWTWL AYKANRLEVA NAVNPLPKEE DKKLVIVKTP NAVNPLVWDY SPLLTIDTWE HAYYLDFENR 
RAEYINTYME KLVSWETVST RLESAIARAV QREQEGTETE DEENLDDEEP EVYLDSDIDV SEVD 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGACAG TAGCAGTGAC AGCCACTTCC TCAGCTCTCT CGTGCCCTTT GCTTCTTCCT TCTCAAGGTC TCTTCTTTAT TTAGTTTTAA TCTTTCTTAC CTCTTTCTAT TGCTCACTGT  GAACACTTGG GTTTGTTTAT ATGGCAGGGT CAAACCGGCG AATGCAATGG AAAAGAAACG TAAAGGTTGT GTTTTTAACT TCTCTTATAT CCTTTGAAAG TTCTAATCAG CTGATAAATT  CTACAAGGAA CTCTTTTTTT CAGTGATAGT ATGACCCAGG AATTATGCAT GGACAATGTT TGATGAAATG CTTGAATGAA ACTTGAACAC ATTCTTTGGT TGTTGTTGTG TTTTTTTTTT  TTTTTTTTTT TTTTTTTACT TTTATTTCAC AGAGACGGTG CTCGACAAAG GTGGCTGTTT CCGGAGTTGT TACAGCTGGA TTTGAGCTGA AGCCGCCTCC ATATCCTCTT GTATGTATTC  TTCAGTTCGT TATCAAGAGT TTAGTTTTGA GTTTTAAATA AAAAGACACA GCCTTTAGTT TTAAATAAAA AGACACAGCC TTTAGTTTCG AGTTTTGGTT GATATAATGT TATCATTGGA  TTAGAGTTTT TTTATTTATT CTGTTGCTAA TAATACGGTA GTGATATAAG GATGTGAAGG TTATTGAACA TATTACCGAA ACATTACTTT CAATTTAAAG ATGAATTTAG GAATAGGGAA  TAAGACACTA TGTAAATCAT ACTTAAAAGT CAAAGAAATG TTGAGGTTGC TGGTTTGGAT TGGAACCATA TGGGAGATGT TGCTCACTGT GTCTGTTGTT GGATGTGTTG ATATATGGTA  GGATGCTTTG GAGCCGCATA TGAGTCGGGA AACCTTGGAT TATCATTGGG GAAAGCATCA CAGAACTTAC GTAGAGAACC TGAATAAGCA AATCGTTGGC ACAGATCTAG ATGGATTGTC  CTTAGAAGAA GTTGTGCTTC TTTCATACAA CAGAGGCAAT ATGCTTCCTG CCTTCAACAA CGCTGCACAG GTAAAGTCCA TATTGTTTCC AATTAGTACG TATAACGGTA TAAGTGGTAG  TATCGGTATT GAAAAGCTTC AGGCTATGTA GATATATTGC TTTGGCTAGT TAGAGGCAGT GACACGGTTA AATGCATTGA CATGTTGCAT TTAGTTTGGT CAAGAAATAA CATTTCAGGA  TAAGTGAGTT CCATAACTTG TTCAGAGTAG GTCCACTGGT CATAATGGGA AGTCTCTTCT TAATGTGTGA TGGTTGGTTT CTCTGGATTA GATGTGAATT AAAAGTATAT GAGGAGATTG  CAGGCATGGA ACCATGAGTT CTTCTGGGGG TGTATCCAAC CTGGAGGTGG AGGAAAGCCA ACTGGAGAGC TCCTCAGATT AATAGAGAGA GATTTCGGGT CTTTGGAAGA CTTTGTGGAA  AGGTTCAAGT CGGCCGCAGC CTCTAATTTT GGTTCGGGTT GGACATGGCT TGCATGTAAA TGTTTTCTTT TTAACTTAAT CCCTTTTAAA ATGTGCAAAC TCCCCCAACA ACTTACTTAC  TTAAGCTTCT GAGGATCCAT TGATGCAGAC AAGGCGAATA GACTTGAAGT TGCAAATGCT GTAAATCCTC TCCCAAAGGA AGAAGACAAG AAGCTTGTAA TAGTGAAGAC TCCAAACGCA  GTGAATCCAC TCGTATGGGA TTATTCTGTA TGTATCCAAA CTTCCAGTAT ATAGATGAAT CTTTGTTGTT GGCTATAATG AATCTTTATC TCCTCACACT TTTGGTCTTT CCTTTTATGT  GCAGCCACTT CTCACCATTG ATACCTGGGA GGTATTTAAT ATAATCCTAC TCCGGTCTTT CTTAATTTCA TCTCGAAAGA TTGGTTTCTT CTTTGCTAAC TTAGTTTTCT TTTTCCCTCT  TTGTACCAAA CAGCATGCTT ACTATCTGGA TTTCGAGGTA CAATCAAAGA CTTTCACTAT ATTTGAAAGC AATGGTTCTC ATGTTTGTTA TATTCTACGC AGAACCGAAG AGCTGAATAC  ATAAATACAT ACATGGAAAA GCTTGTGTCA TGGGAAACTG TAAGCACAAG GCTGGAATCT GCAATCGCTC GAGCAGTACA AAGAGAACAA GAAGGAACAG AGACAGAAGA TGAAGAGAAT 
TTAGATGATG AAGAGCCAGA GGTTTACTTA GATAGTGATA TCGATGTATC TGAAGTTGAT TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGACAG TAGCAGTGAC AGCCACTTCC TCAGCTCTCT CGTGCCCTTT GCTTCTTCCT TCTCAAGGGT CAAACCGGCG AATGCAATGG AAAAGAAACG TAAAGAGACG GTGCTCGACA  AAGGTGGCTG TTTCCGGAGT TGTTACAGCT GGATTTGAGC TGAAGCCGCC TCCATATCCT CTTGATGCTT TGGAGCCGCA TATGAGTCGG GAAACCTTGG ATTATCATTG GGGAAAGCAT  CACAGAACTT ACGTAGAGAA CCTGAATAAG CAAATCGTTG GCACAGATCT AGATGGATTG TCCTTAGAAG AAGTTGTGCT TCTTTCATAC AACAGAGGCA ATATGCTTCC TGCCTTCAAC  AACGCTGCAC AGGCATGGAA CCATGAGTTC TTCTGGGGGT GTATCCAACC TGGAGGTGGA GGAAAGCCAA CTGGAGAGCT CCTCAGATTA ATAGAGAGAG ATTTCGGGTC TTTGGAAGAC  TTTGTGGAAA GGTTCAAGTC GGCCGCAGCC TCTAATTTTG GTTCGGGTTG GACATGGCTT GCATACAAGG CGAATAGACT TGAAGTTGCA AATGCTGTAA ATCCTCTCCC AAAGGAAGAA  GACAAGAAGC TTGTAATAGT GAAGACTCCA AACGCAGTGA ATCCACTCGT ATGGGATTAT TCTCCACTTC TCACCATTGA TACCTGGGAG CATGCTTACT ATCTGGATTT CGAGAACCGA  AGAGCTGAAT ACATAAATAC ATACATGGAA AAGCTTGTGT CATGGGAAAC TGTAAGCACA AGGCTGGAAT CTGCAATCGC TCGAGCAGTA CAAAGAGAAC AAGAAGGAAC AGAGACAGAA 
GATGAAGAGA ATTTAGATGA TGAAGAGCCA GAGGTTTACT TAGATAGTGA TATCGATGTA TCTGAAGTTG ATTAA 

Retrieve as FASTA